Definition Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome.
Accession NC_002662
Length 2,365,589

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The map label for this gene is yoiA

Identifier: 15673438

GI number: 15673438

Start: 1479930

End: 1483202

Strand: Reverse

Name: yoiA

Synonym: L79678

Alternate gene names: NA

Gene position: 1483202-1479930 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15673439

Following gene: 15673437

Centisome position: 62.7

GC content: 30.09

Gene sequence:

>3273_bases
TTGATGAAGAAACAAGGTAGACAACTTAATATTTTGAATGGTTTGTTCTTGAAAAATACGAAAGAGCAAGAAGAGAAAGT
ACTATCAGCGGAAATTCAGAAAAGTCAAGTTGATTTGAAAGACAAGAAAGAAACATTACCAGTAAGACAAAGGGAAGTGG
AGCTTATGTTAGGAAGAAATTCATATTCTTCAGGATTAAGAACATATAAGCAGTTACTTGAAAAATATCTTCAACATTCC
GAAAAATATTCTGTTGATTTAGGAGAATATAAAAAAGCTTATCTTAAATTAAACAGTAATTTGAAAGATTTTAATCTACT
TTCTCAAAAAATTGCCGATAAAAAACAAGATTATAACTCGGAAATGATTAAGTACGAGGAAGTTAAGAAAAAGTACGAGC
AAAGTCTGAAAGAATATCAAGAAATTACTAAAGAGTATGAAAATGTTATTAACGATAGAAAAGCTGCCCAAAAGAAGTTT
GAAGAAAACTCTTTAGCTCTGAAAAATATTAATGATGAAGTTCAAAACCTGATTGATAAAAAATCAGTGAAGAATGATGC
TTTTATAGAAATAAAAGAAAAATTAGCGGTAGAACAAGAGGAATTTAAAGCTGCTGAAAGTCAATTAAATGGAATTGTCT
CTGTCTATGAACTTCTTAAGAAAAATTATCAAGAAAAGAAAGCAACATTTGAAGAATCTCGAAAAAAATATCATCATGCG
AATACCATAAAAAATGATTGGGAGATGTTGATTAAAGATTTTGAAAAAACAAAATCAAACAAAGAAAAATTCGAGCAAAA
TCTTCAGGCTATAGATGACAAGGTAAAAGCTACAGAGGAAGAAGCCAATATCTCAAATGAAATTTATAATTTTGTTGAAC
CTTCTTTAGTAGCTATGACAGAAAAATACAAAGAACACAAAAAAGTATATGAAGCAGCAGCTATAGCCTATAATATTTCC
AAAAAGGGTTATGATGCAGAATATGCAAAGTTTAGTGAACTTAAAGAAAATTTTCAGGAAATAAATAGTCTGAAGAATCC
AAGTCAGACTGTCATTGGATATATCACTCGGGATATGGAGGCTGCCAAAAATAGAGTTGATAATTTGGCGAAAGACTTTT
ATCCGCTGGAGGAAAAGTTTAATCTACAAAAAAATATTTTTGAGCAAATCAGCACGAGCTATGTTTTGGTAAAAAATCTT
GTAGATGAAAAAAAGGGTAAATCCAAAGTTTCTAATGGAACATTAACTGAAACATTGAACGCTCAGAAAAAAATTACAAT
GGTTTTAGAGGTTTTAAAATCAAAATATGGTCTTCTTAATCATCAGCGTGGGCAATCCGAAGAAGCATTTAAGGTTATTT
CTCAACAATATGAAGAGCTAGAAAAAGAATTTCAAAAAGAGCAATCTTCTTTTAGTAAGATAAAAGAGTATTACACAGCT
TTTGAAACTCGGTATAATTCAACTAAGGAATCTTACGATATTGCCAAAGAAAAACTTGCTCAAAGTGAGGAAAATCTAGA
GATTGTAAAAAAAGCCTATTCTGATATAGCAGGTCTTCTCAGGGTTGCTACGGTCAATAAAGAATCTATTTTAGAGGAGT
ATAAAAATTCTGAAAAAGAATTTAATAGATTGACAGATACAAAAGAAGGCTTTGAATTTGAAGTGCAAAATAATTTTACT
GGTTTAGATGAAACTTACCAAAAGGGAGAGCAACTTTGTTTGAATTTAACAGAACAGGCAAAAACTTGGCATGATGACTA
TCCTCAATATAGTCATTCCTATAAGACAATACTACCTGAATATACAAAGGTGAATAGTCAGCTAGAAAAGCTTAGTCAAC
AATATGAAGTTGTTTTCAATGATTATCAAAATTTGAATAAATCTAGTGAAATTGTTCGAACGCAATATCAACAAGAGATG
CAAAGATACAATGCTGACCAAGAATTGTATAATCAGGTAAGCCAAGAATTTAATCATTGTCTCGATTTAAGAAATGTTGT
ACTCAAAAAAGATAATGAATTTGAGACTGCATTGAACAATTTGAATCAATTTATCTTCAAGAATAATACTTTAACTTTTC
CAATTGGTGAGGCGACAGGTTCTAATTTTATAGATGAATTTAATATTCCAGAAATTGAAGTTAGTGAATCATCTTCTAAA
TTAACAAATAAATTTGAACTCTCACAATGGACAGAAACCTATCAAAATCTGTATGCATTAGTTGATTCAATTTCTAAAGA
GCTCAAGCAAGCATTAACAGAATATCAAAATCAACTTTCAATCTTTATTAAGGTTGGTGGTAAACGGGTGATTGATTTAG
GAAATAGTGATATCGCCTATCGCGGAACAAATATTGAAAGTTACTTAGAAAGACTAGCAATTAATTTCAAAGAATGGCAA
TCAGAGTATGTCAAAAGAGAACAGGTTTTTTCTCTATTAGTTAAAAATTATCGTCAATATTTAGAGGAATCAGTTAAACT
AAATGAAAACATTGCAAGAATGTCGGAATCTAAAAATGGTTTGCAAGAGATTATTAATGCAATTAATTCACTCCCTAATT
ATATGGACATATATAGTACTTCCTATCGAAATGTTGAATTGTTAGCTAGTGCTCTTGGTGCTGAGGTTTCTGATTTAACG
CATTTGCGAAATATTGACGAATTAAAAGAGATTATTAATAAAGTTTATTTTGAACACGTTTTAGCTCTGATTGATGAAAA
CTTAGAAAATACAATCAATCATTTCTCAGAAATTCGTTCTAGTTATGACCAAAGCATTATTAACCTGAGAAAACAGTTGG
ATGAAATGGAAAAAATAACGGGGATTCCAACAAGAAAAGTTATGATTGAAAGTTCTCTACCTAATGACCTTGATTTGAAG
AGCTATTTTACAGGAGCTTTAAATGAAAATGTAAAACAACTGTTTTCTACAATCATTAGTAGTTCATCTTTTATTAATAG
CGTGAAAAAGGTTAATCAATTTAAACGTGTTCAAAATCTTTTATCGGTAAATGAAGGAGGAAATGCAATTATTCTTCCTG
AAGTTCCAATTGCTTTTGATAAAAAAGAACTTGAGTTTTCACTTGTTATAGCCACTATAAAAAATATTGATGCACCAGTC
AAGGTTGAGAAGTTAGAATCAGCTTATGTAAAACCAGAAAAACCAGAAAATCTTGCTGATAAGCCTAGCTATGTTGAAGA
TATCGTAGAAGTAGAAAAAATTGAAAAACAACATCAAAAGATAGATACAGAACCGTTAAAAGCTCTTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCTAAATTTTAGGCAGATAGGTAATCAATCTATCTGTCTAATGCTATTATTTTTTATTATTATTTTATAACTTTATT
TATTAGAGAGGTTAGGTTCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTTGTTTTAACAATTACCTAAGAGAAGGACACTGATAATGAATTATTTTGTAAATGAGAATATTTTTACTCTAAATTC
GGGGACAGAATTTTCGGCGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1090; Mature: 1090

Protein sequence:

>1090_residues
MMKKQGRQLNILNGLFLKNTKEQEEKVLSAEIQKSQVDLKDKKETLPVRQREVELMLGRNSYSSGLRTYKQLLEKYLQHS
EKYSVDLGEYKKAYLKLNSNLKDFNLLSQKIADKKQDYNSEMIKYEEVKKKYEQSLKEYQEITKEYENVINDRKAAQKKF
EENSLALKNINDEVQNLIDKKSVKNDAFIEIKEKLAVEQEEFKAAESQLNGIVSVYELLKKNYQEKKATFEESRKKYHHA
NTIKNDWEMLIKDFEKTKSNKEKFEQNLQAIDDKVKATEEEANISNEIYNFVEPSLVAMTEKYKEHKKVYEAAAIAYNIS
KKGYDAEYAKFSELKENFQEINSLKNPSQTVIGYITRDMEAAKNRVDNLAKDFYPLEEKFNLQKNIFEQISTSYVLVKNL
VDEKKGKSKVSNGTLTETLNAQKKITMVLEVLKSKYGLLNHQRGQSEEAFKVISQQYEELEKEFQKEQSSFSKIKEYYTA
FETRYNSTKESYDIAKEKLAQSEENLEIVKKAYSDIAGLLRVATVNKESILEEYKNSEKEFNRLTDTKEGFEFEVQNNFT
GLDETYQKGEQLCLNLTEQAKTWHDDYPQYSHSYKTILPEYTKVNSQLEKLSQQYEVVFNDYQNLNKSSEIVRTQYQQEM
QRYNADQELYNQVSQEFNHCLDLRNVVLKKDNEFETALNNLNQFIFKNNTLTFPIGEATGSNFIDEFNIPEIEVSESSSK
LTNKFELSQWTETYQNLYALVDSISKELKQALTEYQNQLSIFIKVGGKRVIDLGNSDIAYRGTNIESYLERLAINFKEWQ
SEYVKREQVFSLLVKNYRQYLEESVKLNENIARMSESKNGLQEIINAINSLPNYMDIYSTSYRNVELLASALGAEVSDLT
HLRNIDELKEIINKVYFEHVLALIDENLENTINHFSEIRSSYDQSIINLRKQLDEMEKITGIPTRKVMIESSLPNDLDLK
SYFTGALNENVKQLFSTIISSSSFINSVKKVNQFKRVQNLLSVNEGGNAIILPEVPIAFDKKELEFSLVIATIKNIDAPV
KVEKLESAYVKPEKPENLADKPSYVEDIVEVEKIEKQHQKIDTEPLKALA

Sequences:

>Translated_1090_residues
MMKKQGRQLNILNGLFLKNTKEQEEKVLSAEIQKSQVDLKDKKETLPVRQREVELMLGRNSYSSGLRTYKQLLEKYLQHS
EKYSVDLGEYKKAYLKLNSNLKDFNLLSQKIADKKQDYNSEMIKYEEVKKKYEQSLKEYQEITKEYENVINDRKAAQKKF
EENSLALKNINDEVQNLIDKKSVKNDAFIEIKEKLAVEQEEFKAAESQLNGIVSVYELLKKNYQEKKATFEESRKKYHHA
NTIKNDWEMLIKDFEKTKSNKEKFEQNLQAIDDKVKATEEEANISNEIYNFVEPSLVAMTEKYKEHKKVYEAAAIAYNIS
KKGYDAEYAKFSELKENFQEINSLKNPSQTVIGYITRDMEAAKNRVDNLAKDFYPLEEKFNLQKNIFEQISTSYVLVKNL
VDEKKGKSKVSNGTLTETLNAQKKITMVLEVLKSKYGLLNHQRGQSEEAFKVISQQYEELEKEFQKEQSSFSKIKEYYTA
FETRYNSTKESYDIAKEKLAQSEENLEIVKKAYSDIAGLLRVATVNKESILEEYKNSEKEFNRLTDTKEGFEFEVQNNFT
GLDETYQKGEQLCLNLTEQAKTWHDDYPQYSHSYKTILPEYTKVNSQLEKLSQQYEVVFNDYQNLNKSSEIVRTQYQQEM
QRYNADQELYNQVSQEFNHCLDLRNVVLKKDNEFETALNNLNQFIFKNNTLTFPIGEATGSNFIDEFNIPEIEVSESSSK
LTNKFELSQWTETYQNLYALVDSISKELKQALTEYQNQLSIFIKVGGKRVIDLGNSDIAYRGTNIESYLERLAINFKEWQ
SEYVKREQVFSLLVKNYRQYLEESVKLNENIARMSESKNGLQEIINAINSLPNYMDIYSTSYRNVELLASALGAEVSDLT
HLRNIDELKEIINKVYFEHVLALIDENLENTINHFSEIRSSYDQSIINLRKQLDEMEKITGIPTRKVMIESSLPNDLDLK
SYFTGALNENVKQLFSTIISSSSFINSVKKVNQFKRVQNLLSVNEGGNAIILPEVPIAFDKKELEFSLVIATIKNIDAPV
KVEKLESAYVKPEKPENLADKPSYVEDIVEVEKIEKQHQKIDTEPLKALA
>Mature_1090_residues
MMKKQGRQLNILNGLFLKNTKEQEEKVLSAEIQKSQVDLKDKKETLPVRQREVELMLGRNSYSSGLRTYKQLLEKYLQHS
EKYSVDLGEYKKAYLKLNSNLKDFNLLSQKIADKKQDYNSEMIKYEEVKKKYEQSLKEYQEITKEYENVINDRKAAQKKF
EENSLALKNINDEVQNLIDKKSVKNDAFIEIKEKLAVEQEEFKAAESQLNGIVSVYELLKKNYQEKKATFEESRKKYHHA
NTIKNDWEMLIKDFEKTKSNKEKFEQNLQAIDDKVKATEEEANISNEIYNFVEPSLVAMTEKYKEHKKVYEAAAIAYNIS
KKGYDAEYAKFSELKENFQEINSLKNPSQTVIGYITRDMEAAKNRVDNLAKDFYPLEEKFNLQKNIFEQISTSYVLVKNL
VDEKKGKSKVSNGTLTETLNAQKKITMVLEVLKSKYGLLNHQRGQSEEAFKVISQQYEELEKEFQKEQSSFSKIKEYYTA
FETRYNSTKESYDIAKEKLAQSEENLEIVKKAYSDIAGLLRVATVNKESILEEYKNSEKEFNRLTDTKEGFEFEVQNNFT
GLDETYQKGEQLCLNLTEQAKTWHDDYPQYSHSYKTILPEYTKVNSQLEKLSQQYEVVFNDYQNLNKSSEIVRTQYQQEM
QRYNADQELYNQVSQEFNHCLDLRNVVLKKDNEFETALNNLNQFIFKNNTLTFPIGEATGSNFIDEFNIPEIEVSESSSK
LTNKFELSQWTETYQNLYALVDSISKELKQALTEYQNQLSIFIKVGGKRVIDLGNSDIAYRGTNIESYLERLAINFKEWQ
SEYVKREQVFSLLVKNYRQYLEESVKLNENIARMSESKNGLQEIINAINSLPNYMDIYSTSYRNVELLASALGAEVSDLT
HLRNIDELKEIINKVYFEHVLALIDENLENTINHFSEIRSSYDQSIINLRKQLDEMEKITGIPTRKVMIESSLPNDLDLK
SYFTGALNENVKQLFSTIISSSSFINSVKKVNQFKRVQNLLSVNEGGNAIILPEVPIAFDKKELEFSLVIATIKNIDAPV
KVEKLESAYVKPEKPENLADKPSYVEDIVEVEKIEKQHQKIDTEPLKALA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 126943; Mature: 126943

Theoretical pI: Translated: 5.21; Mature: 5.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMKKQGRQLNILNGLFLKNTKEQEEKVLSAEIQKSQVDLKDKKETLPVRQREVELMLGRN
CCCCCCCEEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCC
SYSSGLRTYKQLLEKYLQHSEKYSVDLGEYKKAYLKLNSNLKDFNLLSQKIADKKQDYNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
EMIKYEEVKKKYEQSLKEYQEITKEYENVINDRKAAQKKFEENSLALKNINDEVQNLIDK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHH
KSVKNDAFIEIKEKLAVEQEEFKAAESQLNGIVSVYELLKKNYQEKKATFEESRKKYHHA
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTIKNDWEMLIKDFEKTKSNKEKFEQNLQAIDDKVKATEEEANISNEIYNFVEPSLVAMT
HCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
EKYKEHKKVYEAAAIAYNISKKGYDAEYAKFSELKENFQEINSLKNPSQTVIGYITRDME
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HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEECCCCCCEE
RGTNIESYLERLAINFKEWQSEYVKREQVFSLLVKNYRQYLEESVKLNENIARMSESKNG
ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQEIINAINSLPNYMDIYSTSYRNVELLASALGAEVSDLTHLRNIDELKEIINKVYFEHV
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LALIDENLENTINHFSEIRSSYDQSIINLRKQLDEMEKITGIPTRKVMIESSLPNDLDLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEECCCCCCCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDTEPLKALA
CCCHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCEEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCC
SYSSGLRTYKQLLEKYLQHSEKYSVDLGEYKKAYLKLNSNLKDFNLLSQKIADKKQDYNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
EMIKYEEVKKKYEQSLKEYQEITKEYENVINDRKAAQKKFEENSLALKNINDEVQNLIDK
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEECCCCCCEE
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ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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SYFTGALNENVKQLFSTIISSSSFINSVKKVNQFKRVQNLLSVNEGGNAIILPEVPIAFD
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KKELEFSLVIATIKNIDAPVKVEKLESAYVKPEKPENLADKPSYVEDIVEVEKIEKQHQK
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDTEPLKALA
CCCHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA