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The map label for this gene is 170761870

Identifier: 170761870

GI number: 170761870

Start: 11960

End: 14170

Strand: Reverse

Name: 170761870

Synonym: UPA3_0014

Alternate gene names: NA

Gene position: 14170-11960 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170762076

Following gene: 170762019

Centisome position: 1.89

GC content: 25.51

Gene sequence:

>2211_bases
ATGTTGAAATTTAAAACTCTTTTAAGTTACGATAGCTTTCTTAAAGGTCAAGAGCGAAAAACAATCACTAAAAAATTCTT
ATCGACAGTTTTTGCCATTTTTGTAGCGATAGTAGTTTCAGCTATTTTGGTTGGAATATTAGGCTATAACATACGTGATT
TCTTTATAAGATTATTTACTAAATGAATTGGTTCGCCAGATATTTATTTAACAAAAGTAGCAATTTTAGGAATTGCCGCA
TTATCATTTATTTTCGCTTTTAAAGCGGGATTATTTAATATTGGTATTTCTGGACAAATGTTAGGTTCAGGTTTGATTAT
GTTATTAGTCGTAAAAAACATGCAAATTGCCAATATTAATATGCCTAATGTTTTAGGTCAATTTTTCTTATTAATCATTG
CAATGTTAGCAGGAGCAATGTTTGCAGTTTTTATAGGAATTTTAAAAGTATTTTTAAAGATTAATGAAGTTGTTAGTTCA
ATTTTATTGAATTGAATAATGTTCTATATTACGCGTTATGTTGTTTTTACTGCACAAAGTAAAATGTATAATCCAACACC
AGATCAAGTTGGATCACGATCAATTCCTTTTGCTGATAATTATTCTTTATTTCATTTAGCATCTGGATATGGTTATTTAT
TTGCTTTATTGATCTTTATTTCTTTATCTATTATTATTTGAGTAATCTTAAAATACACAGTTTTTGGTCACAAAGTCTTA
TCTGTTGGTAAATCATTTGATGCAGCAAAATATGCTGGATACCGAACAAAAATTATTTCATTAGCAACTTTTGCGATCTC
TGGTGCATTAGCTGGGGCTTTAGCAATGGTTAATTATACTTCAACAACAACAAATGCGATTGTTATTAGTCAAGCTGCTG
ATGCCTTACCAACCCAAGGATATGATGGAATTGCGATGGGATTAATTTCTCTAGCACATCCTTTAGCAACAATTCCTGTC
TCATTCTTAATGGGATTATTACAACAATCTGCTGATAATTTAGGAGGAAGTTTTCCACAAGATTTATCTGGAATTATTAT
TTCATTTGTAATGTTAGGGGCAGCAATGTTTATTTTATTTGAACGAATAAGTCCCGTTTATTGAATTTATCATTTAATCT
ATACTTATAAAGGTAAGGATTATTATCGAGATTATGAAAATAAAAACAATAACATTATTTCTGAATATAAAGCAATCTAT
AGTGAAATTAATAAAAAACGTAATCAATATTTACAAGAGTTAAAGAAATTACGTAAAGAATTAGATCAATTTAAAAATCA
TGAACAATATAACAAAGTTAACCAACAATATGAATATACTATTAGTTACATTAAAACAACATATAATGCTTGATTAAAAG
TTGAATATGATAAATATTTGAAACAATTGAAAAATAATGCAATGCAACTTAAAAAACATTTAATTATTGAAAGAGCAACA
CTTGTTTATTATCCAGAAATTAACACAACAAGAAAAATTAAAAATAAACTAAAACATTTTGAAAACATAAGCGCTAAAAA
ACTAAGTCGTATTAAAGACAAAATTCATAATGAAGATTTTTTAATTAAAAATTTAGTGGCTAAAGAAATTAGTAAATATG
CTCAATCAAAATCGTTTGATTATAATAAGCTAAAATATTTATTACAAGAATATGAAAATAACAATTCAGTGTTAACAACC
GAGTTAGTTAATGAGTTATCTTTAGTTCTAAAAGATGAACAAGCACAATTAATGTTTAGTGAATTTAAACAGGCAAGTTT
TGAGAATAATTTAGATCACATGATTGATTTAAAAAATCAAATTATGACATACATTAATTCTTTATTAGATTCTCGATTAG
AACAATTGTCAATAACTTTAAAATCAAAGAATTTAGTTCATGATGAACAAATGGATAAGATTATTTTATTACTAAATCCA
AATGATAAAATTCTTAATAAAATTATTATTTCGCGTAATAAACATTTAGAAAATTACACGAAAGAAATTACAAAATTAGA
ATTAAGAAATATTTCGCAAGATGATGAAATTAAAAAGAATACAAAACAACGCTCATCATCATACTTGACAAAACATTATG
AAAAAACTAAACAACATATTAATAAAATTAATCTAGATCAAGAACAAAAATTATTATTAGAAGATTGATTAACAACTGCT
TATCAAAAAGCAATTATTAATCAACAAAACATGAAAGAGGTGATTAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCTGTAATTCATAATGGATATTTCATTAGTGTTGGTGATCGTTTTTCAATGACAAGACAAAAAATTGGTGAATTAATG
GCAGGTGAAAAAATATAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGCCTTCATTATCATTAATTAACGATGCCTCTATTTACGCTGCTATTTTAATTCTAGGTGCGTTAAGTGGTTTCTTTTGT
GAACGTGTTGGGATTGCTAA

Product: ribose/galactose ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 736; Mature: 736

Protein sequence:

>736_residues
MLKFKTLLSYDSFLKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYNIRDFFIRLFTKWIGSPDIYLTKVAILGIAA
LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS
ILLNWIMFYITRYVVFTAQSKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLSIIIWVILKYTVFGHKVL
SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQAADALPTQGYDGIAMGLISLAHPLATIPV
SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVYWIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNIISEYKAIY
SEINKKRNQYLQELKKLRKELDQFKNHEQYNKVNQQYEYTISYIKTTYNAWLKVEYDKYLKQLKNNAMQLKKHLIIERAT
LVYYPEINTTRKIKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEISKYAQSKSFDYNKLKYLLQEYENNNSVLTT
ELVNELSLVLKDEQAQLMFSEFKQASFENNLDHMIDLKNQIMTYINSLLDSRLEQLSITLKSKNLVHDEQMDKIILLLNP
NDKILNKIIISRNKHLENYTKEITKLELRNISQDDEIKKNTKQRSSSYLTKHYEKTKQHINKINLDQEQKLLLEDWLTTA
YQKAIINQQNMKEVIS

Sequences:

>Translated_736_residues
MLKFKTLLSYDSFLKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYNIRDFFIRLFTK*IGSPDIYLTKVAILGIAA
LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS
ILLN*IMFYITRYVVFTAQSKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLSIII*VILKYTVFGHKVL
SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQAADALPTQGYDGIAMGLISLAHPLATIPV
SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVY*IYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNIISEYKAIY
SEINKKRNQYLQELKKLRKELDQFKNHEQYNKVNQQYEYTISYIKTTYNA*LKVEYDKYLKQLKNNAMQLKKHLIIERAT
LVYYPEINTTRKIKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEISKYAQSKSFDYNKLKYLLQEYENNNSVLTT
ELVNELSLVLKDEQAQLMFSEFKQASFENNLDHMIDLKNQIMTYINSLLDSRLEQLSITLKSKNLVHDEQMDKIILLLNP
NDKILNKIIISRNKHLENYTKEITKLELRNISQDDEIKKNTKQRSSSYLTKHYEKTKQHINKINLDQEQKLLLED*LTTA
YQKAIINQQNMKEVIS
>Mature_736_residues
MLKFKTLLSYDSFLKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYNIRDFFIRLFTK*IGSPDIYLTKVAILGIAA
LSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINMPNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSS
ILLN*IMFYITRYVVFTAQSKMYNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLSIII*VILKYTVFGHKVL
SVGKSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQAADALPTQGYDGIAMGLISLAHPLATIPV
SFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERISPVY*IYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNIISEYKAIY
SEINKKRNQYLQELKKLRKELDQFKNHEQYNKVNQQYEYTISYIKTTYNA*LKVEYDKYLKQLKNNAMQLKKHLIIERAT
LVYYPEINTTRKIKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEISKYAQSKSFDYNKLKYLLQEYENNNSVLTT
ELVNELSLVLKDEQAQLMFSEFKQASFENNLDHMIDLKNQIMTYINSLLDSRLEQLSITLKSKNLVHDEQMDKIILLLNP
NDKILNKIIISRNKHLENYTKEITKLELRNISQDDEIKKNTKQRSSSYLTKHYEKTKQHINKINLDQEQKLLLED*LTTA
YQKAIINQQNMKEVIS

Specific function: Unknown

COG id: COG4603

COG function: function code R; ABC-type uncharacterized transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001851 [H]

Pfam domain/function: PF02653 BPD_transp_2 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83413; Mature: 83413

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKFKTLLSYDSFLKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYNIRDFFIRLFT
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
KIGSPDIYLTKVAILGIAALSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINM
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC
PNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSSILLNIMFYITRYVVFTAQSKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLSIIIVILKYTVFGHKVLSVG
CCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQAADALPTQGYDG
CCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECHHCCCCCCCCCH
IAMGLISLAHPLATIPVSFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SPVYIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNIISEYKAIYSEINKKRNQYLQELKKLRKELDQF
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNHEQYNKVNQQYEYTISYIKTTYNALKVEYDKYLKQLKNNAMQLKKHLIIERATLVYYP
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC
EINTTRKIKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEISKYAQSKSFDYNKLK
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
YLLQEYENNNSVLTTELVNELSLVLKDEQAQLMFSEFKQASFENNLDHMIDLKNQIMTYI
HHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NSLLDSRLEQLSITLKSKNLVHDEQMDKIILLLNPNDKILNKIIISRNKHLENYTKEITK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LELRNISQDDEIKKNTKQRSSSYLTKHYEKTKQHINKINLDQEQKLLLEDLTTAYQKAII
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NQQNMKEVIS
CHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
MLKFKTLLSYDSFLKGQERKTITKKFLSTVFAIFVAIVVSAILVGILGYNIRDFFIRLFT
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
KIGSPDIYLTKVAILGIAALSFIFAFKAGLFNIGISGQMLGSGLIMLLVVKNMQIANINM
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCC
PNVLGQFFLLIIAMLAGAMFAVFIGILKVFLKINEVVSSILLNIMFYITRYVVFTAQSKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YNPTPDQVGSRSIPFADNYSLFHLASGYGYLFALLIFISLSIIIVILKYTVFGHKVLSVG
CCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
KSFDAAKYAGYRTKIISLATFAISGALAGALAMVNYTSTTTNAIVISQAADALPTQGYDG
CCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECHHCCCCCCCCCH
IAMGLISLAHPLATIPVSFLMGLLQQSADNLGGSFPQDLSGIIISFVMLGAAMFILFERI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SPVYIYHLIYTYKGKDYYRDYENKNNNIISEYKAIYSEINKKRNQYLQELKKLRKELDQF
CHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNHEQYNKVNQQYEYTISYIKTTYNALKVEYDKYLKQLKNNAMQLKKHLIIERATLVYYP
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEC
EINTTRKIKNKLKHFENISAKKLSRIKDKIHNEDFLIKNLVAKEISKYAQSKSFDYNKLK
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
YLLQEYENNNSVLTTELVNELSLVLKDEQAQLMFSEFKQASFENNLDHMIDLKNQIMTYI
HHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NSLLDSRLEQLSITLKSKNLVHDEQMDKIILLLNPNDKILNKIIISRNKHLENYTKEITK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LELRNISQDDEIKKNTKQRSSSYLTKHYEKTKQHINKINLDQEQKLLLEDLTTAYQKAII
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NQQNMKEVIS
CHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7569993; 8253680 [H]