Definition Rickettsia akari str. Hartford, complete genome.
Accession NC_009881
Length 1,231,060

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The map label for this gene is 157825770

Identifier: 157825770

GI number: 157825770

Start: 629688

End: 632546

Strand: Direct

Name: 157825770

Synonym: A1C_03490

Alternate gene names: NA

Gene position: 629688-632546 (Clockwise)

Preceding gene: 157825769

Following gene: 157825772

Centisome position: 51.15

GC content: 27.28

Gene sequence:

>2859_bases
ATGGATGTTACAAATAATACAAATTATCAAAAGGTTGTAGAAAAAGTTTTATCTTCTTCTAACGCTAATAAAGCACTAAA
AAGTGCAATTAAGGACTTATCATCTTCAAAGAGTATAAGCTTAAGAACGGTGTTACTCGGAGCAAAATTTGTTTTAACTA
ATCCTGTAAATACTTATAATCTTGTCAAACTTGCTAAATCCTCTAATATATATCTTGATCCGGAATTTCAAAAATCACTT
CTTGAGAAATCTCCAATATGGGAATTTTTAAAAAAACATTCAGACGATTTGCCTAAAATAGGTCAAATCTTAGCAAATTC
AGGCTTTAGAGAATTTCAAGATAAGAGTGCTTTAGATAAAAAGGGACTCGAAATACTAAAAGAATGTTTTAAAAATGAAA
AAGTACTTAAAAAACTTCAAGAAATTGCAGTTGAAGTAAAGCAAGAGCTACCTGACTGGAATAAAGTGACGTCTAGCGTT
TTGGGTATGCTGGTTACCGATAAAAATTTCAAAAAATTCTTTAATGACAAGAGCGAAGATATTACGAATTATATACGCAC
TGGAGCAACTGAAATACTTCCAAGCGATTATATAAAAACTTTTGATAATATATTACAAAAACCCGACAAGAAAAATGTGT
TAAAAATATTTAATACACATCCTCATTTTAAGCAAGAACTGGCTGAAAATATAAACGATCCTAATACTCTAAAAAGTTTT
AATAAGTTATCTCCTGAAGAACAACTAATTATTGGCAGTTTCTTAGAAGAAGCAAAAGAACAAGCTAAACCTTTCTTAAA
AGAACATTTTGAAAGCTACAAAATTGATCTTAAAATTTTAGATATTATTCCTACTTTATTAAACAAAATTCCTGAGACAA
AAGAGATTTTTGATACTCTTCATGATCCAAATCAAGGTTTCATGATATCTCTTGAAAAATCCTTAGAAATGGTGGCGGGT
GATGATAAAGTAAAAAGTTTTTTTGCTAATAATAAAACAATCTTACCAAATATTGCTTTAGGTATTATTGAAAATAATCC
TAGCATACAAAGCATAACAAAAGAATATAATTTTGATCAACAAATGCTTAGTATAGTAGGTGAAGTTATGTCAAAGCCAG
AAATTGCTCATGAGATTGTTGCAGACTTAAATAAAGGCGATTATATGAGTTTAACCGGTAATATAATCTCTGCCCTGAAT
GATCCTTCATTTAAATTAAAAGATATATTAGTAGAGCAAAGTAAAGAAGGTCTATTTGATAATTTCATTACAGGAGTTTT
AGAACAAGATGAAAAAAATAGCCAAACTATAAAACTACAACTTATAAATTATGATCTGGAAGCAAGTGATATTACAAAGT
TAATGCGCATAATGCCTATATTACTTGATAAACCTGAATCATTAAAAAAGGTTTTTCGAGATTTTATTAAAGGTGATTAT
ATTGGAATGGCAAAAGAGTTAATAATTTTAACTAACGACAATCCTGAAATTAAAAAATATTTAAACAATAATAGAGCAAT
ATTTGCAAATATTTTAGACAAAACTTTAGTGGACATACCAGGTATAAATAACCTTGATAAGAAAGAATTATATAATGTAC
TTCCATCAATGTTAAACCATCCTGATGAATTAGTTAAAGTTATAGAAGCGGTTGAACAAAGTAATTATCGTGGTGCAGCT
AGTGCTATATATAATCTAGCTCAAAAAACCAATTATTTTGAAGGACAATTGCCGAATATTATAAAAGCAAGTTTTAACTA
TGCTACTGAAAAAGTAAAAGATGTATTTAGTCCATCACAAGATTTTAAAGATAAAACTATAGATGAAATTACTCTTAGAA
ATAACTTAAATAAAATACAAAATGGAAAATTCAGCTTAGAGGGAGCTATATTAGTAGGTAATTTATCTAATATTGACTTC
TCAGGCATATCATTAAAAAATGCAGATTTAACTAAAGTAACTTCTTTAAAAGATTGTAATTTTAAAAATACTAATTTAGC
AGGTGCTAAACTACCTGATAATTTAATGCTACTTACTGATACTTACAATCTTAATAAGACAATCCATTCTTTAGCACCTG
AACTAATTAAAGAGCAACAAGCAAAATTAATTGATAAGGCAATTGATAAAGTATTTTTACAAATACAGGCCGAAGAAAAA
AGGCATTTACTGAGTAAAAAAGAATTTGCTCAACAGGTAAATATGTTATGCGAAGAAAATCAAGCGGTTAAAGACTATAT
TATAGAAAAACTCAATTCGCTACCTATGAATATGGTTACTAACCTAGCTACTCCTAAAACAAATCAATATAAACATATTA
CAAATCATTTAAATTCTCCATTACAAATATTGAGCCCTTTATATGAAAATATTGTAAATAAAGAAGATATTAAGAGTAAT
TTATTGACAAATATTTTAAGCGAAAAAATAGCACAAAAACTTTTTGATAAAGGTGATAATAGAGGTGAAGATTTTTTCAT
GATTAAGCAGATGCTCAAACCTATCGTTTCTGAATATTCTAATAAGAATCCTGATAATATCAATAATTTTTTAGAGCCGA
AAAATCTAGAAAAATTAGCAATTAATATTGCCTCTAATTTAAATTCTAAATCTAAATATACTTGGGCAGGTACTATTACC
GGTGGAATTTATTTACCACAAGAAATCTTCAATGAACAGTTAAAAGATAATTTTAAGAATGAGTTTGAAAATATTAATAA
ACTAAATCTTTTAAAAGAAGCAAAAAATGTAGTTTCAAATTTAGATAGTAAAGTGCATATAGTAGATCATCACTATAAAT
CACATACTTACGCATCATTACCTACAAAAAGTAAAAAAAATAAACATATAGCTCTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCGGATGCTGAACATGTTGTATCGAAGTATACATATTAACAACAACAATAAAAAAATTTAAAATACCTAATTTTTATTTG
TGAAAATTTTGAATAATGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCTTAGATCCAATTGATTTAATTACCATATTATGTAATATAAATTAAAATATTTAAGTAGTTCTTAATTTATTTTTTTG
AATCAGTTTTAAGAGAATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 952; Mature: 952

Protein sequence:

>952_residues
MDVTNNTNYQKVVEKVLSSSNANKALKSAIKDLSSSKSISLRTVLLGAKFVLTNPVNTYNLVKLAKSSNIYLDPEFQKSL
LEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDKKGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSV
LGMLVTDKNFKKFFNDKSEDITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF
NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTLHDPNQGFMISLEKSLEMVAG
DDKVKSFFANNKTILPNIALGIIENNPSIQSITKEYNFDQQMLSIVGEVMSKPEIAHEIVADLNKGDYMSLTGNIISALN
DPSFKLKDILVEQSKEGLFDNFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY
IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPDELVKVIEAVEQSNYRGAA
SAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQDFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDF
SGISLKNADLTKVTSLKDCNFKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK
RHLLSKKEFAQQVNMLCEENQAVKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPKTNQYKHITNHLNSPLQILSPLYENIVNKEDIKSN
LLTNILSEKIAQKLFDKGDNRGEDFFMIKQMLKPIVSEYSNKNPDNINNFLEPKNLEKLAINIASNLNSKSKYTWAGTIT
GGIYLPQEIFNEQLKDNFKNEFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL

Sequences:

>Translated_952_residues
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LEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDKKGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSV
LGMLVTDKNFKKFFNDKSEDITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF
NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTLHDPNQGFMISLEKSLEMVAG
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DPSFKLKDILVEQSKEGLFDNFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY
IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPDELVKVIEAVEQSNYRGAA
SAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQDFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDF
SGISLKNADLTKVTSLKDCNFKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK
RHLLSKKEFAQQVNMLCEENQAVKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPKTNQYKHITNHLNSPLQILSPLYENIVNKEDIKSN
LLTNILSEKIAQKLFDKGDNRGEDFFMIKQMLKPIVSEYSNKNPDNINNFLEPKNLEKLAINIASNLNSKSKYTWAGTIT
GGIYLPQEIFNEQLKDNFKNEFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL
>Mature_952_residues
MDVTNNTNYQKVVEKVLSSSNANKALKSAIKDLSSSKSISLRTVLLGAKFVLTNPVNTYNLVKLAKSSNIYLDPEFQKSL
LEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDKKGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSV
LGMLVTDKNFKKFFNDKSEDITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF
NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTLHDPNQGFMISLEKSLEMVAG
DDKVKSFFANNKTILPNIALGIIENNPSIQSITKEYNFDQQMLSIVGEVMSKPEIAHEIVADLNKGDYMSLTGNIISALN
DPSFKLKDILVEQSKEGLFDNFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY
IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPDELVKVIEAVEQSNYRGAA
SAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQDFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDF
SGISLKNADLTKVTSLKDCNFKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK
RHLLSKKEFAQQVNMLCEENQAVKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPKTNQYKHITNHLNSPLQILSPLYENIVNKEDIKSN
LLTNILSEKIAQKLFDKGDNRGEDFFMIKQMLKPIVSEYSNKNPDNINNFLEPKNLEKLAINIASNLNSKSKYTWAGTIT
GGIYLPQEIFNEQLKDNFKNEFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 108211; Mature: 108211

Theoretical pI: Translated: 7.77; Mature: 7.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDVTNNTNYQKVVEKVLSSSNANKALKSAIKDLSSSKSISLRTVLLGAKFVLTNPVNTYN
CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHEEECCCCHHH
LVKLAKSSNIYLDPEFQKSLLEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDK
HHHHHCCCCEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
KGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSVLGMLVTDKNFKKFFNDKSED
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHH
ITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF
HHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTL
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
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NFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY
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IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNH
HCCCCEEEEEECCCHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
PDELVKVIEAVEQSNYRGAASAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQ
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DFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDFSGISLKNADLTKVTSLKDCN
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FKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCH
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CCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHH
EFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL
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>Mature Secondary Structure
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EFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]