Definition | Streptococcus pyogenes M1 GAS chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_002737 |
Length | 1,852,441 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 15675912
GI number: 15675912
Start: 1808123
End: 1810396
Strand: Reverse
Name: yhgE [H]
Synonym: SPy_2176
Alternate gene names: 15675912
Gene position: 1810396-1808123 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15675914
Following gene: 15675908
Centisome position: 97.73
GC content: 40.63
Gene sequence:
>2274_bases ATGTTAGAAGAATTGAAAACACTTATTAAAAATCCAAAATTAATGATTACAATGATTGGTGTGGCCCTAGTGCCTGCCTT ATATAATTTATCCTTTCTAGGCTCAATGTGGGATCCTTATGGTCGGGTCAATGACCTTCCCATTGCTGTTGTTAATCATG ATAAGCCTGCAAAGAGAGCTGATAAGTCATTGACAATTGGGAATGATATGGTGGACAAGATGTCTAAAAGTAAAGATTTA GAGTATCATTTTGTCTCAGCTAAGCAAGCTCAAGAGGGACTTAAAGAAGGTGATTATTATATGGTTATTACTTTACCCGA AGATCTTTCTCAACGGGCAGCAACCTTATTAAATCCCGAACCCCAAAAATTAACTATCCGTTACCAAACGAGTAAAGGAC ATGGAATGGTCGCTGCTAAGATGGGGGAAACAGCGATGGCTAAGCTGAAAGAGTCTGTTTCGCAAAACATTACGAAGACT TATACCTCAGCAGTTTTTAGCAGTATGACAGACCTCCAATCAGGATTAAAAGAAGCCTCAGCTGGAAGTCAAGCACTTGC TTCAGGAGCGAAGACTGCTCAGGCGGGGAGTCAAACACTTTCGACGAACTTAGCAGCCTTAACGGGTGCTAGCCAACAGT TTCAACAAGGTACTGGTCGATTGACATCAGGTTTGACTACCTATACAGATGGTGTCAACCAAGTCAAGAATGGGTTAGGA ACATTATCAACGGACATCCCCAATTATCTGAATGGGGTTTCTAGGTTATCCCAGGGAGCTTCTCAGCTTAATCAGGGTCT TTCACAGTTGACACAAGCAACAACACTTTCTGACGAGAAAGCTAAGGGAATTCAATCCTTAATTGTAGGACTACCAGTCC TAAATCAAGGCATTCAGCAACTAAATACAGAGCTATCAACATTGCAACCCCCTAACCTTAATGCTGATGAGTTAGGTAAT AGCTTAGGAGCTATCGCTCAAGCTGCCAAACAAGTCATTGCTGAAGAGACTGCCGCTCAGAATGAAGAATTATCGGCTCT CCAAGCTACTAGCGTTTACCAATCATTAACTGCTGAACAACAAGGAGAGTTAGCTGCGGCCCTCAGTCAATCTGATAAAA GTCAGACCGTATCTGCAGCCCAAACTATTTTAAGTTCTGTTCAAACTTTGTCAACAAGTTTACAGTCTCTCTCTCAAGAA GATCAGTCAAAACAGTTGGAGCAACTTAAGGAAGCTGTTGCACAGATTGCTAATCAATCCAATCAAGCTTTGCCGGGAGC AAGTTCTGCTTTAACTGAATTATCAACGGGATTAGCAAAGGTAAATGGTAGCTTAAATCAACAAGTTCTACCAGGAAGTA ATCAATTGACAACAGGATTAGCACAATTAAACAGGTATAATACTGCCATTGGTTCTGGGGTAATAAAACTCTCAGAAGGT GCCAATGCCTTGTCATCCAAGTCCGGAGAATTACTAGATGGTAGCCATCAATTATCAGAAGGTGCTACTAAACTAGCTGA TGGTAGTTCTCAATTGAGTCAGGGTGGTCATCAATTAACGAGCGGATTGACTGAATTATCAACAGGATTGTCAACCTTAA ATGGTTCCTTAGCCAAAGCCTCTCAGCAGTTATCGCTTGTTTCTGTGACTGATAAAAATGCTAAAGCTGTCGCAAAACCT CTTGTGTTAAATGAGAAAGACAAAGATGGTGTTAAGACGAATGGGATCGGGATGGCACCTTATATGATTGCTGTTTCTCT AATGGTTGTGGCCCTTTCAACCAACGTCATTTTTGCTAATTCTTTATCTGGTCGTCCGGTCAAAGATAAATGGGATTGGG CTAAACAAAAATTTGTTATTAATGGTTTTATTTCGACTATGGGATCCATTGTTCTCTACTTAGCTATTCAATTATTAGGG TTTGAAGCCCGTTATGGTATGGAAACCTTAGGATTTATTATGCTAAGTGGTTGGACGTTTATGGCTCTTGTCACAGCTTT GGTCGGTTGGGATGATCGATATGGCTCTTTTGCTTCTTTGGTCATGTTATTGCTTCAGGTTGGCTCTTCAGGTGGCTCTT ACCCCATTGAGTTAAGTGGAGCATTCTTCCAAAAGTTACATCCTTTCTTACCAATGACTTATGTGGTATCTGGTTTACGA CAAACCATTTCATTATCAGGTCATATTGGAGTAGAAGTGAAAGTCTTAACTGGTTTCTTACTGGCATTTATGGTATTAGC ACTACTCATTTATCGTCCCAAGAAAACAGTCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTCCAAAAGTGAATTTTTTTCTCTTGTAAATTTAAATTTAAATTGTATAATATATTTTATCATAATTTTTGAACAGTA TGTCCATTTTAGGAGAAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAAAATAACCTCAAAAAAAAAACAGCATCTAAGGCAGTTACACTAGATGCTGTTTTTTGTCTTATTTTGACAATAACTT GACAATTTCTGTCAAGTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 757; Mature: 757
Protein sequence:
>757_residues MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRADKSLTIGNDMVDKMSKSKDL EYHFVSAKQAQEGLKEGDYYMVITLPEDLSQRAATLLNPEPQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKT YTSAVFSSMTDLQSGLKEASAGSQALASGAKTAQAGSQTLSTNLAALTGASQQFQQGTGRLTSGLTTYTDGVNQVKNGLG TLSTDIPNYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQATTLSDEKAKGIQSLIVGLPVLNQGIQQLNTELSTLQPPNLNADELGN SLGAIAQAAKQVIAEETAAQNEELSALQATSVYQSLTAEQQGELAAALSQSDKSQTVSAAQTILSSVQTLSTSLQSLSQE DQSKQLEQLKEAVAQIANQSNQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSTLNGSLAKASQQLSLVSVTDKNAKAVAKP LVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFANSLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLG FEARYGMETLGFIMLSGWTFMALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLALLIYRPKKTV
Sequences:
>Translated_757_residues MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRADKSLTIGNDMVDKMSKSKDL EYHFVSAKQAQEGLKEGDYYMVITLPEDLSQRAATLLNPEPQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKT YTSAVFSSMTDLQSGLKEASAGSQALASGAKTAQAGSQTLSTNLAALTGASQQFQQGTGRLTSGLTTYTDGVNQVKNGLG TLSTDIPNYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQATTLSDEKAKGIQSLIVGLPVLNQGIQQLNTELSTLQPPNLNADELGN SLGAIAQAAKQVIAEETAAQNEELSALQATSVYQSLTAEQQGELAAALSQSDKSQTVSAAQTILSSVQTLSTSLQSLSQE DQSKQLEQLKEAVAQIANQSNQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSTLNGSLAKASQQLSLVSVTDKNAKAVAKP LVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFANSLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLG FEARYGMETLGFIMLSGWTFMALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLALLIYRPKKTV >Mature_757_residues MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRADKSLTIGNDMVDKMSKSKDL EYHFVSAKQAQEGLKEGDYYMVITLPEDLSQRAATLLNPEPQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKT YTSAVFSSMTDLQSGLKEASAGSQALASGAKTAQAGSQTLSTNLAALTGASQQFQQGTGRLTSGLTTYTDGVNQVKNGLG TLSTDIPNYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQATTLSDEKAKGIQSLIVGLPVLNQGIQQLNTELSTLQPPNLNADELGN SLGAIAQAAKQVIAEETAAQNEELSALQATSVYQSLTAEQQGELAAALSQSDKSQTVSAAQTILSSVQTLSTSLQSLSQE DQSKQLEQLKEAVAQIANQSNQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSTLNGSLAKASQQLSLVSVTDKNAKAVAKP LVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFANSLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLG FEARYGMETLGFIMLSGWTFMALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLALLIYRPKKTV
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80050; Mature: 80050
Theoretical pI: Translated: 7.85; Mature: 7.85
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRA CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHC DKSLTIGNDMVDKMSKSKDLEYHFVSAKQAQEGLKEGDYYMVITLPEDLSQRAATLLNPE CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCC PQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKTYTSAVFSSMTDLQSGLKEAS CCEEEEEEECCCCCCEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC AGSQALASGAKTAQAGSQTLSTNLAALTGASQQFQQGTGRLTSGLTTYTDGVNQVKNGLG CCHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHC TLSTDIPNYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQATTLSDEKAKGIQSLIVGLPVLNQGIQQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNTELSTLQPPNLNADELGNSLGAIAQAAKQVIAEETAAQNEELSALQATSVYQSLTAEQ HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGELAAALSQSDKSQTVSAAQTILSSVQTLSTSLQSLSQEDQSKQLEQLKEAVAQIANQS HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCC ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSTLNGSLAKA CCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH SQQLSLVSVTDKNAKAVAKPLVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFAN HHHEEEEEECCCCHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE SLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLGFEARYGMETLGFIMLSGWTF CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH MALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLALLIYRPKKTV HHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MLEELKTLIKNPKLMITMIGVALVPALYNLSFLGSMWDPYGRVNDLPIAVVNHDKPAKRA CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCCHHHC DKSLTIGNDMVDKMSKSKDLEYHFVSAKQAQEGLKEGDYYMVITLPEDLSQRAATLLNPE CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCC PQKLTIRYQTSKGHGMVAAKMGETAMAKLKESVSQNITKTYTSAVFSSMTDLQSGLKEAS CCEEEEEEECCCCCCEEEEHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC AGSQALASGAKTAQAGSQTLSTNLAALTGASQQFQQGTGRLTSGLTTYTDGVNQVKNGLG CCHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHC TLSTDIPNYLNGVSRLSQGASQLNQGLSQLTQATTLSDEKAKGIQSLIVGLPVLNQGIQQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LNTELSTLQPPNLNADELGNSLGAIAQAAKQVIAEETAAQNEELSALQATSVYQSLTAEQ HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGELAAALSQSDKSQTVSAAQTILSSVQTLSTSLQSLSQEDQSKQLEQLKEAVAQIANQS HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NQALPGASSALTELSTGLAKVNGSLNQQVLPGSNQLTTGLAQLNRYNTAIGSGVIKLSEG CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCC ANALSSKSGELLDGSHQLSEGATKLADGSSQLSQGGHQLTSGLTELSTGLSTLNGSLAKA CCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH SQQLSLVSVTDKNAKAVAKPLVLNEKDKDGVKTNGIGMAPYMIAVSLMVVALSTNVIFAN HHHEEEEEECCCCHHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE SLSGRPVKDKWDWAKQKFVINGFISTMGSIVLYLAIQLLGFEARYGMETLGFIMLSGWTF CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH MALVTALVGWDDRYGSFASLVMLLLQVGSSGGSYPIELSGAFFQKLHPFLPMTYVVSGLR HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH QTISLSGHIGVEVKVLTGFLLAFMVLALLIYRPKKTV HHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]