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The map label for this gene is yabM [H]

Identifier: 15926181

GI number: 15926181

Start: 534713

End: 536239

Strand: Direct

Name: yabM [H]

Synonym: SA0462

Alternate gene names: 15926181

Gene position: 534713-536239 (Clockwise)

Preceding gene: 15926180

Following gene: 15926182

Centisome position: 19.0

GC content: 32.94

Gene sequence:

>1527_bases
ATGAAGCATAAAGAAGCATTTAATGGCGTTGTCGTGTTAACTGCTGCATTAATTGTCATTAAAATTCTGAGTGCTGTATA
TCGAATTCCATATCAAAATATATTAGGTGATACAGGTTTGTATGCATATCAACAAGTGTATCCAATTGTAGCATTAGGAA
TGATATTATCGATGAATGCCATTCCTAGTGCAATTACACAAAATATAGGGAAGTATCATAGTGACGAAGCATATGCAAAA
GCGGTCGCTTATATACAATTAGTTGGTATATTATTATTTATTGCTATTTTTGTGTTTGCGAACAATATTGCACATATGAT
GGGTGATAGCCATTTAACACCAATGATTCAAGCAGCAAGTTTAAGCTTTATATTTATAGGTATGCTTGGCGTGTTAAGAG
GTTATTATCAATCTGCAAATAATATGACAGTTCCGGCTATTTCCCAGGTTATAGAACAAGTTATACGAGTAGGTATTATC
ATTGTTACTATTGTTATTTTTGTAGACAGAGGTTGGACGATATATGAAGCGGGAACAATTGCTATTTTAGCATCAACGAT
AGGTTTTTTAGGTTCTTCAATTTATTTAGTAGCGCACCGACCTTTTAAGTTTAAAATGGTAAATAACACTGCAAAGATTG
TTTGGAAACAGTTCGCACTTTCGGTTTTGATTTTCGCTATCAGTCAATTAATCGTAATTTTATGGCAAGTGATTGATAGT
GTTACTATTATTAAGTCACTTCAAGCGATACGCGTGCCATTCGATGTTGCCATAACTGAAAAAGGAGTCTATGACCGTGG
TGCATCATTTATTCAGATGGGATTGATTGTAACTACAACATTTAGTTTTGCGCTCATTCCTCTGTTAAGTGACGCAATCA
AAATGAATAATCAGGTACTTATGAATCGTTATGCAAATGCGTCATTAAAGATTACGATTTTAATAAGTACAGCAGCGGGA
ATAGGATTAATTAATTTATTGCCTTTAATGAACGGTGTGTTTTTTAAGACGAATGATTTAACCTTAACGTTAAGTGTTTA
TATGATTACGGTCATTTGTGTATCGTTAATTATGATGGATATGGCTTTATTACAAGCGCAACATGCTGTGAGACCTATTT
TTGTTGGTATGACGGCAGGATTGGTTATTAAATTTATACTTAATATCATTTTGATTCGTTTAAGTGGCATTATTGGTGCG
AGCATTAGTACTGTTGTATCATTAATTATATTCGGTACGATTATCCATATTGCTGTCACGAGAAAATACCACTTACATGC
GATGAGACGATTTTTTATCAATGTTGTTTTAGGTATGGTATTTATGTCGATTGTTGTTCAATGCGTGTTAAACATAGTGA
CAACACACGGTAGATTCACTGGACTCATTGAATTATTATGTGCAGCAGTATTAGGTATCATTGCATTGTTTTTCTATATT
TTTAGATTTAATGTTTTGACATATAAAGAGTTAACTTATTTACCATTTGGTTCAAAGTTGTATCAAATTAAGAAAGGAAG
ACGTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAATAATGCAATGACAATTACTTTAACGAAACAAAATCAATGGCTTGATAGTTTGAAGTTTTTAGTTAAGTGCATTGA
AGAAAGCATGAGAATCAGTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGCACATACCATTACGATTGTTGGCTTAGGAAACTATGGCATTGATGATTTGCCGCTAGGGATATATAAATTTTTAAAG
ACACAAGATAAAGTTTATGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 508; Mature: 508

Protein sequence:

>508_residues
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAK
AVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDSHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGII
IVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAG
IGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGA
SISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLHAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRFTGLIELLCAAVLGIIALFFYI
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR

Sequences:

>Translated_508_residues
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAK
AVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDSHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGII
IVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAG
IGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGA
SISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLHAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRFTGLIELLCAAVLGIIALFFYI
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR
>Mature_508_residues
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNAIPSAITQNIGKYHSDEAYAK
AVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDSHLTPMIQAASLSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGII
IVTIVIFVDRGWTIYEAGTIAILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVLMNRYANASLKITILISTAAG
IGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMDMALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGA
SISTVVSLIIFGTIIHIAVTRKYHLHAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRFTGLIELLCAAVLGIIALFFYI
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56129; Mature: 56129

Theoretical pI: Translated: 10.24; Mature: 10.24

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNA
CCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPSAITQNIGKYHSDEAYAKAVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDSHLTPMIQAAS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
LSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGIIIVTIVIFVDRGWTIYEAGTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHH
AILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
HHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVL
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MNRYANASLKITILISTAAGIGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMD
HHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGASISTVVSLIIFGTIIHIAVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKYHLHAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRFTGLIELLCAAVLGIIALFFYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR
HHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHKEAFNGVVVLTAALIVIKILSAVYRIPYQNILGDTGLYAYQQVYPIVALGMILSMNA
CCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPSAITQNIGKYHSDEAYAKAVAYIQLVGILLFIAIFVFANNIAHMMGDSHLTPMIQAAS
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
LSFIFIGMLGVLRGYYQSANNMTVPAISQVIEQVIRVGIIIVTIVIFVDRGWTIYEAGTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCHH
AILASTIGFLGSSIYLVAHRPFKFKMVNNTAKIVWKQFALSVLIFAISQLIVILWQVIDS
HHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTIIKSLQAIRVPFDVAITEKGVYDRGASFIQMGLIVTTTFSFALIPLLSDAIKMNNQVL
HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MNRYANASLKITILISTAAGIGLINLLPLMNGVFFKTNDLTLTLSVYMITVICVSLIMMD
HHHHCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCEEEECCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MALLQAQHAVRPIFVGMTAGLVIKFILNIILIRLSGIIGASISTVVSLIIFGTIIHIAVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKYHLHAMRRFFINVVLGMVFMSIVVQCVLNIVTTHGRFTGLIELLCAAVLGIIALFFYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FRFNVLTYKELTYLPFGSKLYQIKKGRR
HHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7584024; 9384377 [H]