Definition | Finegoldia magna ATCC 29328 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010376 |
Length | 1,797,577 |
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The map label for this gene is 169824185
Identifier: 169824185
GI number: 169824185
Start: 548721
End: 551165
Strand: Direct
Name: 169824185
Synonym: FMG_0488
Alternate gene names: NA
Gene position: 548721-551165 (Clockwise)
Preceding gene: 169824184
Following gene: 169824186
Centisome position: 30.53
GC content: 32.31
Gene sequence:
>2445_bases ATGTTTACTTACAAACTAAAAAAATTATACAGATACAGGCTGATTCCATTTTTGATTCTATTTTCTATTACTATGGGTGT GGTTGTTTTTTTTCTACATTTTAGAACAACAAACCATGCGTTTGATTTTCTTAATTCAAATGACATCTCCATTTCTAATA ATATCAGTTGGGATGAGTTAATCATCAAAAAAACTGATTGGAAGAAAATAACACCAGAAGAACCAGACAAAAAAAGCTAC GAAGACCACAAAGCGTACCTAAATGAAGGGAAAAATGTATTACAAAACTTAATGAAAGCTCATGGGCTTGATGAAAACTA CAAGTACGATAAGTCTAAATACAATGAAAAGGATATCATAAAGTACACTAATGAATTGGATGCTCTGAATAATAAATACC ATACAGACGAGAACATGGATAATCCTAAGGAACTCAGGAGATCTGTACTGAGATCAGAAGGCTACATAAATTTCTTGAAA GATAGAAACTCCGTAGAAGATAGATTGATTGACGAGAATGACAATCACAGTTTCAGCAAAGTGATATTTGATGAAGCTGG TGTGATTTTTGGTGCTGTTCCGATAATTCTACTAGGCTTTGTGATTATTTTCATAATGAGAGAAGATGATATAACCAGCG TAACATCGAATTCCAAAATAAAGGATGTGGCAAATAATTTTGGTATTATTATGTGTATGATTGTGATGTACATTATCATT TCATTGTTGACAGTGTTTGTGGCTTCTTTAATAACTGGAAATGGTGTGGGCGATTTAACATATCACTACGATTCTACATT TGTTATTAGGACTGTTCAGGACAGGAGTGGTTCGATAAGAGAATACTCATACGTTATGAGAACGCCTTTGTCTACATTTT TTAAGAGTGTATTTCCTTTTGCTTTAATCACTATGTCGTTTGGATTTGCGTTTTCTTTTGTTGATAAACTTATACAAAAC ACCAAAGTAAAGTATTTTACTTTGATCTTGATAATGAGTTTGCTATTGGTTGATTTTAATTTCTTCAATCATGCATACAA TCCTCTAAGCTTGTTTAAGTCGTTTTCGTTAAAACCTGTGATTGCTACAGTGTTTATGCTTTTGATAACGGCTATAGGTA CGATTTTTTTGAACAGGAGAAAAGAATTCACATCACATGATACATACAAAGAGCGAAATGTATTCAGCTTAAAAGGTTCC GTGAAAAACTGTGTATTATCATTTAATGGGTTTTTGATATTGTTTGTCGTGTGTGCTATTTTGGTTGGAAATATCTGCCT ACAAAACAATTGGCACAATTTTAATTCCACTCAAATTAAAAACTATACCGATCTTAATTCTACTATGGAGAATTTGGTAT ATAGGGATATTGATGAGATTAAGGCAAAATACGGCAATAGCAAAAGAGCAAAGGAAATGATAGATTCTCATTCAGATGCT TTGAAATTTTACGAAAATGAGAACAAATACTTCGACGCTTATGAAAATAGATACAAGACTCCCCAAAAGTTCAATAATGT GAATAAGGAAAGGGTAACTGAATTTAATGGTTTTGATTTTCAAGGAACAGGTAGTGAAACAACAGGAATGGTGGATGTAT TCAACGATTTTGCTCTTGAAGGAGCATTCTTCAAACAAAAATATATGCTCATAAACAACATCACACCAACAGACAGATTC TATATTCCGCAATCAGGAATTGATTATAATCCTTTTGATGTGGATAGTTTCAAAGGAACTTTGCCTAAAATCAATTACTA CATTACTCATGGAATATCAGAGAGAAATAATGCTTTTGCGATGTTACATGATTACTTCTATCTTAAATTTAATGTAGTGT TGATTGTGTTTGCGGTATTGCTGTTCACATCTACGATTATCAAATCGAATAAGCAGCTTGAACTTAAATCAGTACTTCCT GTAAGTCGAACAAAATCGTACAAGTCAAAGATAATGGAAAGCTTAATATACGCGATTGGTATAAACATCGTTGCAGTTTT GGTATTATTCTTAGCTGGTGGTATTATGGGTGGATTTGCAGACAGTGATTTTCCAATTATTAACTATATTGTGGACGGTG GAATTATTTACTTAAATGTTGGTCCATTTCTGGTATATATACTAGAATCTTTTACAATAACTGTGTTGTTTACGATATTT ATCAGTATGTTTGTAAATGCTATGTACACTACTACTAACAAGTTATTTACGATATTAATATCCATAATTGCATTGATAAT TCCATTTACCGCAATTAAATACATGGGAGCAATAGGATCTTTTATTCCATTTAACTATGTGGATTCGGGATTTGTAACTA CGGGATTTTTGTCGGCGTTGATAAGACAGAATTCTTACACGATGGTGATAGCTGTTGTAGTTCTTGTGATTAGTTCAATA TTGTTTTATATATTGGGTAGAGTTTCATTTGGCAGGAGGAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGGGAGTACTGAAAAAATCAATACGTCCAGACTATGAAGAAGAGGGTAGGTTGTATTACAGATACTCTGGGAATTTAAA GAAACAATAAGGAGACAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTAGAAGTAGTAAATATTGAAAAAAGTTACGGAAAGAAAAAGATACTTCACGATATATCTTTTAGTATTGAAAAAGGA CAAATCAAAGCGTTGGTAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 814; Mature: 814
Protein sequence:
>814_residues MFTYKLKKLYRYRLIPFLILFSITMGVVVFFLHFRTTNHAFDFLNSNDISISNNISWDELIIKKTDWKKITPEEPDKKSY EDHKAYLNEGKNVLQNLMKAHGLDENYKYDKSKYNEKDIIKYTNELDALNNKYHTDENMDNPKELRRSVLRSEGYINFLK DRNSVEDRLIDENDNHSFSKVIFDEAGVIFGAVPIILLGFVIIFIMREDDITSVTSNSKIKDVANNFGIIMCMIVMYIII SLLTVFVASLITGNGVGDLTYHYDSTFVIRTVQDRSGSIREYSYVMRTPLSTFFKSVFPFALITMSFGFAFSFVDKLIQN TKVKYFTLILIMSLLLVDFNFFNHAYNPLSLFKSFSLKPVIATVFMLLITAIGTIFLNRRKEFTSHDTYKERNVFSLKGS VKNCVLSFNGFLILFVVCAILVGNICLQNNWHNFNSTQIKNYTDLNSTMENLVYRDIDEIKAKYGNSKRAKEMIDSHSDA LKFYENENKYFDAYENRYKTPQKFNNVNKERVTEFNGFDFQGTGSETTGMVDVFNDFALEGAFFKQKYMLINNITPTDRF YIPQSGIDYNPFDVDSFKGTLPKINYYITHGISERNNAFAMLHDYFYLKFNVVLIVFAVLLFTSTIIKSNKQLELKSVLP VSRTKSYKSKIMESLIYAIGINIVAVLVLFLAGGIMGGFADSDFPIINYIVDGGIIYLNVGPFLVYILESFTITVLFTIF ISMFVNAMYTTTNKLFTILISIIALIIPFTAIKYMGAIGSFIPFNYVDSGFVTTGFLSALIRQNSYTMVIAVVVLVISSI LFYILGRVSFGRRK
Sequences:
>Translated_814_residues MFTYKLKKLYRYRLIPFLILFSITMGVVVFFLHFRTTNHAFDFLNSNDISISNNISWDELIIKKTDWKKITPEEPDKKSY EDHKAYLNEGKNVLQNLMKAHGLDENYKYDKSKYNEKDIIKYTNELDALNNKYHTDENMDNPKELRRSVLRSEGYINFLK DRNSVEDRLIDENDNHSFSKVIFDEAGVIFGAVPIILLGFVIIFIMREDDITSVTSNSKIKDVANNFGIIMCMIVMYIII SLLTVFVASLITGNGVGDLTYHYDSTFVIRTVQDRSGSIREYSYVMRTPLSTFFKSVFPFALITMSFGFAFSFVDKLIQN TKVKYFTLILIMSLLLVDFNFFNHAYNPLSLFKSFSLKPVIATVFMLLITAIGTIFLNRRKEFTSHDTYKERNVFSLKGS VKNCVLSFNGFLILFVVCAILVGNICLQNNWHNFNSTQIKNYTDLNSTMENLVYRDIDEIKAKYGNSKRAKEMIDSHSDA LKFYENENKYFDAYENRYKTPQKFNNVNKERVTEFNGFDFQGTGSETTGMVDVFNDFALEGAFFKQKYMLINNITPTDRF YIPQSGIDYNPFDVDSFKGTLPKINYYITHGISERNNAFAMLHDYFYLKFNVVLIVFAVLLFTSTIIKSNKQLELKSVLP VSRTKSYKSKIMESLIYAIGINIVAVLVLFLAGGIMGGFADSDFPIINYIVDGGIIYLNVGPFLVYILESFTITVLFTIF ISMFVNAMYTTTNKLFTILISIIALIIPFTAIKYMGAIGSFIPFNYVDSGFVTTGFLSALIRQNSYTMVIAVVVLVISSI LFYILGRVSFGRRK >Mature_814_residues MFTYKLKKLYRYRLIPFLILFSITMGVVVFFLHFRTTNHAFDFLNSNDISISNNISWDELIIKKTDWKKITPEEPDKKSY EDHKAYLNEGKNVLQNLMKAHGLDENYKYDKSKYNEKDIIKYTNELDALNNKYHTDENMDNPKELRRSVLRSEGYINFLK DRNSVEDRLIDENDNHSFSKVIFDEAGVIFGAVPIILLGFVIIFIMREDDITSVTSNSKIKDVANNFGIIMCMIVMYIII SLLTVFVASLITGNGVGDLTYHYDSTFVIRTVQDRSGSIREYSYVMRTPLSTFFKSVFPFALITMSFGFAFSFVDKLIQN TKVKYFTLILIMSLLLVDFNFFNHAYNPLSLFKSFSLKPVIATVFMLLITAIGTIFLNRRKEFTSHDTYKERNVFSLKGS VKNCVLSFNGFLILFVVCAILVGNICLQNNWHNFNSTQIKNYTDLNSTMENLVYRDIDEIKAKYGNSKRAKEMIDSHSDA LKFYENENKYFDAYENRYKTPQKFNNVNKERVTEFNGFDFQGTGSETTGMVDVFNDFALEGAFFKQKYMLINNITPTDRF YIPQSGIDYNPFDVDSFKGTLPKINYYITHGISERNNAFAMLHDYFYLKFNVVLIVFAVLLFTSTIIKSNKQLELKSVLP VSRTKSYKSKIMESLIYAIGINIVAVLVLFLAGGIMGGFADSDFPIINYIVDGGIIYLNVGPFLVYILESFTITVLFTIF ISMFVNAMYTTTNKLFTILISIIALIIPFTAIKYMGAIGSFIPFNYVDSGFVTTGFLSALIRQNSYTMVIAVVVLVISSI LFYILGRVSFGRRK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 93563; Mature: 93563
Theoretical pI: Translated: 9.02; Mature: 9.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFTYKLKKLYRYRLIPFLILFSITMGVVVFFLHFRTTNHAFDFLNSNDISISNNISWDEL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCEECCCCCHHHE IIKKTDWKKITPEEPDKKSYEDHKAYLNEGKNVLQNLMKAHGLDENYKYDKSKYNEKDII EEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCHHHH KYTNELDALNNKYHTDENMDNPKELRRSVLRSEGYINFLKDRNSVEDRLIDENDNHSFSK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHCCCCHHHHCCCCCCCCHHHH VIFDEAGVIFGAVPIILLGFVIIFIMREDDITSVTSNSKIKDVANNFGIIMCMIVMYIII HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH SLLTVFVASLITGNGVGDLTYHYDSTFVIRTVQDRSGSIREYSYVMRTPLSTFFKSVFPF HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH ALITMSFGFAFSFVDKLIQNTKVKYFTLILIMSLLLVDFNFFNHAYNPLSLFKSFSLKPV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHH IATVFMLLITAIGTIFLNRRKEFTSHDTYKERNVFSLKGSVKNCVLSFNGFLILFVVCAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH LVGNICLQNNWHNFNSTQIKNYTDLNSTMENLVYRDIDEIKAKYGNSKRAKEMIDSHSDA HHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHH LKFYENENKYFDAYENRYKTPQKFNNVNKERVTEFNGFDFQGTGSETTGMVDVFNDFALE HHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC GAFFKQKYMLINNITPTDRFYIPQSGIDYNPFDVDSFKGTLPKINYYITHGISERNNAFA CHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEE MLHDYFYLKFNVVLIVFAVLLFTSTIIKSNKQLELKSVLPVSRTKSYKSKIMESLIYAIG EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INIVAVLVLFLAGGIMGGFADSDFPIINYIVDGGIIYLNVGPFLVYILESFTITVLFTIF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISMFVNAMYTTTNKLFTILISIIALIIPFTAIKYMGAIGSFIPFNYVDSGFVTTGFLSAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH IRQNSYTMVIAVVVLVISSILFYILGRVSFGRRK HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFTYKLKKLYRYRLIPFLILFSITMGVVVFFLHFRTTNHAFDFLNSNDISISNNISWDEL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCEECCCCCHHHE IIKKTDWKKITPEEPDKKSYEDHKAYLNEGKNVLQNLMKAHGLDENYKYDKSKYNEKDII EEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHCCCCHHHH KYTNELDALNNKYHTDENMDNPKELRRSVLRSEGYINFLKDRNSVEDRLIDENDNHSFSK HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHCCCCHHHHCCCCCCCCHHHH VIFDEAGVIFGAVPIILLGFVIIFIMREDDITSVTSNSKIKDVANNFGIIMCMIVMYIII HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH SLLTVFVASLITGNGVGDLTYHYDSTFVIRTVQDRSGSIREYSYVMRTPLSTFFKSVFPF HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH ALITMSFGFAFSFVDKLIQNTKVKYFTLILIMSLLLVDFNFFNHAYNPLSLFKSFSLKPV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHH IATVFMLLITAIGTIFLNRRKEFTSHDTYKERNVFSLKGSVKNCVLSFNGFLILFVVCAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH LVGNICLQNNWHNFNSTQIKNYTDLNSTMENLVYRDIDEIKAKYGNSKRAKEMIDSHSDA HHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHH LKFYENENKYFDAYENRYKTPQKFNNVNKERVTEFNGFDFQGTGSETTGMVDVFNDFALE HHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC GAFFKQKYMLINNITPTDRFYIPQSGIDYNPFDVDSFKGTLPKINYYITHGISERNNAFA CHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEE MLHDYFYLKFNVVLIVFAVLLFTSTIIKSNKQLELKSVLPVSRTKSYKSKIMESLIYAIG EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH INIVAVLVLFLAGGIMGGFADSDFPIINYIVDGGIIYLNVGPFLVYILESFTITVLFTIF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISMFVNAMYTTTNKLFTILISIIALIIPFTAIKYMGAIGSFIPFNYVDSGFVTTGFLSAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH IRQNSYTMVIAVVVLVISSILFYILGRVSFGRRK HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA