Definition Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome, complete genome.
Accession NC_003106
Length 2,694,756

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15920300

Identifier: 15920300

GI number: 15920300

Start: 141197

End: 144088

Strand: Reverse

Name: 15920300

Synonym: ST0122

Alternate gene names: NA

Gene position: 144088-141197 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15920306

Following gene: 15920298

Centisome position: 5.35

GC content: 29.56

Gene sequence:

>2892_bases
ATGAGAAAAATTACCTCTCTTACAAGTCTTAAGGTATTATTGAAGAAGGATAGGATGATTATAAGGGTTCTTCCCTACAT
GGAAAATTTAGTCAAAAAATATTGTCCGCAATGTGTTGAAGTTCCTAGAGAGTTCAATAGTGTTGAAGAATTACAGAACT
GGCGCGATTATATAAAATCTAAATCAACATATAAGATAGTAGGTAGAAGTTATGTAATTGATTTACTTTTAAACAAGATA
AATATCGGTGAAGGTGACCTAAAAATAAGAGGGAATATATTAACTATATCTCCTTATAAGGCAATAAGTTATGTTTCAAA
AAAAGTAAAAAATAAAGAAGATACACCTAAAATACTTGATTATTCTATTCTTATTCTAAAAGGTTATTCTACGTATATTC
CAGCACTTCTAACCGAAGGTATAAAATTATCCAATATGAAAAAAATTGATGAATCGTTAAAGATCTTTAATAAGTTCAGA
AGGATATTGTACATAAATGAGAACCAATTTCACTCTCCACAAGAATTACTAAAAAATGTGTATAAAGGTACTAATTTACG
TGAGGATTGGGAGAAGCTCTCGCCAATATGGAAGGAGATAATTTATTACCTTATTGATTCTTCATTAGGTTTATTACCCG
GTCAAGCAAAGAGAGAATTAAGTATTTTTGATTATTCTACAGAAGAAGAAGATATCTCAACAATCCCTTATCCAGAGTAT
GTTGATATTGTAAACTTAGCCGTAGCTGAACTGATGAGGGGGAATAATGTTGTACTCTTAGGTAATTTAAAGACTGGAAA
AAGTACTATAGCTGAATTAATAAGAAAGAGGTCTTTAGAGCATAAACTCCAAATTGACTTGGTGGATTATCATGATATTA
ACGGCAATTACACTAGTATAGAAAAATTGAAAAGTGATAGAAAGAGAACTCTTTATGTACTTACTGAGGACTTATTTCAA
AGCTTAGAAATAAATAACGTATTTAAAATCTTTACAAATGAAAGATTTATTTATTCTCTATCAAAAGACAAGGGACTAAC
TTTACGATTAGATGAAAGAATTGCCGCAATACCTATGCATTATATAATAATGTTCCAAACTGATAACATAGAAACTACTG
TTAGTAAAGCACTAGAAAATTTCTATTATGATTACTGGGAATATGTATACAATGTAATATTTGATGCTGATCCGAATAAA
ATACTATGGTATTCTCCTATTTTAGCTATCTATGATCATTACAATACCTCTATACCTGTAAAAATTTCGTTACTTGTTCT
AAAGAGCACTGGGAGGAAAAATGTAAATGAAAATGATTTAATACTTAAATGGTTCTCAAAATGTAGTATTCCCTTTAAAG
TTCCAAGATCTTCGGATTATTACACTGATGTTTTAGATCAGGTAGATGTTAGCAACTTACTGAGAAAGATTAGTGAGGAA
ATAGCTAATAGTATTAGAACAAATGAGGCTGTCGATAACGTATTAGAAGTCTATTCTTATTTAACCATAAATGAAGGAAA
TGAACCTATTATAGTACCAGAACTTAACAGATACTTTGATAATAATCTCTCCTTTATGAAAATTATATTACCATACATCA
TGGAAAAGATAAGAGACAAAATTGATATAGAAAGATACTGTAAGGAACTTAGTTATACGAAACAACCCTATGAAACTTTA
GCAAGAATTAAAGGAATATTAATGAGGGGAACAGAAGAAAATTGCTACTCACTAGCAATAGATATACTTTTATCTGCATC
TAAAAACGGCAAGGTTGAATGGATAAGATTCGTTTTAGATGATATCTTAACTAATATTAATTACCTTAAAAAAACTTCAT
ATAAAATTATTGCAATGCTTTTCAATTATTTGAAATATTCTAGGGATGATATAGATAAAATAAAGAAAATATTTTATAAT
GTGGAGAATGAAAGTAAATATTCTATATTTTTAAAATCTCTTCTTGATTACAATGACGGTTCGCTAGATGATCTTAGTTT
CGACAATCCTTTATGGGCAACCTTAGGTTATGGCTTTCTCGGTATATATTCCCTTTCTAATCATGACTTGCTAAAATTAG
CAATGATATATGATAAGTTTAGGAAAAGTTATTCTATTGTTAAAAGTAATAAAATAAGTACTGATGATCCGCATTTAAAG
GATTTCTTTCCTATAAACAACGGAATCCATGATTATATTGATGAACTTAAGGATAGATTAGATGCTGGTATAGGTTATAC
TTTACTTCTAACACATCCAAAGGAGGAGTCAGCTAGGGCTACAATAGAATTGGCTGAAAAATTAATGCTTAATTGGTATA
CTAGGATAAAGAACAAGCTAAAATCTGGGAAAATTAAAGATGAGGAAGCTATGGATTTACTTAAAATATATCAGATAAAG
TTAATGAAGAGTTTGATATCTGGAGGTAAATATGAATATAAATCAGTGTTACAAGACATAACAGAGCTAGAAAATTTATC
AAAAATGGTTTATGAACCGGATGTAAAAGGGTCTTTATCTATAGCTTCCTATATAGCAAAAAGAGTACTTGGGATGGAAG
AAAAGCCTAGATTATTTAGCGGTACAACACTTGACCTCCTTATATATATATCCTCGGAAATTTTACTTGGAGGTGAAGAT
AAAAGCAAATTCTTCGATTTTATAGCAAATCAGATAAAGAATAAAGAAGAGGGAATAGATAAAGCGTTGGTAGGAATTAT
AATAAGTGTAATAAGAAATGATAAGAAAGAGTTAGATAAAGCCCTAGAATATGCAAGGGAGAACTATTATTCTGTGATGT
TAGAGATACTATCAAGGTATGTTAACGATAAAAAAATGTTTGTGGTAGCACTCATACCTTATATAGGTATGTGGCATTTT
TTAGGTGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTTTTTTCTTTTCACGAATTAATATATGTAGCCTAACATTTTAGGTTTTGAGTCTTTGGCTAATGGTTTTATACCTTA
TCCTATAAAATACTCAAGAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTCTGAGGTTTAAAACTACACTTTTCTTCAATCTTTCCTTCTAACGCATCTTTTAGATACACATAAGGATCTTTAACTT
CTCTCATATGCTTTCCACTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 963; Mature: 963

Protein sequence:

>963_residues
MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKSKSTYKIVGRSYVIDLLLNKI
NIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILDYSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFR
RILYINENQFHSPQELLKNVYKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY
VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSIEKLKSDRKRTLYVLTEDLFQ
SLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMHYIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNK
ILWYSPILAIYDHYNTSIPVKISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE
IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDKIDIERYCKELSYTKQPYETL
ARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLDDILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYN
VENESKYSIFLKSLLDYNDGSLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK
DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKLKSGKIKDEEAMDLLKIYQIK
LMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLSIASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGED
KSKFFDFIANQIKNKEEGIDKALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF
LGG

Sequences:

>Translated_963_residues
MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKSKSTYKIVGRSYVIDLLLNKI
NIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILDYSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFR
RILYINENQFHSPQELLKNVYKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY
VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSIEKLKSDRKRTLYVLTEDLFQ
SLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMHYIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNK
ILWYSPILAIYDHYNTSIPVKISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE
IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDKIDIERYCKELSYTKQPYETL
ARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLDDILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYN
VENESKYSIFLKSLLDYNDGSLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK
DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKLKSGKIKDEEAMDLLKIYQIK
LMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLSIASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGED
KSKFFDFIANQIKNKEEGIDKALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF
LGG
>Mature_963_residues
MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKSKSTYKIVGRSYVIDLLLNKI
NIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILDYSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFR
RILYINENQFHSPQELLKNVYKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY
VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSIEKLKSDRKRTLYVLTEDLFQ
SLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMHYIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNK
ILWYSPILAIYDHYNTSIPVKISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE
IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDKIDIERYCKELSYTKQPYETL
ARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLDDILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYN
VENESKYSIFLKSLLDYNDGSLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK
DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKLKSGKIKDEEAMDLLKIYQIK
LMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLSIASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGED
KSKFFDFIANQIKNKEEGIDKALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF
LGG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 112171; Mature: 112171

Theoretical pI: Translated: 8.38; Mature: 8.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKS
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KSTYKIVGRSYVIDLLLNKINIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILD
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHC
YSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFRRILYINENQFHSPQELLKNV
EEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHH
YKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSI
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHH
EKLKSDRKRTLYVLTEDLFQSLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMH
HHHHCCCHHEEEEEEHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEECCHHHHCCEE
YIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNKILWYSPILAIYDHYNTSIPV
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCE
KISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE
EEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDIERYCKELSYTKQPYETLARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLD
CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
DILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYNVENESKYSIFLKSLLDYNDG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
SLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK
CCCCCCCCCCHHHHHCCHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSGKIKDEEAMDLLKIYQIKLMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLS
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
IASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGEDKSKFFDFIANQIKNKEEGID
HHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHEEEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
KALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LGG
CCC
>Mature Secondary Structure
MRKITSLTSLKVLLKKDRMIIRVLPYMENLVKKYCPQCVEVPREFNSVEELQNWRDYIKS
CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KSTYKIVGRSYVIDLLLNKINIGEGDLKIRGNILTISPYKAISYVSKKVKNKEDTPKILD
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHC
YSILILKGYSTYIPALLTEGIKLSNMKKIDESLKIFNKFRRILYINENQFHSPQELLKNV
EEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHH
YKGTNLREDWEKLSPIWKEIIYYLIDSSLGLLPGQAKRELSIFDYSTEEEDISTIPYPEY
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHH
VDIVNLAVAELMRGNNVVLLGNLKTGKSTIAELIRKRSLEHKLQIDLVDYHDINGNYTSI
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHH
EKLKSDRKRTLYVLTEDLFQSLEINNVFKIFTNERFIYSLSKDKGLTLRLDERIAAIPMH
HHHHCCCHHEEEEEEHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCEEEECCHHHHCCEE
YIIMFQTDNIETTVSKALENFYYDYWEYVYNVIFDADPNKILWYSPILAIYDHYNTSIPV
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCE
KISLLVLKSTGRKNVNENDLILKWFSKCSIPFKVPRSSDYYTDVLDQVDVSNLLRKISEE
EEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
IANSIRTNEAVDNVLEVYSYLTINEGNEPIIVPELNRYFDNNLSFMKIILPYIMEKIRDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDIERYCKELSYTKQPYETLARIKGILMRGTEENCYSLAIDILLSASKNGKVEWIRFVLD
CCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
DILTNINYLKKTSYKIIAMLFNYLKYSRDDIDKIKKIFYNVENESKYSIFLKSLLDYNDG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
SLDDLSFDNPLWATLGYGFLGIYSLSNHDLLKLAMIYDKFRKSYSIVKSNKISTDDPHLK
CCCCCCCCCCHHHHHCCHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
DFFPINNGIHDYIDELKDRLDAGIGYTLLLTHPKEESARATIELAEKLMLNWYTRIKNKL
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSGKIKDEEAMDLLKIYQIKLMKSLISGGKYEYKSVLQDITELENLSKMVYEPDVKGSLS
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHH
IASYIAKRVLGMEEKPRLFSGTTLDLLIYISSEILLGGEDKSKFFDFIANQIKNKEEGID
HHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCHHEEEEEEECCEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
KALVGIIISVIRNDKKELDKALEYARENYYSVMLEILSRYVNDKKMFVVALIPYIGMWHF
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LGG
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA