Definition Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome.
Accession NC_009997
Length 5,347,283

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The map label for this gene is ybbP [H]

Identifier: 160875894

GI number: 160875894

Start: 3313801

End: 3316314

Strand: Reverse

Name: ybbP [H]

Synonym: Sbal195_2783

Alternate gene names: 160875894

Gene position: 3316314-3313801 (Counterclockwise)

Preceding gene: 160875895

Following gene: 160875893

Centisome position: 62.02

GC content: 50.64

Gene sequence:

>2514_bases
ATGGAGTTAAGTCTGGCATGGCGCCTGTTTAAGCGCGAGTTACAGCAAGGGCAATTGTTATTGATTATCCTCGCTATTAC
GCTCGCGGTACTGTCTGTGAGTGGGTTAGCGCGGGTGAGTGAGCGCCTGCAAGTGGCGATCACTGGCCAAGCTTCACAGT
TTATTGCCGCCGATCGGATTATCGATTCGCCGGTTAAAATTGATGTGGCGATTTTAACCAATGCCGAAGATCTTGGGCTT
AAGCATGTGACGAACATGCAATTTAATTCCATGGTCTATTCGGGTGATAAGTTTCAGTTAGTCACAGTTCGCGCCGTTGA
AACGGGTTATCCACTCAAGGGTGACATTGAACTCACCAGCGGTAAAACCAAGGCTTTACCTCAAGCGGGTGAAATCTGGT
TTGAGACTCGCTTAGGTGGACTCCTCGGTTATCCTAAAACCATCGAACTAGGTAACAGCGAATTTGTGCTCAGCAATGAA
ATAAGCCGCTTACCCGACGCGGGCTTTAATCCTTTTGCTTCATCGCCCGTGGTATTGATGCGCATGGAAGATGTCGCCAA
AACGGGAGTGATTCAACCGGGCAGCCGCGTGACCTATCTGTATCAATTTGCTGGCGATGAAGCCTCGCTTACGGCCTTTG
AGCAAAGTGTTAAACCGCTTCTCAATAGCACCCAGCGCTGGGTCGATGTGCAATCCGGTGACTCGCCGATTGCGGGAGCA
GTTAAGCGAGCTGAGCGCTTCCTACTGCTGGCTAGTTTGATGGGCATTGCACTGGCCTGCGCCGCGATAGGCATTGCCGC
CCAGCGTTATTGTCAGCGCCATTACGATGTGGTGGCCATGCTGAAAACCTTTGGCGCCTCGTCAAAGCAAATTCGGTTGT
TGTTCGGCACTCACTTATTTTTAGTGACGTTAATGGGGATTGTGCTTGGCATTATCGGTGGTGTGTTACTCGATTTTGGG
ATCAGTTATTTATTGCCGCCCGAAATTGCCGCCTATTCGCCGCCACTCACTCGGCCATTACTGCTTGGTGTAAGCACAGG
ACTTATCAGCGCCTTTATGTTTTCGGCTTATCCACTGATGCGCTTACTGGCTATTCCGCCACTACGAGTGCTACAGCGTC
AGTTAGAAGGCTTACAGCTAGGGATGTGGCTGCATCTACTTTTGAGCTTAGGGGCGATGGCGTTACTGGGCTATTTGTAT
TCCCAAAGTTGGGCTTTGACCCTGACTGTGGTCGCGGCCGTGTTGCTGCTCGGTGTGCTGTTAAGTGTGCTTGGCTTTGT
GATGATACGTTTAGGCCACAGTGTCGGTATGAAGACCACCAATCCCTTACAGTTGGCACTGGCAGGGCTCAGACGTCGTG
CGCGGCAAAATGCGGTGCAATTGGTGGGATTTAGCGCCGCACTGGTATTGTTATTGACGATTCTGGCATTAAGACAAGAT
TTGCTCAACGAGTGGCAAAAACAGTTGCCCGAAAATGCACCTAACTACTTCCTCGTTAATATCGCCCCCGACGATGCTAA
GCCCTTAAATGATTTTATGACGGCTAAGGGCATTGTTGCGACGGACATTTATCCTGTGATCCGTGGCCGTTTAACTCAAA
TTAACGGTGAAGCGCTGATTTCGAATGAACAGTCTGAAGCGGGTGAAAAGGGCCGAGTGGGTATTTCCCGCGAGTTAAAC
CTAACGTGGCGCAATACGCTACCAGCCAATAACGAACTGTTAGAGGGGCATTTTAATCAAGCGGCCGATGAAGTGTCGGT
GGAATCTGGCGTGGCGGACCGTTTAGGTATTGGCATTGGCGATAAGTTGACTTATGTGATTGATAATCAAGAGCTCACAG
TTAAGGTTGCCAGTATTCGTGCCGTGCACTGGGAAACGCTACAGCCGAACTTCTTTATGATTTTCACCCAAGAAGCTCTC
GCGCCCTTTGCTTATACCTCGATGGCGAGTTTCTATCTGAATGATCAGCAAGCTACGAATGACCAGTCAACAAACGGCCA
AGCGCTGAGTGCCGATGGTACGCCTAAGGATGCTGTGATCCTTGCGCTTATTCAGCAATTCCCGACCATATCGATCATCG
ATGTGGGCGCTATGGTGGGGCAGTTACGGCAGATCATAGAGCAAGTGTCGCTGTCGCTGACCTTAGTGCTGGCCTTAGTG
TTACTGGCAAGTGCCTTAGTCTTGATTGCACAGACTGAAGCGGGCATGGCAACTCGGCAGCGCGAACTGGCTGTGCTGCG
TACCTTTGGCGCTTCGGGATGGTTATTGCGCAGTGCAACGGGTTTAGAGTTCGCCTTGCTTGGCGGTATTGCGGGCGTGT
TAGCAGTCATAGTGGCTGAATTTGCGTTATATCTACTTAAGACGCAAGTGTTTGAGCTTAACGTGTATATGCACTGGCCT
TGGTGGGGAATCGCCCCTGTTTCTGGCGCCTTAATCGTGGCCTTACTTGGGGTGTGGCGTTGCCGACAATTGCTTAGCCA
ATCTTGCTCTGAGCTATTAAAGGCGGGCAGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGGCCAAGCGTTGTGAGCGGCAGCTGGTTATGGATAACGGCCATTTACAGGAAGATACGGCGCATACAGCACCGCTCGCC
GATGCTAAGGAGGCTTAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGTTGCTTGCATGGGCTAACACTATAAGTTTATGACGTAAGTAGACAGCGTTAACAATTAAAGCACTGATGCCGCCTAA
GCTCAGTGCTTTTTTATTGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 837

Protein sequence:

>837_residues
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRIIDSPVKIDVAILTNAEDLGL
KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTSGKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNE
ISRLPDAGFNPFASSPVVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
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SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
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LTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIGDKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEAL
APFAYTSMASFYLNDQQATNDQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV
LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWP
WWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS

Sequences:

>Translated_837_residues
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRIIDSPVKIDVAILTNAEDLGL
KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTSGKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNE
ISRLPDAGFNPFASSPVVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
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APFAYTSMASFYLNDQQATNDQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV
LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWP
WWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS
>Mature_837_residues
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRIIDSPVKIDVAILTNAEDLGL
KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTSGKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNE
ISRLPDAGFNPFASSPVVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
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ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY
SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD
LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALISNEQSEAGEKGRVGISRELN
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APFAYTSMASFYLNDQQATNDQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV
LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWP
WWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS

Specific function: Unknown

COG id: COG3127

COG function: function code Q; Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786704, Length=816, Percent_Identity=37.1323529411765, Blast_Score=475, Evalue=1e-135,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90867; Mature: 90867

Theoretical pI: Translated: 6.96; Mature: 6.96

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRI
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHH
IDSPVKIDVAILTNAEDLGLKHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTS
CCCCCEEEEEEEECCHHCCCHHHCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECC
GKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNEISRLPDAGFNPFASSPVVLM
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEE
RMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA
EEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCHHHH
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHH
LVTLMGIVLGIIGGVLLDFGISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLYSQSWALTLTVVAAVLLLGVL
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALI
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHEEECCCEEE
SNEQSEAGEKGRVGISRELNLTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIG
CCCHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
DKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEALAPFAYTSMASFYLNDQQATN
CCEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
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FALYLLKTQVFELNVYMHWPWWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS
HHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCEEEEEEEECCHHCCCHHHCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECC
GKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNEISRLPDAGFNPFASSPVVLM
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEE
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EEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCHHHH
VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLF
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FALYLLKTQVFELNVYMHWPWWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS
HHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]