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The map label for this gene is 167623421

Identifier: 167623421

GI number: 167623421

Start: 1791556

End: 1793094

Strand: Direct

Name: 167623421

Synonym: Shal_1490

Alternate gene names: NA

Gene position: 1791556-1793094 (Clockwise)

Preceding gene: 167623420

Following gene: 167623422

Centisome position: 34.28

GC content: 32.36

Gene sequence:

>1539_bases
ATGACCGAAGGGACGACTAAGCAAGAAGGAAATAAAATAATAGCGAAAAATGCTATTTTCTTGTATTTAAGAATGTTTTT
TACCTTAGGTGTATCTTTATATACTTCTCGAGTTGTGTTGGATGCTCTAGGTGTAGAAGATTTTGGTATTTACAATGTCG
TTGGTAGCATCGTTTTAATGCTGTCTTTTTTAAATACGTCAATGAGTAGTGCTACTGCAAGATTTATTACTTTTGAAATT
GGGAAAAAAGGGAAAGTTCAACAGGTTTTTACCGCATCTGTCCTGATACATATAATAATTGCATTTTTAATACTTGTTAC
CGGTTGGGTACTAGGTAAGTTTGTAATTTTTGAACAATTAGATATACCTTTATCGCGCTTAACAGCTGCTCAATGGGTTT
ATTATTTTTCATTGTTGTCAGCAAGTGTTGCTGTTTTGCAAGTACCTTATAGTGCTATGGTTATTGCGTATGAAAAATTT
AATGTTTTTGCGTACGTTGAAATATGGAACTCAATTTTAAAGCTAATAGTTGTATATCTACTATTTAATCTAGATGAAGA
TAAGTTGGTAATATATGGTTGTCTAGTATTTATTGTTTCAATAATTATATTTTTGACTTACTTTATATACGCAAAAAACA
GTTTTAAGGATTGTGCGTTAGATTTTAATTTAGACTTTTTACTAATTAAAAGAATGTTTTCATTTTCAGGTTGGGATCTA
TATGGGAATTTGAGTGTGCTTGCAAGGATGCAGGGGGTTAATATCTTGTTTAATGTTTTCTTTGGTGCATTGATTAATGC
GGCAAACGGTGTTGCTACTCAAGTTCAGTCAGCGGTTATGGCATTTGCAAATAGTGCGGTAACAGCTGTTAAGCCACAGA
TAGTTAAGAGTTATGCTAGTGGTGATTATGTCAGAACTAATGAGTTAGTCTTAAATGCGGCTAAATTTACTTTTATTATT
CTGTTACTGGTTACATTACCGCTTATATTTGAGATGGAATACGTTCTTGGTCTTTGGTTGGTTAAAGTTCCGGAATATGC
TGTTTCTTTCTGTCAGTATATTTTGGTATTTAACTTTTTTGCAAATACATCGTTCGTGATTATTAGTGCGATACATGCCA
CGGGTAATGTGAAAAGGCCTAGTTTAATTAATGGTACACTTTATCTTTTAGTCGTTCCACTTTCATATATAGCATTTAGC
ATGGGGACAGGTCCTATTGTATCATTCCAAATAAATATATTTATGGTTATGCTTGGTATGCTGTCTAATGCTTGGACGTT
AAACATGTATTTGCCACAATTTTCAATAATGTCGTTTGTAAGGCAAATGATGCTCCCGTGTTTGGTTATAACATTTTTGA
GTACAATTGTTTTGTTTGCATTTGTAACAATGTTCGAACAAGGATTTGTTAGGCTTGTAATTACAACTACGTTATCTTCA
GTTGTGATTTTAGTAGCAAGTTATTTACTTGCATTGGATAAGAAACAGAAAGAATGGTTGCTTGATATGTTTTTTAGTAA
GTTTAATATAAAAGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATAAATTGGCCTCTTTCCGGAATTCCTATGCTTTCTGAAAAAGATATAAATGGAATAACATTTGAAACGATAATTAGTA
ATGATTGGGTTTGATTGCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGGTGAGTATTTAATGAAAGCTAGAAAGGTTAGTGTAATAACTCCATGCTATAATGGCGGCGGGTATGTATATCGACTGT
TAGATTCCATTTTGAATCAG

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 512; Mature: 511

Protein sequence:

>512_residues
MTEGTTKQEGNKIIAKNAIFLYLRMFFTLGVSLYTSRVVLDALGVEDFGIYNVVGSIVLMLSFLNTSMSSATARFITFEI
GKKGKVQQVFTASVLIHIIIAFLILVTGWVLGKFVIFEQLDIPLSRLTAAQWVYYFSLLSASVAVLQVPYSAMVIAYEKF
NVFAYVEIWNSILKLIVVYLLFNLDEDKLVIYGCLVFIVSIIIFLTYFIYAKNSFKDCALDFNLDFLLIKRMFSFSGWDL
YGNLSVLARMQGVNILFNVFFGALINAANGVATQVQSAVMAFANSAVTAVKPQIVKSYASGDYVRTNELVLNAAKFTFII
LLLVTLPLIFEMEYVLGLWLVKVPEYAVSFCQYILVFNFFANTSFVIISAIHATGNVKRPSLINGTLYLLVVPLSYIAFS
MGTGPIVSFQINIFMVMLGMLSNAWTLNMYLPQFSIMSFVRQMMLPCLVITFLSTIVLFAFVTMFEQGFVRLVITTTLSS
VVILVASYLLALDKKQKEWLLDMFFSKFNIKA

Sequences:

>Translated_512_residues
MTEGTTKQEGNKIIAKNAIFLYLRMFFTLGVSLYTSRVVLDALGVEDFGIYNVVGSIVLMLSFLNTSMSSATARFITFEI
GKKGKVQQVFTASVLIHIIIAFLILVTGWVLGKFVIFEQLDIPLSRLTAAQWVYYFSLLSASVAVLQVPYSAMVIAYEKF
NVFAYVEIWNSILKLIVVYLLFNLDEDKLVIYGCLVFIVSIIIFLTYFIYAKNSFKDCALDFNLDFLLIKRMFSFSGWDL
YGNLSVLARMQGVNILFNVFFGALINAANGVATQVQSAVMAFANSAVTAVKPQIVKSYASGDYVRTNELVLNAAKFTFII
LLLVTLPLIFEMEYVLGLWLVKVPEYAVSFCQYILVFNFFANTSFVIISAIHATGNVKRPSLINGTLYLLVVPLSYIAFS
MGTGPIVSFQINIFMVMLGMLSNAWTLNMYLPQFSIMSFVRQMMLPCLVITFLSTIVLFAFVTMFEQGFVRLVITTTLSS
VVILVASYLLALDKKQKEWLLDMFFSKFNIKA
>Mature_511_residues
TEGTTKQEGNKIIAKNAIFLYLRMFFTLGVSLYTSRVVLDALGVEDFGIYNVVGSIVLMLSFLNTSMSSATARFITFEIG
KKGKVQQVFTASVLIHIIIAFLILVTGWVLGKFVIFEQLDIPLSRLTAAQWVYYFSLLSASVAVLQVPYSAMVIAYEKFN
VFAYVEIWNSILKLIVVYLLFNLDEDKLVIYGCLVFIVSIIIFLTYFIYAKNSFKDCALDFNLDFLLIKRMFSFSGWDLY
GNLSVLARMQGVNILFNVFFGALINAANGVATQVQSAVMAFANSAVTAVKPQIVKSYASGDYVRTNELVLNAAKFTFIIL
LLVTLPLIFEMEYVLGLWLVKVPEYAVSFCQYILVFNFFANTSFVIISAIHATGNVKRPSLINGTLYLLVVPLSYIAFSM
GTGPIVSFQINIFMVMLGMLSNAWTLNMYLPQFSIMSFVRQMMLPCLVITFLSTIVLFAFVTMFEQGFVRLVITTTLSSV
VILVASYLLALDKKQKEWLLDMFFSKFNIKA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57561; Mature: 57429

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTEGTTKQEGNKIIAKNAIFLYLRMFFTLGVSLYTSRVVLDALGVEDFGIYNVVGSIVLM
CCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LSFLNTSMSSATARFITFEIGKKGKVQQVFTASVLIHIIIAFLILVTGWVLGKFVIFEQL
HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DIPLSRLTAAQWVYYFSLLSASVAVLQVPYSAMVIAYEKFNVFAYVEIWNSILKLIVVYL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFNLDEDKLVIYGCLVFIVSIIIFLTYFIYAKNSFKDCALDFNLDFLLIKRMFSFSGWDL
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCE
YGNLSVLARMQGVNILFNVFFGALINAANGVATQVQSAVMAFANSAVTAVKPQIVKSYAS
ECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCC
GDYVRTNELVLNAAKFTFIILLLVTLPLIFEMEYVLGLWLVKVPEYAVSFCQYILVFNFF
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANTSFVIISAIHATGNVKRPSLINGTLYLLVVPLSYIAFSMGTGPIVSFQINIFMVMLGM
CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH
LSNAWTLNMYLPQFSIMSFVRQMMLPCLVITFLSTIVLFAFVTMFEQGFVRLVITTTLSS
HCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHH
VVILVASYLLALDKKQKEWLLDMFFSKFNIKA
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
TEGTTKQEGNKIIAKNAIFLYLRMFFTLGVSLYTSRVVLDALGVEDFGIYNVVGSIVLM
CCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LSFLNTSMSSATARFITFEIGKKGKVQQVFTASVLIHIIIAFLILVTGWVLGKFVIFEQL
HHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
DIPLSRLTAAQWVYYFSLLSASVAVLQVPYSAMVIAYEKFNVFAYVEIWNSILKLIVVYL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEECCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFNLDEDKLVIYGCLVFIVSIIIFLTYFIYAKNSFKDCALDFNLDFLLIKRMFSFSGWDL
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCE
YGNLSVLARMQGVNILFNVFFGALINAANGVATQVQSAVMAFANSAVTAVKPQIVKSYAS
ECCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCC
GDYVRTNELVLNAAKFTFIILLLVTLPLIFEMEYVLGLWLVKVPEYAVSFCQYILVFNFF
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANTSFVIISAIHATGNVKRPSLINGTLYLLVVPLSYIAFSMGTGPIVSFQINIFMVMLGM
CCCCEEEEEEECCCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHH
LSNAWTLNMYLPQFSIMSFVRQMMLPCLVITFLSTIVLFAFVTMFEQGFVRLVITTTLSS
HCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHH
VVILVASYLLALDKKQKEWLLDMFFSKFNIKA
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA