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The map label for this gene is betT [C]

Identifier: 148825751

GI number: 148825751

Start: 710607

End: 712634

Strand: Direct

Name: betT [C]

Synonym: CGSHiEE_03500

Alternate gene names: 148825751

Gene position: 710607-712634 (Clockwise)

Preceding gene: 148825750

Following gene: 148825753

Centisome position: 39.19

GC content: 35.6

Gene sequence:

>2028_bases
TTGTCTTTATCTCAATTTATGACAAAGCGAACGTCATTTAATCCTTTGGTAATTGGCGTTACGTTATTTTTTATATTGTT
ACTGATGGCAATGATTTTTATTGCGCCAGAGCAAACTCAAGCATTATTGAATCAAGCTAAAAGTGGTATTTTTGCTAATT
TTAGTTGGTTTTATGTACTCACTTTTTCAGTGTTTTTAGGATTTTTATTAATTTTATCAGTAAGTAGTCTTGGCAATATA
AAACTAGGGCAAGATGAAGAAGAACCTGAATTTAGTTTCTTATCTTGGCTTGCGATGTTATTTGCCGCTGGAATGGGGGT
TGGGCTGATGTTTTTTGGCGTAGCAGAACCATTAACCCATTATCTTTCTGACATTACAGTAGGTTCTGCAGAACATAAAC
AACAAGAGGCTTTACTTCATACTTTGTTCCACTGGGGAATTCACGCGTGGGCAGTATATGGCACCATTGCTTTAGCATTA
GCTTATTTTGGGTTTCGTTATAAATTACCTTTAGCGTTGCGCTCTTGTTTTTATCCTTTATTAAAAGATCGTATTAATGG
CAAAATTGGCGATGCGATTGATGTTATGGCATTACTTGCCACATTATTTGGGATTATTACTACATTAGGTTTTGGTTCAT
CACAGCTTGGTGCAGGGCTTGAACAAATAGGTTGGATAAGTCAGAACAGCTTTGCCTTACAAGTTGGCGTTATTGTTGTG
GTGATGTGTTTAGCGGTGTTTTCTGCTATTTCTGGTATTGGAAAAGGCGTGAAAATATTAAGTGAAATTAACTTAACTTT
AGCATTTTGTTTACTTCTTTTTGTTTTAATTTCAGGCCCTACGTTATACCTTTTATCTGCATTTAGCGACAATATTGGTA
ATTATTTCAGCAATTTAGTGCAACTCAGTTTTAAAACCTATGCTTATGAACAAGAACATACTAGCTGGTTTAGCGGATGG
ACTGTGCTTTATTGGGCTTGGTGGTGTTCTTGGGCTCCGTTTGTGGGTTTATTTATTGCGCGTATTTCTAAAGGGCGAAC
TATCCGTGAATTTATTTTTGGCGTATTAGTTATTCCAAGTTTATTTGGTATTTTATGGTTTACTGTTTTTGGTAATACAG
CAGTATGGCTAAATGATGGCATTGCTGCGGGCGGGCTTGGCGAATTTATTTCTTCCCCAGAAATTTTATTATTTAAATTT
TTAAATTATCTGCCTTTACCAACAATAACAGGCTTTGTGAGCTTATTAGTGATTTCATTGTTTTTTATCACTTCAGCGGA
TTCAGGTATTTATGTGTTAAATAACATTGCATCTCGAGATAAAAGTTTAGCTTCTCCTGCGTGGCAAGCCATAATGTGGG
GCACTTTGATGTCAGTTGTTGCAATTGTGCTAATGCAATCTGGTGGACTTGCTAATTTGCAAACAATGACATTAATTGTT
GCCTTGCCTTTTGCTTTATTGATGTTGGTAATGTGTTTTAGTTTATGGAAAGGCTTAATTGCGGATAAAAAATATTTTTC
TACTAAAGTCAATCCAACTAGTATTTTCTGGAGCGGCGATAAATGGAAATCACATTTAGAGCAAATGATGAACCAAACGC
AAGAGAAAGATATTTTACGTTTCCTTAAAAATACGGCGTTACCCGCTATGCGAGAATTACGTCAAGAATTAACAGGAAAA
TATAATTTAAGTGTAGAAATCAACACATTATTTGAACAAGAAGAGCCAGCTTTGGAATTGGTAATTCATAAAGAATCAAT
GCGAGATTTTATGTATGGTATTAAATCTGTTGGGCGAGAAGTGTCAGAGCAATTAATTAACGATGAAAATTTACCGCACA
TTCAGCATAGTGTTACTTACGAGCCTTACACTTATTTTTTTGATGGACGAGTCGGTTACGATGTTCAATATATGGATCAA
GATGAATTGATTGCCGATATGTTGAAACAATATGAACGTTATCTAAGTTTGCTTGATGATGTGGGTCAGGAACTGATGGC
ACACGAGCAAACCGAACTAGCAGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGCTGTCCTTTGTAGTGGTTCCATTACACATTTTTGCCTCTAGGCAATGTTTATTAAATCTATTTTTAATCTATTCATT
TAATCGTTAAGGGGAAAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCGATTTAAAGGTGCAACGTGTGCCAGTTTTGTGGTTATTTAACTTGATTAATCAAAAATTGGGTTAATAGCGAAACAGG
GCGACCTGTTGCACCTTTAT

Product: glucose-specific PTS system enzyme IIA component

Products: Proton [Cytoplasm]; choline [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 675; Mature: 674

Protein sequence:

>675_residues
MSLSQFMTKRTSFNPLVIGVTLFFILLLMAMIFIAPEQTQALLNQAKSGIFANFSWFYVLTFSVFLGFLLILSVSSLGNI
KLGQDEEEPEFSFLSWLAMLFAAGMGVGLMFFGVAEPLTHYLSDITVGSAEHKQQEALLHTLFHWGIHAWAVYGTIALAL
AYFGFRYKLPLALRSCFYPLLKDRINGKIGDAIDVMALLATLFGIITTLGFGSSQLGAGLEQIGWISQNSFALQVGVIVV
VMCLAVFSAISGIGKGVKILSEINLTLAFCLLLFVLISGPTLYLLSAFSDNIGNYFSNLVQLSFKTYAYEQEHTSWFSGW
TVLYWAWWCSWAPFVGLFIARISKGRTIREFIFGVLVIPSLFGILWFTVFGNTAVWLNDGIAAGGLGEFISSPEILLFKF
LNYLPLPTITGFVSLLVISLFFITSADSGIYVLNNIASRDKSLASPAWQAIMWGTLMSVVAIVLMQSGGLANLQTMTLIV
ALPFALLMLVMCFSLWKGLIADKKYFSTKVNPTSIFWSGDKWKSHLEQMMNQTQEKDILRFLKNTALPAMRELRQELTGK
YNLSVEINTLFEQEEPALELVIHKESMRDFMYGIKSVGREVSEQLINDENLPHIQHSVTYEPYTYFFDGRVGYDVQYMDQ
DELIADMLKQYERYLSLLDDVGQELMAHEQTELAE

Sequences:

>Translated_675_residues
MSLSQFMTKRTSFNPLVIGVTLFFILLLMAMIFIAPEQTQALLNQAKSGIFANFSWFYVLTFSVFLGFLLILSVSSLGNI
KLGQDEEEPEFSFLSWLAMLFAAGMGVGLMFFGVAEPLTHYLSDITVGSAEHKQQEALLHTLFHWGIHAWAVYGTIALAL
AYFGFRYKLPLALRSCFYPLLKDRINGKIGDAIDVMALLATLFGIITTLGFGSSQLGAGLEQIGWISQNSFALQVGVIVV
VMCLAVFSAISGIGKGVKILSEINLTLAFCLLLFVLISGPTLYLLSAFSDNIGNYFSNLVQLSFKTYAYEQEHTSWFSGW
TVLYWAWWCSWAPFVGLFIARISKGRTIREFIFGVLVIPSLFGILWFTVFGNTAVWLNDGIAAGGLGEFISSPEILLFKF
LNYLPLPTITGFVSLLVISLFFITSADSGIYVLNNIASRDKSLASPAWQAIMWGTLMSVVAIVLMQSGGLANLQTMTLIV
ALPFALLMLVMCFSLWKGLIADKKYFSTKVNPTSIFWSGDKWKSHLEQMMNQTQEKDILRFLKNTALPAMRELRQELTGK
YNLSVEINTLFEQEEPALELVIHKESMRDFMYGIKSVGREVSEQLINDENLPHIQHSVTYEPYTYFFDGRVGYDVQYMDQ
DELIADMLKQYERYLSLLDDVGQELMAHEQTELAE
>Mature_674_residues
SLSQFMTKRTSFNPLVIGVTLFFILLLMAMIFIAPEQTQALLNQAKSGIFANFSWFYVLTFSVFLGFLLILSVSSLGNIK
LGQDEEEPEFSFLSWLAMLFAAGMGVGLMFFGVAEPLTHYLSDITVGSAEHKQQEALLHTLFHWGIHAWAVYGTIALALA
YFGFRYKLPLALRSCFYPLLKDRINGKIGDAIDVMALLATLFGIITTLGFGSSQLGAGLEQIGWISQNSFALQVGVIVVV
MCLAVFSAISGIGKGVKILSEINLTLAFCLLLFVLISGPTLYLLSAFSDNIGNYFSNLVQLSFKTYAYEQEHTSWFSGWT
VLYWAWWCSWAPFVGLFIARISKGRTIREFIFGVLVIPSLFGILWFTVFGNTAVWLNDGIAAGGLGEFISSPEILLFKFL
NYLPLPTITGFVSLLVISLFFITSADSGIYVLNNIASRDKSLASPAWQAIMWGTLMSVVAIVLMQSGGLANLQTMTLIVA
LPFALLMLVMCFSLWKGLIADKKYFSTKVNPTSIFWSGDKWKSHLEQMMNQTQEKDILRFLKNTALPAMRELRQELTGKY
NLSVEINTLFEQEEPALELVIHKESMRDFMYGIKSVGREVSEQLINDENLPHIQHSVTYEPYTYFFDGRVGYDVQYMDQD
ELIADMLKQYERYLSLLDDVGQELMAHEQTELAE

Specific function: High-Affinity Uptake Of Choline Driven By A Proton- Motive Force. [C]

COG id: COG1292

COG function: function code M; Choline-glycine betaine transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the BCCT transporter (TC 2.A.15) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786506, Length=662, Percent_Identity=34.441087613293, Blast_Score=407, Evalue=1e-114,
Organism=Escherichia coli, GI1788102, Length=434, Percent_Identity=29.4930875576037, Blast_Score=159, Evalue=7e-40,
Organism=Escherichia coli, GI1786224, Length=506, Percent_Identity=28.0632411067194, Blast_Score=152, Evalue=1e-37,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000060
- InterPro:   IPR018093 [H]

Pfam domain/function: PF02028 BCCT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75759; Mature: 75628

Theoretical pI: Translated: 5.01; Mature: 5.01

Prosite motif: PS01303 BCCT

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SLSQFMTKRTSFNPLVIGVTLFFILLLMAMIFIAPEQTQALLNQAKSGIFANFSWFYVL
CHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; choline [Periplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + choline [Periplasm] = Proton [Cytoplasm] + choline [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]