| Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009997 |
| Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is ybbP [H]
Identifier: 160875894
GI number: 160875894
Start: 3313801
End: 3316314
Strand: Reverse
Name: ybbP [H]
Synonym: Sbal195_2783
Alternate gene names: 160875894
Gene position: 3316314-3313801 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160875895
Following gene: 160875893
Centisome position: 62.02
GC content: 50.64
Gene sequence:
>2514_bases ATGGAGTTAAGTCTGGCATGGCGCCTGTTTAAGCGCGAGTTACAGCAAGGGCAATTGTTATTGATTATCCTCGCTATTAC GCTCGCGGTACTGTCTGTGAGTGGGTTAGCGCGGGTGAGTGAGCGCCTGCAAGTGGCGATCACTGGCCAAGCTTCACAGT TTATTGCCGCCGATCGGATTATCGATTCGCCGGTTAAAATTGATGTGGCGATTTTAACCAATGCCGAAGATCTTGGGCTT AAGCATGTGACGAACATGCAATTTAATTCCATGGTCTATTCGGGTGATAAGTTTCAGTTAGTCACAGTTCGCGCCGTTGA AACGGGTTATCCACTCAAGGGTGACATTGAACTCACCAGCGGTAAAACCAAGGCTTTACCTCAAGCGGGTGAAATCTGGT TTGAGACTCGCTTAGGTGGACTCCTCGGTTATCCTAAAACCATCGAACTAGGTAACAGCGAATTTGTGCTCAGCAATGAA ATAAGCCGCTTACCCGACGCGGGCTTTAATCCTTTTGCTTCATCGCCCGTGGTATTGATGCGCATGGAAGATGTCGCCAA AACGGGAGTGATTCAACCGGGCAGCCGCGTGACCTATCTGTATCAATTTGCTGGCGATGAAGCCTCGCTTACGGCCTTTG AGCAAAGTGTTAAACCGCTTCTCAATAGCACCCAGCGCTGGGTCGATGTGCAATCCGGTGACTCGCCGATTGCGGGAGCA GTTAAGCGAGCTGAGCGCTTCCTACTGCTGGCTAGTTTGATGGGCATTGCACTGGCCTGCGCCGCGATAGGCATTGCCGC CCAGCGTTATTGTCAGCGCCATTACGATGTGGTGGCCATGCTGAAAACCTTTGGCGCCTCGTCAAAGCAAATTCGGTTGT TGTTCGGCACTCACTTATTTTTAGTGACGTTAATGGGGATTGTGCTTGGCATTATCGGTGGTGTGTTACTCGATTTTGGG ATCAGTTATTTATTGCCGCCCGAAATTGCCGCCTATTCGCCGCCACTCACTCGGCCATTACTGCTTGGTGTAAGCACAGG ACTTATCAGCGCCTTTATGTTTTCGGCTTATCCACTGATGCGCTTACTGGCTATTCCGCCACTACGAGTGCTACAGCGTC AGTTAGAAGGCTTACAGCTAGGGATGTGGCTGCATCTACTTTTGAGCTTAGGGGCGATGGCGTTACTGGGCTATTTGTAT TCCCAAAGTTGGGCTTTGACCCTGACTGTGGTCGCGGCCGTGTTGCTGCTCGGTGTGCTGTTAAGTGTGCTTGGCTTTGT GATGATACGTTTAGGCCACAGTGTCGGTATGAAGACCACCAATCCCTTACAGTTGGCACTGGCAGGGCTCAGACGTCGTG CGCGGCAAAATGCGGTGCAATTGGTGGGATTTAGCGCCGCACTGGTATTGTTATTGACGATTCTGGCATTAAGACAAGAT TTGCTCAACGAGTGGCAAAAACAGTTGCCCGAAAATGCACCTAACTACTTCCTCGTTAATATCGCCCCCGACGATGCTAA GCCCTTAAATGATTTTATGACGGCTAAGGGCATTGTTGCGACGGACATTTATCCTGTGATCCGTGGCCGTTTAACTCAAA TTAACGGTGAAGCGCTGATTTCGAATGAACAGTCTGAAGCGGGTGAAAAGGGCCGAGTGGGTATTTCCCGCGAGTTAAAC CTAACGTGGCGCAATACGCTACCAGCCAATAACGAACTGTTAGAGGGGCATTTTAATCAAGCGGCCGATGAAGTGTCGGT GGAATCTGGCGTGGCGGACCGTTTAGGTATTGGCATTGGCGATAAGTTGACTTATGTGATTGATAATCAAGAGCTCACAG TTAAGGTTGCCAGTATTCGTGCCGTGCACTGGGAAACGCTACAGCCGAACTTCTTTATGATTTTCACCCAAGAAGCTCTC GCGCCCTTTGCTTATACCTCGATGGCGAGTTTCTATCTGAATGATCAGCAAGCTACGAATGACCAGTCAACAAACGGCCA AGCGCTGAGTGCCGATGGTACGCCTAAGGATGCTGTGATCCTTGCGCTTATTCAGCAATTCCCGACCATATCGATCATCG ATGTGGGCGCTATGGTGGGGCAGTTACGGCAGATCATAGAGCAAGTGTCGCTGTCGCTGACCTTAGTGCTGGCCTTAGTG TTACTGGCAAGTGCCTTAGTCTTGATTGCACAGACTGAAGCGGGCATGGCAACTCGGCAGCGCGAACTGGCTGTGCTGCG TACCTTTGGCGCTTCGGGATGGTTATTGCGCAGTGCAACGGGTTTAGAGTTCGCCTTGCTTGGCGGTATTGCGGGCGTGT TAGCAGTCATAGTGGCTGAATTTGCGTTATATCTACTTAAGACGCAAGTGTTTGAGCTTAACGTGTATATGCACTGGCCT TGGTGGGGAATCGCCCCTGTTTCTGGCGCCTTAATCGTGGCCTTACTTGGGGTGTGGCGTTGCCGACAATTGCTTAGCCA ATCTTGCTCTGAGCTATTAAAGGCGGGCAGCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGCCAAGCGTTGTGAGCGGCAGCTGGTTATGGATAACGGCCATTTACAGGAAGATACGGCGCATACAGCACCGCTCGCC GATGCTAAGGAGGCTTAACA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGTTGCTTGCATGGGCTAACACTATAAGTTTATGACGTAAGTAGACAGCGTTAACAATTAAAGCACTGATGCCGCCTAA GCTCAGTGCTTTTTTATTGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 837; Mature: 837
Protein sequence:
>837_residues MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRIIDSPVKIDVAILTNAEDLGL KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTSGKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNE ISRLPDAGFNPFASSPVVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLFLVTLMGIVLGIIGGVLLDFG ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALISNEQSEAGEKGRVGISRELN LTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIGDKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEAL APFAYTSMASFYLNDQQATNDQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWP WWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS
Sequences:
>Translated_837_residues MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRIIDSPVKIDVAILTNAEDLGL KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTSGKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNE ISRLPDAGFNPFASSPVVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLFLVTLMGIVLGIIGGVLLDFG ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALISNEQSEAGEKGRVGISRELN LTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIGDKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEAL APFAYTSMASFYLNDQQATNDQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWP WWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS >Mature_837_residues MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRIIDSPVKIDVAILTNAEDLGL KHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTSGKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNE ISRLPDAGFNPFASSPVVLMRMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLFLVTLMGIVLGIIGGVLLDFG ISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLMRLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLY SQSWALTLTVVAAVLLLGVLLSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALISNEQSEAGEKGRVGISRELN LTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIGDKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEAL APFAYTSMASFYLNDQQATNDQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAEFALYLLKTQVFELNVYMHWP WWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS
Specific function: Unknown
COG id: COG3127
COG function: function code Q; Predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786704, Length=816, Percent_Identity=37.1323529411765, Blast_Score=475, Evalue=1e-135,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 90867; Mature: 90867
Theoretical pI: Translated: 6.96; Mature: 6.96
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRI CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHH IDSPVKIDVAILTNAEDLGLKHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTS CCCCCEEEEEEEECCHHCCCHHHCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECC GKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNEISRLPDAGFNPFASSPVVLM CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEE RMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA EEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCHHHH VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHH LVTLMGIVLGIIGGVLLDFGISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLYSQSWALTLTVVAAVLLLGVL HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALI HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHEEECCCEEE SNEQSEAGEKGRVGISRELNLTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIG CCCHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC DKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEALAPFAYTSMASFYLNDQQATN CCEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC DQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV CCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAE HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FALYLLKTQVFELNVYMHWPWWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS HHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MELSLAWRLFKRELQQGQLLLIILAITLAVLSVSGLARVSERLQVAITGQASQFIAADRI CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHH IDSPVKIDVAILTNAEDLGLKHVTNMQFNSMVYSGDKFQLVTVRAVETGYPLKGDIELTS CCCCCEEEEEEEECCHHCCCHHHCCCCCCCEEECCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEECC GKTKALPQAGEIWFETRLGGLLGYPKTIELGNSEFVLSNEISRLPDAGFNPFASSPVVLM CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEEECCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEE RMEDVAKTGVIQPGSRVTYLYQFAGDEASLTAFEQSVKPLLNSTQRWVDVQSGDSPIAGA EEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCCCCHHHH VKRAERFLLLASLMGIALACAAIGIAAQRYCQRHYDVVAMLKTFGASSKQIRLLFGTHLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHH LVTLMGIVLGIIGGVLLDFGISYLLPPEIAAYSPPLTRPLLLGVSTGLISAFMFSAYPLM HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLLAIPPLRVLQRQLEGLQLGMWLHLLLSLGAMALLGYLYSQSWALTLTVVAAVLLLGVL HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LSVLGFVMIRLGHSVGMKTTNPLQLALAGLRRRARQNAVQLVGFSAALVLLLTILALRQD HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLNEWQKQLPENAPNYFLVNIAPDDAKPLNDFMTAKGIVATDIYPVIRGRLTQINGEALI HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCHHEEECCCEEE SNEQSEAGEKGRVGISRELNLTWRNTLPANNELLEGHFNQAADEVSVESGVADRLGIGIG CCCHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC DKLTYVIDNQELTVKVASIRAVHWETLQPNFFMIFTQEALAPFAYTSMASFYLNDQQATN CCEEEEECCCEEEEEEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC DQSTNGQALSADGTPKDAVILALIQQFPTISIIDVGAMVGQLRQIIEQVSLSLTLVLALV CCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLASALVLIAQTEAGMATRQRELAVLRTFGASGWLLRSATGLEFALLGGIAGVLAVIVAE HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH FALYLLKTQVFELNVYMHWPWWGIAPVSGALIVALLGVWRCRQLLSQSCSELLKAGS HHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9278503 [H]