| Definition | Yersinia pseudotuberculosis YPIII chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010465 |
| Length | 4,689,441 |
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The map label for this gene is 170025366
Identifier: 170025366
GI number: 170025366
Start: 3439672
End: 3442944
Strand: Direct
Name: 170025366
Synonym: YPK_3147
Alternate gene names: NA
Gene position: 3439672-3442944 (Clockwise)
Preceding gene: 170025365
Following gene: 170025367
Centisome position: 73.35
GC content: 31.47
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: TPR repeat-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1090; Mature: 1090
Protein sequence:
>1090_residues MEKQIHTGSGDNVANNKIVNIINSIEPKDIKGFIADFMQDISHRKISDAEKKIDSITNIDGLDGNVKSILNALKIKADLI REKKGLRKQELQNLVRNKTLDYDVLDVTLSILLHFESKIQLDSARDRYFSAERIGQYSNEIFFEYLSTDDEIVESFNNQD KFNFLEHEVLGLIRGSLRNNNINIAYDLSKHLNANYPSINSTFFLLHCETLLLLNNTKNRHILSFNRHEKNHADILIDSL LDNFSSDASRFILPLINQLYITGFTNTKLVDLAKKNIIEIKKISSECADIITKITNKTVLPYSQLTLPQEIKDLETFSTL DELLTIGSFNKTSLADWRYSGGKISTDDSYINSLLELQVSVWLCTSQDKNSIMDLTQQAEEFLSLDINRYKELNPSNLIF LCERFMALNLSLIAVKYLDPILPDEPWLSPLLENLLQALYLSEQNDLFFKKLALFSDDVKSESIWLLEAQVYERLQQDDK AITAVQEAIKIDNKNAYSWDLLLYLRQKKKTNKDDLTKLVVEIPSEVFYTYHETKIPLLNSIAKYVDPNIAESVLVDWFV VNPNQLAKHLIDIHHNSLINRTDKQDVVYLPKYCIKGIEYNDGFRKNKRILIKDVVTEHPLFLNINSPLGKIVEKLTIGE TVEDPYLGEISLTDEIPAPVAAYQAAIKIRDQINDGSDSFKLFELPSNEDDFLPYFEKILRRFSGNKAAQNPVLQNPNIP LCMRGNFTHHGDYFRAAYYHLTSIETTQYINLHNEGIKDPDKIIVDTYTSIYLSLLGFVPLIEKKGTTLILTNYTKDILE SWIRDITREDYLSLDVTKFGMQRITAEDIRNNAYDFIQQLKLLIDISQEEKINVVDTPENLVKIKDIIDPSVFSTIQLSH ANNIPWLSIDHLLCILAQKSDFPVVNSYNFLNMLINSSDFKERKESIIVSLTCGLPVPIFYSDIIILSRSNENKDIYLTA KFIEKHKSPSNDTLENINYLSQIMRNVIVKAYLDRDILKGSRAYNPIYDGYEEYVFNVCCQTALLCLEGKTAEARMALLI SETLEPFYQSRSLRKLVCDLATSFSTGHFLSIEAINIELERIISSKNITA
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 125056; Mature: 125056
Theoretical pI: Translated: 5.11; Mature: 5.11
Prosite motif: PS50005 TPR
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEKQIHTGSGDNVANNKIVNIINSIEPKDIKGFIADFMQDISHRKISDAEKKIDSITNID CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC GLDGNVKSILNALKIKADLIREKKGLRKQELQNLVRNKTLDYDVLDVTLSILLHFESKIQ CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEE LDSARDRYFSAERIGQYSNEIFFEYLSTDDEIVESFNNQDKFNFLEHEVLGLIRGSLRNN ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NINIAYDLSKHLNANYPSINSTFFLLHCETLLLLNNTKNRHILSFNRHEKNHADILIDSL CEEEEEECHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHH LDNFSSDASRFILPLINQLYITGFTNTKLVDLAKKNIIEIKKISSECADIITKITNKTVL HHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PYSQLTLPQEIKDLETFSTLDELLTIGSFNKTSLADWRYSGGKISTDDSYINSLLELQVS CHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEE VWLCTSQDKNSIMDLTQQAEEFLSLDINRYKELNPSNLIFLCERFMALNLSLIAVKYLDP EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC ILPDEPWLSPLLENLLQALYLSEQNDLFFKKLALFSDDVKSESIWLLEAQVYERLQQDDK CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH AITAVQEAIKIDNKNAYSWDLLLYLRQKKKTNKDDLTKLVVEIPSEVFYTYHETKIPLLN HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCHHHH SIAKYVDPNIAESVLVDWFVVNPNQLAKHLIDIHHNSLINRTDKQDVVYLPKYCIKGIEY HHHHHHCCCHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHCCCCC NDGFRKNKRILIKDVVTEHPLFLNINSPLGKIVEKLTIGETVEDPYLGEISLTDEIPAPV CCCCCCCCCEEEEHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCH AAYQAAIKIRDQINDGSDSFKLFELPSNEDDFLPYFEKILRRFSGNKAAQNPVLQNPNIP HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC LCMRGNFTHHGDYFRAAYYHLTSIETTQYINLHNEGIKDPDKIIVDTYTSIYLSLLGFVP EEEECCCCCCCCHHHHHHHEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHH LIEKKGTTLILTNYTKDILESWIRDITREDYLSLDVTKFGMQRITAEDIRNNAYDFIQQL HHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH KLLIDISQEEKINVVDTPENLVKIKDIIDPSVFSTIQLSHANNIPWLSIDHLLCILAQKS HHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHCCCC DFPVVNSYNFLNMLINSSDFKERKESIIVSLTCGLPVPIFYSDIIILSRSNENKDIYLTA CCCEECCCHHHHHHHCCCHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEE KFIEKHKSPSNDTLENINYLSQIMRNVIVKAYLDRDILKGSRAYNPIYDGYEEYVFNVCC HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHH QTALLCLEGKTAEARMALLISETLEPFYQSRSLRKLVCDLATSFSTGHFLSIEAINIELE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHH RIISSKNITA HHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MEKQIHTGSGDNVANNKIVNIINSIEPKDIKGFIADFMQDISHRKISDAEKKIDSITNID CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC GLDGNVKSILNALKIKADLIREKKGLRKQELQNLVRNKTLDYDVLDVTLSILLHFESKIQ CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEE LDSARDRYFSAERIGQYSNEIFFEYLSTDDEIVESFNNQDKFNFLEHEVLGLIRGSLRNN ECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NINIAYDLSKHLNANYPSINSTFFLLHCETLLLLNNTKNRHILSFNRHEKNHADILIDSL CEEEEEECHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHH LDNFSSDASRFILPLINQLYITGFTNTKLVDLAKKNIIEIKKISSECADIITKITNKTVL HHHHCCHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC PYSQLTLPQEIKDLETFSTLDELLTIGSFNKTSLADWRYSGGKISTDDSYINSLLELQVS CHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEE VWLCTSQDKNSIMDLTQQAEEFLSLDINRYKELNPSNLIFLCERFMALNLSLIAVKYLDP EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC ILPDEPWLSPLLENLLQALYLSEQNDLFFKKLALFSDDVKSESIWLLEAQVYERLQQDDK CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHH AITAVQEAIKIDNKNAYSWDLLLYLRQKKKTNKDDLTKLVVEIPSEVFYTYHETKIPLLN HHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHEECCCCCCHHHH SIAKYVDPNIAESVLVDWFVVNPNQLAKHLIDIHHNSLINRTDKQDVVYLPKYCIKGIEY HHHHHHCCCHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHCCCCC NDGFRKNKRILIKDVVTEHPLFLNINSPLGKIVEKLTIGETVEDPYLGEISLTDEIPAPV CCCCCCCCCEEEEHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCH AAYQAAIKIRDQINDGSDSFKLFELPSNEDDFLPYFEKILRRFSGNKAAQNPVLQNPNIP HHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC LCMRGNFTHHGDYFRAAYYHLTSIETTQYINLHNEGIKDPDKIIVDTYTSIYLSLLGFVP EEEECCCCCCCCHHHHHHHEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHH LIEKKGTTLILTNYTKDILESWIRDITREDYLSLDVTKFGMQRITAEDIRNNAYDFIQQL HHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH KLLIDISQEEKINVVDTPENLVKIKDIIDPSVFSTIQLSHANNIPWLSIDHLLCILAQKS HHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEECCCCCCEEEHHHHHHHHCCCC DFPVVNSYNFLNMLINSSDFKERKESIIVSLTCGLPVPIFYSDIIILSRSNENKDIYLTA CCCEECCCHHHHHHHCCCHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEE KFIEKHKSPSNDTLENINYLSQIMRNVIVKAYLDRDILKGSRAYNPIYDGYEEYVFNVCC HHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHH QTALLCLEGKTAEARMALLISETLEPFYQSRSLRKLVCDLATSFSTGHFLSIEAINIELE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHH RIISSKNITA HHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA