Definition Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome.
Accession NC_009495
Length 3,886,916

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The map label for this gene is 148379043

Identifier: 148379043

GI number: 148379043

Start: 1155823

End: 1157196

Strand: Reverse

Name: 148379043

Synonym: CBO1052

Alternate gene names: NA

Gene position: 1157196-1155823 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148379044

Following gene: 148379034

Centisome position: 29.77

GC content: 23.14

Gene sequence:

>1374_bases
ATGGAAAAACAACAAATATTACAGATTTCTCGATTTTTATCAGGATACTCAACAATGATTTTTCTATATACAATCAAATA
CTATTTCTATAAAAATTTTTTAGGATTTAAAAATAAAGTTTGGCATTTTACTTTATGTGCATTATTAGTAACAGTTATTG
ATTTTTATATGATGAAAACAATATCCCTACTATGGAGTATAATTATAAATAATATAATTTGGCTACTAATTATATGTTTT
TTATGTAATGGTAATTTCTTAATGAAATTTTATGCTGTTATTCTTGAAGAAGCAGCATTACTACTTATTAATCTAACTTT
TTTAACCTTTGATTTTACAATTTTGCCTACTATTCATAACATTAATGTATCTTTTAATAAACATATAATTATTAGTTTTA
TCACTAACATTATTAATGATCTTATACGTTATACTATATTATTTGTATTTTTAAAAAACATTTGTAAATTTCTAAATTTA
AAAGAAAAATCAATAAAATTATATGAAAACTTATTTTTGCTCATTCCTTGTTTATCAATTTATAGTTTAGGACTTATTTT
TTATATCATTCAGCCTATTAATATTAATAATAAAAGATACTATTTACCTTATATTTTTCCTAGAATTTATTATACCCTCC
CCTTTATAAGTTTTGCTTTATTAGTATCATTATTAATTATGGCCTATACCTTTAAAAAAATGCTTGAAGGCCAATTAGAA
GAGAATAAAAACCTTCTCATGGAACAACAATTTAAGCTACAGCTTACTCATAGCAACAACATAGAAATGCTTTATAAAGG
GATAAGAGGCATAATCCACGATATGAATAATCATGTTTCCTGTTTGAAAAATTTAGCTGCTACTAATAACATTGAAGATA
TAAAAAAGTATCTTATAAATATTGATGAAACCATAAGCAAACTTGATTTTAAAATAAAAACGGGTAATTCTATATCTGAT
GCAGTGATAAATGAAAAATATAACATTGCTAAAACTAATAAAATAGAGTTTATATGCGATTTCCTATTACCCAAAGAAAC
CCTATTAGAGCCTGTAGATTTATGCATTATTTTAAGTAACGCATTGGACAATGCCCTTGAAGCGTGCATGAGAATTACAG
ATAGTAATCTTCAAAAAAAAATATGTATAAAATCTTACATAAAAAATATGTATTTAATAATTGAAATTTCCAACAGTGCT
ACAGATAAAATTCAATATGCCGAAAATAAAATTATCAGCACAAAAACTGATAAAAATAACCATGGTATAGGAATTTCTAA
CATAAAAACTGTTGCCAAAAAATATAATGGCATAGTTGATATACTAGAAGAAAAACATAAATTTATTATTAATATTATGC
TTAAAATAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAACCTTAATAAACTCAGAAAAAATATATGTTTCAAAATATAGATTAGATGATTTTTCAAAGGCCTTTATGTATTATTTA
AAAAATGAGGTTCAGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATAACATATAATGACTTATATAAAATTCATATATATTCCTTAAAAATCATATAATAATTATCTCTTTTATATAAAAAG
CTACATAAAAAATAAAAGTT

Product: sensor histidine kinase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 457; Mature: 457

Protein sequence:

>457_residues
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHNINVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPININNKRYYLPYIFPRIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK

Sequences:

>Translated_457_residues
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHNINVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPININNKRYYLPYIFPRIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
>Mature_457_residues
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKTISLLWSIIINNIIWLLIICF
LCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHNINVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNL
KEKSIKLYENLFLLIPCLSIYSLGLIFYIIQPININNKRYYLPYIFPRIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLINIDETISKLDFKIKTGNSISD
AVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSNALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSA
TDKIQYAENKIISTKTDKNNHGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK

Specific function: Unknown

COG id: COG2972

COG function: function code T; Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53436; Mature: 53436

Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECEEEE
INVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLGLIFYIIQPININNKRYYLPYIFPRIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLIN
CCCCHHHEHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN
HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC
HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MEKQQILQISRFLSGYSTMIFLYTIKYYFYKNFLGFKNKVWHFTLCALLVTVIDFYMMKT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLLWSIIINNIIWLLIICFLCNGNFLMKFYAVILEEAALLLINLTFLTFDFTILPTIHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECEEEE
INVSFNKHIIISFITNIINDLIRYTILFVFLKNICKFLNLKEKSIKLYENLFLLIPCLSI
EEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSLGLIFYIIQPININNKRYYLPYIFPRIYYTLPFISFALLVSLLIMAYTFKKMLEGQLE
HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENKNLLMEQQFKLQLTHSNNIEMLYKGIRGIIHDMNNHVSCLKNLAATNNIEDIKKYLIN
CCCCHHHEHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
IDETISKLDFKIKTGNSISDAVINEKYNIAKTNKIEFICDFLLPKETLLEPVDLCIILSN
HHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ALDNALEACMRITDSNLQKKICIKSYIKNMYLIIEISNSATDKIQYAENKIISTKTDKNN
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEECCCCCCC
HGIGISNIKTVAKKYNGIVDILEEKHKFIINIMLKIK
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA