Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_001318 |
Length | 910,724 |
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The map label for this gene is 15594671
Identifier: 15594671
GI number: 15594671
Start: 330803
End: 333598
Strand: Reverse
Name: 15594671
Synonym: BB0326
Alternate gene names: NA
Gene position: 333598-330803 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15594672
Following gene: 15594670
Centisome position: 36.63
GC content: 28.58
Gene sequence:
>2796_bases ATGCCTGATGTAGATAAGATAATACAGTTTAAAAGAGAAATATTAGATAATCTTTCTAATGAAAGATTATCTAAAGAATC TTTTGGCTTAAGTATGGATGTTAAGCTTCCCGAGCCTGGAGAGAGTATTGTTCCTTGGATAGGCGAAGATCTTGCTTTAG ATGAAACTGATGATGAACTTGATTTAAATTTTATGCTTGATGCTCTTGAGAATGAGGATAAATTATCCTATTCTGACATT TTTAATGACAATTTGCCTTTAAGTGGTTCTAACTTAAGGGTTGATGTGGATTCAGAGCTTTCAACTTTAAATAATGATTT TGACGTTTCTTCTAGCGATTCTTTTGAAAATAATATTGACAAAGTTCTTGATGATAATTCTATTGATTTAGAAATTGCTT CTAAGCTTGATTTTGACAATTTAATCAATTCCCCAGAATTAAGTTCTGAGGAGTTGATTAACAATCAAGGCAATAATAAT TTTTTTGAAGCCAATAATGATTCTTCTGTTTTAGGGGATAGTAATTTTTTACAGTCTAATGAATTTAATATTGATGATGC GGTAAATGGCAAAAACCAAACAGATGAACAATCAGAGATGTTTGTTGGAGACAGTTTAAATTTAAGTGCCGATGAGGATG ATTTTGAAAACGTTATAGATGATTTTAAATTTTTAGAGTATGATCAAAATGCAAATTTTAAACGTTTTGAATTTAAGGTT AATTATCCATTATTTTTAAAGCATTTAAATTCCTATCCTAGAAATTTAAGAATTGCAATTGCTGAGGCTTTAACTAAGGA AAATGTTTCAAGGTTTAAGCTTGAAGCGCTAATTGATCTTGTTGAAAAAAATAAAAAAAGGTTGAAATTTATTGCTAAAT TTGTAGGAGATATTGTTGGGCGATCTATTAAATTGCCTGTAATTTATTTCAAGGCGGAAGAATTTAGCAAGCTTCAGCAA AAATTGAGCTACAGGGTTTCAAGGGCTTTGCTACCTTTGATAAAAATAGCCTCTTTTTTTGTTGTTTTAGTTTTAGTTTC TTTGTACCTTATAGTAGATGTAATATTTTTTTATGTTGCCTCTGAGAGCAAGTATAAAGAGGGCATAGAATCTATATATG CAAATAAAAGAGATCTTGCCAAATCTATCTTTAGAGATGCTTACTATATTAGGCCTGATGATAAATGGTTTATTAATTAT GCTAAGGCGTTTGAAGACGTTAGAGATTTTGATAGTGCTGAAGAGAAGTATGAGGAATTGTTTACTATTGAGCCTTTTTC TAAAAATTCTACAAACAGAAGACGAAAAAAGTTTAATAAGGAAGGATATATTTCGTATGCTTCCATGAAAATTGGTCTTG GAGAGCACTCTGAGGCTAATTCAATACTTGATGAGGTTATATCTTATGATCTTTACGATTATGATGCTTTAGTATTAAAG GGAGATAATTATTTTAAATGGGCTAAGACAAATTCCAACTACTATAAAGATAGTATTAATAGCTATACGGTTGTGCTTTC TAAATATGGACAAAAAAAGGAAATTTTATTTAAGCTTTTCAATGCTTATATTGAAGCTAATTTAGATACCGAGTCTGATA ATGTCAATAATTTTATTAAGTCAAATGAAATTCTAGATATTGATGAAGTTGTTTACACAAAATATGCTAAAAAGCTTGTA GATAAGTATATTTCTTTTGTGACTTATAATCAAAGAGCAAATAATCTTGCTATAAATTTAAATTATCTTAATGGACAAAC AAATTTATTGAATAAGGAATTTTCTGATTTTAAAAGAAATGATGGCAGAACTATTTTTAAGCTTGACAATAATGTTAATA TGAATTCAGAGATTGAATACATTCTCAGAAAAATATTAAATAAAAATCCCAATTACGACAAGGCACTTTTTGAAAGTGGA AGATATTCGTATTACATAGGAGATTTTAAGAAGGCCGAAGTTTATTTGCTTAAAGCATTAAATAGTTTTAGGCATAAAAA TTCAATTGAAGATGCTGGGGACAAGATATTGGCTTATAAAATTTTAGCAGACATTTATGAAAAAACTCGAGATTCTCTTA GGGCTAGTAATATTATTGGTTTAGCCTTGAGTGATTATTCTTTTTATAAAAAACACAATCTTATAAAAGGATCTAAGGAG ATTTCTTCAATTTATGAAAAGCAAGGCGATATTCTTAGATCTTTAAATGACTTTAAGTCTGCGATATCTTCTTACAAATT GGCAATAAATGAGGGCGTTGATTATCCAGATGTTTACTATAAAGTTGGACTACTTAGTTATAGAGAAAATAATTATGATG ATGCATTGAAATATTTATTTAAAGTAGAGAGCATGGCGGGGTTTTCAAGTAGTAACGAAGTTTTAAATACTATTGCCCTA ACTCTTTATAAAATAGGCGATTTTTTAGCTTCTAGGAGCTATTATTTAAGGGTTATGCAAAATTTAGAACTAGAGAAGGC TAATGTTTTGAATTTTAACCCCAAAGAAAATGATTATCATAAAACTCTTTTATTAAAAGAAATTGAGACTTATAATAATC TTGGGGTTGTAGAAGTGATGGCTTCTTTTTCATCTATAAGAGATACTAAACTTTTTAATTCTGGAGTTAGCAATTTAAGC GAATCAGCCAAGATTTTTGATATATTAAATAGGGATGAAGATATGGTAAAAAGTGTTAAAAAAGATCTTGCTAGTTTAAA TCTCAGGAATATTTTTAAGAATAGTTTTTCTAAATCTAATGTTTTATTTTATGAAAATTTATCCGAAAAACTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATTGCTGAAGATTTAGAAAATCGCTTTAATGTTCTTCATGCAAAAGGTCATGAATTTTATAAAAAAAGCTTTTTATAA GCTAGGAACTTGATTACAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATAGATCTTATTCATTGTTTTTGAGTTATTTATGAGGGTGGTTTCCTTATGAAGAAAATTTTTTTATTTCTTTTTATT AGTTTTTATTTGTTTGGATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 931; Mature: 930
Protein sequence:
>931_residues MPDVDKIIQFKREILDNLSNERLSKESFGLSMDVKLPEPGESIVPWIGEDLALDETDDELDLNFMLDALENEDKLSYSDI FNDNLPLSGSNLRVDVDSELSTLNNDFDVSSSDSFENNIDKVLDDNSIDLEIASKLDFDNLINSPELSSEELINNQGNNN FFEANNDSSVLGDSNFLQSNEFNIDDAVNGKNQTDEQSEMFVGDSLNLSADEDDFENVIDDFKFLEYDQNANFKRFEFKV NYPLFLKHLNSYPRNLRIAIAEALTKENVSRFKLEALIDLVEKNKKRLKFIAKFVGDIVGRSIKLPVIYFKAEEFSKLQQ KLSYRVSRALLPLIKIASFFVVLVLVSLYLIVDVIFFYVASESKYKEGIESIYANKRDLAKSIFRDAYYIRPDDKWFINY AKAFEDVRDFDSAEEKYEELFTIEPFSKNSTNRRRKKFNKEGYISYASMKIGLGEHSEANSILDEVISYDLYDYDALVLK GDNYFKWAKTNSNYYKDSINSYTVVLSKYGQKKEILFKLFNAYIEANLDTESDNVNNFIKSNEILDIDEVVYTKYAKKLV DKYISFVTYNQRANNLAINLNYLNGQTNLLNKEFSDFKRNDGRTIFKLDNNVNMNSEIEYILRKILNKNPNYDKALFESG RYSYYIGDFKKAEVYLLKALNSFRHKNSIEDAGDKILAYKILADIYEKTRDSLRASNIIGLALSDYSFYKKHNLIKGSKE ISSIYEKQGDILRSLNDFKSAISSYKLAINEGVDYPDVYYKVGLLSYRENNYDDALKYLFKVESMAGFSSSNEVLNTIAL TLYKIGDFLASRSYYLRVMQNLELEKANVLNFNPKENDYHKTLLLKEIETYNNLGVVEVMASFSSIRDTKLFNSGVSNLS ESAKIFDILNRDEDMVKSVKKDLASLNLRNIFKNSFSKSNVLFYENLSEKL
Sequences:
>Translated_931_residues MPDVDKIIQFKREILDNLSNERLSKESFGLSMDVKLPEPGESIVPWIGEDLALDETDDELDLNFMLDALENEDKLSYSDI FNDNLPLSGSNLRVDVDSELSTLNNDFDVSSSDSFENNIDKVLDDNSIDLEIASKLDFDNLINSPELSSEELINNQGNNN FFEANNDSSVLGDSNFLQSNEFNIDDAVNGKNQTDEQSEMFVGDSLNLSADEDDFENVIDDFKFLEYDQNANFKRFEFKV NYPLFLKHLNSYPRNLRIAIAEALTKENVSRFKLEALIDLVEKNKKRLKFIAKFVGDIVGRSIKLPVIYFKAEEFSKLQQ KLSYRVSRALLPLIKIASFFVVLVLVSLYLIVDVIFFYVASESKYKEGIESIYANKRDLAKSIFRDAYYIRPDDKWFINY AKAFEDVRDFDSAEEKYEELFTIEPFSKNSTNRRRKKFNKEGYISYASMKIGLGEHSEANSILDEVISYDLYDYDALVLK GDNYFKWAKTNSNYYKDSINSYTVVLSKYGQKKEILFKLFNAYIEANLDTESDNVNNFIKSNEILDIDEVVYTKYAKKLV DKYISFVTYNQRANNLAINLNYLNGQTNLLNKEFSDFKRNDGRTIFKLDNNVNMNSEIEYILRKILNKNPNYDKALFESG RYSYYIGDFKKAEVYLLKALNSFRHKNSIEDAGDKILAYKILADIYEKTRDSLRASNIIGLALSDYSFYKKHNLIKGSKE ISSIYEKQGDILRSLNDFKSAISSYKLAINEGVDYPDVYYKVGLLSYRENNYDDALKYLFKVESMAGFSSSNEVLNTIAL TLYKIGDFLASRSYYLRVMQNLELEKANVLNFNPKENDYHKTLLLKEIETYNNLGVVEVMASFSSIRDTKLFNSGVSNLS ESAKIFDILNRDEDMVKSVKKDLASLNLRNIFKNSFSKSNVLFYENLSEKL >Mature_930_residues PDVDKIIQFKREILDNLSNERLSKESFGLSMDVKLPEPGESIVPWIGEDLALDETDDELDLNFMLDALENEDKLSYSDIF NDNLPLSGSNLRVDVDSELSTLNNDFDVSSSDSFENNIDKVLDDNSIDLEIASKLDFDNLINSPELSSEELINNQGNNNF FEANNDSSVLGDSNFLQSNEFNIDDAVNGKNQTDEQSEMFVGDSLNLSADEDDFENVIDDFKFLEYDQNANFKRFEFKVN YPLFLKHLNSYPRNLRIAIAEALTKENVSRFKLEALIDLVEKNKKRLKFIAKFVGDIVGRSIKLPVIYFKAEEFSKLQQK LSYRVSRALLPLIKIASFFVVLVLVSLYLIVDVIFFYVASESKYKEGIESIYANKRDLAKSIFRDAYYIRPDDKWFINYA KAFEDVRDFDSAEEKYEELFTIEPFSKNSTNRRRKKFNKEGYISYASMKIGLGEHSEANSILDEVISYDLYDYDALVLKG DNYFKWAKTNSNYYKDSINSYTVVLSKYGQKKEILFKLFNAYIEANLDTESDNVNNFIKSNEILDIDEVVYTKYAKKLVD KYISFVTYNQRANNLAINLNYLNGQTNLLNKEFSDFKRNDGRTIFKLDNNVNMNSEIEYILRKILNKNPNYDKALFESGR YSYYIGDFKKAEVYLLKALNSFRHKNSIEDAGDKILAYKILADIYEKTRDSLRASNIIGLALSDYSFYKKHNLIKGSKEI SSIYEKQGDILRSLNDFKSAISSYKLAINEGVDYPDVYYKVGLLSYRENNYDDALKYLFKVESMAGFSSSNEVLNTIALT LYKIGDFLASRSYYLRVMQNLELEKANVLNFNPKENDYHKTLLLKEIETYNNLGVVEVMASFSSIRDTKLFNSGVSNLSE SAKIFDILNRDEDMVKSVKKDLASLNLRNIFKNSFSKSNVLFYENLSEKL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 107525; Mature: 107394
Theoretical pI: Translated: 4.64; Mature: 4.64
Prosite motif: PS50293 TPR_REGION L=RR ; PS00107 PROTEIN_KINASE_ATP
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPDVDKIIQFKREILDNLSNERLSKESFGLSMDVKLPEPGESIVPWIGEDLALDETDDEL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC DLNFMLDALENEDKLSYSDIFNDNLPLSGSNLRVDVDSELSTLNNDFDVSSSDSFENNID CHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH KVLDDNSIDLEIASKLDFDNLINSPELSSEELINNQGNNNFFEANNDSSVLGDSNFLQSN HHHCCCCCCEEECCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCC EFNIDDAVNGKNQTDEQSEMFVGDSLNLSADEDDFENVIDDFKFLEYDQNANFKRFEFKV CCCCCCCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEE NYPLFLKHLNSYPRNLRIAIAEALTKENVSRFKLEALIDLVEKNKKRLKFIAKFVGDIVG CCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RSIKLPVIYFKAEEFSKLQQKLSYRVSRALLPLIKIASFFVVLVLVSLYLIVDVIFFYVA CCEECEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SESKYKEGIESIYANKRDLAKSIFRDAYYIRPDDKWFINYAKAFEDVRDFDSAEEKYEEL CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH FTIEPFSKNSTNRRRKKFNKEGYISYASMKIGLGEHSEANSILDEVISYDLYDYDALVLK EEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEE GDNYFKWAKTNSNYYKDSINSYTVVLSKYGQKKEILFKLFNAYIEANLDTESDNVNNFIK CCCEEEEEECCCCHHHCCCCCEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHH SNEILDIDEVVYTKYAKKLVDKYISFVTYNQRANNLAINLNYLNGQTNLLNKEFSDFKRN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC DGRTIFKLDNNVNMNSEIEYILRKILNKNPNYDKALFESGRYSYYIGDFKKAEVYLLKAL CCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHH NSFRHKNSIEDAGDKILAYKILADIYEKTRDSLRASNIIGLALSDYSFYKKHNLIKGSKE HHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHH ISSIYEKQGDILRSLNDFKSAISSYKLAINEGVDYPDVYYKVGLLSYRENNYDDALKYLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH KVESMAGFSSSNEVLNTIALTLYKIGDFLASRSYYLRVMQNLELEKANVLNFNPKENDYH HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCHH KTLLLKEIETYNNLGVVEVMASFSSIRDTKLFNSGVSNLSESAKIFDILNRDEDMVKSVK HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KDLASLNLRNIFKNSFSKSNVLFYENLSEKL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHCCC >Mature Secondary Structure PDVDKIIQFKREILDNLSNERLSKESFGLSMDVKLPEPGESIVPWIGEDLALDETDDEL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC DLNFMLDALENEDKLSYSDIFNDNLPLSGSNLRVDVDSELSTLNNDFDVSSSDSFENNID CHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH KVLDDNSIDLEIASKLDFDNLINSPELSSEELINNQGNNNFFEANNDSSVLGDSNFLQSN HHHCCCCCCEEECCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCC EFNIDDAVNGKNQTDEQSEMFVGDSLNLSADEDDFENVIDDFKFLEYDQNANFKRFEFKV CCCCCCCCCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEEEE NYPLFLKHLNSYPRNLRIAIAEALTKENVSRFKLEALIDLVEKNKKRLKFIAKFVGDIVG CCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC RSIKLPVIYFKAEEFSKLQQKLSYRVSRALLPLIKIASFFVVLVLVSLYLIVDVIFFYVA CCEECEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SESKYKEGIESIYANKRDLAKSIFRDAYYIRPDDKWFINYAKAFEDVRDFDSAEEKYEEL CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH FTIEPFSKNSTNRRRKKFNKEGYISYASMKIGLGEHSEANSILDEVISYDLYDYDALVLK EEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEE GDNYFKWAKTNSNYYKDSINSYTVVLSKYGQKKEILFKLFNAYIEANLDTESDNVNNFIK CCCEEEEEECCCCHHHCCCCCEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHH SNEILDIDEVVYTKYAKKLVDKYISFVTYNQRANNLAINLNYLNGQTNLLNKEFSDFKRN CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCC DGRTIFKLDNNVNMNSEIEYILRKILNKNPNYDKALFESGRYSYYIGDFKKAEVYLLKAL CCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHH NSFRHKNSIEDAGDKILAYKILADIYEKTRDSLRASNIIGLALSDYSFYKKHNLIKGSKE HHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCHHH ISSIYEKQGDILRSLNDFKSAISSYKLAINEGVDYPDVYYKVGLLSYRENNYDDALKYLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH KVESMAGFSSSNEVLNTIALTLYKIGDFLASRSYYLRVMQNLELEKANVLNFNPKENDYH HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCHH KTLLLKEIETYNNLGVVEVMASFSSIRDTKLFNSGVSNLSESAKIFDILNRDEDMVKSVK HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KDLASLNLRNIFKNSFSKSNVLFYENLSEKL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA