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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 150392867

GI number: 150392867

Start: 417350

End: 418705

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: SaurJH1_0393

Alternate gene names: 150392867

Gene position: 417350-418705 (Clockwise)

Preceding gene: 150392866

Following gene: 150392868

Centisome position: 14.36

GC content: 32.82

Gene sequence:

>1356_bases
ATGAAAGACGAACAATTATATTATTTTGAGAAATCGCCAGTATTTAAAGCGATGATGCATTTCTCATTGCCAATGATGAT
AGGGACTTTATTAAGCGTTATTTATGGCATATTAAATATTTACTTTATAGGATTTTTAGAAGATAGCCACATGATTTCTG
CTATCTCTCTAACACTGCCAGTATTTGCTATCTTAATGGGGTTGGGTAATTTATTTGGCGTTGGTGCAGGAACTTATATT
TCACGTTTATTAGGTGCGAAAGACTATAGTAAGAGTAAATTTGTAAGTAGTTTCTCTATTTATGGTGGTATTGCACTAGG
ACTTATCGTGATTTTAGTTACTTTACCATTCAGTGATCAAATCGCAGCAATTTTAGGAGCGAGAGGTGAAACGTTAGCTT
TAACAAGTAATTATTTGAAAGTAATGTTTTTAAGTGCACCTTTTGTAATTTTGTTCTTCATATTAGAACAATTTGCACGT
GCAATTGGGGCACCAATGATTTCTATGATTGGTATGTTAGCTAGTGTAGGCTTAAATATTATTTTAGATCCAATTTTAAT
TTTTGGTTTTGATTTAAACGTTGTTGGTGCAGCTTTGGGTACAGCAATCAGTAATGTTGCTGCTGCTCTGTTCTTTATCA
TTTATTTTATGAAAAATAGTGACGTTGTGTCAGTTAATATTAAACTTGCGAAACCTAATAAAGAAATGCTTTCTGAAATC
TTTAAAATAGGTATTCCTGCATTTTTAATGAGTATCTTAATGGGATTCACAGGATTAGTTTTAAATTTATTTTTAGCACA
TTATGGAAACTTCGCGATTGCAAGTTATGGTATCTCATTTAGACTTGTGCAATTTCCAGAACTTATTATCATGGGATTAT
GTGAAGGTGTTGTACCACTAATTGCATATAACTTTATGGCAAATAAAGGCCGTATGAAAGACGTTATCAAAGCAGTTATC
ATGTCTATCGGCGTTATCTTTGTTGTATGTATGATTGCTGTATTTACAATTGGACATCATATGGTCGGACTATTTACTAC
TGATCAAGCCATTGTTGAGATGGCGACATTTATTTTGAAAGTAACAATGGCATCATTATTATTAAATGGTATAGGTTTCT
TGTTTACTGGTATGCTTCAAGCGACTGGGCAAGGTCGTGGTGCTACAATTATGGCCATTTTACAAGGTGCGATTATCATT
CCAGTATTATTTATTATGAATGCTTTGTTTGGACTAACAGGTGTCATTTGGTCATTATTAATTGCTGAGTCACTTTGTGC
TTTAGCAGCAATGTTAATCGTTTATTTATTACGTGATCGTTTGACAGTTGATACATCTGAATTAATAGAAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTGTGACTGGTAGAAATCAGTCACTTTATCTTTAATATTATAGTTAGATATCTAATTGTTAGTAAGCTAATTATTGGAA
AAGACAAGGAGTATTGAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTCGTACACTTCTGGCTGAGTATATTTCGGTCGGAAGGGTATTTTTCGAAAAAAATAAATATATGATACGATTATG
AAAAAATAAAGTGAGATTGG

Product: MATE efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451

Protein sequence:

>451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFGVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMISMIGMLASVGLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMANKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIII
PVLFIMNALFGLTGVIWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG

Sequences:

>Translated_451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFGVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMISMIGMLASVGLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMANKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIII
PVLFIMNALFGLTGVIWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
>Mature_451_residues
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLPVFAILMGLGNLFGVGAGTYI
SRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQIAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFAR
AIGAPMISMIGMLASVGLNIILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPLIAYNFMANKGRMKDVIKAVI
MSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILKVTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIII
PVLFIMNALFGLTGVIWSLLIAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48817; Mature: 48817

Theoretical pI: Translated: 7.54; Mature: 7.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
6.0 %Met     (Translated Protein)
6.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
6.0 %Met     (Mature Protein)
6.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLP
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VFAILMGLGNLFGVGAGTYISRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQ
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFARAIGAPMISMIGMLASVGLNI
HHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHH
ILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHH
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYNFMANKGRMKDVIKAVIMSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILK
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHH
VTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIIIPVLFIMNALFGLTGVIWSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKDEQLYYFEKSPVFKAMMHFSLPMMIGTLLSVIYGILNIYFIGFLEDSHMISAISLTLP
CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
VFAILMGLGNLFGVGAGTYISRLLGAKDYSKSKFVSSFSIYGGIALGLIVILVTLPFSDQ
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
IAAILGARGETLALTSNYLKVMFLSAPFVILFFILEQFARAIGAPMISMIGMLASVGLNI
HHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHH
ILDPILIFGFDLNVVGAALGTAISNVAAALFFIIYFMKNSDVVSVNIKLAKPNKEMLSEI
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHHH
FKIGIPAFLMSILMGFTGLVLNLFLAHYGNFAIASYGISFRLVQFPELIIMGLCEGVVPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYNFMANKGRMKDVIKAVIMSIGVIFVVCMIAVFTIGHHMVGLFTTDQAIVEMATFILK
HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHH
VTMASLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGAIIIPVLFIMNALFGLTGVIWSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAESLCALAAMLIVYLLRDRLTVDTSELIEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA