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The map label for this gene is yddE [H]

Identifier: 170016343

GI number: 170016343

Start: 25677

End: 28199

Strand: Direct

Name: yddE [H]

Synonym: LCK_p100036

Alternate gene names: 170016343

Gene position: 25677-28199 (Clockwise)

Preceding gene: 170016342

Following gene: 170016344

Centisome position: 66.33

GC content: 36.42

Gene sequence:

>2523_bases
ATGAAACTAGCAGTACCATTTAAAGCCGTGAAAGATAATATTTTATTAACCCAGGACAATGAAGCTTGGGCATATTTCAA
TATTGAAGCACTAAGTATTTCAGATAATGATGAGGAGGGCATTGCGAAACGACAAACACAATTGAGTCTGTTATTTGATC
GGCTCGCTGATTTTGAAGATTTTGAATTGCGTCTTTATAATCGTGATTTGGATTTGGTTAATCGTTATAAAGAATTACAA
CCCTCGTTAGCAACCGATATGGGTGAGACACCAGTTCAAATGATTGTAGATGAAATTAGTGCAATCACTGCTACTGGTGT
GTCACAGACAATTGAACGTTTTGTTTTGGGTATCAAATTACATAATCAAAATTCTGGTAAAGTGATTAAACAAGCCACTA
ATGCCATGAATAACTTTGTAGATGAGTTGGCTGGTTGGTTTAATTATGAAAAGCCATTAGATGAAAAACTGTTTGATGAT
TTTAGAACTAGTGAAAAACAGGCTTATGAAAAAGTTGGCTATTTGGATCATACCAGGCGTTTGACCACTGATGAATTAGT
TCATTTAATGCGTAATAACTTTATCCAGGGACAGCTACATGATTTTAGAAAAGTCGGACAAGAACGTGATATTTTCAAAT
TAAGTGATACTGTGATTGATGATGGGGCAGTGAGTGGGTACGTTAAATTGGTTAATGATGATAATGTGCGTTATGTTGCC
AAATTAGTGTTATCGACAACGCCAGAAAACATCACAGGCTTTCATTTATTCCGACTAGTACAAAATATGAGTTATCCAAT
CGACATCAATTTGAAAGCACATTATTATAAGTCAGAGGGTATCTATGGCTTAGCAACTCGTGCTAGTCAATCGTTAAAGA
CTGCTAGTAATAATGTGAACGAGCGTTATCAAGCGGAAGGATTTTCTTCTAGTAAAGATGATAATACGGTTGAAATTGCC
GAAGTGCTAAACGATCATATTTCAGAAAAGAGAAACTTCTTTTCCACCTTAGTCACGTTTACGGTATCAGCGGAATATAT
TGAAACCCTACATGATCGTGTTGCTAATTTAATAGAATCATTTAGGAGTATTGACGTGAATATTGTGAAACCAATCGGTG
AACAAAAACGTCTTTTCTATTACGATTTAATGGGTTCTGATGTGTCCCAAAACCGCTATTGGGTGCAATTATTGACTAGT
GAGGGTATCGGTGAGTTGTTATTTGCGGTTAATCAGCAAGTTGGTAGTAATATTGGCTTTTATATTGGACGTGGTGCGCC
AAAAACAGTTGCCAATAGTACCCAGGACGCATTAGACAGTTCAAAGCGCTTGGTCTTTTTTAATCCGTTGATTACCAACG
AAATATTAGACGGATCGACTAGCACAACCAGCCCTAATATTATGATTACGGGTAAAACGGGTAGAGGAAAGTCTTACCTC
ACTAAAATTATTTTGAAAATTATTCAACTTTCAAATGCTAAAGCAATCTATTTTGATCCTAAGCAGGAAATGCGTAAATG
GTATTCAGCGGTATTAAACGATCAGACCTTTAAAGCAGATTATCCAGATGAATATACATTATTGAATAATGTGCGTTTTG
TGACGCTTGATGTTTCTGATAAAACAAATTATGGTGTTTTGGATCCCTTTATTGTGATTGATGTGCGGCATACAATGGGA
CAAACACAGTCAGGTGAAGAAAGCTTAAAGGCTACGGTACAAGAAATTTTTAAACAAATTTACCGTGATTATGGTTCCTT
AATTGCCGAAACAGAATTAGATCTTGCCATTAATAAAATTATTCAAAAACGACAAGCTGGTGAAACCGTTGGTATGTTAG
ATGTCATTGAAGAATTAGCCCAAAATGAAGATGAAGACGTGAAACATTTAGCTAAGTTTTTATCAGGTAAGGTTACTCGT
AGCTCATTATCTCTAGTATTTTCACATGGTGAAAGTGAGGGCTTGAAGTTAAACAATCGAATTACCATTCTTGAAACAGC
AGGATTGACATTGCCACAACATGACAAATCCAAACAAGATTACACCGAATTTGAGGTAGCAAGTATGATTGTGATGACGG
TGTTAGGGGTCTTTAGTCGGACGTTTGCGACACGGGATTATGATGAAAAAACGGTTGAAATATTTGATGAAGCTTGGACG
TTTACAACGTCTGATATTGGTAGTCGTATTTTTAATGAAATGGCACGTATTGGACGTTCTGCCAATAACTTGTTAATTCC
AGTGACACAATCAGTTCATGATGTTAAAAGTGATAATTTTGGTGTTTTATTTGCTTTTGATGAGGATAAGGAACAGCCAG
ATATTTTACAACATGTTGGTTTGCCAGTTAATGATGACAACATCAAAGAATTAGGCAATATGGTCATGGGACAGTGTTTC
ATGAAAGATATTTATGGACGGGTTGAAAAAATAACGGTTGATGAGCCATTGGTTGCTATGCAACGTGCCTATCAGACGGT
TAAGGCAGGTGACACGGCACAAGCCGAAAAAGCTTATCGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTGTTGGAAGATACAAAAAAAGTGATTGTCTATTAGCAATCATCTACAAAGCTTTGACTTTGTAGGTACATAACAAAT
AAAAAGATAGGGAGACATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGTTAAAATAGAACAGTCGATAGTTAAGTTAAGTGGTGGCTATTCTTTCAACAGAAAAGAGGTGGTGCTTATGGTGTA
AAACCTATAAACACGAACCC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 840; Mature: 840

Protein sequence:

>840_residues
MKLAVPFKAVKDNILLTQDNEAWAYFNIEALSISDNDEEGIAKRQTQLSLLFDRLADFEDFELRLYNRDLDLVNRYKELQ
PSLATDMGETPVQMIVDEISAITATGVSQTIERFVLGIKLHNQNSGKVIKQATNAMNNFVDELAGWFNYEKPLDEKLFDD
FRTSEKQAYEKVGYLDHTRRLTTDELVHLMRNNFIQGQLHDFRKVGQERDIFKLSDTVIDDGAVSGYVKLVNDDNVRYVA
KLVLSTTPENITGFHLFRLVQNMSYPIDINLKAHYYKSEGIYGLATRASQSLKTASNNVNERYQAEGFSSSKDDNTVEIA
EVLNDHISEKRNFFSTLVTFTVSAEYIETLHDRVANLIESFRSIDVNIVKPIGEQKRLFYYDLMGSDVSQNRYWVQLLTS
EGIGELLFAVNQQVGSNIGFYIGRGAPKTVANSTQDALDSSKRLVFFNPLITNEILDGSTSTTSPNIMITGKTGRGKSYL
TKIILKIIQLSNAKAIYFDPKQEMRKWYSAVLNDQTFKADYPDEYTLLNNVRFVTLDVSDKTNYGVLDPFIVIDVRHTMG
QTQSGEESLKATVQEIFKQIYRDYGSLIAETELDLAINKIIQKRQAGETVGMLDVIEELAQNEDEDVKHLAKFLSGKVTR
SSLSLVFSHGESEGLKLNNRITILETAGLTLPQHDKSKQDYTEFEVASMIVMTVLGVFSRTFATRDYDEKTVEIFDEAWT
FTTSDIGSRIFNEMARIGRSANNLLIPVTQSVHDVKSDNFGVLFAFDEDKEQPDILQHVGLPVNDDNIKELGNMVMGQCF
MKDIYGRVEKITVDEPLVAMQRAYQTVKAGDTAQAEKAYR

Sequences:

>Translated_840_residues
MKLAVPFKAVKDNILLTQDNEAWAYFNIEALSISDNDEEGIAKRQTQLSLLFDRLADFEDFELRLYNRDLDLVNRYKELQ
PSLATDMGETPVQMIVDEISAITATGVSQTIERFVLGIKLHNQNSGKVIKQATNAMNNFVDELAGWFNYEKPLDEKLFDD
FRTSEKQAYEKVGYLDHTRRLTTDELVHLMRNNFIQGQLHDFRKVGQERDIFKLSDTVIDDGAVSGYVKLVNDDNVRYVA
KLVLSTTPENITGFHLFRLVQNMSYPIDINLKAHYYKSEGIYGLATRASQSLKTASNNVNERYQAEGFSSSKDDNTVEIA
EVLNDHISEKRNFFSTLVTFTVSAEYIETLHDRVANLIESFRSIDVNIVKPIGEQKRLFYYDLMGSDVSQNRYWVQLLTS
EGIGELLFAVNQQVGSNIGFYIGRGAPKTVANSTQDALDSSKRLVFFNPLITNEILDGSTSTTSPNIMITGKTGRGKSYL
TKIILKIIQLSNAKAIYFDPKQEMRKWYSAVLNDQTFKADYPDEYTLLNNVRFVTLDVSDKTNYGVLDPFIVIDVRHTMG
QTQSGEESLKATVQEIFKQIYRDYGSLIAETELDLAINKIIQKRQAGETVGMLDVIEELAQNEDEDVKHLAKFLSGKVTR
SSLSLVFSHGESEGLKLNNRITILETAGLTLPQHDKSKQDYTEFEVASMIVMTVLGVFSRTFATRDYDEKTVEIFDEAWT
FTTSDIGSRIFNEMARIGRSANNLLIPVTQSVHDVKSDNFGVLFAFDEDKEQPDILQHVGLPVNDDNIKELGNMVMGQCF
MKDIYGRVEKITVDEPLVAMQRAYQTVKAGDTAQAEKAYR
>Mature_840_residues
MKLAVPFKAVKDNILLTQDNEAWAYFNIEALSISDNDEEGIAKRQTQLSLLFDRLADFEDFELRLYNRDLDLVNRYKELQ
PSLATDMGETPVQMIVDEISAITATGVSQTIERFVLGIKLHNQNSGKVIKQATNAMNNFVDELAGWFNYEKPLDEKLFDD
FRTSEKQAYEKVGYLDHTRRLTTDELVHLMRNNFIQGQLHDFRKVGQERDIFKLSDTVIDDGAVSGYVKLVNDDNVRYVA
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EVLNDHISEKRNFFSTLVTFTVSAEYIETLHDRVANLIESFRSIDVNIVKPIGEQKRLFYYDLMGSDVSQNRYWVQLLTS
EGIGELLFAVNQQVGSNIGFYIGRGAPKTVANSTQDALDSSKRLVFFNPLITNEILDGSTSTTSPNIMITGKTGRGKSYL
TKIILKIIQLSNAKAIYFDPKQEMRKWYSAVLNDQTFKADYPDEYTLLNNVRFVTLDVSDKTNYGVLDPFIVIDVRHTMG
QTQSGEESLKATVQEIFKQIYRDYGSLIAETELDLAINKIIQKRQAGETVGMLDVIEELAQNEDEDVKHLAKFLSGKVTR
SSLSLVFSHGESEGLKLNNRITILETAGLTLPQHDKSKQDYTEFEVASMIVMTVLGVFSRTFATRDYDEKTVEIFDEAWT
FTTSDIGSRIFNEMARIGRSANNLLIPVTQSVHDVKSDNFGVLFAFDEDKEQPDILQHVGLPVNDDNIKELGNMVMGQCF
MKDIYGRVEKITVDEPLVAMQRAYQTVKAGDTAQAEKAYR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016628
- InterPro:   IPR002789 [H]

Pfam domain/function: PF01935 DUF87 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95189; Mature: 95189

Theoretical pI: Translated: 4.79; Mature: 4.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLAVPFKAVKDNILLTQDNEAWAYFNIEALSISDNDEEGIAKRQTQLSLLFDRLADFED
CCCCCCHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
FELRLYNRDLDLVNRYKELQPSLATDMGETPVQMIVDEISAITATGVSQTIERFVLGIKL
CEEEEECCCHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE
HNQNSGKVIKQATNAMNNFVDELAGWFNYEKPLDEKLFDDFRTSEKQAYEKVGYLDHTRR
ECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCC
LTTDELVHLMRNNFIQGQLHDFRKVGQERDIFKLSDTVIDDGAVSGYVKLVNDDNVRYVA
CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHH
KLVLSTTPENITGFHLFRLVQNMSYPIDINLKAHYYKSEGIYGLATRASQSLKTASNNVN
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCC
ERYQAEGFSSSKDDNTVEIAEVLNDHISEKRNFFSTLVTFTVSAEYIETLHDRVANLIES
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRSIDVNIVKPIGEQKRLFYYDLMGSDVSQNRYWVQLLTSEGIGELLFAVNQQVGSNIGF
HHCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCE
YIGRGAPKTVANSTQDALDSSKRLVFFNPLITNEILDGSTSTTSPNIMITGKTGRGKSYL
EEECCCCHHHHCCCHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHH
TKIILKIIQLSNAKAIYFDPKQEMRKWYSAVLNDQTFKADYPDEYTLLNNVRFVTLDVSD
HHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCEEEECCEEEEEEEECC
KTNYGVLDPFIVIDVRHTMGQTQSGEESLKATVQEIFKQIYRDYGSLIAETELDLAINKI
CCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IQKRQAGETVGMLDVIEELAQNEDEDVKHLAKFLSGKVTRSSLSLVFSHGESEGLKLNNR
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHEECCCCCCEEECCE
ITILETAGLTLPQHDKSKQDYTEFEVASMIVMTVLGVFSRTFATRDYDEKTVEIFDEAWT
EEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCC
FTTSDIGSRIFNEMARIGRSANNLLIPVTQSVHDVKSDNFGVLFAFDEDKEQPDILQHVG
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LPVNDDNIKELGNMVMGQCFMKDIYGRVEKITVDEPLVAMQRAYQTVKAGDTAQAEKAYR
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKLAVPFKAVKDNILLTQDNEAWAYFNIEALSISDNDEEGIAKRQTQLSLLFDRLADFED
CCCCCCHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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HHCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCE
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LPVNDDNIKELGNMVMGQCFMKDIYGRVEKITVDEPLVAMQRAYQTVKAGDTAQAEKAYR
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]