| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 160877354
Identifier: 160877354
GI number: 160877354
Start: 5030218
End: 5031996
Strand: Direct
Name: 160877354
Synonym: Sbal195_4252
Alternate gene names: NA
Gene position: 5030218-5031996 (Clockwise)
Preceding gene: 160877353
Following gene: 160877356
Centisome position: 94.07
GC content: 34.23
Gene sequence:
>1779_bases ATGACTGGCGAATATGTTGACGCTTTTAAGGCATTAAAGTGGGATGAAAAGATCTCCATTATTCCTGAAGATGGTCACTC CTATGAACTTCATCTTCGAACCGTCATAGGAAAAGAAGTTAGTTATTCAAAAAAAACCACCTTGTCTATGCTTGAGAGGG TTGTCAGTTTGAAGCTTAGGCACCCCGATAATATCTATAACCCGTTCACATTAGTCTTACCTTCAGAAACGAATATTTTG AAATATTTTACTAAAGAAGACCTAGAGTTTTATGAAGCCATCATTCCTTTTACTGACGATAATTACCTAAAAGCTCGGCT GGCTGAGATTCTTTTTTATAGTACTAAATACCAAATTAAAGATTGGGCTAAACTTGCAATTGATTGTTACACCAGAAAGA AAATCAAGCTTGACTCAAGTTTTTTGTATAAAGTCAACGAATGGGAAAGAGCTTTAGTACTATGCATAAAAATCAAAGAC TTAAATAGATTGACTGAGTTAAAAGATAGAATATTAGAGGCTATTCATCTAGATCATGGAAAATATAATTTCATAGTTCA AAAACTCTGCTCATTACTATTTAAAACAAGTAGTAAGGCTGATAATTTTGACAATATTTTTTTACGCTTAACTGAACTAG CCAGAGAGTCTAACGAGCAAGGCGAGTATCATGTAGTCAGAGAATATATGAAACTTGCAATTGAAATTTCTACACTATTT AAAGATAAAGCACCATGGGTGAACTCAAGGGTTTTTTATGCTAACAGTTATGAGCTTGAAGGGGATAAAAGATTAACGGA CTCGGCTGTAGTTGCAAAATTATTTTATTGTGATGCATTAAAAGCATACCGAGATATTGAAATTAAATATCGTACTGATC AAAACAAAATAGAAGAAATAATAAGTAGGCTAAAGCATAAAATTGAGCATTCAGGTAAACAGATGATTGATGAAATGGTC ACGATAGAACTCCCAATGCCAGATGTATCTGATATGGTAGTTAACGCAAAAAAACATGTATCAGGTAAAACAGATGCAAA AACGGCTCTTCTCTATTACTGTGGTTTGATTGTTAGTTCTGATTTAGAAACTATGTCCGCTGATGCTGAAAAAAGCTTAA GAAATGTAAATTATAAATCGATGGTAAGTACGATCAATATTTCACGAAATGGGCGAGTTATTGGTAAATCACCAGCTCAT AATAAAGATGATGCTAAAGATGTTGAACGTGCAATACATGAACAATGTATTGAAAATTATCTCTTCTACATGAATTTCGA TGTAAAAACTAAATTATTGCCTGCTTTAGACCAACTACGTGAAGAGCATTCTTTCTCTAGAGAGTTTTTTGAGTTGATAT GCTTACACTCTCCATTAGTACCTGATGGCCGAGAAAAAACCTTAGGCTTGGCACTTTGGTTTGGTTTTGAGCATGATTTT TCTGCTGCTATACATTTATTGTGTCCACAGATAGAACATATTGTTCGAATGAAACTAAAGGATGCAGGTGAACATAGCAC AACAATAAATGATAGTAAGGGTAGTATTGAGGATGAAATTTCATTGAGCTCTTTAGTACTGAAAAATAATTTCGAAACAA TGTTCGGTGAAAAAGTAGCATTTGAACTTAAGACGATCTTTACCGAGAGTCTGGGTTGTAATTTTAGAAACCAAGTGGCC CACGGATTATTGGATGATAATGATGGTCAAAGCCATCATTCGGTTTACGCTTGGTGGTATGTACTTCGAATGATTTGTCA CTCTCTTGTTAGGGATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAAGTCTTCGCAGAATGATGAGCATTAATCCGTGACGTAACTAAGTGTTATGCTAATATTAGTCATTGATTTTATCGCAT AAAATTCTCGGCGGAAAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATGCAGTGGTATAACTGATTTTGTTACAAAACAAGTTATACCACTATACAGAACTAATTTTATCATTAATGTGAGTAAG ATTATCAGCTCGATTTCCTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 592; Mature: 591
Protein sequence:
>592_residues MTGEYVDAFKALKWDEKISIIPEDGHSYELHLRTVIGKEVSYSKKTTLSMLERVVSLKLRHPDNIYNPFTLVLPSETNIL KYFTKEDLEFYEAIIPFTDDNYLKARLAEILFYSTKYQIKDWAKLAIDCYTRKKIKLDSSFLYKVNEWERALVLCIKIKD LNRLTELKDRILEAIHLDHGKYNFIVQKLCSLLFKTSSKADNFDNIFLRLTELARESNEQGEYHVVREYMKLAIEISTLF KDKAPWVNSRVFYANSYELEGDKRLTDSAVVAKLFYCDALKAYRDIEIKYRTDQNKIEEIISRLKHKIEHSGKQMIDEMV TIELPMPDVSDMVVNAKKHVSGKTDAKTALLYYCGLIVSSDLETMSADAEKSLRNVNYKSMVSTINISRNGRVIGKSPAH NKDDAKDVERAIHEQCIENYLFYMNFDVKTKLLPALDQLREEHSFSREFFELICLHSPLVPDGREKTLGLALWFGFEHDF SAAIHLLCPQIEHIVRMKLKDAGEHSTTINDSKGSIEDEISLSSLVLKNNFETMFGEKVAFELKTIFTESLGCNFRNQVA HGLLDDNDGQSHHSVYAWWYVLRMICHSLVRD
Sequences:
>Translated_592_residues MTGEYVDAFKALKWDEKISIIPEDGHSYELHLRTVIGKEVSYSKKTTLSMLERVVSLKLRHPDNIYNPFTLVLPSETNIL KYFTKEDLEFYEAIIPFTDDNYLKARLAEILFYSTKYQIKDWAKLAIDCYTRKKIKLDSSFLYKVNEWERALVLCIKIKD LNRLTELKDRILEAIHLDHGKYNFIVQKLCSLLFKTSSKADNFDNIFLRLTELARESNEQGEYHVVREYMKLAIEISTLF KDKAPWVNSRVFYANSYELEGDKRLTDSAVVAKLFYCDALKAYRDIEIKYRTDQNKIEEIISRLKHKIEHSGKQMIDEMV TIELPMPDVSDMVVNAKKHVSGKTDAKTALLYYCGLIVSSDLETMSADAEKSLRNVNYKSMVSTINISRNGRVIGKSPAH NKDDAKDVERAIHEQCIENYLFYMNFDVKTKLLPALDQLREEHSFSREFFELICLHSPLVPDGREKTLGLALWFGFEHDF SAAIHLLCPQIEHIVRMKLKDAGEHSTTINDSKGSIEDEISLSSLVLKNNFETMFGEKVAFELKTIFTESLGCNFRNQVA HGLLDDNDGQSHHSVYAWWYVLRMICHSLVRD >Mature_591_residues TGEYVDAFKALKWDEKISIIPEDGHSYELHLRTVIGKEVSYSKKTTLSMLERVVSLKLRHPDNIYNPFTLVLPSETNILK YFTKEDLEFYEAIIPFTDDNYLKARLAEILFYSTKYQIKDWAKLAIDCYTRKKIKLDSSFLYKVNEWERALVLCIKIKDL NRLTELKDRILEAIHLDHGKYNFIVQKLCSLLFKTSSKADNFDNIFLRLTELARESNEQGEYHVVREYMKLAIEISTLFK DKAPWVNSRVFYANSYELEGDKRLTDSAVVAKLFYCDALKAYRDIEIKYRTDQNKIEEIISRLKHKIEHSGKQMIDEMVT IELPMPDVSDMVVNAKKHVSGKTDAKTALLYYCGLIVSSDLETMSADAEKSLRNVNYKSMVSTINISRNGRVIGKSPAHN KDDAKDVERAIHEQCIENYLFYMNFDVKTKLLPALDQLREEHSFSREFFELICLHSPLVPDGREKTLGLALWFGFEHDFS AAIHLLCPQIEHIVRMKLKDAGEHSTTINDSKGSIEDEISLSSLVLKNNFETMFGEKVAFELKTIFTESLGCNFRNQVAH GLLDDNDGQSHHSVYAWWYVLRMICHSLVRD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 68631; Mature: 68500
Theoretical pI: Translated: 6.63; Mature: 6.63
Prosite motif: PS00284 SERPIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTGEYVDAFKALKWDEKISIIPEDGHSYELHLRTVIGKEVSYSKKTTLSMLERVVSLKLR CCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC HPDNIYNPFTLVLPSETNILKYFTKEDLEFYEAIIPFTDDNYLKARLAEILFYSTKYQIK CCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH DWAKLAIDCYTRKKIKLDSSFLYKVNEWERALVLCIKIKDLNRLTELKDRILEAIHLDHG HHHHHHHHHHHCCEEEECCHHEEEECHHCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KYNFIVQKLCSLLFKTSSKADNFDNIFLRLTELARESNEQGEYHVVREYMKLAIEISTLF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KDKAPWVNSRVFYANSYELEGDKRLTDSAVVAKLFYCDALKAYRDIEIKYRTDQNKIEEI CCCCCCCCCEEEEEECEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHHHH ISRLKHKIEHSGKQMIDEMVTIELPMPDVSDMVVNAKKHVSGKTDAKTALLYYCGLIVSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC DLETMSADAEKSLRNVNYKSMVSTINISRNGRVIGKSPAHNKDDAKDVERAIHEQCIENY CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEECCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC LFYMNFDVKTKLLPALDQLREEHSFSREFFELICLHSPLVPDGREKTLGLALWFGFEHDF EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCH SAAIHLLCPQIEHIVRMKLKDAGEHSTTINDSKGSIEDEISLSSLVLKNNFETMFGEKVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHH FELKTIFTESLGCNFRNQVAHGLLDDNDGQSHHSVYAWWYVLRMICHSLVRD HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TGEYVDAFKALKWDEKISIIPEDGHSYELHLRTVIGKEVSYSKKTTLSMLERVVSLKLR CCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCC HPDNIYNPFTLVLPSETNILKYFTKEDLEFYEAIIPFTDDNYLKARLAEILFYSTKYQIK CCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH DWAKLAIDCYTRKKIKLDSSFLYKVNEWERALVLCIKIKDLNRLTELKDRILEAIHLDHG HHHHHHHHHHHCCEEEECCHHEEEECHHCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC KYNFIVQKLCSLLFKTSSKADNFDNIFLRLTELARESNEQGEYHVVREYMKLAIEISTLF HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH KDKAPWVNSRVFYANSYELEGDKRLTDSAVVAKLFYCDALKAYRDIEIKYRTDQNKIEEI CCCCCCCCCEEEEEECEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCHHHHHHH ISRLKHKIEHSGKQMIDEMVTIELPMPDVSDMVVNAKKHVSGKTDAKTALLYYCGLIVSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC DLETMSADAEKSLRNVNYKSMVSTINISRNGRVIGKSPAHNKDDAKDVERAIHEQCIENY CHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEECCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC LFYMNFDVKTKLLPALDQLREEHSFSREFFELICLHSPLVPDGREKTLGLALWFGFEHDF EEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCH SAAIHLLCPQIEHIVRMKLKDAGEHSTTINDSKGSIEDEISLSSLVLKNNFETMFGEKVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHH FELKTIFTESLGCNFRNQVAHGLLDDNDGQSHHSVYAWWYVLRMICHSLVRD HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA