Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150401831

Identifier: 150401831

GI number: 150401831

Start: 1464109

End: 1466724

Strand: Direct

Name: 150401831

Synonym: Maeo_1409

Alternate gene names: NA

Gene position: 1464109-1466724 (Clockwise)

Preceding gene: 150401829

Following gene: 150401832

Centisome position: 93.29

GC content: 32.07

Gene sequence:

>2616_bases
ATGGAACAAATTAAAAAAATAGCAAAATTCATAAACAATCACAGCTATTTAAAAACAATATTGATTGTATTGGTTATAGC
ATTAATGAGTTTTCAATTAAGAGCTCAACCTGCTGACATGGGATTTACAGACAATCAGCAATTAAAAGAGATGTTTGCTG
ATGAAAATGGTAGAATGTATTTAATTGCATTAGACCCCTATTATTATCTTAGATTGGCAGAAAATTATAATAATAACGGA
CATTTGGGAGAAACACTAAAAGAAATTAATGGGGAGAAGGTTCCGTATGATACAATTCAATATGCTCCACCGGGACACCC
TGCACCAAAAGATGTTCCTACAATTACAATGGTAACGCTGGCAGTTTATGATATTTGGCATTCATTTGATTCAACTGTGT
CTATAATGAATGCGGCATATTGGGTTCCAGCATTATTGAGTATGCTGTTGGGAGCTCCTGTATTTTTCATGATTAGGAGA
ATTACCCAAAGCAATATTGGAGGAATTGTTGGAGCAACAATTATAAGCACAAGCCCAGCTTTATTATATAAAACATCAGC
AGGATTTGCAGATACGCCGATATTTGAGGTTTTACCTATATTATTTATAATATGGTTTATTATGGAGGCAATCCACAACC
AAAATAATTTAAAAAAATCTTTAATATTTGCATCACTGGCAACCATTGCAATGACTTTGGCAACTAAAATGTGGGCAGGT
TGGTGGTATGGTTATTATATCTCCGCTGGATTTTTATTGATATACTCAATATATTCTATAATAATTAAAAAATATGACAT
AAAATCAATAGTAAAAGCTGAAAATATAAAAAGTATCCTTTCAATTGCAGGAATATTTATTATTGGAAGTGCATTATTAA
TATCATTATTATATGGCGTGGATACACTTATGGGGGGGATAATGTCTCCTATTGGTCAGCAAGCCGCCCTCACAACAACG
GAACATGCATCAGGTTGGCCTAATGTATATACTACTGTTGCGGAATTAAATAAGGTAGATATGAACACAATAATAGGGAG
CTCCGCAGGAAGTAAATATTTATTTGTGGCAGGAATTATCGGAGTATTGGCATCATTTGTATCTATGAGATATCGAGGTA
AAAAAGAAGATAATATAATTAAATTTGATGTAAAATATGCCCTTATATTGGCAATTTGGTTGGCAATAACATTTTATGCG
GCAACAAAAGGAAATAGGTTTATTGGATTAATGGTTCCACCATTATCAATAGGTATCGGAGTATTTGCGGGACAACTTGA
TAATATTATTAAAATAAGAAATGATGATTTAACAAAATGGATTTTATATCCGATAATTGGATTATTGGGGCTTATTAGTA
TTATCGGAATAAAGTCTGAAATATTAAATATATTATTGCCTACAACCTATGTTCCTATTGCGGCATATGGGTTTTTGGCA
TTAGTGGCAATACTTGCTATTTATAAAATGGTAGATATAATAGCTTCAAATAAAGATATGCAAATTAAAAAATTAATTAG
TATATTGTTGGCAATAATATTGGTAGTTCCATCACTGGCAAGTGCAGTTCCGCTAGCAACTGTTCCAACTTATAATGATG
GCTGGAAAGAAGGATTAGACTGGATAGCAACAGAAACACCAGATAATTCAGTAACTACCTGTTGGTGGGATAATGGACAT
ATATATACATGGGCTACTCGAAAAATGGTTACATTTGATGGAGGAAGTCAAAATTCACCACGGGCATATTGGGTAGGAAA
AGCATATTCTACTTCTGATGAAAAATTGGCAACAGGGATATTAAGGATGATTGCTACAAGTGGAGATAGTGCCTTTGATG
GAAGTAGCATATTGATGAAAAAAACAAATGGCAGTGTTAAAGAAACCACCACAATATTAAATAAAATATTGCCATTAAAT
AAATCTTCGGCATATGCGGTATTAACTAACCAATATGGATTAACCGACGAAGAAACAAAAGAAGTATTGAATTTAACACA
TCCGGAAAATCCAAATCCTGATTATTTAATTACATACAATAGAATGACAGATATTGCATCTGTATGGAGTATGTTTGGTA
ATTGGGATTATGGTCTTCCAGCAGATACACCAAATGACAAAAGAGAAATGGGATTCTTCGCTAAAACTAATGGAGAGGGA
TATATGGTAAATGATACCTTAGTTGTAAAGGTTGTATCTCAAAATGATGGAAATTATATGGCAATGGATGCGATATTAAT
TCAAAATAATACAATGGACTCATATAATTTGGTGTATGATTTAAAAACACAAAAGCTTGTTAGTCAAAAACCATCACAAT
ATCATAAAATAATAATTTATGATGGAACAAAGATACAAGAAAAACAATTCAACGAAAACGGAACATACAGTTTATTGATT
AGACTAAATCCTGTTGGAAATAATAAATATTCTGCAAATGCTTGGATATCTTCGAAAAATCTTGAAAATAGTGTATATTC
AAAATTGCATTTCTTTGATGGTGCAGGATTGGAAAATATGGCTCTTATTAAAGCCTCAATTGACCCAACAAATCAAGGAG
TTCAACCAGGATTTAAAATATATAAAGTAGATTATGGAACTGAATATTTAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGTTTGGGGGCAGTAAAAATTCCAAAGGAATTTTGACACTACTCGAAATGGAAAAGTTTGATTTTTCAAACATGCCCT
ATATAAAATTAGGTGGCACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATAATATAACATCTTTTTATATTTTAAATTTTATCATATGTATGTTCTGGAACTTTTTACATTATAGTTTGGGAAAT
AATATTATATTTTATTATTT

Product: oligosaccharyl transferase STT3 subunit

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 871; Mature: 871

Protein sequence:

>871_residues
MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMYLIALDPYYYLRLAENYNNNG
HLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTLAVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRR
ITQSNIGGIVGATIISTSPALLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG
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ATKGNRFIGLMVPPLSIGIGVFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA
LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLDWIATETPDNSVTTCWWDNGH
IYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGILRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLN
KSSAYAVLTNQYGLTDEETKEVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG
YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIYDGTKIQEKQFNENGTYSLLI
RLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENMALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK

Sequences:

>Translated_871_residues
MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMYLIALDPYYYLRLAENYNNNG
HLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTLAVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRR
ITQSNIGGIVGATIISTSPALLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG
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ATKGNRFIGLMVPPLSIGIGVFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA
LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLDWIATETPDNSVTTCWWDNGH
IYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGILRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLN
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RLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENMALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK
>Mature_871_residues
MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMYLIALDPYYYLRLAENYNNNG
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ITQSNIGGIVGATIISTSPALLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG
WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGVDTLMGGIMSPIGQQAALTTT
EHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGIIGVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYA
ATKGNRFIGLMVPPLSIGIGVFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA
LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLDWIATETPDNSVTTCWWDNGH
IYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGILRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLN
KSSAYAVLTNQYGLTDEETKEVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG
YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIYDGTKIQEKQFNENGTYSLLI
RLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENMALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK

Specific function: Unknown

COG id: COG1287

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the STT3 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003674 [H]

Pfam domain/function: PF02516 STT3 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96747; Mature: 96747

Theoretical pI: Translated: 8.15; Mature: 8.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMY
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEE
LIALDPYYYLRLAENYNNNGHLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTL
EEEECCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
AVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRRITQSNIGGIVGATIISTSPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCC
LLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG
EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DTLMGGIMSPIGQQAALTTTEHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGII
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHH
GVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYAATKGNRFIGLMVPPLSIGIG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHH
VFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA
HHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHCCC
WIATETPDNSVTTCWWDNGHIYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGI
EEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH
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HHHHCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCEEEEECCCC
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EEECCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEE
DGTKIQEKQFNENGTYSLLIRLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENM
CCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCE
ALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK
EEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHCC
>Mature Secondary Structure
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CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEE
LIALDPYYYLRLAENYNNNGHLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTL
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AVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRRITQSNIGGIVGATIISTSPA
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DTLMGGIMSPIGQQAALTTTEHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGII
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EEECCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEE
DGTKIQEKQFNENGTYSLLIRLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENM
CCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCE
ALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK
EEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]