Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ysaB

Identifier: 15673731

GI number: 15673731

Start: 1806775

End: 1808778

Strand: Reverse

Name: ysaB

Synonym: L190126

Alternate gene names: 15673731

Gene position: 1808778-1806775 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15673732

Following gene: 15673730

Centisome position: 76.46

GC content: 32.34

Gene sequence:

>2004_bases
ATGCTTAGTTTAAAACTTGCGGCCAATAACATCAAAAAGGGATTTAAAAGTTTTGCACCTTTTTTAATGGCCTCAGTTAC
GATGTTCGTAATGATTTTCGTCACAGCATCAATCGCTTTATCTCCCTCTATTAGTAAATTAAAAGGAGGGAGTTCTCTTT
CACAAGTGATGGGATTTGCATTGATTGTTTTATCTATTTTTGCAGTTCTTATCTTAGTTTATAGTTATCGCTTTTTACAA
ACTCAGCGCTCTAAAGAATTTGGACTTTATGATATTCTTGGCTTTGGTAAAACAAGAATTGTAGGAGTCGCATTTTTAGA
ATTACTCTTAAGCTATATCATTACGGTTATTGTTGGAACGATTTGTGGGATTGCTTTTTCAAAATTTCTCTTCTTAGTGT
TTGTAAATATGATTGGAGGAAATTATTTTAATCTAGTCATTAGTCCCACAGCAATTTTATTACTTGCCATTCTCTTCTTT
GTTTTCTTTTTAGTTTTAATGATGATCGGAGTTTGGATTATCTGGCGTTCTTCAAGTCTTGATCTTCTAAGAGAAGAGTC
AAAAGGTGAAAAAGAACCAAAATCAAATTTATTTTTCGCCATTGCCGCAGTCATTCTTTTAGGAGCTGGTTACTATATCG
CTTTAACGGTTGAAGACCCAATGGCAGCAATAATGAAATTCTTTATTGCCGTTTTACTTGTTATCTTTGGTACTTATCTT
TTCTATATTAGTTTTACCGTTTGGTACCTTAAATTGAAAAAGAAACGTCCAAGTTACTATAAACCAAATAATTTCATTAC
AACAAGTTCTATGCTTTATCGAATGAAAGCAAATGCTGTTGGTCTAGGGAATATCACTATTTTGTTATCTATGACAATCG
TGACCGTAGTTGTCAGTTTAGGTGTTTTTCTTGGAACTGAGAACTCAGTAAAAACCTACTATACCCGAGAAGCAAAGACT
TATTCGGTTGCAAATAATACGGATGTAAAACAAGACATTGAACGAATTAAAAGTGCCGCAGCTAGCAAAAATATAGAAAT
CAAAAATCTATCTGATATGTACTATGCTCAAGATTTACAAGCCGATAGAGTCAAGTCGTCTAAAGATCAATTTATTACTT
CAAATAAGCAAGGAGTGATGTTTGATAAAAATTCATATTTTGCGACCTTAACAACTGCTCAAACACTTAAATCTTTAGGA
AATAAAGATATTCCTTCTTTAAAAGACAATCAAGTCTTACTTGTGGACATATCGAAAAATAAAACGTCATTTGATAGTAA
GATAAAATCAATTCAATGGTATGGAGAGACTTATCAAGTTGCTGACACGCTTAATTCTGTTAAAGATTTTCCATCAAGCA
GTGTTGTAACGGTTTCTTCTAAGGTTATGATGATTGTCTTTGCTAATAATCAAGCTTTTGATAAAGGACTCGCTAATTAC
AATAAAACAATTAGTGATGATCAAGGATTTTCAAATCTTGCATCAACATCAATCATCTTTGATATCAAACCTGTTGATGA
AAAAAGATTTACTAAAGCTTTCAAGGAAGAGTTTAAAGATAATAAAGATTTATCGATTTCATATAGAAGTGAAGCTTTGC
AAGATCAGCGCGCTCAAATTGGAGGATTTGTCTTTGTTGGTTTTGTTTTAGGAATTAGTTTGATTCTTGGAGCTGCATTA
ATTATCTACTACAAGCAACTCTCAGAAGGGGCACAAGATAAACGCTCATTCAAAATTTTACAGGAAGTGGGACTTTCAAA
AGAAGAAGTTCAAAAAACAATCAAATCACAAGTTCGTTTGATATTCTTCCTACCATTAGTTATCACTATCGCCCATTTTG
CTGGTGCATATTTAATGATTGAAAAAATAATAATGTTGTTTGACATTAATGACCGCTCAGTTATTTTTACTATTTCCTTA
GCAACAATTGCAATCCTTGCAATTATTTACTACCTCATCTATAAGGCAACGAGTCGTGTTTACTACAAAATTGTTGAAAG
ATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTATCGTGGTGAAAAAAGCTCAACTGAATTTGCAAAAGAAATTACTCTTTCAATGATTGCTTTCTTGGGAGCATCAGA
GGATGAGGAGGTGTCCTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAGAAGGCATAAATATGCCTCTTTTTTTGTTTAAATCCATATAGAAGAAACAAGGGAAGGAAAAAGCTACAAAAGAGA
GCTACTTTTGATATAATAAA

Product: ABC transporter permease and substrate binding protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 667; Mature: 667

Protein sequence:

>667_residues
MLSLKLAANNIKKGFKSFAPFLMASVTMFVMIFVTASIALSPSISKLKGGSSLSQVMGFALIVLSIFAVLILVYSYRFLQ
TQRSKEFGLYDILGFGKTRIVGVAFLELLLSYIITVIVGTICGIAFSKFLFLVFVNMIGGNYFNLVISPTAILLLAILFF
VFFLVLMMIGVWIIWRSSSLDLLREESKGEKEPKSNLFFAIAAVILLGAGYYIALTVEDPMAAIMKFFIAVLLVIFGTYL
FYISFTVWYLKLKKKRPSYYKPNNFITTSSMLYRMKANAVGLGNITILLSMTIVTVVVSLGVFLGTENSVKTYYTREAKT
YSVANNTDVKQDIERIKSAAASKNIEIKNLSDMYYAQDLQADRVKSSKDQFITSNKQGVMFDKNSYFATLTTAQTLKSLG
NKDIPSLKDNQVLLVDISKNKTSFDSKIKSIQWYGETYQVADTLNSVKDFPSSSVVTVSSKVMMIVFANNQAFDKGLANY
NKTISDDQGFSNLASTSIIFDIKPVDEKRFTKAFKEEFKDNKDLSISYRSEALQDQRAQIGGFVFVGFVLGISLILGAAL
IIYYKQLSEGAQDKRSFKILQEVGLSKEEVQKTIKSQVRLIFFLPLVITIAHFAGAYLMIEKIIMLFDINDRSVIFTISL
ATIAILAIIYYLIYKATSRVYYKIVER

Sequences:

>Translated_667_residues
MLSLKLAANNIKKGFKSFAPFLMASVTMFVMIFVTASIALSPSISKLKGGSSLSQVMGFALIVLSIFAVLILVYSYRFLQ
TQRSKEFGLYDILGFGKTRIVGVAFLELLLSYIITVIVGTICGIAFSKFLFLVFVNMIGGNYFNLVISPTAILLLAILFF
VFFLVLMMIGVWIIWRSSSLDLLREESKGEKEPKSNLFFAIAAVILLGAGYYIALTVEDPMAAIMKFFIAVLLVIFGTYL
FYISFTVWYLKLKKKRPSYYKPNNFITTSSMLYRMKANAVGLGNITILLSMTIVTVVVSLGVFLGTENSVKTYYTREAKT
YSVANNTDVKQDIERIKSAAASKNIEIKNLSDMYYAQDLQADRVKSSKDQFITSNKQGVMFDKNSYFATLTTAQTLKSLG
NKDIPSLKDNQVLLVDISKNKTSFDSKIKSIQWYGETYQVADTLNSVKDFPSSSVVTVSSKVMMIVFANNQAFDKGLANY
NKTISDDQGFSNLASTSIIFDIKPVDEKRFTKAFKEEFKDNKDLSISYRSEALQDQRAQIGGFVFVGFVLGISLILGAAL
IIYYKQLSEGAQDKRSFKILQEVGLSKEEVQKTIKSQVRLIFFLPLVITIAHFAGAYLMIEKIIMLFDINDRSVIFTISL
ATIAILAIIYYLIYKATSRVYYKIVER
>Mature_667_residues
MLSLKLAANNIKKGFKSFAPFLMASVTMFVMIFVTASIALSPSISKLKGGSSLSQVMGFALIVLSIFAVLILVYSYRFLQ
TQRSKEFGLYDILGFGKTRIVGVAFLELLLSYIITVIVGTICGIAFSKFLFLVFVNMIGGNYFNLVISPTAILLLAILFF
VFFLVLMMIGVWIIWRSSSLDLLREESKGEKEPKSNLFFAIAAVILLGAGYYIALTVEDPMAAIMKFFIAVLLVIFGTYL
FYISFTVWYLKLKKKRPSYYKPNNFITTSSMLYRMKANAVGLGNITILLSMTIVTVVVSLGVFLGTENSVKTYYTREAKT
YSVANNTDVKQDIERIKSAAASKNIEIKNLSDMYYAQDLQADRVKSSKDQFITSNKQGVMFDKNSYFATLTTAQTLKSLG
NKDIPSLKDNQVLLVDISKNKTSFDSKIKSIQWYGETYQVADTLNSVKDFPSSSVVTVSSKVMMIVFANNQAFDKGLANY
NKTISDDQGFSNLASTSIIFDIKPVDEKRFTKAFKEEFKDNKDLSISYRSEALQDQRAQIGGFVFVGFVLGISLILGAAL
IIYYKQLSEGAQDKRSFKILQEVGLSKEEVQKTIKSQVRLIFFLPLVITIAHFAGAYLMIEKIIMLFDINDRSVIFTISL
ATIAILAIIYYLIYKATSRVYYKIVER

Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74777; Mature: 74777

Theoretical pI: Translated: 10.02; Mature: 10.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLSLKLAANNIKKGFKSFAPFLMASVTMFVMIFVTASIALSPSISKLKGGSSLSQVMGFA
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHH
LIVLSIFAVLILVYSYRFLQTQRSKEFGLYDILGFGKTRIVGVAFLELLLSYIITVIVGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICGIAFSKFLFLVFVNMIGGNYFNLVISPTAILLLAILFFVFFLVLMMIGVWIIWRSSSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
DLLREESKGEKEPKSNLFFAIAAVILLGAGYYIALTVEDPMAAIMKFFIAVLLVIFGTYL
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYISFTVWYLKLKKKRPSYYKPNNFITTSSMLYRMKANAVGLGNITILLSMTIVTVVVSL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVFLGTENSVKTYYTREAKTYSVANNTDVKQDIERIKSAAASKNIEIKNLSDMYYAQDLQ
HHHHCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHCC
ADRVKSSKDQFITSNKQGVMFDKNSYFATLTTAQTLKSLGNKDIPSLKDNQVLLVDISKN
HHHHCCCCHHHEECCCCCEEEECCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
KTSFDSKIKSIQWYGETYQVADTLNSVKDFPSSSVVTVSSKVMMIVFANNQAFDKGLANY
CCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHC
NKTISDDQGFSNLASTSIIFDIKPVDEKRFTKAFKEEFKDNKDLSISYRSEALQDQRAQI
CCCCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
GGFVFVGFVLGISLILGAALIIYYKQLSEGAQDKRSFKILQEVGLSKEEVQKTIKSQVRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
IFFLPLVITIAHFAGAYLMIEKIIMLFDINDRSVIFTISLATIAILAIIYYLIYKATSRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYKIVER
HHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MLSLKLAANNIKKGFKSFAPFLMASVTMFVMIFVTASIALSPSISKLKGGSSLSQVMGFA
CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHH
LIVLSIFAVLILVYSYRFLQTQRSKEFGLYDILGFGKTRIVGVAFLELLLSYIITVIVGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ICGIAFSKFLFLVFVNMIGGNYFNLVISPTAILLLAILFFVFFLVLMMIGVWIIWRSSSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
DLLREESKGEKEPKSNLFFAIAAVILLGAGYYIALTVEDPMAAIMKFFIAVLLVIFGTYL
HHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYISFTVWYLKLKKKRPSYYKPNNFITTSSMLYRMKANAVGLGNITILLSMTIVTVVVSL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVFLGTENSVKTYYTREAKTYSVANNTDVKQDIERIKSAAASKNIEIKNLSDMYYAQDLQ
HHHHCCCCCCEEEEECCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHCC
ADRVKSSKDQFITSNKQGVMFDKNSYFATLTTAQTLKSLGNKDIPSLKDNQVLLVDISKN
HHHHCCCCHHHEECCCCCEEEECCCEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCC
KTSFDSKIKSIQWYGETYQVADTLNSVKDFPSSSVVTVSSKVMMIVFANNQAFDKGLANY
CCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHC
NKTISDDQGFSNLASTSIIFDIKPVDEKRFTKAFKEEFKDNKDLSISYRSEALQDQRAQI
CCCCCCCCCCHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH
GGFVFVGFVLGISLILGAALIIYYKQLSEGAQDKRSFKILQEVGLSKEEVQKTIKSQVRL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
IFFLPLVITIAHFAGAYLMIEKIIMLFDINDRSVIFTISLATIAILAIIYYLIYKATSRV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYKIVER
HHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]