| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is spoIIIAE [H]
Identifier: 167040167
GI number: 167040167
Start: 1554056
End: 1555213
Strand: Direct
Name: spoIIIAE [H]
Synonym: Teth514_1529
Alternate gene names: 167040167
Gene position: 1554056-1555213 (Clockwise)
Preceding gene: 167040166
Following gene: 167040168
Centisome position: 63.24
GC content: 33.07
Gene sequence:
>1158_bases TTGAAAAAGGTACTTTTTATAATTCTAATGATTATGACTTTATTAACAACTGCCAAAGCGGATACAGGACAACAAGATAT AGAAAACCAATTGAAAGACATTGATACTTATCAGATTGACCGCTTTGTAAAAGAAGCTAATCAAAAAAATGGCAATATAC TTCCCTATGTTGATATAAAGACTTATATACAAGATGTGATATCAGGAAAACAACCTTTTAATATAAAGGAACTCTTTGAA AATTTATTAAAATTGTTTTTCAAAGAATTATATTCCTCTGTAAGACTTTTAACACAACTTTTAATTTTGGCTGTAATTGG CGGCATATTAATGAATTTGCACAGTTCCTTTGAAAATGAAAATATAAGTGAGATTGCTTTTTTAGCGGTCTATATGGTTT TTATAGTAATAGCGGTTAAAAGCTTTACAGAAGCTTTAGGAATTGGCAAAGAGGCAATTGACAGTATGATTGATTTTATG CAATCGATGCTGCCTGTACTTATAACTTTACTTGTTTCAGTAGGTGCTTTTACCTCTGCAGCGTTTTTTCACCCTGTTGT CATTGTGACAGTTGAGTTTATAGCCCATCTGATGAGGGATTTTGTGTTGCCTATTATTTTGCTCATGACAGCTGTAAAAA TTGTAGGAAATATTTCTGAAAAGTTTAGCTTGAATAAAATGGGGGATTTTTTTAAGACTTTGTCTACAGCTTCTATTTCA ATTTTATTGAGTATTTTTTTAGGAGTAGTAACTATACAAGGTTTATCTTCTTCAATGGCAGATGGTGTCATATCGAGAAC GGCGAAGTATACAGTTGGTGCTTTTTTGCCAGTAGTAGGAGGGCTTTTATCTGATAGTGTCGATGCAGTTATAGGGGCAT CATTATTGATAAAAGGAGCAGTAGGCACTTATGGGCTTATAGCAATTGTGATAATTTCTGCAGTACCTTTAATAAAGCTT TTTTCTCTCATAATCATTTATCGCTTTGCAGCAGCAGTGATTGAACCAATCTCCGATAAAAGGATAGTAAATTGCCTTTC AGATGTGGCAACTTCTTTAACTTATGTTTTTGGGGTATTGGCTTCTGTTACTGTGATGATGTTCTTTACAATAACAGCTA TTATAGGAACAGCTAATATTACCACTATGCTGAGGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGAGATAGCAGGAAAGGTAATCATAATTTTTTTATCAATACCTATAATTGTTGCATTAATGGAAACAATTCTTTCAATA ATGCCGTGAGGTGTAAAAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGAAACAATGGAGTTTTTAAAAGACTGGATAACACAGATAATTTATATTGCAATCCTTTTGATAGTTTTAGAACTTTTA GTTCCTTCCTCCAGTTTAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 385; Mature: 385
Protein sequence:
>385_residues MKKVLFIILMIMTLLTTAKADTGQQDIENQLKDIDTYQIDRFVKEANQKNGNILPYVDIKTYIQDVISGKQPFNIKELFE NLLKLFFKELYSSVRLLTQLLILAVIGGILMNLHSSFENENISEIAFLAVYMVFIVIAVKSFTEALGIGKEAIDSMIDFM QSMLPVLITLLVSVGAFTSAAFFHPVVIVTVEFIAHLMRDFVLPIILLMTAVKIVGNISEKFSLNKMGDFFKTLSTASIS ILLSIFLGVVTIQGLSSSMADGVISRTAKYTVGAFLPVVGGLLSDSVDAVIGASLLIKGAVGTYGLIAIVIISAVPLIKL FSLIIIYRFAAAVIEPISDKRIVNCLSDVATSLTYVFGVLASVTVMMFFTITAIIGTANITTMLR
Sequences:
>Translated_385_residues MKKVLFIILMIMTLLTTAKADTGQQDIENQLKDIDTYQIDRFVKEANQKNGNILPYVDIKTYIQDVISGKQPFNIKELFE NLLKLFFKELYSSVRLLTQLLILAVIGGILMNLHSSFENENISEIAFLAVYMVFIVIAVKSFTEALGIGKEAIDSMIDFM QSMLPVLITLLVSVGAFTSAAFFHPVVIVTVEFIAHLMRDFVLPIILLMTAVKIVGNISEKFSLNKMGDFFKTLSTASIS ILLSIFLGVVTIQGLSSSMADGVISRTAKYTVGAFLPVVGGLLSDSVDAVIGASLLIKGAVGTYGLIAIVIISAVPLIKL FSLIIIYRFAAAVIEPISDKRIVNCLSDVATSLTYVFGVLASVTVMMFFTITAIIGTANITTMLR >Mature_385_residues MKKVLFIILMIMTLLTTAKADTGQQDIENQLKDIDTYQIDRFVKEANQKNGNILPYVDIKTYIQDVISGKQPFNIKELFE NLLKLFFKELYSSVRLLTQLLILAVIGGILMNLHSSFENENISEIAFLAVYMVFIVIAVKSFTEALGIGKEAIDSMIDFM QSMLPVLITLLVSVGAFTSAAFFHPVVIVTVEFIAHLMRDFVLPIILLMTAVKIVGNISEKFSLNKMGDFFKTLSTASIS ILLSIFLGVVTIQGLSSSMADGVISRTAKYTVGAFLPVVGGLLSDSVDAVIGASLLIKGAVGTYGLIAIVIISAVPLIKL FSLIIIYRFAAAVIEPISDKRIVNCLSDVATSLTYVFGVLASVTVMMFFTITAIIGTANITTMLR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR014194 [H]
Pfam domain/function: PF09546 Spore_III_AE [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42015; Mature: 42015
Theoretical pI: Translated: 6.81; Mature: 6.81
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.9 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKVLFIILMIMTLLTTAKADTGQQDIENQLKDIDTYQIDRFVKEANQKNGNILPYVDIK CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHH TYIQDVISGKQPFNIKELFENLLKLFFKELYSSVRLLTQLLILAVIGGILMNLHSSFENE HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NISEIAFLAVYMVFIVIAVKSFTEALGIGKEAIDSMIDFMQSMLPVLITLLVSVGAFTSA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFFHPVVIVTVEFIAHLMRDFVLPIILLMTAVKIVGNISEKFSLNKMGDFFKTLSTASIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILLSIFLGVVTIQGLSSSMADGVISRTAKYTVGAFLPVVGGLLSDSVDAVIGASLLIKGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGTYGLIAIVIISAVPLIKLFSLIIIYRFAAAVIEPISDKRIVNCLSDVATSLTYVFGVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASVTVMMFFTITAIIGTANITTMLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKKVLFIILMIMTLLTTAKADTGQQDIENQLKDIDTYQIDRFVKEANQKNGNILPYVDIK CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHH TYIQDVISGKQPFNIKELFENLLKLFFKELYSSVRLLTQLLILAVIGGILMNLHSSFENE HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NISEIAFLAVYMVFIVIAVKSFTEALGIGKEAIDSMIDFMQSMLPVLITLLVSVGAFTSA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFFHPVVIVTVEFIAHLMRDFVLPIILLMTAVKIVGNISEKFSLNKMGDFFKTLSTASIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILLSIFLGVVTIQGLSSSMADGVISRTAKYTVGAFLPVVGGLLSDSVDAVIGASLLIKGA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGTYGLIAIVIISAVPLIKLFSLIIIYRFAAAVIEPISDKRIVNCLSDVATSLTYVFGVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASVTVMMFFTITAIIGTANITTMLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9384377 [H]