| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus N315, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002745 |
| Length | 2,814,816 |
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The map label for this gene is yfhO [H]
Identifier: 15926825
GI number: 15926825
Start: 1226508
End: 1229114
Strand: Reverse
Name: yfhO [H]
Synonym: SA1085
Alternate gene names: 15926825
Gene position: 1229114-1226508 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15926870
Following gene: 15926807
Centisome position: 43.67
GC content: 29.8
Gene sequence:
>2607_bases GTGTTAAAAAAGTGGCTAAATTCAAACGTCAAACAATTCTTTGTTATAACTTTCATTAGTGTAATATTAACGCTTATTTT ATTTTCTACTCATATCTATGATTATATTGTGAATGGTACTGTTTTTAGTGGGGCTGGAGATGGATTCCGTCAAATGATGC CATTTCAAATGTATTTGTATGAACATCTAAGTAGTTTTTCTAGTTTATATGATGCATCGTTTGGATTAGGTGGCGATTAT ATGAAAGGACTATCATATTATTATTCGCTGTCACCTTTAATGTGGCTAAATTTTCTATTCATTAAAATAGGAGAAACGGT TGGTATATTTAATCCGACAACAATACATTTTTGGCCGACAAACCAACTTATTATGGCTATGATACGAGCTATCATAACAT TTGTCGTGACCTTCTACTTATTTAAAATATTACACTTTAAACGCTCAACAAATATGATCGCTACGATTTTATACGGCATG TCAACTGTCGTTATATACTTTAATTTTACTTGGTCATTTTATGGAAATTTATTATATTTATTGCCATTATCGATTCTTGG TTTGGAAAGATATTTTCAACAACGCAAAATCGGTATTTTCATTGTTGCGATAGCCTTAACACTATTTAGCAATTTTTATT TCAGTTATTATCAAGCTATTATTATAGGTTGCTACTATTTATATCGACTCATTTTCACTTACAAATATGACATTGTCTCT AGAACACAAAAATTTATTTGCGTCATATCTGCTACAGTTTTGAGTGTGTTATCAAGTGTATTTGGTTTATTCACTGGCAT TTCTGCGTTTTTGGAAAATGACAGAAAGCAAAATCCCAATGTTGATATACCGTTTTTGACACCACTTGATTATCATTATT TTTTCTTTAGCGATGGATTTTATATTACGATTTCAATTCTTACTATCGTTGCATTATTGTCATTCAAACTGTATCGTTTT TACTTTTATAGACTTTTCGCAATAGTAACATGGATATTATTTATTGGTTCATTATCACAGTATTTCGACAGTGCTTTTAA TGGTTTTTCATTTCCAGAAAGGCGTTGGGTGTATATCTTAGCACTATCATCAAGCGCTCTTTGCGGATTGTTTATTCAAC ATTTATCAACATTAAATATGAAATATTATTTAATCAGAACAATACCAGTAAGTATCATCGCATTACTTTATGTATTACTA TCACCGACACACCCACTTGCACTTATAGTAGGTATTATCCTGCTAATGGTGCTTGCCGTTATTTTAAAATTTAGTTTATG GCGTTATAAAAAATTAACCGTTGCAATATTAGTATTAATCGTTATGATTCAACAAATCGTCATTTTAGATAACAACAAAA ATATGGCAATCAAACCTTATCAACAATCATTATCAACGTTGAAACAACATGATTACCATAGTAACTATGTAAACCAGCTT ATAAAAAAGATAAATCAAAATGCAACAGGCCCATTTAATCGCATTGATTATATGTCAGACTATGCATTAAATTCACCATT TATATATCATTATAATGGCATTTCATTATATTCTAGTATTTTTAATGGAGACATTTTAAAATATTATGACAAGACACTCC AAATTAATATGCCAATTGATAAAAACAGCACTTATAGATTACTTGGCAATCGTCAAAATTTACTATCACTTTGGAATGTT AATGATCGAATTAGAGTGAATCATGATGACAACTTACCATATAGATTTAAAATTAACTCTGAACACAAAGACAATAAAGT TCGTTGGATTCATTCTAAAAATACCATCCATTATCCAAGTGCACATATTACAAATAAGGTCTTTTCCAATAAAGAATTAA AATCTCCATTAGATAAAGAACAAGCAATGTTGCAAGGGATTGTTTCTAACAATACTAAAGATGTTAATACACATTTTAAA GCCAATAAAAATTTACTATCAGATTCAACAATTAAATTAAATAGTTCAGCCTGGCAATCTCCTACAAAACATTTATTACA AGTTAAACAAAATAATGGTGGTCTAACTGTACAGTTGCCAAAATCAGTTTCTAATCAATTTAAAGATTTGTATTTTGAAA TGGATTTAGAATTACTTTCGCCGGATAAAGCTCATGATGTTAAAGTGAATGAATATACACAAGAAAGAAATAAACTCACT TATAAATATCGACGCTTTGTAACACCCGTAACGATACGCATTAAAGCTTCAGATAGAATTAGATTATCATTGCCTAAAGG TAAGTATCGAGTAAATTTAAAAGGGATATACGGCGAAGATTATACCACGCTTAAAGACGCTTCAAATTCATTAGAGGCTG TCAAAGTTAGTAAGACAAAGCAAGGTTATACTATTACTAAAAATAAAAATTCATCTGGGTATATTGTTTTGCCAACAGCA TATAATCAAGGTATGAAAGCGACATCAGGTGATCAAAGTCTTAAAGTTGCACAAGTAAATGGTGTTATGACCGGCATTAA AGCACCTAAAAATATAACAAAGATTCAATTGAGCTATACCCCACCATACTATTATTTACTTATAACAATTACTATATTTG GCATTATATGTAGTATTATTTTCACGAGATGGGCAAGACAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATCTGTTCCACAGTCATCTTCGTCTTTACCTATCAAGAACCTCATTAACTTTAGTTTCAGTTAAACTTAATTTTAAATT TGAAAGTTGAGGATAATGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTGCTACGCATATATTTAATAAATCTACTAAGTCCTTTTCAATGGCACTTAGTAGATTTTTGTTTATATAAGCATTTT TGAGCAAACACGTTATGAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 868; Mature: 868
Protein sequence:
>868_residues MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDY MKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGM STVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS RTQKFICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRF YFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLL SPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL IKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNV NDRIRVNHDDNLPYRFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFK ANKNLLSDSTIKLNSSAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT YKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTA YNQGMKATSGDQSLKVAQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK
Sequences:
>Translated_868_residues MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDY MKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGM STVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS RTQKFICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRF YFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLL SPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL IKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNV NDRIRVNHDDNLPYRFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFK ANKNLLSDSTIKLNSSAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT YKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTA YNQGMKATSGDQSLKVAQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK >Mature_868_residues MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDY MKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGM STVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS RTQKFICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFYITISILTIVALLSFKLYRF YFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLL SPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL IKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNV NDRIRVNHDDNLPYRFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFK ANKNLLSDSTIKLNSSAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT YKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTA YNQGMKATSGDQSLKVAQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK
Specific function: Unknown
COG id: COG4485
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018580 [H]
Pfam domain/function: PF09586 YfhO [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 100499; Mature: 100499
Theoretical pI: Translated: 10.06; Mature: 10.06
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLY CCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH EHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPT HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEEEECC NQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHCCHHHH LPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RTQKFICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCC YITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYIL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEE ALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLLSPTHPLALIVGIILLMVLAV EECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH IKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPID HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHCCCCEEEEECCCC KNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYRFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPS CCCCEEEECCCCHHHHEECCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCC AHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSSAWQS HHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHCCC PTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT HHHHHHEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHEECHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH YKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTK HHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCEEEEECCC QGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVAQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYT CCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHCCCCCCCCCEEEEEEEC PPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLKKWLNSNVKQFFVITFISVILTLILFSTHIYDYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLY CCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH EHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLMWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPT HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCEEEEECC NQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHCCHHHH LPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVS HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RTQKFICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEEECCC YITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIVTWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYIL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEE ALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVSIIALLYVLLSPTHPLALIVGIILLMVLAV EECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH ILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEECHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH IKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPID HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCHHHCCCCEEEEECCCC KNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYRFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPS CCCCEEEECCCCHHHHEECCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCEEEEECCCEEECCC AHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLSDSTIKLNSSAWQS HHHHHHHHCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHCCC PTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLT HHHHHHEEEECCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHEECHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH YKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTK HHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCEEEEECCC QGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVAQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYT CCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHCCCCCCCCCEEEEEEEC PPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8946165; 9384377 [H]