Definition | Sulfolobus solfataricus P2 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_002754 |
Length | 2,992,245 |
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The map label for this gene is 15897979
Identifier: 15897979
GI number: 15897979
Start: 964453
End: 965712
Strand: Reverse
Name: 15897979
Synonym: SSO1119
Alternate gene names: NA
Gene position: 965712-964453 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15897981
Following gene: 15897973
Centisome position: 32.27
GC content: 35.79
Gene sequence:
>1260_bases ATGAGTGTATCAACAGTAGATCCACTTGAGGAAATATTAAAACCGGAAAACTTAAGTAGGTTATCCAAGATAGTTGACGC ATTACCTACAATAGAGAAAGTAACTGATAAAATAACAGAAATGGATAAAAAAGGTCAAGTGGACTTCTTACTCTCATTAT TTGATCAAACAGTTTCCATACTTGATGCTGTACAGAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATCTCATTCGGAATGGATCAA CTACCAAAAATACAAGCAATATGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGGGCTTTGCAATTACTATCGCAGATTGA TATAGACTCTACTCTTACCGCGTTAGAGAAATTATCGCCAATAATTAAGAAGCTAACTGACGAAAAAGTGTTGAAAGTAA TTGATCAGATAGACTATGATTCTTTAATAGATAGTACTTCGAAGTTAGTACCTATTTTATCTAAACTTGCAAATGAGAGG ACTGTTAAGACTATTGAAGCCCTAGATATTGATATGTTACTTAACTTAGCGTCAAAGATGGCTCCTACGCTAAACAAATT TGCGTCATTAATGGATCAGATGTCTAGCAAAGGCCAAGTCGACATGTTAGTTAACTTAATGGAGCAAGGAATATCGCTAC TTGATGCTGTACAGAAGGCAGACCTAATAAACACACTCATCTCATTCGGAATGGATCAACTACCAAAAATACAAGCAATA TGGCCAATACTAGAAAAACTAACAAGCGAAAGAACCCTTAACTTAATACAAAGTTTAGATCTGGACTCAATGTTCAACGC GTTAGAAGCACTAACGCCAATAATGAAACAGCTAACAAGCGATAAGGCAATAAAGATCATTCAACAATTCGATATTGCTT CTACACTTGGCGCCTTAGAGGCAGCAATGCCACTATTAAAGAAACTAACTGACGAAAAAACTGTTAAGATAATATCTCAA ATAGACGTTAACTCGTTACTTATGCTTACAAACAAACTAGTCGAAATGCAGAAGTCTGGTAGTTTGGATAGACTAATGCA GTTATTGGAAATAATTTCTGATCCACAATTCGTTAACGGACTGGTTACAGTCATGGATAAGTTTTCTAAGGCCTTTAAAG CTTGGGTTAATGACATACCAAACGCAAGACCAGTCGGAACTATGGGCTTATTGAGAGCTACAAGCGATAAAGATGTCAGT TATGCTTTAGGATTAATGCTTGAACTAGCTAAAGAAGTTGGAAAGAGTTTTAAATCTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAGTATTTCTTTTAATTTTCCGAAAGCGCTTGGCGAGATAACTGCAAACATATTAAATATATATAAACATGCTAGATTAA TTAATTTAGGGTATAGTAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATAATTTTTTCTATTCTTCTTATTTTTCCTATATCCTCAGAAGATGTAAGCGGTTCATAAGAAGTTCTTCTGCCTAACA ATCCTTCTAAGAACGAAACC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 418
Protein sequence:
>419_residues MSVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSPIIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANER TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ IDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNGLVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVS YALGLMLELAKEVGKSFKS
Sequences:
>Translated_419_residues MSVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQ LPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSPIIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANER TVKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQ IDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNGLVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVS YALGLMLELAKEVGKSFKS >Mature_418_residues SVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSILDAVQKADLINTLISFGMDQL PKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSPIIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANERT VKTIEALDIDMLLNLASKMAPTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIW PILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALEAAMPLLKKLTDEKTVKIISQI DVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNGLVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVSY ALGLMLELAKEVGKSFKS
Specific function: Unknown
COG id: COG2427
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46461; Mature: 46330
Theoretical pI: Translated: 4.65; Mature: 4.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 4.5 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 4.3 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI CCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSP HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH IIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANERTVKTIEALDIDMLLNLASKM HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH APTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAMPLLKKLTDEKTVKIISQIDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH LVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVSYALGLMLELAKEVGKSFKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SVSTVDPLEEILKPENLSRLSKIVDALPTIEKVTDKITEMDKKGQVDFLLSLFDQTVSI CCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH LDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAIWPILEKLTSERALQLLSQIDIDSTLTALEKLSP HHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH IIKKLTDEKVLKVIDQIDYDSLIDSTSKLVPILSKLANERTVKTIEALDIDMLLNLASKM HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH APTLNKFASLMDQMSSKGQVDMLVNLMEQGISLLDAVQKADLINTLISFGMDQLPKIQAI HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCCHHHHH WPILEKLTSERTLNLIQSLDLDSMFNALEALTPIMKQLTSDKAIKIIQQFDIASTLGALE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AAMPLLKKLTDEKTVKIISQIDVNSLLMLTNKLVEMQKSGSLDRLMQLLEIISDPQFVNG HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHH LVTVMDKFSKAFKAWVNDIPNARPVGTMGLLRATSDKDVSYALGLMLELAKEVGKSFKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA