Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009972 |
Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159899636
Identifier: 159899636
GI number: 159899636
Start: 3932678
End: 3934960
Strand: Direct
Name: 159899636
Synonym: Haur_3117
Alternate gene names: NA
Gene position: 3932678-3934960 (Clockwise)
Preceding gene: 159899635
Following gene: 159899637
Centisome position: 61.97
GC content: 48.88
Gene sequence:
>2283_bases ATGAGGAACCAAGCCTTAACCATTACACGCCGCGACTTACGCGATACGCTCAGCGATTGGCGCACATTGATTCCGTTATG CATTCTTTCGGTGTTGTTGCCGCTAATTCTGCGGGCGGGGGTAGCGCAAGCAGTGAGTTTTCTCGACGATGAATTTATCA ACCGCAGTTTAGTGCCATTAGGTCTGTTGATTGCGGGATTCTTGCCAGCCTCACTCTCCTTGATTGGCCCCTTGGAATCG TTTGTCGGCGAACGTGAACGCTCAACCCTGGAATCGTTGTTGGCCATGCCAATGAGCGATCGTGGACTCTATCTAGCCAA GTTTTTGGCGGCACTATTGCCACCAATTGGCTCCTCGGCAGTGGCGATGCTGATGTATAGCCTAGCGATTGAGCTTGGGC GACCAGTACGCGTAGCCTTTGTGCAAAAGCTGCTCAGCGACTATTTAACCAGCGGCTGGATTATTGGCATCACATGTATT TTGTTGATTAAAGTTTTTACCATGGTTGCGGCAGCTGTCTATGTTTCGTCACATACTACCAGCATTCGGGCAGCCAACTT ATTAGCCAGTTTCATCCTAATTCCAATGGCAATTTTGGTCCAGATCGAAGCACTGATCATCATCAACGGCATGTTTTTGC CAATTGTGTTGATTAATGGTTTGTTGCTCGTGGTTGGTCTGACCATGGTTGGTTGGGGCATGTATAGCTTTAATCGCGAA GAATTGCTCTCACGTGAGCATGAAAGCATCAGCAAACGAGCCTCAACCCAACGCCTGAGCCAATCGACCCGCACCTATGG CCCTGTGATGACCATTGTACAGCGCGAGGCTGTTGACACGCTCAGCGACTGGCGAATTTTGGTGCCAATTGGCCTCTTGA CCTTTTTAGTGCCAATTGGCGCTTTGTTTGGGGTCATTTATGCTTTTGCTAATGTCGATGACCCGACTGGGGTGGTTAAT CTATTGCCCTTTATCGTGTTGCTGGTGGGCTTCTTACCAGCCTCATTTTCGCTGATTGTGGCACTTGAAGTTTTTGTTGG TGAGCGCGAACGTGGGTCGCTGGAGTCATTATTCTCAATGCCGATCAGCGATGGTCAGTTGTATCGAGGAAAGTTATTGG CGGCGATCGTGCCACCAATTGGCGCAAGCTTGGTTGGCATGCTGTTGTTTGGGGTTGGACTGAGCGTCTTTGCCCCAACT GCCTTGCTGGGACGGATCAACTTAAGCATTTTTAGCCAAATGGTCTTGCTGAGTATTGCCCAAGCCTTGACGATGGTTTC AGCAGCGGTGGTGATTTCGTCGCATACCAACACCGTGCGCTTAGCCAATTTATTGGCAAGCTTTATTTTGATCCCAGTGG CGATTATGGTACAGCTTGAAGCGGTGCTGATTATCGGCGAACGCTTCGACGTGCTGAATGCGATAATGGCAGTAATGTTA ATTTTGACAATCGTCTTGACGCGTACCGGCATTGGTAGCTTTAAGCGTGAATCAATTCTATCGCGTGAGCATTTAGCCCT CAATTTTAGTCAAATCAATCGAGCCTTCAAAGCCTTTTTCAGCGAAATTCGCCCAGCAGGCAGCAACCCCGATAGCCATC TCGGCTTATTCAATGTTGAAACTACTAATGGCCCACAACGCAATCTAGGACTGTGGCTCAAACGCTTCTATCGCCAAGAA TTAGCTGTCGTTTGGCGCGAGACCCGACTAGCGCTGGTTGTGGTGCTCCTCTTTTGTGGCGCAGCAATCCTTTTTGGTAG CCAATTTAATCCAGTCAGTAGCCGCGAACAATCATTGGCCAATGTTATGACGCGCTTAGACGTAGGTCAGGGCACACTCT GGGAGCCGCCATTAAGCTTTATTGTCATTAGCAATAGCTTTGCAATCTTTTTTGCTGGGCTATTTTCAAGCATCACTTTA GGCTTTTTTGGCTTGATTCTGCCAGCCATTAACCTAATGGGATTGAGTTTTCGAACCAGTAGTTTAGCCGCAAGCGGCGG CCTAGCAACTGCTCTCAATTATCTAGTGGGCTATGAATTGCCGCATGGGTTATTGGAAATTCCGCTAAGTATATTTGCGG CAGCCTTGGCATTACGTATGGGTGCGGCTTTGGCGTTTGTGCCACCAACCTATAGCGCTGGGCGGCATTTGCTCTGGGCT TGGGCCATGTATCTCAAAGTATTTTGCTTGCTAATTGTGCCTGGACTCGTGCTGGCGGGCTTGATTGAAGTGTTGGTAAC CCCAGCTGTGCATCAGATGGTCTATGGGTTTCTGTGGATTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGAAGATGTCTATCTGACGATTGTTGGCCAAACTCACCGCGAACGGATGAGCAGCCCACTTGAGCAGCCCAATGCGGCG GCAGTTGCCGAGGTCGCCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CCTGTTGACAAGCCATGAAGCTGCTACGTACAATGGAGCCATCACTTGGTACTGCTAGGAGGGTACTTCGATGGTGGCTC CTTCTGCGCTTGCGTTAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 760; Mature: 760
Protein sequence:
>760_residues MRNQALTITRRDLRDTLSDWRTLIPLCILSVLLPLILRAGVAQAVSFLDDEFINRSLVPLGLLIAGFLPASLSLIGPLES FVGERERSTLESLLAMPMSDRGLYLAKFLAALLPPIGSSAVAMLMYSLAIELGRPVRVAFVQKLLSDYLTSGWIIGITCI LLIKVFTMVAAAVYVSSHTTSIRAANLLASFILIPMAILVQIEALIIINGMFLPIVLINGLLLVVGLTMVGWGMYSFNRE ELLSREHESISKRASTQRLSQSTRTYGPVMTIVQREAVDTLSDWRILVPIGLLTFLVPIGALFGVIYAFANVDDPTGVVN LLPFIVLLVGFLPASFSLIVALEVFVGERERGSLESLFSMPISDGQLYRGKLLAAIVPPIGASLVGMLLFGVGLSVFAPT ALLGRINLSIFSQMVLLSIAQALTMVSAAVVISSHTNTVRLANLLASFILIPVAIMVQLEAVLIIGERFDVLNAIMAVML ILTIVLTRTGIGSFKRESILSREHLALNFSQINRAFKAFFSEIRPAGSNPDSHLGLFNVETTNGPQRNLGLWLKRFYRQE LAVVWRETRLALVVVLLFCGAAILFGSQFNPVSSREQSLANVMTRLDVGQGTLWEPPLSFIVISNSFAIFFAGLFSSITL GFFGLILPAINLMGLSFRTSSLAASGGLATALNYLVGYELPHGLLEIPLSIFAAALALRMGAALAFVPPTYSAGRHLLWA WAMYLKVFCLLIVPGLVLAGLIEVLVTPAVHQMVYGFLWI
Sequences:
>Translated_760_residues MRNQALTITRRDLRDTLSDWRTLIPLCILSVLLPLILRAGVAQAVSFLDDEFINRSLVPLGLLIAGFLPASLSLIGPLES FVGERERSTLESLLAMPMSDRGLYLAKFLAALLPPIGSSAVAMLMYSLAIELGRPVRVAFVQKLLSDYLTSGWIIGITCI LLIKVFTMVAAAVYVSSHTTSIRAANLLASFILIPMAILVQIEALIIINGMFLPIVLINGLLLVVGLTMVGWGMYSFNRE ELLSREHESISKRASTQRLSQSTRTYGPVMTIVQREAVDTLSDWRILVPIGLLTFLVPIGALFGVIYAFANVDDPTGVVN LLPFIVLLVGFLPASFSLIVALEVFVGERERGSLESLFSMPISDGQLYRGKLLAAIVPPIGASLVGMLLFGVGLSVFAPT ALLGRINLSIFSQMVLLSIAQALTMVSAAVVISSHTNTVRLANLLASFILIPVAIMVQLEAVLIIGERFDVLNAIMAVML ILTIVLTRTGIGSFKRESILSREHLALNFSQINRAFKAFFSEIRPAGSNPDSHLGLFNVETTNGPQRNLGLWLKRFYRQE LAVVWRETRLALVVVLLFCGAAILFGSQFNPVSSREQSLANVMTRLDVGQGTLWEPPLSFIVISNSFAIFFAGLFSSITL GFFGLILPAINLMGLSFRTSSLAASGGLATALNYLVGYELPHGLLEIPLSIFAAALALRMGAALAFVPPTYSAGRHLLWA WAMYLKVFCLLIVPGLVLAGLIEVLVTPAVHQMVYGFLWI >Mature_760_residues MRNQALTITRRDLRDTLSDWRTLIPLCILSVLLPLILRAGVAQAVSFLDDEFINRSLVPLGLLIAGFLPASLSLIGPLES FVGERERSTLESLLAMPMSDRGLYLAKFLAALLPPIGSSAVAMLMYSLAIELGRPVRVAFVQKLLSDYLTSGWIIGITCI LLIKVFTMVAAAVYVSSHTTSIRAANLLASFILIPMAILVQIEALIIINGMFLPIVLINGLLLVVGLTMVGWGMYSFNRE ELLSREHESISKRASTQRLSQSTRTYGPVMTIVQREAVDTLSDWRILVPIGLLTFLVPIGALFGVIYAFANVDDPTGVVN LLPFIVLLVGFLPASFSLIVALEVFVGERERGSLESLFSMPISDGQLYRGKLLAAIVPPIGASLVGMLLFGVGLSVFAPT ALLGRINLSIFSQMVLLSIAQALTMVSAAVVISSHTNTVRLANLLASFILIPVAIMVQLEAVLIIGERFDVLNAIMAVML ILTIVLTRTGIGSFKRESILSREHLALNFSQINRAFKAFFSEIRPAGSNPDSHLGLFNVETTNGPQRNLGLWLKRFYRQE LAVVWRETRLALVVVLLFCGAAILFGSQFNPVSSREQSLANVMTRLDVGQGTLWEPPLSFIVISNSFAIFFAGLFSSITL GFFGLILPAINLMGLSFRTSSLAASGGLATALNYLVGYELPHGLLEIPLSIFAAALALRMGAALAFVPPTYSAGRHLLWA WAMYLKVFCLLIVPGLVLAGLIEVLVTPAVHQMVYGFLWI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82593; Mature: 82593
Theoretical pI: Translated: 9.21; Mature: 9.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNQALTITRRDLRDTLSDWRTLIPLCILSVLLPLILRAGVAQAVSFLDDEFINRSLVPL CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH GLLIAGFLPASLSLIGPLESFVGERERSTLESLLAMPMSDRGLYLAKFLAALLPPIGSSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHH VAMLMYSLAIELGRPVRVAFVQKLLSDYLTSGWIIGITCILLIKVFTMVAAAVYVSSHTT HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH SIRAANLLASFILIPMAILVQIEALIIINGMFLPIVLINGLLLVVGLTMVGWGMYSFNRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH ELLSREHESISKRASTQRLSQSTRTYGPVMTIVQREAVDTLSDWRILVPIGLLTFLVPIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH ALFGVIYAFANVDDPTGVVNLLPFIVLLVGFLPASFSLIVALEVFVGERERGSLESLFSM HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHC PISDGQLYRGKLLAAIVPPIGASLVGMLLFGVGLSVFAPTALLGRINLSIFSQMVLLSIA CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QALTMVSAAVVISSHTNTVRLANLLASFILIPVAIMVQLEAVLIIGERFDVLNAIMAVML HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILTIVLTRTGIGSFKRESILSREHLALNFSQINRAFKAFFSEIRPAGSNPDSHLGLFNVE HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEE TTNGPQRNLGLWLKRFYRQELAVVWRETRLALVVVLLFCGAAILFGSQFNPVSSREQSLA CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH NVMTRLDVGQGTLWEPPLSFIVISNSFAIFFAGLFSSITLGFFGLILPAINLMGLSFRTS HHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH SLAASGGLATALNYLVGYELPHGLLEIPLSIFAAALALRMGAALAFVPPTYSAGRHLLWA HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCCHHHHHH WAMYLKVFCLLIVPGLVLAGLIEVLVTPAVHQMVYGFLWI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MRNQALTITRRDLRDTLSDWRTLIPLCILSVLLPLILRAGVAQAVSFLDDEFINRSLVPL CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH GLLIAGFLPASLSLIGPLESFVGERERSTLESLLAMPMSDRGLYLAKFLAALLPPIGSSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHH VAMLMYSLAIELGRPVRVAFVQKLLSDYLTSGWIIGITCILLIKVFTMVAAAVYVSSHTT HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH SIRAANLLASFILIPMAILVQIEALIIINGMFLPIVLINGLLLVVGLTMVGWGMYSFNRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH ELLSREHESISKRASTQRLSQSTRTYGPVMTIVQREAVDTLSDWRILVPIGLLTFLVPIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH ALFGVIYAFANVDDPTGVVNLLPFIVLLVGFLPASFSLIVALEVFVGERERGSLESLFSM HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHC PISDGQLYRGKLLAAIVPPIGASLVGMLLFGVGLSVFAPTALLGRINLSIFSQMVLLSIA CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QALTMVSAAVVISSHTNTVRLANLLASFILIPVAIMVQLEAVLIIGERFDVLNAIMAVML HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILTIVLTRTGIGSFKRESILSREHLALNFSQINRAFKAFFSEIRPAGSNPDSHLGLFNVE HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEE TTNGPQRNLGLWLKRFYRQELAVVWRETRLALVVVLLFCGAAILFGSQFNPVSSREQSLA CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHH NVMTRLDVGQGTLWEPPLSFIVISNSFAIFFAGLFSSITLGFFGLILPAINLMGLSFRTS HHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH SLAASGGLATALNYLVGYELPHGLLEIPLSIFAAALALRMGAALAFVPPTYSAGRHLLWA HHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCCHHHHHH WAMYLKVFCLLIVPGLVLAGLIEVLVTPAVHQMVYGFLWI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA