| Definition | Streptococcus pyogenes M1 GAS chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002737 |
| Length | 1,852,441 |
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The map label for this gene is ppc
Identifier: 15674689
GI number: 15674689
Start: 487642
End: 490404
Strand: Direct
Name: ppc
Synonym: SPy_0608
Alternate gene names: 15674689
Gene position: 487642-490404 (Clockwise)
Preceding gene: 15674686
Following gene: 15674690
Centisome position: 26.32
GC content: 39.02
Gene sequence:
>2763_bases TTGCCACTTAAAAAGTTAGAGAGTAGTAACAATCAAGATATCATTGCTGAAGAAGTTGCTCTTTTGAAAGAAATGTTGGA AAATATCACACGACGGATGATTGGAGATGATGCGTTTACAGTTATCGAGTCTATTATGGTGTTATCTGAAAAACAAGATT ACATAGAATTAGAAAAAGTTGTCGCCAATATTTCAAATCAAGAAATGGAAGTGATTTCCAGGTATTTTTCTATTTTACCC TTGCTAATCAATATTTCAGAAGATGTCGATTTAGCCTATGAAATCAATTATCAAAATAATACGGATACTGATTATTTAGG AAAATTAGCCCTAACCATCAAGGATCTTGCTGGAAAAGATAATGGTAAAGACATTTTGGAGCAGGTTAATGTGGTTCCTG TTTTAACAGCACATCCGACGCAAGTACAACGTAAAACGATTCTGGAATTGACAACTCACATTCATAAACTTCTGCGCAAA TACCGTGATGCTAAGGCTGGTGTGATTAATCTTGAGAAATGGCGTCAGGAGCTATATCGTTATATTGAAATGATCATGCA GACAGATATTATTCGCGAGAAAAAGCTTCAGGTGAAAAACGAGATAAAAAATGTCATGCAGTATTACGATGGTTCTCTCA TTCAAGCAGTGACCAAGTTGACAACAGAGTACAAAAACTTAGCCCAAAAACACGGTCTAGAGTTAGACAATCCCAAACCC ATTACCATGGGGATGTGGATTGGTGGGGACCGTGATGGGAACCCCTTTGTCACAGCTGAAACCTTGTGCTTGTCAGCTAC GGTTCAAAGTGAGGTTATCCTCAATTACTACATTGACGAATTAGCAGCCCTTTACCGAACATTTTCACTGTCGTCAACCT TGGTACAACCCAACTCGGAAGTGGAACGTTTAGCCAGTTTGTCTCAGGACCAATCGATTTACCGTGGAAATGAACCTTAT CGCAGAGCTTTTCATTATATTCAATCGCGTCTTAAACAAACACAAATTCAACTAACTAATCAGCCAGCAGCTAGTATGAG TAGTAGTGTGGGACTAAACACATCTGCTTGGTCCTCACCAGCTAGTTTAGAAAATCCCATCTTAGCCTATGACTCTCCTG TTGATTTTAAAGCTGATTTAAAGGCTATTGAGCAGTCGCTACTTGATAATGGCAACTCCGCTTTGATTGAGGGGGATTTG CGAGAAGTCATGCAAGCTGTTGATATTTTTGGCTTCTTCTTAGCAAGCATTGACATGAGGCAAGACTCCAGTGTCCAAGA AGCTTGTGTGGCAGAGTTATTAAAAGGAGCCAATATTGTTGACGATTATAGCTCTCTTTCAGAAACTGAAAAATGCGATG TTCTCTTACAACAATTAATGGAGGAGCCAAGGACTTTATCCTCAGCGGCAGTTGCTAAATCAGACCTATTGGAAAAAGAA CTGGCTATCTATACTACGGCACGAGAATTGAAAGATAAGCTTGGAGAAGAGGTTATTAAACAACATATTATTTCACATAC AGAAAGTGTCTCTGATATGTTTGAGTTGGCCATCATGCTTAAAGAAGTGGGATTGGTTGACCAGCAGCGGGCTCGTGTGC AAATTGTTCCCCTCTTTGAAACCATTGAGGATTTAGATAATGCCCGTGACATCATGGCAGCCTATTTAAGCCATGACATT GTCAAATCTTGGATTGCAACGAATCGTAATTACCAAGAAATCATGTTAGGTTATTCTGACAGTAATAAAGATGGTGGCTA CTTGGCATCGGGTTGGACTCTTTATAAAGCTCAGAATGAATTAACGGCTATTGGTGAGGAACATGGAGTGAAGATCACCT TCTTCCATGGTCGTGGAGGAACAGTTGGTCGAGGAGGTGGCCCTTCTTATGATGCCATTACTTCACAACCTTTTGGTTCC ATCAAAGATCGGATTCGTCTGACAGAGCAAGGGGAAATTATTGAAAACAAATACGGCAATAAAGATGTGGCTTATTACCA TTTAGAAATGTTGATTTCAGCTTCTATCAATCGTATGGTGACTCAAATGATAACAGATCCTAATGAGATTGATAGTTTTC GAGAAATCATGGATAGCATTGTTGCTGATAGCAATATCATTTATCGAAAATTGGTTTTTGACAATCCCCATTTCTATGAT TATTTCTTTGAGGCAAGTCCGATTAAGGAAGTTTCCAGTCTCAACATTGGGTCAAGACCAGCGGCCCGTAAAACGATTAC GGAAATTACAGGCTTGCGTGCCATTCCTTGGGTCTTTTCATGGTCACAAAATCGCATCATGTTTCCAGGTTGGTATGGGG TAGGTTCAGCCTTTAAACGTTATATTGACCGAGCACAAGGTAACCTTGAACGCCTCCAACATATGTATCAGACGTGGCCT TTTTTCCATTCCTTGTTATCAAATGTTGATATGGTATTATCTAAATCAAACATGAATATTGCCTTTCAGTATGCACAACT AGCTGAAAGGCAGGATGTTCGAGATGTTTTTTATGAGATTTTGGATGAGTGGCAATTGACAAAAAATGTTATTCTTGCTA TCCAAGACCATGATGATCTATTGGAGGATAATCCTTCCCTTAAGCATAGCTTGAAATCACGCTTGCCGTATTTTAATGTG TTGAACTATATTCAAATTGAATTGATTAAACGTTGGCGTAATAATCAACTTGACGAAAATGATGAAAAATTGATCCATAC AACTATCAATGGCATAGCGACTGGTTTACGTAATTCAGGCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCTTACTTTTGTTAAAAAACAAACGTTATGAACATGATCACTTTTATTTTTGGTAAAAAGTGGTATGATAGAAGAAACTA GCAAAGAAGGAGATGGTCAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGCTCTTGAGTATTAATTGGTATTTATAGAAGTTTTCAAGTGACTAATCAGAATTTTAAAGGTTAGCCCTTGGAGCTTCT TTTTTTGAGGATTCTTGACT
Product: phosphoenolpyruvate carboxylase
Products: NA
Alternate protein names: PEPC; PEPCase
Number of amino acids: Translated: 920; Mature: 919
Protein sequence:
>920_residues MPLKKLESSNNQDIIAEEVALLKEMLENITRRMIGDDAFTVIESIMVLSEKQDYIELEKVVANISNQEMEVISRYFSILP LLINISEDVDLAYEINYQNNTDTDYLGKLALTIKDLAGKDNGKDILEQVNVVPVLTAHPTQVQRKTILELTTHIHKLLRK YRDAKAGVINLEKWRQELYRYIEMIMQTDIIREKKLQVKNEIKNVMQYYDGSLIQAVTKLTTEYKNLAQKHGLELDNPKP ITMGMWIGGDRDGNPFVTAETLCLSATVQSEVILNYYIDELAALYRTFSLSSTLVQPNSEVERLASLSQDQSIYRGNEPY RRAFHYIQSRLKQTQIQLTNQPAASMSSSVGLNTSAWSSPASLENPILAYDSPVDFKADLKAIEQSLLDNGNSALIEGDL REVMQAVDIFGFFLASIDMRQDSSVQEACVAELLKGANIVDDYSSLSETEKCDVLLQQLMEEPRTLSSAAVAKSDLLEKE LAIYTTARELKDKLGEEVIKQHIISHTESVSDMFELAIMLKEVGLVDQQRARVQIVPLFETIEDLDNARDIMAAYLSHDI VKSWIATNRNYQEIMLGYSDSNKDGGYLASGWTLYKAQNELTAIGEEHGVKITFFHGRGGTVGRGGGPSYDAITSQPFGS IKDRIRLTEQGEIIENKYGNKDVAYYHLEMLISASINRMVTQMITDPNEIDSFREIMDSIVADSNIIYRKLVFDNPHFYD YFFEASPIKEVSSLNIGSRPAARKTITEITGLRAIPWVFSWSQNRIMFPGWYGVGSAFKRYIDRAQGNLERLQHMYQTWP FFHSLLSNVDMVLSKSNMNIAFQYAQLAERQDVRDVFYEILDEWQLTKNVILAIQDHDDLLEDNPSLKHSLKSRLPYFNV LNYIQIELIKRWRNNQLDENDEKLIHTTINGIATGLRNSG
Sequences:
>Translated_920_residues MPLKKLESSNNQDIIAEEVALLKEMLENITRRMIGDDAFTVIESIMVLSEKQDYIELEKVVANISNQEMEVISRYFSILP LLINISEDVDLAYEINYQNNTDTDYLGKLALTIKDLAGKDNGKDILEQVNVVPVLTAHPTQVQRKTILELTTHIHKLLRK YRDAKAGVINLEKWRQELYRYIEMIMQTDIIREKKLQVKNEIKNVMQYYDGSLIQAVTKLTTEYKNLAQKHGLELDNPKP ITMGMWIGGDRDGNPFVTAETLCLSATVQSEVILNYYIDELAALYRTFSLSSTLVQPNSEVERLASLSQDQSIYRGNEPY RRAFHYIQSRLKQTQIQLTNQPAASMSSSVGLNTSAWSSPASLENPILAYDSPVDFKADLKAIEQSLLDNGNSALIEGDL REVMQAVDIFGFFLASIDMRQDSSVQEACVAELLKGANIVDDYSSLSETEKCDVLLQQLMEEPRTLSSAAVAKSDLLEKE LAIYTTARELKDKLGEEVIKQHIISHTESVSDMFELAIMLKEVGLVDQQRARVQIVPLFETIEDLDNARDIMAAYLSHDI VKSWIATNRNYQEIMLGYSDSNKDGGYLASGWTLYKAQNELTAIGEEHGVKITFFHGRGGTVGRGGGPSYDAITSQPFGS IKDRIRLTEQGEIIENKYGNKDVAYYHLEMLISASINRMVTQMITDPNEIDSFREIMDSIVADSNIIYRKLVFDNPHFYD YFFEASPIKEVSSLNIGSRPAARKTITEITGLRAIPWVFSWSQNRIMFPGWYGVGSAFKRYIDRAQGNLERLQHMYQTWP FFHSLLSNVDMVLSKSNMNIAFQYAQLAERQDVRDVFYEILDEWQLTKNVILAIQDHDDLLEDNPSLKHSLKSRLPYFNV LNYIQIELIKRWRNNQLDENDEKLIHTTINGIATGLRNSG >Mature_919_residues PLKKLESSNNQDIIAEEVALLKEMLENITRRMIGDDAFTVIESIMVLSEKQDYIELEKVVANISNQEMEVISRYFSILPL LINISEDVDLAYEINYQNNTDTDYLGKLALTIKDLAGKDNGKDILEQVNVVPVLTAHPTQVQRKTILELTTHIHKLLRKY RDAKAGVINLEKWRQELYRYIEMIMQTDIIREKKLQVKNEIKNVMQYYDGSLIQAVTKLTTEYKNLAQKHGLELDNPKPI TMGMWIGGDRDGNPFVTAETLCLSATVQSEVILNYYIDELAALYRTFSLSSTLVQPNSEVERLASLSQDQSIYRGNEPYR RAFHYIQSRLKQTQIQLTNQPAASMSSSVGLNTSAWSSPASLENPILAYDSPVDFKADLKAIEQSLLDNGNSALIEGDLR EVMQAVDIFGFFLASIDMRQDSSVQEACVAELLKGANIVDDYSSLSETEKCDVLLQQLMEEPRTLSSAAVAKSDLLEKEL AIYTTARELKDKLGEEVIKQHIISHTESVSDMFELAIMLKEVGLVDQQRARVQIVPLFETIEDLDNARDIMAAYLSHDIV KSWIATNRNYQEIMLGYSDSNKDGGYLASGWTLYKAQNELTAIGEEHGVKITFFHGRGGTVGRGGGPSYDAITSQPFGSI KDRIRLTEQGEIIENKYGNKDVAYYHLEMLISASINRMVTQMITDPNEIDSFREIMDSIVADSNIIYRKLVFDNPHFYDY FFEASPIKEVSSLNIGSRPAARKTITEITGLRAIPWVFSWSQNRIMFPGWYGVGSAFKRYIDRAQGNLERLQHMYQTWPF FHSLLSNVDMVLSKSNMNIAFQYAQLAERQDVRDVFYEILDEWQLTKNVILAIQDHDDLLEDNPSLKHSLKSRLPYFNVL NYIQIELIKRWRNNQLDENDEKLIHTTINGIATGLRNSG
Specific function: Through the carboxylation of phosphoenolpyruvate (PEP) it forms oxaloacetate, a four-carbon dicarboxylic acid source for the tricarboxylic acid cycle
COG id: COG2352
COG function: function code C; Phosphoenolpyruvate carboxylase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the PEPCase type 1 family
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790393, Length=933, Percent_Identity=29.5819935691318, Blast_Score=358, Evalue=1e-99,
Paralogues:
None
Copy number: 3,500 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]
Swissprot (AC and ID): CAPP_STRP1 (Q9A0U7)
Other databases:
- EMBL: AE004092 - EMBL: CP000017 - RefSeq: NP_268863.1 - RefSeq: YP_281868.1 - ProteinModelPortal: Q9A0U7 - SMR: Q9A0U7 - EnsemblBacteria: EBSTRT00000000021 - EnsemblBacteria: EBSTRT00000027885 - GeneID: 3572404 - GeneID: 900815 - GenomeReviews: AE004092_GR - GenomeReviews: CP000017_GR - KEGG: spy:SPy_0608 - KEGG: spz:M5005_Spy_0505 - GeneTree: EBGT00050000028190 - HOGENOM: HBG351035 - OMA: AIPWVFG - ProtClustDB: PRK00009 - BioCyc: SPYO160490:SPY0608-MONOMER - BioCyc: SPYO293653:M5005_SPY0505-MONOMER - HAMAP: MF_00595 - InterPro: IPR021135 - InterPro: IPR018129 - InterPro: IPR022805 - InterPro: IPR015813 - PRINTS: PR00150
Pfam domain/function: PF00311 PEPcase; SSF51621 Pyrv/PenolPyrv_Kinase_cat
EC number: =4.1.1.31
Molecular weight: Translated: 104753; Mature: 104622
Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80
Prosite motif: PS00781 PEPCASE_1; PS00393 PEPCASE_2
Important sites: ACT_SITE 138-138 ACT_SITE 583-583
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPLKKLESSNNQDIIAEEVALLKEMLENITRRMIGDDAFTVIESIMVLSEKQDYIELEKV CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH VANISNQEMEVISRYFSILPLLINISEDVDLAYEINYQNNTDTDYLGKLALTIKDLAGKD HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC NGKDILEQVNVVPVLTAHPTQVQRKTILELTTHIHKLLRKYRDAKAGVINLEKWRQELYR CCHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHH YIEMIMQTDIIREKKLQVKNEIKNVMQYYDGSLIQAVTKLTTEYKNLAQKHGLELDNPKP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC ITMGMWIGGDRDGNPFVTAETLCLSATVQSEVILNYYIDELAALYRTFSLSSTLVQPNSE EEEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH VERLASLSQDQSIYRGNEPYRRAFHYIQSRLKQTQIQLTNQPAASMSSSVGLNTSAWSSP HHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCC ASLENPILAYDSPVDFKADLKAIEQSLLDNGNSALIEGDLREVMQAVDIFGFFLASIDMR CCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC QDSSVQEACVAELLKGANIVDDYSSLSETEKCDVLLQQLMEEPRTLSSAAVAKSDLLEKE CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LAIYTTARELKDKLGEEVIKQHIISHTESVSDMFELAIMLKEVGLVDQQRARVQIVPLFE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHH TIEDLDNARDIMAAYLSHDIVKSWIATNRNYQEIMLGYSDSNKDGGYLASGWTLYKAQNE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEECCCCCCCCCEEECCEEEEECCCH LTAIGEEHGVKITFFHGRGGTVGRGGGPSYDAITSQPFGSIKDRIRLTEQGEIIENKYGN HHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHEEECCCCCHHHHCCCC KDVAYYHLEMLISASINRMVTQMITDPNEIDSFREIMDSIVADSNIIYRKLVFDNPHFYD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEE YFFEASPIKEVSSLNIGSRPAARKTITEITGLRAIPWVFSWSQNRIMFPGWYGVGSAFKR EEECCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHCCHHEECCCCCEECCCCCCHHHHHHH YIDRAQGNLERLQHMYQTWPFFHSLLSNVDMVLSKSNMNIAFQYAQLAERQDVRDVFYEI HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDEWQLTKNVILAIQDHDDLLEDNPSLKHSLKSRLPYFNVLNYIQIELIKRWRNNQLDEN HHHHHHCCCEEEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DEKLIHTTINGIATGLRNSG CHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure PLKKLESSNNQDIIAEEVALLKEMLENITRRMIGDDAFTVIESIMVLSEKQDYIELEKV CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH VANISNQEMEVISRYFSILPLLINISEDVDLAYEINYQNNTDTDYLGKLALTIKDLAGKD HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC NGKDILEQVNVVPVLTAHPTQVQRKTILELTTHIHKLLRKYRDAKAGVINLEKWRQELYR CCHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHH YIEMIMQTDIIREKKLQVKNEIKNVMQYYDGSLIQAVTKLTTEYKNLAQKHGLELDNPKP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC ITMGMWIGGDRDGNPFVTAETLCLSATVQSEVILNYYIDELAALYRTFSLSSTLVQPNSE EEEEEEECCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH VERLASLSQDQSIYRGNEPYRRAFHYIQSRLKQTQIQLTNQPAASMSSSVGLNTSAWSSP HHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCC ASLENPILAYDSPVDFKADLKAIEQSLLDNGNSALIEGDLREVMQAVDIFGFFLASIDMR CCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC QDSSVQEACVAELLKGANIVDDYSSLSETEKCDVLLQQLMEEPRTLSSAAVAKSDLLEKE CCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LAIYTTARELKDKLGEEVIKQHIISHTESVSDMFELAIMLKEVGLVDQQRARVQIVPLFE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHH TIEDLDNARDIMAAYLSHDIVKSWIATNRNYQEIMLGYSDSNKDGGYLASGWTLYKAQNE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEECCCCCCCCCEEECCEEEEECCCH LTAIGEEHGVKITFFHGRGGTVGRGGGPSYDAITSQPFGSIKDRIRLTEQGEIIENKYGN HHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHEEECCCCCHHHHCCCC KDVAYYHLEMLISASINRMVTQMITDPNEIDSFREIMDSIVADSNIIYRKLVFDNPHFYD CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEE YFFEASPIKEVSSLNIGSRPAARKTITEITGLRAIPWVFSWSQNRIMFPGWYGVGSAFKR EEECCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHCCHHEECCCCCEECCCCCCHHHHHHH YIDRAQGNLERLQHMYQTWPFFHSLLSNVDMVLSKSNMNIAFQYAQLAERQDVRDVFYEI HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDEWQLTKNVILAIQDHDDLLEDNPSLKHSLKSRLPYFNVLNYIQIELIKRWRNNQLDEN HHHHHHCCCEEEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DEKLIHTTINGIATGLRNSG CHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11296296