Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_001318 |
Length | 910,724 |
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The map label for this gene is 15594662
Identifier: 15594662
GI number: 15594662
Start: 322847
End: 323779
Strand: Reverse
Name: 15594662
Synonym: BB0317
Alternate gene names: NA
Gene position: 323779-322847 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15594663
Following gene: 15594661
Centisome position: 35.55
GC content: 25.29
Gene sequence:
>933_bases ATGATCTTTTTTAGAAATAGCTTTATGGCATTAATTTTTTCTTTTTCAATATTAAGTATTAGCTATTTTTTCGGTGATTT TTTTCAATTTTCTTATATTAAAATGATATCTTGGCGCTTTATTTTATTTTTAATTATGGCTACGGGGATTGCTACTTGTG CCAAGAGTAATTCATTAAATCTTGGGAATGAAGGTCAGATTTATTTTGGGGCATTTTTAGTTTATATATTTTCAAGTTTT TTTGGATTAACCTATTTTAATTTTGTATTTTTGATACTTTTAAGTTCTTTTTTTGTAGGACTTTTGGGGCTTATCCCCTT TTTTATTACTTTTTTCTTCGGATTAAATAAAGCCTTAACAGGTCTTTTAATATCTTATGGAAATCAAAGATTGGTGGATG GATTTATTTTAAATATGTTAAAAACAGGTAGTTTTTCTAATCAGACAAAAAGGATTAATAGTTTGTTTGCTTTAGATTCA TCACTTATTTACTTGTTTTTGCTTGGTGTATCAGTTTGGCTTTTTTATGTTTTTATTCACAAAAAAACTATTTATGGTCT TCAGCTTGAAATATTAAGCAATAAAAAAAAGATAGACATTTTTTTCAATATAAATGAATTTAAATATAAGTTTTTCGCTG TATTTGGCAGTGCTTTTTTAAATGGTCTTGCAGGTTCTATGTTTGTAGTGTTTTTTAGACCATATTTGGTTTTAGGGCTA ACTTCAGGACTTGGTTGGAGTAGTCTAATTGTTGCTGTAATTTCAGGATTTAATTATGTTTATGTATTATTTTTTAGCTT ATTGTTTTCAATATTAATTGAATTTAATAATTTTCTTAATATAAATTATGACTTTAAGTATGAATTTATTGGGCTTTGTC AATCAATTGCTATTTTTATCTCTTTATTTTTGATTAAAGCTAGGAAAAAGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGCTCTCTGATAACATTTTGGCAATGAAAATGGGAGAAGTTTTGTTAAACGTATCTAGAGAAAAGATTAGTAAAGAAAAA TTAAAGGAATTGCTATTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGTTTAGTATTTTTGAGCAGGCTATTGTATTTTCGTATTTAGCACTTGGAGTTCTTTATACAGAGAAAATAGGATTTTT AAATGTATCTATTGAAGGCA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 310; Mature: 310
Protein sequence:
>310_residues MIFFRNSFMALIFSFSILSISYFFGDFFQFSYIKMISWRFILFLIMATGIATCAKSNSLNLGNEGQIYFGAFLVYIFSSF FGLTYFNFVFLILLSSFFVGLLGLIPFFITFFFGLNKALTGLLISYGNQRLVDGFILNMLKTGSFSNQTKRINSLFALDS SLIYLFLLGVSVWLFYVFIHKKTIYGLQLEILSNKKKIDIFFNINEFKYKFFAVFGSAFLNGLAGSMFVVFFRPYLVLGL TSGLGWSSLIVAVISGFNYVYVLFFSLLFSILIEFNNFLNINYDFKYEFIGLCQSIAIFISLFLIKARKK
Sequences:
>Translated_310_residues MIFFRNSFMALIFSFSILSISYFFGDFFQFSYIKMISWRFILFLIMATGIATCAKSNSLNLGNEGQIYFGAFLVYIFSSF FGLTYFNFVFLILLSSFFVGLLGLIPFFITFFFGLNKALTGLLISYGNQRLVDGFILNMLKTGSFSNQTKRINSLFALDS SLIYLFLLGVSVWLFYVFIHKKTIYGLQLEILSNKKKIDIFFNINEFKYKFFAVFGSAFLNGLAGSMFVVFFRPYLVLGL TSGLGWSSLIVAVISGFNYVYVLFFSLLFSILIEFNNFLNINYDFKYEFIGLCQSIAIFISLFLIKARKK >Mature_310_residues MIFFRNSFMALIFSFSILSISYFFGDFFQFSYIKMISWRFILFLIMATGIATCAKSNSLNLGNEGQIYFGAFLVYIFSSF FGLTYFNFVFLILLSSFFVGLLGLIPFFITFFFGLNKALTGLLISYGNQRLVDGFILNMLKTGSFSNQTKRINSLFALDS SLIYLFLLGVSVWLFYVFIHKKTIYGLQLEILSNKKKIDIFFNINEFKYKFFAVFGSAFLNGLAGSMFVVFFRPYLVLGL TSGLGWSSLIVAVISGFNYVYVLFFSLLFSILIEFNNFLNINYDFKYEFIGLCQSIAIFISLFLIKARKK
Specific function: Unknown
COG id: COG4603
COG function: function code R; ABC-type uncharacterized transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 35681; Mature: 35681
Theoretical pI: Translated: 10.02; Mature: 10.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIFFRNSFMALIFSFSILSISYFFGDFFQFSYIKMISWRFILFLIMATGIATCAKSNSLN CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LGNEGQIYFGAFLVYIFSSFFGLTYFNFVFLILLSSFFVGLLGLIPFFITFFFGLNKALT CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLLISYGNQRLVDGFILNMLKTGSFSNQTKRINSLFALDSSLIYLFLLGVSVWLFYVFIH HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKTIYGLQLEILSNKKKIDIFFNINEFKYKFFAVFGSAFLNGLAGSMFVVFFRPYLVLGL HHHHHHEEEEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSGLGWSSLIVAVISGFNYVYVLFFSLLFSILIEFNNFLNINYDFKYEFIGLCQSIAIFI CCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH SLFLIKARKK HHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MIFFRNSFMALIFSFSILSISYFFGDFFQFSYIKMISWRFILFLIMATGIATCAKSNSLN CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LGNEGQIYFGAFLVYIFSSFFGLTYFNFVFLILLSSFFVGLLGLIPFFITFFFGLNKALT CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLLISYGNQRLVDGFILNMLKTGSFSNQTKRINSLFALDSSLIYLFLLGVSVWLFYVFIH HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKTIYGLQLEILSNKKKIDIFFNINEFKYKFFAVFGSAFLNGLAGSMFVVFFRPYLVLGL HHHHHHEEEEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TSGLGWSSLIVAVISGFNYVYVLFFSLLFSILIEFNNFLNINYDFKYEFIGLCQSIAIFI CCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH SLFLIKARKK HHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA