Definition Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome.
Accession NC_002754
Length 2,992,245

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15897979

Identifier: 15897979

GI number: 15897979

Start: 964453

End: 965712

Strand: Reverse

Name: 15897979

Synonym: SSO1119

Alternate gene names: NA

Gene position: 965712-964453 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15897981

Following gene: 15897973

Centisome position: 32.27

GC content: 35.79

Gene sequence:

>1260_bases
ATGAGTGTATCAACAGTAGATCCACTTGAGGAAATATTAAAACCGGAAAACTTAAGTAGGTTATCCAAGATAGTTGACGC
ATTACCTACAATAGAGAAAGTAACTGATAAAATAACAGAAATGGATAAAAAAGGTCAAGTGGACTTCTTACTCTCATTAT
TTGATCAAACAGTTTCCATACTTGATGCTGTACAGAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATCTCATTCGGAATGGATCAA
CTACCAAAAATACAAGCAATATGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGGGCTTTGCAATTACTATCGCAGATTGA
TATAGACTCTACTCTTACCGCGTTAGAGAAATTATCGCCAATAATTAAGAAGCTAACTGACGAAAAAGTGTTGAAAGTAA
TTGATCAGATAGACTATGATTCTTTAATAGATAGTACTTCGAAGTTAGTACCTATTTTATCTAAACTTGCAAATGAGAGG
ACTGTTAAGACTATTGAAGCCCTAGATATTGATATGTTACTTAACTTAGCGTCAAAGATGGCTCCTACGCTAAACAAATT
TGCGTCATTAATGGATCAGATGTCTAGCAAAGGCCAAGTCGACATGTTAGTTAACTTAATGGAGCAAGGAATATCGCTAC
TTGATGCTGTACAGAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATCTCATTCGGAATGGATCAACTACCAAAAATACAAGCAATA
TGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGAACCCTTAACTTAATACAAAGTTTAGATCTGGACTCAATGTTCAACGC
GTTAGAAGCACTAACGCCAATAATGAAACAGCTAACAAGCGATAAGGCAATAAAGATCATTCAACAATTCGATATTGCTT
CTACACTTGGCGCCTTAGAGGCAGCAATGCCACTATTAAAGAAACTAACTGACGAAAAAACTGTTAAGATAATATCTCAA
ATAGACGTTAACTCGTTACTTATGCTTACAAACAAACTAGTCGAAATGCAGAAGTCTGGTAGTTTGGATAGACTAATGCA
GTTATTGGAAATAATTTCTGATCCACAATTCGTTAACGGACTGGTTACAGTCATGGATAAGTTTTCTAAGGCCTTTAAAG
CTTGGGTTAATGACATACCAAACGCAAGACCAGTCGGAACTATGGGCTTATTGAGAGCTACAAGCGATAAAGATGTCAGT
TATGCTTTAGGATTAATGCTTGAACTAGCTAAAGAAGTTGGAAAGAGTTTTAAATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAGTATTTCTTTTAATTTTCCGAAAGCGCTTGGCGAGATAACTGCAAACATATTAAATATATATAAACATGCTAGATTAA
TTAATTTAGGGTATAGTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAATTTTTTCTATTCTTCTTATTTTTCCTATATCCTCAGAAGATGTAAGCGGTTCATAAGAAGTTCTTCTGCCTAACA
ATCCTTCTAAGAACGAAACC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 418

Protein sequence:

>419_residues
MSVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ
LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSPIIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANER
TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ
IDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNGLVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVS
YALGLMLELAKEVGKSFKS

Sequences:

>Translated_419_residues
MSVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ
LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSPIIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANER
TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ
IDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNGLVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVS
YALGLMLELAKEVGKSFKS
>Mature_418_residues
SVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQL
PKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSPIIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANERT
VKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIW
PILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQI
DVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNGLVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVSY
ALGLMLELAKEVGKSFKS

Specific function: Unknown

COG id: COG2427

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46461; Mature: 46330

Theoretical pI: Translated: 4.65; Mature: 4.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI
CCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSP
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
IIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANERTVKTIEALDIDMLLNLASKM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
APTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAMPLLKKLTDEKTVKIISQIDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVSYALGLMLELAKEVGKSFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI
CCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSP
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
IIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANERTVKTIEALDIDMLLNLASKM
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
APTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH
WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAMPLLKKLTDEKTVKIISQIDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNG
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
LVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVSYALGLMLELAKEVGKSFKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA