Definition Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome, complete genome.
Accession NC_010263
Length 1,268,188

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Identifier: 165933656

GI number:

Start: 1014062

End: 1019026

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: RrIowa_1295

Alternate gene names: NA

Gene position: NA

Preceding gene: 319717303

Following gene: 165933655

Centisome position: NA

GC content: NA

Gene sequence:

>4965_bases
ATGGCTCAAAAACCAAATTTTCTAAAAAAATTAATTTCCGCAGGGTTGGTAACTGCTTCTACAGCTACCATAGTAGCCAG
TTTTGCAGGTTCAGCTATGGGTGCTGCTATACAGCAGAATAGAACAACAAACGGCGCTGCTACAACTGTTGATGGTGCGG
GATTTGACCAAACTGCCGCTCCTGCAAATGTTGGAGTTGCTCTAAATGCAGTTATTACTGCTAATGCTAATAATGGTATT
AATTTCAATACTCCAGCCGGTAGTTTTAACGGTTTGTTGTTAAATACTGCAAACAATTTAGCAGTGACAGTGAGTGAAGA
TACTACCTTAGGGTTCATCACTAATGTTGCTCATAACGCTCACTCCTTTAACCTTACGCTTAATGCCGGTAAAACTCTTA
CTATAACAGGTCAAGGTGTTACTAATGCACAAGCTGCTGCTACAAAAAATGCTCAAAATGTTGTTGTACAATTTAATAAT
GGTGCTGCTATTGACAATAATGATCTTAAAGGTGTAGGAAGAATAGACTTCGGTGCTCCGGCTTCTACATTAGTATTTAA
TTTAGCAAATCCTACAACTCAAAAAGCTCCTCTTATACTTGGAGATAATGCTGTAATAGCTAATGGTGTTAACGGTACAT
TAAATGTTACTAATGGATTTATTCAAGTTTCAAATAAAAGTTTTGCTACTGTTAAGGCAATTAATATCGCTGACGGTCAA
GGTATCATATTCAATACTGATGCTAATAATGCTAATACTTTAAATTTACAAGCAGGTGGTACTACTATTAATTTTACTGG
AACAGACGGTACGGGTAGATTAGTATTATTAAGTAAGCATGCTGCTGCTACCAACTTTAACATTACAGGAAGTTTAGGCG
GTAATCTAAAAGGTGTTATCGAATTTAACACTGTTGCAGTAGACGGTCAACTTACAGCTAATGCAGGCGCTGCTAATGCA
GTAATAGGTACTAATAATGGCGCAGGTAGAGCTGCAGGATTTGTTGTTAGCGTAGATAATGGTAAGGTAGCAACAATCGA
TGGACAAGTTTATGCTAAAGACATGGTTATACAAAGTGCTAATGCAACTGGGCAAGTAAATTTTAGACACATAGTTGATG
TTGGTGCAGACGGTACTACTGCCTTTAAAACAGCAGCTTCTAAAGTTACAATAACCCAAGACTCAAACTTTGGTAATACT
GATTTTGGTAATCTTGCAGCACAGATTAAAGTTCCTAATGCTATAACCCTTACCGGTAATTTTACAGGTGATGCTAGCAA
TCCCGGTAACACTGCAGGTGTGATAACTTTTGATGCTAACGGTACTTTAGAAAGTGCTAGTGCAGATGCAAATGTTGCGG
TGACAAATAATATTACAGCAATTGAAGCATCAGGTGCCGGAGTTGTCCAATTATCAGGAACACATGCTGCCGAGTTACGT
TTAGGAAATGCCGGTTCTATCTTTAAACTTGCTGACGGTACAGTTATAAACGGTAAAGTTAACCAAACTGCTCTTGTCGG
CGGTGCTCTTGCAGCCGGTACTATTACCTTAGACGGTAGTGCTACAATTACCGGCGATATAGGGAACGCTGGCGGTGCTG
CTGCGTTACAACGCATTACTTTAGCTAACGATGCTAAAAAAACATTAACACTTGGTGGGGCAAATATTATCGGTGCTGGT
GGTGGAACGATTGATTTGCAAGCTAACGGTGGTACTATTAAATTAACAAGCACTCAAAATAATATTGTAGTTGATTTTGA
TTTAGCTATAGCTACTGATCAAACAGGCGTTGTTGATGCGAGTAGCCTAACAAATGCTCAAACTTTAACTATTAACGGTA
AAATCGGTACTATTGGAGATAATAATAAAACTCTTGGACAATTTAATATTGGCTCAAGTAAAACAGTTTTAAGTAACGGT
AATGTTGCTATTAACGAGTTAGTTATTGGAAATGACGGTGCAGTACAATTCGCTCATGATACTTATTTAATAACAAGAAC
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GAAGGTGTAAATTTATATGCTACTAATATTACTACTACCGATGCTAACGTAGGTTCTTTCGTCTTTAATGCCGGTGGAAC
AAATATAGTAAGCGGTACAGTCGGTGGACAGCAAGGTAATAAGTTTAATACTGTAGCATTAGAGAACGGTACTACTGTTA
AGTTCTTAGGTAATGCAACATTTAACGGTAACACTACAATTGCAGCTAATTCTACCTTACAAATCGGTGGTAACTATACT
GCAGACTGTGTTGCATCTGCCGATGGTACCGGTATAGTAGAATTCGTTAACACCGGTCCTATTACCGTAACATTAAACAA
ACAAGCTGCACCTGTTAATGCTTTAAAACAAATAACGGTTTCTGGTCCCGGTAACGTAGTGATTAATGAGATAGGTAATG
CAGGTAATCATCATGGTGCCGTGACTGATACGATTGCTTTTGAAAATTCAAGTTTAGGTGCAGTTGTATTCTTACCTAGA
GGCATTCCATTCAATGATGCAGGCAACACAATGCCTTTAACAATTAAAAGTACCGTAGGTAATAAAACAGCTAAAGGTTT
TGATGTTCCTAGCGTGGTTGTTTTAGGTGTTGATAGTGTCATCGCTGACGGTCAAGTAATCGGTGATCAAAATAATATCG
TAGATCTAGGTCTTGGAAGCGATAACGGCATAATCGTTAATGCTACTACATTATATGCAGGTATCAGTACTCTAAACAAT
AATCAAGGTACTGTCACACTTAGCGGTGGTGTTCCTAATACCCCTGGTACAGTTTATGGCTTAGGCACAGGTATTGGCGC
TTCAAAGTTCAAGCAAGTAACGTTTACTACAGACTATAACAACTTAGGTAATATTATTGCAACTAACGCAACAATTAATG
ACGGTGTAACTGTTACTACAGGCGGTATAGCCGGAATAGGTTTTGACGGTAAAATTACTCTTGGAAGTGTTAACGGTAAC
GGTAATGTAAGATTTGCTGACGGTATATTGTCTAATTCTACAAGTATGATTGGTACTACTAAAGCTAATAATGGTACTGT
AACTTATTTAGGTAATGCATTCGTCGGTAATATAGGTGATTCAGATACTCCTGTAGCTTCTGTTAGATTTACAGGTAGTG
ATAGTGGTGCAGGATTACAAGGAAATATTTATTCACAAGTCATAGACTTTGGTACTTATAACTTAGGTATTGTAAATTCT
AATATAATTTTAGGCGGCGGTGCTACTGCTATTAACGGTAAAATCGATCTTGTTACAAATACTTTAACATTTGCAAGTGG
TACTTCAACATGGGGAAACAATACTTCTATTGAAACTACTTTAACATTAGCAAACGGTAATATAGGTCACATCGTTATCT
TGGAAGGTGCGCAAGTTAATACAACAACCACAGGAACTACAACCATTAAAGTACAAGATAATGCCAATGCAAATTTCAGT
GGTACACAAACTTATACTTTAATCCAAGGTGGTGCTAGATTTAACGGTACTTTAGGAAGTCCCAACTTTGCTGTAACCGG
AAGTAATCGTTTCGTAAATTACAGTTTAATACGTGCTGCTAACCAAGATTATGTAATAACACGTACTAACAATGCAGAAA
ACGTAGTTACTAATGATATCGCAAATAGTCCGTTTGGAGGTGCACCGGGTGTAGATCAGAACGTTACAACATTTGTAAAT
GCAACTAATACTGCAGCATATAATAATCTTCTTTTAGCTAAAAATAGTGCTAATTCTGCTAACTTTGTTGGAGCTATCGT
TACCGATACAAGTGCGGCCATAACTAATGTACAATTAGATTTAGCTAAAGATATCCAAGCTCAACTTGGTAACAGATTAG
GTGCTCTTAGATATTTAGGTACTCCTGAAACTGCTGAAATGGCTGGACCTGAAGCTGGAGCAATATCGGCTGCGGTTGCT
GCAGGTGACGAGGCTATTGATAATGTAGCTTACGGTATATGGGCAAAACCTTTCTATACTGATGCACATCAAAGTAAGAA
AGGTGGTTTAGCTGGTTATAAAGCTAAAACCACCGGTGTCGTAATCGGTTTAGATACGCTAGCTAACGATAATTTAATGA
TCGGTGCTGCTATCGGTATCACTAAAACTGATATAAAACATCAAGATTATAAGAAAGGTGATAAAACCGACGTTAACGGT
TTCTCATTCTCTCTATATGGTGCCCAGCAGCTTGTTAAGAACTTCTTTGCTCAAGGTAGTGCAATATTTAGCTTAAACCA
AGTGAAGAACAAAAGTCAGCGTTACTTCTTCGATGCTAACGGTAATATGAGCAAGCAAATTGCTGCCGGTCATTACGATA
ACATGACATTTGGTGGTAACTTAACAGTCGGTTATGATTACAATGCAATGCAAGGTGTGTTAGTAACTCCAATGGCAGGA
CTTAGCTACTTAAAGTCTTCTGACGAAAACTACAAAGAAACCGGTACAACAGTTGCAAACAAGCAAGTTAACAGCAAATT
TAGCGATAGAACCGATTTAATAGTAGGTGCTAAAGTAGCCGGCAGTACTATGAACATAACTGATCTTGCGGTATATCCAG
AAGTTCACGCTTTTGTGGTTCACAAAGTAACCGGTAGATTATCTAAAACTCAGTCTGTATTAGACGGACAAGTTACTCCG
TGTATCAACCAGCCTGACAGAACCACTAAAACATCTTATAATTTAGGTTTAAGTGCAAGCATAAGATCTGATGCTAAGAT
GGAGTACGGAATCGGTTACGATGCTCAGATTTCAAGTAAATATACTGCACATCAAGGTACTCTAAAAGTCCGTGTAAACT
TCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGTTATTTCTTTATCAAATGTGGGATATCTTGACTCACGTTTGATAAGCTTGTTTTAATACTAGGTACTAAATTTTAAC
TTAAATATAGGACAAAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGCTCCCGATTAGCAAGTTTATAAGTTCCTCCAGAAAAAAGCCCTCTTTGAAAAAAGGGGGCTTTGTTTGTTCTTTCTT
CCCGCCTACATGCCTTGTTG

Product: outer membrane protein B

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: NA

Protein sequence:

>1654_residues
MAQKPNFLKKLISAGLVTASTATIVASFAGSAMGAAIQQNRTTNGAATTVDGAGFDQTAAPANVGVALNAVITANANNGI
NFNTPAGSFNGLLLNTANNLAVTVSEDTTLGFITNVAHNAHSFNLTLNAGKTLTITGQGVTNAQAAATKNAQNVVVQFNN
GAAIDNNDLKGVGRIDFGAPASTLVFNLANPTTQKAPLILGDNAVIANGVNGTLNVTNGFIQVSNKSFATVKAINIADGQ
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DFGNLAAQIKVPNAITLTGNFTGDASNPGNTAGVITFDANGTLESASADANVAVTNNITAIEASGAGVVQLSGTHAAELR
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GGTIDLQANGGTIKLTSTQNNIVVDFDLAIATDQTGVVDASSLTNAQTLTINGKIGTIGDNNKTLGQFNIGSSKTVLSNG
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GIPFNDAGNTMPLTIKSTVGNKTAKGFDVPSVVVLGVDSVIADGQVIGDQNNIVDLGLGSDNGIIVNATTLYAGISTLNN
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GNVRFADGILSNSTSMIGTTKANNGTVTYLGNAFVGNIGDSDTPVASVRFTGSDSGAGLQGNIYSQVIDFGTYNLGIVNS
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LSYLKSSDENYKETGTTVANKQVNSKFSDRTDLIVGAKVAGSTMNITDLAVYPEVHAFVVHKVTGRLSKTQSVLDGQVTP
CINQPDRTTKTSYNLGLSASIRSDAKMEYGIGYDAQISSKYTAHQGTLKVRVNF

Sequences:
NA

Specific function: NA

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: NA

Metaboloic importance: NA

Operon status: NA

Operon components: NA

Similarity: NA

Homologues:

NA

Paralogues:

NA

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: NA

Theoretical pI: NA

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

NA

Transmembrane regions:

NA

Cys/Met content:

NA

Secondary structure: NA

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: NA

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: NA

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA