| Definition | Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003106 |
| Length | 2,694,756 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 15920300
Identifier: 15920300
GI number: 15920300
Start: 141197
End: 144088
Strand: Reverse
Name: 15920300
Synonym: ST0122
Alternate gene names: NA
Gene position: 144088-141197 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15920306
Following gene: 15920298
Centisome position: 5.35
GC content: 29.56
Gene sequence:
>2892_bases ATGAGAAAAATTACCTCTCTTACAAGTCTTAAGGTATTATTGAAGAAGGATAGGATGATTATAAGGGTTCTTCCCTACAT GGAAAATTTAGTCAAAAAATATTGTCCGCAATGTGTTGAAGTTCCTAGAGAGTTCAATAGTGTTGAAGAATTACAGAACT GGCGCGATTATATAAAATCTAAATCAACATATAAGATAGTAGGTAGAAGTTATGTAATTGATTTACTTTTAAACAAGATA AATATCGGTGAAGGTGACCTAAAAATAAGAGGGAATATATTAACTATATCTCCTTATAAGGCAATAAGTTATGTTTCAAA AAAAGTAAAAAATAAAGAAGATACACCTAAAATACTTGATTATTCTATTCTTATTCTAAAAGGTTATTCTACGTATATTC CAGCACTTCTAACCGAAGGTATAAAATTATCCAATATGAAAAAAATTGATGAATCGTTAAAGATCTTTAATAAGTTCAGA AGGATATTGTACATAAATGAGAACCAATTTCACTCTCCACAAGAATTACTAAAAAATGTGTATAAAGGTACTAATTTACG TGAGGATTGGGAGAAGCTCTCGCCAATATGGAAGGAGATAATTTATTACCTTATTGATTCTTCATTAGGTTTATTACCCG GTCAAGCAAAGAGAGAATTAAGTATTTTTGATTATTCTACAGAAGAAGAAGATATCTCAACAATCCCTTATCCAGAGTAT GTTGATATTGTAAACTTAGCCGTAGCTGAACTGATGAGGGGGAATAATGTTGTACTCTTAGGTAATTTAAAGACTGGAAA AAGTACTATAGCTGAATTAATAAGAAAGAGGTCTTTAGAGCATAAACTCCAAATTGACTTGGTGGATTATCATGATATTA ACGGCAATTACACTAGTATAGAAAAATTGAAAAGTGATAGAAAGAGAACTCTTTATGTACTTACTGAGGACTTATTTCAA AGCTTAGAAATAAATAACGTATTTAAAATCTTTACAAATGAAAGATTTATTTATTCTCTATCAAAAGACAAGGGACTAAC TTTACGATTAGATGAAAGAATTGCCGCAATACCTATGCATTATATAATAATGTTCCAAACTGATAACATAGAAACTACTG TTAGTAAAGCACTAGAAAATTTCTATTATGATTACTGGGAATATGTATACAATGTAATATTTGATGCTGATCCGAATAAA ATACTATGGTATTCTCCTATTTTAGCTATCTATGATCATTACAATACCTCTATACCTGTAAAAATTTCGTTACTTGTTCT AAAGAGCACTGGGAGGAAAAATGTAAATGAAAATGATTTAATACTTAAATGGTTCTCAAAATGTAGTATTCCCTTTAAAG TTCCAAGATCTTCGGATTATTACACTGATGTTTTAGATCAGGTAGATGTTAGCAACTTACTGAGAAAGATTAGTGAGGAA ATAGCTAATAGTATTAGAACAAATGAGGCTGTCGATAACGTATTAGAAGTCTATTCTTATTTAACCATAAATGAAGGAAA TGAACCTATTATAGTACCAGAACTTAACAGATACTTTGATAATAATCTCTCCTTTATGAAAATTATATTACCATACATCA TGGAAAAGATAAGAGACAAAATTGATATAGAAAGATACTGTAAGGAACTTAGTTATACGAAACAACCCTATGAAACTTTA GCAAGAATTAAAGGAATATTAATGAGGGGAACAGAAGAAAATTGCTACTCACTAGCAATAGATATACTTTTATCTGCATC TAAAAACGGCAAGGTTGAATGGATAAGATTCGTTTTAGATGATATCTTAACTAATATTAATTACCTTAAAAAAACTTCAT ATAAAATTATTGCAATGCTTTTCAATTATTTGAAATATTCTAGGGATGATATAGATAAAATAAAGAAAATATTTTATAAT GTGGAGAATGAAAGTAAATATTCTATATTTTTAAAATCTCTTCTTGATTACAATGACGGTTCGCTAGATGATCTTAGTTT CGACAATCCTTTATGGGCAACCTTAGGTTATGGCTTTCTCGGTATATATTCCCTTTCTAATCATGACTTGCTAAAATTAG CAATGATATATGATAAGTTTAGGAAAAGTTATTCTATTGTTAAAAGTAATAAAATAAGTACTGATGATCCGCATTTAAAG GATTTCTTTCCTATAAACAACGGAATCCATGATTATATTGATGAACTTAAGGATAGATTAGATGCTGGTATAGGTTATAC TTTACTTCTAACACATCCAAAGGAGGAGTCAGCTAGGGCTACAATAGAATTGGCTGAAAAATTAATGCTTAATTGGTATA CTAGGATAAAGAACAAGCTAAAATCTGGGAAAATTAAAGATGAGGAAGCTATGGATTTACTTAAAATATATCAGATAAAG TTAATGAAGAGTTTGATATCTGGAGGTAAATATGAATATAAATCAGTGTTACAAGACATAACAGAGCTAGAAAATTTATC AAAAATGGTTTATGAACCGGATGTAAAAGGGTCTTTATCTATAGCTTCCTATATAGCAAAAAGAGTACTTGGGATGGAAG AAAAGCCTAGATTATTTAGCGGTACAACACTTGACCTCCTTATATATATATCCTCGGAAATTTTACTTGGAGGTGAAGAT AAAAGCAAATTCTTCGATTTTATAGCAAATCAGATAAAGAATAAAGAAGAGGGAATAGATAAAGCGTTGGTAGGAATTAT AATAAGTGTAATAAGAAATGATAAGAAAGAGTTAGATAAAGCCCTAGAATATGCAAGGGAGAACTATTATTCTGTGATGT TAGAGATACTATCAAGGTATGTTAACGATAAAAAAATGTTTGTGGTAGCACTCATACCTTATATAGGTATGTGGCATTTT TTAGGTGGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGTTTTTTCTTTTCACGAATTAATATATGTAGCCTAACATTTTAGGTTTTGAGTCTTTGGCTAATGGTTTTATACCTTA TCCTATAAAATACTCAAGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGTCTGAGGTTTAAAACTACACTTTTCTTCAATCTTTCCTTCTAACGCATCTTTTAGATACACATAAGGATCTTTAACTT CTCTCATATGCTTTCCACTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 963; Mature: 963
Protein sequence:
>963_residues MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKSKSTYKIVGRSYVIDLLLNKI NIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILDYSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFR RILYINENQFHSPQELLKNVYKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSIEKLKSDRKRTLYVLTEDLFQ SLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMHYIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNK ILWYSPILAIYDHYNTSIPVKISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDKIDIERYCKELSYTKQPYETL ARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLDDILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYN VENESKYSIFLKSLLDYNDGSLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKLKSGKIKDEEAMDLLKIYQIK LMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLSIASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGED KSKFFDFIANQIKNKEEGIDKALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF LGG
Sequences:
>Translated_963_residues MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKSKSTYKIVGRSYVIDLLLNKI NIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILDYSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFR RILYINENQFHSPQELLKNVYKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSIEKLKSDRKRTLYVLTEDLFQ SLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMHYIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNK ILWYSPILAIYDHYNTSIPVKISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDKIDIERYCKELSYTKQPYETL ARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLDDILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYN VENESKYSIFLKSLLDYNDGSLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKLKSGKIKDEEAMDLLKIYQIK LMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLSIASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGED KSKFFDFIANQIKNKEEGIDKALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF LGG >Mature_963_residues MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKSKSTYKIVGRSYVIDLLLNKI NIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILDYSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFR RILYINENQFHSPQELLKNVYKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSIEKLKSDRKRTLYVLTEDLFQ SLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMHYIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNK ILWYSPILAIYDHYNTSIPVKISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDKIDIERYCKELSYTKQPYETL ARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLDDILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYN VENESKYSIFLKSLLDYNDGSLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKLKSGKIKDEEAMDLLKIYQIK LMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLSIASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGED KSKFFDFIANQIKNKEEGIDKALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF LGG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 112171; Mature: 112171
Theoretical pI: Translated: 8.38; Mature: 8.38
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKS CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KSTYKIVGRSYVIDLLLNKINIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILD CCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHC YSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFRRILYINENQFHSPQELLKNV EEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHH YKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHH VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSI HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHH EKLKSDRKRTLYVLTEDLFQSLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMH HHHHCCCHHEEEEEEHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEECCHHHHCCEE YIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNKILWYSPILAIYDHYNTSIPV EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCE KISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE EEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDIERYCKELSYTKQPYETLARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLD CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH DILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYNVENESKYSIFLKSLLDYNDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC SLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK CCCCCCCCCCHHHHHCCHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSGKIKDEEAMDLLKIYQIKLMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLS HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH IASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGEDKSKFFDFIANQIKNKEEGID HHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHEEEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH KALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LGG CCC >Mature Secondary Structure MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKS CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KSTYKIVGRSYVIDLLLNKINIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILD CCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHC YSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFRRILYINENQFHSPQELLKNV EEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHH YKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHH VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSI HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHH EKLKSDRKRTLYVLTEDLFQSLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMH HHHHCCCHHEEEEEEHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEECCHHHHCCEE YIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNKILWYSPILAIYDHYNTSIPV EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCE KISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE EEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDIERYCKELSYTKQPYETLARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLD CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH DILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYNVENESKYSIFLKSLLDYNDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC SLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK CCCCCCCCCCHHHHHCCHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KSGKIKDEEAMDLLKIYQIKLMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLS HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH IASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGEDKSKFFDFIANQIKNKEEGID HHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHEEEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH KALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LGG CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA