| Definition | Escherichia coli E24377A, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009801 |
| Length | 4,979,619 |
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The map label for this gene is 157158956
Identifier: 157158956
GI number: 157158956
Start: 2285178
End: 2286419
Strand: Reverse
Name: 157158956
Synonym: EcE24377A_2322
Alternate gene names: NA
Gene position: 2286419-2285178 (Counterclockwise)
Preceding gene: 157156116
Following gene: 157158578
Centisome position: 45.92
GC content: 29.71
Gene sequence:
>1242_bases ATGCGTTCTTTATATTTATTTATTTCTTCTGTTTCTAACTTGTTATTTATTGTTCTCATTCAGTTAATAACACTAATTAA AATAGGACCTTCTAGCGATACAGATGCTTTATTTGCCGGTATGACTATACCTTCTGTTATCCTGTCTGTATTAGTTAGTT CATTAACTAATGTTCTGGTTCCATTATTTGTATCTTCAAAGAGTGTTTTAAAAGATCTTTGGGCGCAGATATACTTATTT TCAATCGGCTCAGCATTTATAGTTATACCATTAATATCCTTTAGTCCATTATGGTTGGGATGTGTATTTTCTGGTTTTGA TGTAAAAACATTATCTTTAACGCAACATATTATTACGGTCCAATTCATCGTAATTCCTTTTTCTATCGCATCAGCAATAT TCACTGCCTTTTTTAATGCAAACTCAAAATTTATTTCTGCAGAAGCGATTCCAGCAATTTGTTCTTTAATTATATTTCCA TTTATTTTCCCAGCTATAACTTCTTATGGTGTGTTGGCTGTTACGTATATTTATGCAATAAAAATACTTATGACATTCGT TATGCAAATAATGAAAATAGGAGGCCCAATTAAATTATCCTTTAATGATATAGACATCAAGGGAGCCTTTTCCCGCATTA AATATTTGATTTTAGGTTCTGTCTATTATAAATCAGGTCCCGTTATTGACAGACATATTCTTTCTTATTCAGTTGCTGGC TCTCTCTCTCTTTTTGTTTTAGTCCAGCAATTGCTTTCAATGGCAAACTTAATTTTCACTAAAACAATAATTATTCCTGA TATAACAATGATGAATAAGGTGGCTGTACAGGATAATAAAATATTTAAACATTGGTTAATGACGAGGGTTTTTATTTTAT TTGCCTTTGGTTTGGTTCTATATTTCTTTGCCTTTATATTAGGGGAACAGATAATAAATTTATTTTTAAAAATATTTAAC TTTCAGAAATTTGATGTCCATATTATCTGGATGTTAACTATGGCGTTATTTGGTGGGTTTATAGGGGATTCTATTGCAAC ACTTGTCTCTTCAAGTTTTTATTCTAAAGGTGATACCAAAACACCGTCTTTTTTATCAATTGTAACATTTACTATATTTA TTCCTTTAAAATTTATATCTTATCATTATGCTGGGGTTTATGGATTAGCATTCGCTAGTAGTATTTATTCTTTGATAAAT ATGTCGGTTATGTTTTTAATTATCATGTTGAGGCTTAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCCTTCATCCACACAAAAATAAAATATCAATTATGAATAAGATTTATATTGCTCTTAAAATGAGAATATATTCGAAATTG CATAACATGAAAGGGATATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGTTTTTATTGGCTGGACGGCAGATTATGACCGTATAATGATACAGCAATTAAGAGAACATTTCGAAATAAAAAACATT GCCTATCCTGAAGGGCGATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 413; Mature: 413
Protein sequence:
>413_residues MRSLYLFISSVSNLLFIVLIQLITLIKIGPSSDTDALFAGMTIPSVILSVLVSSLTNVLVPLFVSSKSVLKDLWAQIYLF SIGSAFIVIPLISFSPLWLGCVFSGFDVKTLSLTQHIITVQFIVIPFSIASAIFTAFFNANSKFISAEAIPAICSLIIFP FIFPAITSYGVLAVTYIYAIKILMTFVMQIMKIGGPIKLSFNDIDIKGAFSRIKYLILGSVYYKSGPVIDRHILSYSVAG SLSLFVLVQQLLSMANLIFTKTIIIPDITMMNKVAVQDNKIFKHWLMTRVFILFAFGLVLYFFAFILGEQIINLFLKIFN FQKFDVHIIWMLTMALFGGFIGDSIATLVSSSFYSKGDTKTPSFLSIVTFTIFIPLKFISYHYAGVYGLAFASSIYSLIN MSVMFLIIMLRLK
Sequences:
>Translated_413_residues MRSLYLFISSVSNLLFIVLIQLITLIKIGPSSDTDALFAGMTIPSVILSVLVSSLTNVLVPLFVSSKSVLKDLWAQIYLF SIGSAFIVIPLISFSPLWLGCVFSGFDVKTLSLTQHIITVQFIVIPFSIASAIFTAFFNANSKFISAEAIPAICSLIIFP FIFPAITSYGVLAVTYIYAIKILMTFVMQIMKIGGPIKLSFNDIDIKGAFSRIKYLILGSVYYKSGPVIDRHILSYSVAG SLSLFVLVQQLLSMANLIFTKTIIIPDITMMNKVAVQDNKIFKHWLMTRVFILFAFGLVLYFFAFILGEQIINLFLKIFN FQKFDVHIIWMLTMALFGGFIGDSIATLVSSSFYSKGDTKTPSFLSIVTFTIFIPLKFISYHYAGVYGLAFASSIYSLIN MSVMFLIIMLRLK >Mature_413_residues MRSLYLFISSVSNLLFIVLIQLITLIKIGPSSDTDALFAGMTIPSVILSVLVSSLTNVLVPLFVSSKSVLKDLWAQIYLF SIGSAFIVIPLISFSPLWLGCVFSGFDVKTLSLTQHIITVQFIVIPFSIASAIFTAFFNANSKFISAEAIPAICSLIIFP FIFPAITSYGVLAVTYIYAIKILMTFVMQIMKIGGPIKLSFNDIDIKGAFSRIKYLILGSVYYKSGPVIDRHILSYSVAG SLSLFVLVQQLLSMANLIFTKTIIIPDITMMNKVAVQDNKIFKHWLMTRVFILFAFGLVLYFFAFILGEQIINLFLKIFN FQKFDVHIIWMLTMALFGGFIGDSIATLVSSSFYSKGDTKTPSFLSIVTFTIFIPLKFISYHYAGVYGLAFASSIYSLIN MSVMFLIIMLRLK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 46070; Mature: 46070
Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRSLYLFISSVSNLLFIVLIQLITLIKIGPSSDTDALFAGMTIPSVILSVLVSSLTNVLV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLFVSSKSVLKDLWAQIYLFSIGSAFIVIPLISFSPLWLGCVFSGFDVKTLSLTQHIITV HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHH QFIVIPFSIASAIFTAFFNANSKFISAEAIPAICSLIIFPFIFPAITSYGVLAVTYIYAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KILMTFVMQIMKIGGPIKLSFNDIDIKGAFSRIKYLILGSVYYKSGPVIDRHILSYSVAG HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH SLSLFVLVQQLLSMANLIFTKTIIIPDITMMNKVAVQDNKIFKHWLMTRVFILFAFGLVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFFAFILGEQIINLFLKIFNFQKFDVHIIWMLTMALFGGFIGDSIATLVSSSFYSKGDTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TPSFLSIVTFTIFIPLKFISYHYAGVYGLAFASSIYSLINMSVMFLIIMLRLK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MRSLYLFISSVSNLLFIVLIQLITLIKIGPSSDTDALFAGMTIPSVILSVLVSSLTNVLV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLFVSSKSVLKDLWAQIYLFSIGSAFIVIPLISFSPLWLGCVFSGFDVKTLSLTQHIITV HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHH QFIVIPFSIASAIFTAFFNANSKFISAEAIPAICSLIIFPFIFPAITSYGVLAVTYIYAI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KILMTFVMQIMKIGGPIKLSFNDIDIKGAFSRIKYLILGSVYYKSGPVIDRHILSYSVAG HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH SLSLFVLVQQLLSMANLIFTKTIIIPDITMMNKVAVQDNKIFKHWLMTRVFILFAFGLVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFFAFILGEQIINLFLKIFNFQKFDVHIIWMLTMALFGGFIGDSIATLVSSSFYSKGDTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC TPSFLSIVTFTIFIPLKFISYHYAGVYGLAFASSIYSLINMSVMFLIIMLRLK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA