| Definition | Rickettsia akari str. Hartford, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009881 |
| Length | 1,231,060 |
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The map label for this gene is 157825770
Identifier: 157825770
GI number: 157825770
Start: 629688
End: 632546
Strand: Direct
Name: 157825770
Synonym: A1C_03490
Alternate gene names: NA
Gene position: 629688-632546 (Clockwise)
Preceding gene: 157825769
Following gene: 157825772
Centisome position: 51.15
GC content: 27.28
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATCTTAGATCCAATTGATTTAATTACCATATTATGTAATATAAATTAAAATATTTAAGTAGTTCTTAATTTATTTTTTTG AATCAGTTTTAAGAGAATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 952; Mature: 952
Protein sequence:
>952_residues MDVTNNTNYQKVVEKVLSSSNANKALKSAIKDLSSSKSISLRTVLLGAKFVLTNPVNTYNLVKLAKSSNIYLDPEFQKSL LEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDKKGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSV LGMLVTDKNFKKFFNDKSEDITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTLHDPNQGFMISLEKSLEMVAG DDKVKSFFANNKTILPNIALGIIENNPSIQSITKEYNFDQQMLSIVGEVMSKPEIAHEIVADLNKGDYMSLTGNIISALN DPSFKLKDILVEQSKEGLFDNFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNHPDELVKVIEAVEQSNYRGAA SAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQDFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDF SGISLKNADLTKVTSLKDCNFKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK RHLLSKKEFAQQVNMLCEENQAVKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPKTNQYKHITNHLNSPLQILSPLYENIVNKEDIKSN LLTNILSEKIAQKLFDKGDNRGEDFFMIKQMLKPIVSEYSNKNPDNINNFLEPKNLEKLAINIASNLNSKSKYTWAGTIT GGIYLPQEIFNEQLKDNFKNEFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108211; Mature: 108211
Theoretical pI: Translated: 7.77; Mature: 7.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDVTNNTNYQKVVEKVLSSSNANKALKSAIKDLSSSKSISLRTVLLGAKFVLTNPVNTYN CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHEEECCCCHHH LVKLAKSSNIYLDPEFQKSLLEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDK HHHHHCCCCEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH KGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSVLGMLVTDKNFKKFFNDKSED HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHH ITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF HHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHH NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTL HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH HDPNQGFMISLEKSLEMVAGDDKVKSFFANNKTILPNIALGIIENNPSIQSITKEYNFDQ CCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHH QMLSIVGEVMSKPEIAHEIVADLNKGDYMSLTGNIISALNDPSFKLKDILVEQSKEGLFD HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHH NFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCH IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNH HCCCCEEEEEECCCHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC PDELVKVIEAVEQSNYRGAASAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQ HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDFSGISLKNADLTKVTSLKDCN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCHHHHCCCCCCC FKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK CCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RHLLSKKEFAQQVNMLCEENQAVKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPKTNQYKHITNHLNSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCH LQILSPLYENIVNKEDIKSNLLTNILSEKIAQKLFDKGDNRGEDFFMIKQMLKPIVSEYS HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC NKNPDNINNFLEPKNLEKLAINIASNLNSKSKYTWAGTITGGIYLPQEIFNEQLKDNFKN CCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHH EFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MDVTNNTNYQKVVEKVLSSSNANKALKSAIKDLSSSKSISLRTVLLGAKFVLTNPVNTYN CCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHEEECCCCHHH LVKLAKSSNIYLDPEFQKSLLEKSPIWEFLKKHSDDLPKIGQILANSGFREFQDKSALDK HHHHHCCCCEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH KGLEILKECFKNEKVLKKLQEIAVEVKQELPDWNKVTSSVLGMLVTDKNFKKFFNDKSED HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHH ITNYIRTGATEILPSDYIKTFDNILQKPDKKNVLKIFNTHPHFKQELAENINDPNTLKSF HHHHHHHCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHH NKLSPEEQLIIGSFLEEAKEQAKPFLKEHFESYKIDLKILDIIPTLLNKIPETKEIFDTL HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH HDPNQGFMISLEKSLEMVAGDDKVKSFFANNKTILPNIALGIIENNPSIQSITKEYNFDQ CCCCCCEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEECCCEEEEEEECCCCHHHHHHHCCCHH QMLSIVGEVMSKPEIAHEIVADLNKGDYMSLTGNIISALNDPSFKLKDILVEQSKEGLFD HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHH NFITGVLEQDEKNSQTIKLQLINYDLEASDITKLMRIMPILLDKPESLKKVFRDFIKGDY HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCH IGMAKELIILTNDNPEIKKYLNNNRAIFANILDKTLVDIPGINNLDKKELYNVLPSMLNH HCCCCEEEEEECCCHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCC PDELVKVIEAVEQSNYRGAASAIYNLAQKTNYFEGQLPNIIKASFNYATEKVKDVFSPSQ HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC DFKDKTIDEITLRNNLNKIQNGKFSLEGAILVGNLSNIDFSGISLKNADLTKVTSLKDCN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEECCCCCCCCCCEECCCCHHHHCCCCCCC FKNTNLAGAKLPDNLMLLTDTYNLNKTIHSLAPELIKEQQAKLIDKAIDKVFLQIQAEEK CCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RHLLSKKEFAQQVNMLCEENQAVKDYIIEKLNSLPMNMVTNLATPKTNQYKHITNHLNSP HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCH LQILSPLYENIVNKEDIKSNLLTNILSEKIAQKLFDKGDNRGEDFFMIKQMLKPIVSEYS HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC NKNPDNINNFLEPKNLEKLAINIASNLNSKSKYTWAGTITGGIYLPQEIFNEQLKDNFKN CCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCEECCHHHHHHHHHHHHHH EFENINKLNLLKEAKNVVSNLDSKVHIVDHHYKSHTYASLPTKSKKNKHIAL HHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]