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The map label for this gene is ppsA [H]

Identifier: 157962726

GI number: 157962726

Start: 3544440

End: 3552491

Strand: Direct

Name: ppsA [H]

Synonym: Spea_2907

Alternate gene names: 157962726

Gene position: 3544440-3552491 (Clockwise)

Preceding gene: 157962725

Following gene: 157962727

Centisome position: 68.5

GC content: 48.31

Gene sequence:

>8052_bases
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GGGACTTAATCAGCGAAAAAATCGATGCCATCACCGAATTGCCATCGACTCACTGGCAACCTGAAGAGTATTACGATGCG
AACAAGAGCACCCCAGATAAGAGCTACTGTAAGCGCGGTGGCTTCTTGCCAGATGTTGACTTCAACCCAATGGAGTTTGG
CCTGCCGCCAAATATCCTAGAACTAACCGACTCATCACAGCTGCTTTCTCTGATTGTTGCTAAAGAAGTACTAGCCGATG
CCAACCTGCCTGAAGGTTACGACAGAGATAAGATTGGTATCACTTTAGGTGTCGGTGGCGGCCAAAAAATTAGCCACAGC
CTAACGGCGCGTCTACAGTACCCGGTACTGAAGAAAGTATTCGCGAGCAGCGGCATTAGCGACCAAGACAGTGAAATGTT
GATCAAGAAGTTCCAAGATCAATATGTTCACTGGGAAGAAAACTCATTCCCTGGCTCTCTCGGTAACGTAATTGCTGGTC
GTATCGCTAACCGTTTCGATTTTGGTGGCATGAACTGTGTGGTCGATGCAGCCTGTGCTGGCTCACTCGCGGCTATGCGC
ATGGCTCTTACCGAGCTGACCGAAGGTCGCTCAGAGATGATGATCACCGGTGGTGTGTGTACCGACAACTCGCCGTCTAT
GTACATGAGCTTCTCAAAAACACCAGCCTTTACCACTAACGAAACTATTCAGCCATTTGATATCGATTCAAAAGGCATGA
TGATTGGTGAAGGGATTGGCATGGTCGCACTTAAGCGCCTTGAAGATGCCGAACGCGATGGCGATCGCATTTACTCAGTC
ATTAAAGGTGTGGGCGCTTCATCAGATGGTAAGTTTAAATCTATCTACGCCCCTCGCCCAGAAGGCCAAGCAAAAGCATT
AAACCGCGCCTATGATGACGCAGGTTTTGCGCCGCACACTCTTGGGCTTATCGAAGCGCACGGCACAGGCACCGCTGCTG
GTGACGCCGCTGAGTTTGCCGGCCTTTGCTCAGTATTTCGCGACGAGAACGACACTAAACAACACATCGCACTGGGCTCA
GTGAAGTCACAAATTGGCCACACTAAATCAACTGCGGGCACTGCAGGCCTAATCAAGGCTGCATTGGCACTACACCACAA
AGTGTTGCCGGCAACAATTAACGTCAGCCAACCAAGCCCGAAGCTTGATATCGAGAACTCACCGTTTTATCTCAATACTG
AGACTCGTCCATGGTTGCCTCGCGCCGATGGTACGCCGCGCCGTGCAGGTATTAGCTCATTTGGTTTTGGTGGCACTAAC
TTCCACTTCGTACTCGAAGAGTACAACAATGAGCACAGCCGCATCGATAGCGAGAAAGCTAAGTATCGTCAGCGTCAAGT
TGCCCAAAGCTTCTTAGTCAGTGCTAGCGATAAAGCGACGCTGATAAATGAGCTAAGCACACTGAGTGCTTCTGCTACTC
AAGCTGAGTTCATCTTAAAAGATGCCGCAGCAAACTATCCACTGCGTGAACTTAAAGCCAATGCACCACGTATCGGCCTC
GTCGCAAATAGTAGCGAAGAGCTAGTCAACCAAATCAAGCAAGCGGTCTCTAAGCTTGAATCGAGTGATGATAGCGCATG
GCAGCTTCCAGGCGGCACTAGCTACCGCGCAAATGCTGCAATTGATGTTGCAAACAAAGAGTCGGGTAAAGTTGCCGCGC
TGTTTGCAGGCCAAGGCTCGCAGTATCTAAACATGGGCCGCGAGCTGACTTGTTATTACCCAGAGATGCGTCAGCAATTT
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AGATGATTTAAAGACACAAGAAGCAACACTGACCAATACCGCTAATGCACAGAGTGCAATCGGCGCTATCTCTATGGGTC
AGTATGAGCTATTCACTGCTGCCGGTTTTAATGCCGATATGGTTGCGGGTCATAGCTTTGGTGAGCTGAGCGCATTGTGC
GCTGCCGGTGTTATCTCATCTGATGATTACTACAAGCTCGCTTTTGCTCGCGGTGATGCCATGGCGACTAAAGCACCAGC
AAAAGATGGTGTTGAAGCCGACGCTGGCGCCATGTACGCGATTATTACCAAGAGTGCAGCAGATCTTGAAGCCGTTGAAG
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CGAACTTGTGGGTCACGCCCAAGCACCATTTGCTAAAGCGATTGATGCAGCCAAGTTTACCAAGGCTTGCCGCGCACTTT
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ATAGCGACTTCCAGCTTAAACAAGCCGCGGTTCAGTTAGCTGTTGCAGGTATCAAGCTTGACAACATCGACCCGTACCAA
GCCGATATCGCAGCTCCAGAGAAAAAATCGCCAATGAGCATCTCGCTTAACGCTGCTAACCATATCAGTAAAGCGACACG
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GGTTCAGGTATTGCGATCCCAGAGAGCCTACAACGCTCGATGGAGCAATTCCACCAGCTACAAGCTCAAACACTACAGAG
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CCAGCCACTCCTGTTCAGCCTGCTCCTGTTCAAACTACAGCAGTTCAAACGGCTCCGACTCAAGCACCGCAAGTTAAAAC
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AGGCATCGACTCTATCAAGCGTGTAGAAATTCTAGGTACAGTGCAAGACGAGCTACCGGGTCTGCCTGAACTAAGCCCTG
AAGATTTAGCCGAGTGTCGCACACTAGGCGAAATCGTTAACTATATGAACTCTAAGCTGACTAATACAAGTGCCGCGGCG
GCTCTTAATGTTAGTGCCGCTGAAGGCTCTGCTGTTTCATCTACGCCAGTACATAGCGGTCTTTCTGCAGAGACAGCCCT
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GGTCTACCTGAGCTAAACCCTGAAGATTTAGCCGAGTGTAGAACACTGGGTGAAATCGTGGCTTATATGGGCAGTAAACT
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GCTTAACCCTGAAGATTTAGCCGAGTGTCGCACACTAGGCGAAATCGTGGCGTACATGAACTCTAAGCTGACTAATACAA
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AAGCTTCCAGCTGAAGGCTCTATGAACTCTCAGCACTCTTCGACTGTTGTTTCTACAACAGAGACGCCAGTAAACGGTCT
AAGCGCTGCCAAAGTCCAAAGCACCATGATGTCAGTAGTAGCAGAAAAGACGGGTTACCCAACTGAAATGCTTGAACTGA
GCATGGATATGGAAGCCGATTTGGGTATCGACTCTATCAAGCGCGTTGAGATATTGGGTACAGTACAAGATGAGCTTCCA
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ATCAACTGCTGGCGCAACAGTTGCTTCAACTGTTGCAGCTGCAACCGATGCAGTTAAATCAGTAGCAGACACAATAGCAT
CTACTCTAGAGCTTCCTCCTCATAGCGAGGTAGCGCTAAAAAAGCTTAATGCGGCGGACAAACTACAAGACTGTTTCGCC
GCAGACACGACCATTGTGATCAACGATGATGGTCACAATGCAGGTGTGCTAGCCGAGAAACTGACTAAGCAAGGCCTTAA
AGTAGCCGTAGTTCGACTACCTGACGGTCAGCCGCAATCTCCGCTTTCAAGTGATGTTGCCAGCTTCCAAGCGACCAGCA
TCGATGAAACAGGGATAACTGCCATTATCAATCAAGTTGAACAGCAACTTGGGCAAATTGGCGGCTTTATTCACCTGCAA
CCTGAGGCGAATGAAAGCAATCAAGCCGATGCGGTTAACCTTAACGAACAAGGCTTTACTCACCTAAGCCAAGCGTTCCT
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Upstream 100 bases:

>100_bases
AGCGCTTTCCTGGTGCGACGCCAAATCGCCACACCTCTAAAGAAACGCTTATAACAAACAACAAGACGCCTGACACTCAG
GCACCCAGCGGAGACTCATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
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ATCGCACTCTTGATGCTTCC

Product: polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA

Products: [acyl carrier protein]; acetoacetyl-ACP; CO2; [acyl carrier protein]; beta-ketoacyl-ACP [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 2683; Mature: 2682

Protein sequence:

>2683_residues
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Sequences:

>Translated_2683_residues
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>Mature_2682_residues
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PFAEDLLLQAMLVWARLKYGAASLPSSIGEFISNKPLAFGDKAILELEVVKTNARSLEANVTLYHENGELSAMMKGAKVT
ISKNLNSAFLNETALSVGESALSDSKKALSAEEKALSKGERA

Specific function: Polyketide synthase involved in phenolpthiocerol synthesis [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 acyl carrier domains [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI41872631, Length=464, Percent_Identity=27.1551724137931, Blast_Score=144, Evalue=9e-34,
Organism=Homo sapiens, GI8923559, Length=284, Percent_Identity=31.3380281690141, Blast_Score=122, Evalue=4e-27,
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Organism=Escherichia coli, GI1787337, Length=289, Percent_Identity=29.0657439446367, Blast_Score=104, Evalue=7e-23,
Organism=Escherichia coli, GI1788663, Length=390, Percent_Identity=24.8717948717949, Blast_Score=96, Evalue=5e-20,
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Organism=Caenorhabditis elegans, GI212642053, Length=459, Percent_Identity=25.4901960784314, Blast_Score=137, Evalue=1e-31,
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Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

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- InterPro:   IPR009081
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Pfam domain/function: PF00698 Acyl_transf_1; PF00106 adh_short; PF00109 ketoacyl-synt; PF02801 Ketoacyl-synt_C; PF00550 PP-binding [H]

EC number: 2.3.1.41 [C]

Molecular weight: Translated: 285309; Mature: 285178

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Prosite motif: PS50075 ACP_DOMAIN ; PS00589 PTS_HPR_SER

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

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Cys/Met content:

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0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: None [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

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Substrates: acetyl-ACP; malonyl-ACP; acyl-ACP [C]

Specific reaction: acetyl-ACP + malonyl-ACP = [acyl carrier protein] + acetoacetyl-ACP + CO2 acyl-ACP + malonyl-ACP = [acyl carrier protein] + beta-ketoacyl-ACP + CO2 [C]

General reaction: Acyl group transfer [C]

Inhibitor: Acetyl-CoA; Acyl-CoA; Iodoacetamide; N-Ethyl maleimide acyl -ACP-derivatives protect, malonyl-ACP-decarboxylation, Cerulenin [C]

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]