Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_009635 |
Length | 1,569,500 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 150401831
Identifier: 150401831
GI number: 150401831
Start: 1464109
End: 1466724
Strand: Direct
Name: 150401831
Synonym: Maeo_1409
Alternate gene names: NA
Gene position: 1464109-1466724 (Clockwise)
Preceding gene: 150401829
Following gene: 150401832
Centisome position: 93.29
GC content: 32.07
Gene sequence:
>2616_bases ATGGAACAAATTAAAAAAATAGCAAAATTCATAAACAATCACAGCTATTTAAAAACAATATTGATTGTATTGGTTATAGC ATTAATGAGTTTTCAATTAAGAGCTCAACCTGCTGACATGGGATTTACAGACAATCAGCAATTAAAAGAGATGTTTGCTG ATGAAAATGGTAGAATGTATTTAATTGCATTAGACCCCTATTATTATCTTAGATTGGCAGAAAATTATAATAATAACGGA CATTTGGGAGAAACACTAAAAGAAATTAATGGGGAGAAGGTTCCGTATGATACAATTCAATATGCTCCACCGGGACACCC TGCACCAAAAGATGTTCCTACAATTACAATGGTAACGCTGGCAGTTTATGATATTTGGCATTCATTTGATTCAACTGTGT CTATAATGAATGCGGCATATTGGGTTCCAGCATTATTGAGTATGCTGTTGGGAGCTCCTGTATTTTTCATGATTAGGAGA ATTACCCAAAGCAATATTGGAGGAATTGTTGGAGCAACAATTATAAGCACAAGCCCAGCTTTATTATATAAAACATCAGC AGGATTTGCAGATACGCCGATATTTGAGGTTTTACCTATATTATTTATAATATGGTTTATTATGGAGGCAATCCACAACC AAAATAATTTAAAAAAATCTTTAATATTTGCATCACTGGCAACCATTGCAATGACTTTGGCAACTAAAATGTGGGCAGGT TGGTGGTATGGTTATTATATCTCCGCTGGATTTTTATTGATATACTCAATATATTCTATAATAATTAAAAAATATGACAT AAAATCAATAGTAAAAGCTGAAAATATAAAAAGTATCCTTTCAATTGCAGGAATATTTATTATTGGAAGTGCATTATTAA TATCATTATTATATGGCGTGGATACACTTATGGGGGGGATAATGTCTCCTATTGGTCAGCAAGCCGCCCTCACAACAACG GAACATGCATCAGGTTGGCCTAATGTATATACTACTGTTGCGGAATTAAATAAGGTAGATATGAACACAATAATAGGGAG CTCCGCAGGAAGTAAATATTTATTTGTGGCAGGAATTATCGGAGTATTGGCATCATTTGTATCTATGAGATATCGAGGTA AAAAAGAAGATAATATAATTAAATTTGATGTAAAATATGCCCTTATATTGGCAATTTGGTTGGCAATAACATTTTATGCG GCAACAAAAGGAAATAGGTTTATTGGATTAATGGTTCCACCATTATCAATAGGTATCGGAGTATTTGCGGGACAACTTGA TAATATTATTAAAATAAGAAATGATGATTTAACAAAATGGATTTTATATCCGATAATTGGATTATTGGGGCTTATTAGTA TTATCGGAATAAAGTCTGAAATATTAAATATATTATTGCCTACAACCTATGTTCCTATTGCGGCATATGGGTTTTTGGCA TTAGTGGCAATACTTGCTATTTATAAAATGGTAGATATAATAGCTTCAAATAAAGATATGCAAATTAAAAAATTAATTAG TATATTGTTGGCAATAATATTGGTAGTTCCATCACTGGCAAGTGCAGTTCCGCTAGCAACTGTTCCAACTTATAATGATG GCTGGAAAGAAGGATTAGACTGGATAGCAACAGAAACACCAGATAATTCAGTAACTACCTGTTGGTGGGATAATGGACAT ATATATACATGGGCTACTCGAAAAATGGTTACATTTGATGGAGGAAGTCAAAATTCACCACGGGCATATTGGGTAGGAAA AGCATATTCTACTTCTGATGAAAAATTGGCAACAGGGATATTAAGGATGATTGCTACAAGTGGAGATAGTGCCTTTGATG GAAGTAGCATATTGATGAAAAAAACAAATGGCAGTGTTAAAGAAACCACCACAATATTAAATAAAATATTGCCATTAAAT AAATCTTCGGCATATGCGGTATTAACTAACCAATATGGATTAACCGACGAAGAAACAAAAGAAGTATTGAATTTAACACA TCCGGAAAATCCAAATCCTGATTATTTAATTACATACAATAGAATGACAGATATTGCATCTGTATGGAGTATGTTTGGTA ATTGGGATTATGGTCTTCCAGCAGATACACCAAATGACAAAAGAGAAATGGGATTCTTCGCTAAAACTAATGGAGAGGGA TATATGGTAAATGATACCTTAGTTGTAAAGGTTGTATCTCAAAATGATGGAAATTATATGGCAATGGATGCGATATTAAT TCAAAATAATACAATGGACTCATATAATTTGGTGTATGATTTAAAAACACAAAAGCTTGTTAGTCAAAAACCATCACAAT ATCATAAAATAATAATTTATGATGGAACAAAGATACAAGAAAAACAATTCAACGAAAACGGAACATACAGTTTATTGATT AGACTAAATCCTGTTGGAAATAATAAATATTCTGCAAATGCTTGGATATCTTCGAAAAATCTTGAAAATAGTGTATATTC AAAATTGCATTTCTTTGATGGTGCAGGATTGGAAAATATGGCTCTTATTAAAGCCTCAATTGACCCAACAAATCAAGGAG TTCAACCAGGATTTAAAATATATAAAGTAGATTATGGAACTGAATATTTAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATGTTTGGGGGCAGTAAAAATTCCAAAGGAATTTTGACACTACTCGAAATGGAAAAGTTTGATTTTTCAAACATGCCCT ATATAAAATTAGGTGGCACA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATAATATAACATCTTTTTATATTTTAAATTTTATCATATGTATGTTCTGGAACTTTTTACATTATAGTTTGGGAAAT AATATTATATTTTATTATTT
Product: oligosaccharyl transferase STT3 subunit
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 871; Mature: 871
Protein sequence:
>871_residues MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMYLIALDPYYYLRLAENYNNNG HLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTLAVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRR ITQSNIGGIVGATIISTSPALLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGVDTLMGGIMSPIGQQAALTTT EHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGIIGVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYA ATKGNRFIGLMVPPLSIGIGVFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLDWIATETPDNSVTTCWWDNGH IYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGILRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLN KSSAYAVLTNQYGLTDEETKEVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIYDGTKIQEKQFNENGTYSLLI RLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENMALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK
Sequences:
>Translated_871_residues MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMYLIALDPYYYLRLAENYNNNG HLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTLAVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRR ITQSNIGGIVGATIISTSPALLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGVDTLMGGIMSPIGQQAALTTT EHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGIIGVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYA ATKGNRFIGLMVPPLSIGIGVFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLDWIATETPDNSVTTCWWDNGH IYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGILRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLN KSSAYAVLTNQYGLTDEETKEVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIYDGTKIQEKQFNENGTYSLLI RLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENMALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK >Mature_871_residues MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMYLIALDPYYYLRLAENYNNNG HLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTLAVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRR ITQSNIGGIVGATIISTSPALLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGVDTLMGGIMSPIGQQAALTTT EHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGIIGVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYA ATKGNRFIGLMVPPLSIGIGVFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLDWIATETPDNSVTTCWWDNGH IYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGILRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLN KSSAYAVLTNQYGLTDEETKEVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIYDGTKIQEKQFNENGTYSLLI RLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENMALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK
Specific function: Unknown
COG id: COG1287
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the STT3 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003674 [H]
Pfam domain/function: PF02516 STT3 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 96747; Mature: 96747
Theoretical pI: Translated: 8.15; Mature: 8.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMY CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEE LIALDPYYYLRLAENYNNNGHLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTL EEEECCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH AVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRRITQSNIGGIVGATIISTSPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCC LLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DTLMGGIMSPIGQQAALTTTEHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGII HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHH GVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYAATKGNRFIGLMVPPLSIGIG HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHH VFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA HHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLD HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHCCC WIATETPDNSVTTCWWDNGHIYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGI EEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH LRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLNKSSAYAVLTNQYGLTDEETK HHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHH EVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG HHHHCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCEEEEECCCC YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIY EEECCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEE DGTKIQEKQFNENGTYSLLIRLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENM CCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCE ALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK EEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHCC >Mature Secondary Structure MEQIKKIAKFINNHSYLKTILIVLVIALMSFQLRAQPADMGFTDNQQLKEMFADENGRMY CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCEE LIALDPYYYLRLAENYNNNGHLGETLKEINGEKVPYDTIQYAPPGHPAPKDVPTITMVTL EEEECCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHH AVYDIWHSFDSTVSIMNAAYWVPALLSMLLGAPVFFMIRRITQSNIGGIVGATIISTSPA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCC LLYKTSAGFADTPIFEVLPILFIIWFIMEAIHNQNNLKKSLIFASLATIAMTLATKMWAG EEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WWYGYYISAGFLLIYSIYSIIIKKYDIKSIVKAENIKSILSIAGIFIIGSALLISLLYGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DTLMGGIMSPIGQQAALTTTEHASGWPNVYTTVAELNKVDMNTIIGSSAGSKYLFVAGII HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHH GVLASFVSMRYRGKKEDNIIKFDVKYALILAIWLAITFYAATKGNRFIGLMVPPLSIGIG HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHH VFAGQLDNIIKIRNDDLTKWILYPIIGLLGLISIIGIKSEILNILLPTTYVPIAAYGFLA HHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH LVAILAIYKMVDIIASNKDMQIKKLISILLAIILVVPSLASAVPLATVPTYNDGWKEGLD HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCHHHCCC WIATETPDNSVTTCWWDNGHIYTWATRKMVTFDGGSQNSPRAYWVGKAYSTSDEKLATGI EEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHH LRMIATSGDSAFDGSSILMKKTNGSVKETTTILNKILPLNKSSAYAVLTNQYGLTDEETK HHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHH EVLNLTHPENPNPDYLITYNRMTDIASVWSMFGNWDYGLPADTPNDKREMGFFAKTNGEG HHHHCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCEEEEECCCC YMVNDTLVVKVVSQNDGNYMAMDAILIQNNTMDSYNLVYDLKTQKLVSQKPSQYHKIIIY EEECCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEECHHHHHHHCCCCCCCEEEEE DGTKIQEKQFNENGTYSLLIRLNPVGNNKYSANAWISSKNLENSVYSKLHFFDGAGLENM CCCCCCHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCE ALIKASIDPTNQGVQPGFKIYKVDYGTEYLK EEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]