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The map label for this gene is 148360658

Identifier: 148360658

GI number: 148360658

Start: 851931

End: 854048

Strand: Direct

Name: 148360658

Synonym: LPC_2604

Alternate gene names: NA

Gene position: 851931-854048 (Clockwise)

Preceding gene: 148360659

Following gene: 148360656

Centisome position: 23.82

GC content: 36.87

Gene sequence:

>2118_bases
GTGTTTCGATTTTTATTTCCTGTCAGTCTTTTTATAAGTTCCATTCTCCTATTCAGTATTCAACCCATGGTTGCAAAAGC
AATACTTCCAATTTATGGGGGAACACCTGGTGTGTGGACTGTTTGCGTACTTTTTTTTCAATTTATTCTGCTGATTGCAT
ATGGCTACGTATGGCTTTTAAGTCAGATTAAGAAACCTGCTGTTTGGCGTTTGATCCATATGGTTTTGGTTGTTTTAAGT
TTTACAGCACTTCCATTGCTGTTTCATCCTGCAGCCAGGGATGGACAACCTGAATGGGTGATTCTGCATAATTTGTTAAT
TCAACTGGGTTTGCCTTTGTTAGTAATTGGTGCTTCTGCTCCTTTATTACAATTTGCCTATAGCCAGACAAAAAGCAAAG
GGGCCTCAGACCCTTATTATTTGTACATATCCAGTAATCTTGGAAGCTTGAGTGCCTTGCTTTTTTATCCATGGGTTATT
GAGCGATTTATTGGTTTGACTCGTCAATTTTATTTATGGAACTTTGGATTTGCTATTTATTTGTTACTGTTGGTAACAGT
CTTGTTTTTTACAAAATACCAACCTTTAATATTAACTGAAAAAAAAGAGGTGGATTTTTTGCCTTGGCGAGAGATAGCCT
ATTGGATTTTTTTGAGTTTTGTCCCTTGCAGTTTGATGCTGGGAGTTACTTTATATATCACAACTGATGTTGCTGCAACT
CCCTTATTTTGGGTTTTGCCTTTAGCGCTTTACCTTTTGTCATTTGTATTTACCTTCACAGCGACCCCCCTTATTTCACA
AAAATGGATTTCTCGTAATTGCCTGTTTTTCCTGGTTTTTACAATTCTTGGATTCATTTTTGGAGTTAGCCAAATCAGAG
TGTGGCAATTGGTGTTATTTAATCTGTTAAGTTTTTTTATTTTGGCTTTACTGTGTCATGGCCAGTTATTTGCGCGAAGA
CCCAAGCCACATAAACTCACTTTGTTTTATTTTTGTTTGTCTATCGGAGGAGTTTTAGCAGGGATTTTTAATGGAATTTT
AGCGCCAAATTGGTTTAATTATGTTTATGAATACCCATTAGCCATTTTATTAAGTTTATTTGCTCTTCAGCTGCCGAAAA
CTAACCGAGGATGGTGGGTGCCATTAGTTGTTTTGGGTTTGCTGTCGCTTCATTATTTCATTCCTACCGTTCCCTGGTTT
AAAAGTACTACCACTTTTCACATCCTTGCTATTTTGGCACTTGGAATTATTGTGATTTGGCATCGTAATAAAATCAATCT
TGTACTATCCATGCTCATTTTATTTGTTTTCCTTTACTTTCCTCCGTTGCAAGACAAACAGATTTTACTCAAGGAAAGAA
ATTTTTACGGCGTCAAGCAAGTCTTCAAAAAGGATGATGTGCATGCATTAATAAGCCAATCAACCCTTCATGGGATGCAG
GTAATGAATGGGGAAAAAGCAAGTTATGGAAGAAGCTCCTATTATGGGGCCATAGCTCCAATAGTTGATATTTTGAAGAA
GGAATTTCATCCGCTTTCTGCGACGATTATGGGGTTGGGTGCAGGAACACTACTGTGCCAATTTCGGGCAACTGATTCCA
TAAAGGTTATTGAGATTGATCAACAAGTAATTGACTTAGCTAAAAATAATAAATTATTCACATACATACGAGACTGTTCG
CCTTCAGCTGAGATTATTAAACAGGATGGTCGATTGGCCTTGGTTAATATGCCAGATGCTTCACAGGATTTGTTAATTTT
GGATGCGTTTAATTCAGATGCTATTCCTGTCCATTTGATGACACTTGAAGCTTTCACCTTATATAAGAAGAAAATTGTCG
AAGATGGAGTTATTTTGGTTAATCTAAGTAACAGACATCTGCAAATGCTCCCGGTAATTAATGCAATTGGGCGATCTTTG
AATATGATAACTTTATTTTTAGCCCATAAGGGAGATAAGAAGTTGGGGCAATTTAATTCAGAGTGGGCTATGCTGACCTC
GAATCAATCCTTGGCATTTCAAGTCATGAAAGGAACAAACTGGAAATTTGTAGCAGATGATGATCAGTTTTTATGGACTG
ATGATTATTCTAATATTATTCCCTTGCTGAAATGGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTTTTGCAGAGTAATAATTCATCCTTGTATGAACGAGAGTGTAGTCGTAAAATGATCGATTCATTCATTTGGCAGCAC
CATCGGCTAAGGATTGCTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGTAAAAAGGTAATCTATCAAATTCAATTGTATCCTTGCTTTATCGTGATGCGGGCTATCCATATTACCAAGGATAAGAT
AGAAAAGTAGCCGATAATGG

Product: spermidine synthase

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 705; Mature: 705

Protein sequence:

>705_residues
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLLSQIKKPAVWRLIHMVLVVLS
FTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASAPLLQFAYSQTKSKGASDPYYLYISSNLGSLSALLFYPWVI
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NMITLFLAHKGDKKLGQFNSEWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDDQFLWTDDYSNIIPLLKW

Sequences:

>Translated_705_residues
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLLSQIKKPAVWRLIHMVLVVLS
FTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASAPLLQFAYSQTKSKGASDPYYLYISSNLGSLSALLFYPWVI
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NMITLFLAHKGDKKLGQFNSEWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDDQFLWTDDYSNIIPLLKW
>Mature_705_residues
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLLSQIKKPAVWRLIHMVLVVLS
FTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASAPLLQFAYSQTKSKGASDPYYLYISSNLGSLSALLFYPWVI
ERFIGLTRQFYLWNFGFAIYLLLLVTVLFFTKYQPLILTEKKEVDFLPWREIAYWIFLSFVPCSLMLGVTLYITTDVAAT
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PKPHKLTLFYFCLSIGGVLAGIFNGILAPNWFNYVYEYPLAILLSLFALQLPKTNRGWWVPLVVLGLLSLHYFIPTVPWF
KSTTTFHILAILALGIIVIWHRNKINLVLSMLILFVFLYFPPLQDKQILLKERNFYGVKQVFKKDDVHALISQSTLHGMQ
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NMITLFLAHKGDKKLGQFNSEWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDDQFLWTDDYSNIIPLLKW

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80454; Mature: 80454

Theoretical pI: Translated: 9.60; Mature: 9.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFRFLFPVSLFISSILLFSIQPMVAKAILPIYGGTPGVWTVCVLFFQFILLIAYGYVWLL
CCEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SQIKKPAVWRLIHMVLVVLSFTALPLLFHPAARDGQPEWVILHNLLIQLGLPLLVIGASA
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHCCCEEEECCCC
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HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLLVTVLFFTKYQPLILTEKKEVDFLPWREIAYWIFLSFVPCSLMLGVTLYITTDVAAT
HHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLSFFILALLCHGQLFARRPKPHKLTLFYFCLSIGGVLAGIFNGILAPNWFNYVYEYPL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
AILLSLFALQLPKTNRGWWVPLVVLGLLSLHYFIPTVPWFKSTTTFHILAILALGIIVIW
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VMNGEKASYGRSSYYGAIAPIVDILKKEFHPLSATIMGLGAGTLLCQFRATDSIKVIEID
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QQVIDLAKNNKLFTYIRDCSPSAEIIKQDGRLALVNMPDASQDLLILDAFNSDAIPVHLM
HHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEE
TLEAFTLYKKKIVEDGVILVNLSNRHLQMLPVINAIGRSLNMITLFLAHKGDKKLGQFNS
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEECCCCHHHCCCCC
EWAMLTSNQSLAFQVMKGTNWKFVADDDQFLWTDDYSNIIPLLKW
CEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CEEEEECCCCEEEEEEECCCEEEEECCCCEEEECCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA