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The map label for this gene is 15898826

Identifier: 15898826

GI number: 15898826

Start: 1848518

End: 1849708

Strand: Reverse

Name: 15898826

Synonym: SSO2035

Alternate gene names: NA

Gene position: 1849708-1848518 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15898829

Following gene: 15898824

Centisome position: 61.82

GC content: 34.68

Gene sequence:

>1191_bases
ATGCACAGCTCAAAACATTCATTGATTTACTCGGCCATAATTCTTGTACTAATGACAATCTCAGCCAGAGCTACAAATAA
CATGGTTACTACAACGGTTCCATTATTAGCAAAGTATAGTCTTCAACTATCTAACTCTCTGGTTGGACTTTTATCGGCAT
TACTATTTACCTTCAATTTTATCGCCACAACATTTATTAATCCTGAACTTAATTCGAGGGTAAGAAGGAGAGTATTTGTA
ATTTCCAATGTTATAATTTTATTTTCGTTACCACTCTATTATCTGTCTAACGCAATATCAATATGGATAATCTCAATCTT
AGCCGGAATCGCATTCGGTTTAGTAATGCCTAACCTAATAACAGCAGCGAGTTTGGCAAATGATAAGAAATCAGTTGAGA
GGCTACTATCCCTGTACTCAACTAGCCTTAGTACCAGTTTGATTCTAGGTCCTGCAATTGAAGTCTATTTACTAACTAAA
TACGACTATAGGGATGTATTCTTATGGTTTATTCCAATAGCAGTTATAGGCATTATAATTTCATCGAGTATTAGATTCCC
AGATGTTAAGAGAGAAAGTAGTGGGATTTCAGTGATTAAAAATAAGGGTCTAACAGCTGCTGCACTATCAATTACCACGT
ATAATGTGCCATTCGCAGCATTTACCACATTCTTGGCAATATTGGCAAAGGATAGATTCAACTTACCTAATTTCGATGCC
TACTTTGTCTTTTTGCCATTCTATATAATGTCTTTCTTAACTAGACTTACGATGACCATAAGACCTTTCGAAAACCTCAG
AATGCCAATGTTAATTTCTATCATTATAACAATTTTGGGGTTATTTGGAATCCTATACGCCCCAAATTACTCTATTTTCT
TAGCAGTTATAGCACTACTGGGAATACCTCACGGTTCAATATTTCCTATGGCTACCATAATGATAAGTAGGGCTACAAGT
ATAGCTGAGAGGAATGCAGTAAATTCCTATTTCTTAGCTTATAACAATTTATTGTTCTTAGTAGTACCAGCTACAATTGG
ATTTGTATCAGAGATAGTTGGATTATCACTCTCCATTTCAGCCCTAATAATACCAGTTGCCATTACTGCAGTAGCTTTCT
TCAAGATGTTTTGGAATGATAATATTATGGTTAAGAGATACTTTGTTGATTTGTTCAATTTGTCTCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTCTAATAAAGCTATGCTTATTCGAATCATAAAAAATTAACACGTTTACTACTTTTGTAAGTAAGTTTAAATTTAAC
TTGTCAACTATGTATCTGCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACGATATTGTATAACACTAATTTTTCAGTAATTAATATTTATTTCAACGTTCCTCTCAAGCTTACACCCTAATGCCCGG
AGCCCTACCGACTACAGAAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Multidrug Efflux Permease; Multidrug Resistance Protein

Number of amino acids: Translated: 396; Mature: 396

Protein sequence:

>396_residues
MHSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSLVGLLSALLFTFNFIATTFINPELNSRVRRRVFV
ISNVIILFSLPLYYLSNAISIWIISILAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTK
YDYRDVFLWFIPIAVIGIIISSSIRFPDVKRESSGISVIKNKGLTAAALSITTYNVPFAAFTTFLAILAKDRFNLPNFDA
YFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGILYAPNYSIFLAVIALLGIPHGSIFPMATIMISRATS
IAERNAVNSYFLAYNNLLFLVVPATIGFVSEIVGLSLSISALIIPVAITAVAFFKMFWNDNIMVKRYFVDLFNLSH

Sequences:

>Translated_396_residues
MHSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSLVGLLSALLFTFNFIATTFINPELNSRVRRRVFV
ISNVIILFSLPLYYLSNAISIWIISILAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTK
YDYRDVFLWFIPIAVIGIIISSSIRFPDVKRESSGISVIKNKGLTAAALSITTYNVPFAAFTTFLAILAKDRFNLPNFDA
YFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGILYAPNYSIFLAVIALLGIPHGSIFPMATIMISRATS
IAERNAVNSYFLAYNNLLFLVVPATIGFVSEIVGLSLSISALIIPVAITAVAFFKMFWNDNIMVKRYFVDLFNLSH
>Mature_396_residues
MHSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSLVGLLSALLFTFNFIATTFINPELNSRVRRRVFV
ISNVIILFSLPLYYLSNAISIWIISILAGIAFGLVMPNLITAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTK
YDYRDVFLWFIPIAVIGIIISSSIRFPDVKRESSGISVIKNKGLTAAALSITTYNVPFAAFTTFLAILAKDRFNLPNFDA
YFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGILYAPNYSIFLAVIALLGIPHGSIFPMATIMISRATS
IAERNAVNSYFLAYNNLLFLVVPATIGFVSEIVGLSLSISALIIPVAITAVAFFKMFWNDNIMVKRYFVDLFNLSH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44009; Mature: 44009

Theoretical pI: Translated: 10.19; Mature: 10.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSLVGLLSALLFTFNF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IATTFINPELNSRVRRRVFVISNVIILFSLPLYYLSNAISIWIISILAGIAFGLVMPNLI
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTKYDYRDVFLWFIPIAVIGIII
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSSIRFPDVKRESSGISVIKNKGLTAAALSITTYNVPFAAFTTFLAILAKDRFNLPNFDA
HCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
YFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGILYAPNYSIFLAVIALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
GIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFLAYNNLLFLVVPATIGFVSEIVGLSLSIS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
ALIIPVAITAVAFFKMFWNDNIMVKRYFVDLFNLSH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MHSSKHSLIYSAIILVLMTISARATNNMVTTTVPLLAKYSLQLSNSLVGLLSALLFTFNF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IATTFINPELNSRVRRRVFVISNVIILFSLPLYYLSNAISIWIISILAGIAFGLVMPNLI
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAASLANDKKSVERLLSLYSTSLSTSLILGPAIEVYLLTKYDYRDVFLWFIPIAVIGIII
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SSSIRFPDVKRESSGISVIKNKGLTAAALSITTYNVPFAAFTTFLAILAKDRFNLPNFDA
HCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCH
YFVFLPFYIMSFLTRLTMTIRPFENLRMPMLISIIITILGLFGILYAPNYSIFLAVIALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
GIPHGSIFPMATIMISRATSIAERNAVNSYFLAYNNLLFLVVPATIGFVSEIVGLSLSIS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
ALIIPVAITAVAFFKMFWNDNIMVKRYFVDLFNLSH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA