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The map label for this gene is norB [H]

Identifier: 148359779

GI number: 148359779

Start: 2644728

End: 2647070

Strand: Direct

Name: norB [H]

Synonym: LPC_1704

Alternate gene names: 148359779

Gene position: 2644728-2647070 (Clockwise)

Preceding gene: 148359778

Following gene: 148359784

Centisome position: 73.95

GC content: 41.61

Gene sequence:

>2343_bases
ATGCATACTATTGCAAATGAAACACCTGTTCAAATAAATCACCCATTTGATCCAATAACCAATGTTTTAAAATGGATTTT
ACTAGTCACTGCCATTCTGTGTTTTCTCATCCTCATCTGGGGCACTGTTAAAACCTATCAATTGGCACCTCCTTTACCAG
ACCGTTTTGTGACCTCCACAGGCGAAACGGTGATGACATCACAGGACATTGTGGAAGGAAAAGCAGGTTTTCAACGCGCC
GACTTAATGGACTATGGCAGCTTATATGGTATGGGTTCCTATTTTGGCGAAGACTATACAGCAAAATATCTGGTGCGCTT
GGGAGAGTTGGTCCAGGGAGAATTGGCTAAAATTCGTTTTAATAAAGCCTATTCCGAATTAACAGAAAGTGAACAATACG
TTATTAATAAAGAAATGCAGAGCTCACTGCAACACCTTGATCTTATTGAAAAAACAAGCATCCTGACACCGGCACTTGCC
ACCTCAATACGGCAATTACAGACTGAAATCAGTCAATCGTTACTGAATCATAATTTTATGGCAGGTTATACCCAGGCCTA
TAGCTTAAATCCTGATACTGCGCTTAAAACTGCAAATTTTCTTATTTATTCCTCTTTAACAACAATAGCTCGCCGCCCAA
ATCAAAACATATCTTATACCAATAATTGGCCATACGAGCCAAGTGTTGGCAATACCCCTTCATCAGGAACGTTTTATTGG
ACCTGGATTTCATTTTGCTTTGTGTTTATGGGATTTGGTGCAGTTCTCTACATTTATCATCGTTATTTAAGTGATGTTGA
TCATGGACCCATGGAACCTATTTTTTCAGGTTTCAAACCCCTGACTCAAAGCCAACGTAAAGTAGGTCAATATTTCCTTG
TAGCCGCTTTGTTTCTTTTACTTCAAATCGCGGTAGGAGCCATCATGGCTCATTATTATGCTGAGCGCGAAAGCTTCTAT
GGTATTAATGTCAATACGTGGCTGCCTTTTAATTTCCTTCGAGACGTCCATATCCAAACTCCCATTATCTGGATTGGGCT
TTCATGGATAAGTGCAGGCATATTTATGGCACCCATCATTAGCGGTAAGGAAGCCAAAGGACAAGGGTTTTTAGTTGACC
TTCTGTTTTATGTCACCTTGCTCGTAGTGGGTGGAGCCATCCTTGGCAATTACCTGGGGATTATGGGGTATATTGATAAA
GCCTGGTTTTGGCTAGGTAATCAAGGCTTGTCTTACATACAATTAGGAAGACTGTGGCAAATCGGGTTTTGCATTGGACT
GTTTCTTTGGAGTTTTATTGTTTTCCGCGGTATGTGGCCTACGTGGGATGGATTAAAAAAAGCCACCTTTGAGTTCTGGA
CAGGTCGCATCAAACTTGAAAACCTGTTTTGGGCCAGCACTATGAATGTCGCTGTTTTATATTGTTTTGGGATGATCCCC
TTAACAGGTATTGAAAAATCGTTCACTATCACGGATTTCTGGCGTTGGTGGGTTGTGCATCTGTGGGTTGAACAATCCTT
TGAGTTTTTCGCCGCCTGTGCTACAGCTTATTTGCTCATGGGAACTGGTTTGGTTTCCAGAAAAGCAGCGGAGAGAACGG
TATATTTTGAATCCATTTTAATTTTCTTGGGCGGAGTAATTGGTACTGGCCATCATTGGTACTGGACTGGTACTCCTGAA
ATGTGGATTCCGCTAGGCTCCATGTTTTCCTTTATCGAAGTCTTGCCTCTGGTTCTTCTTATTATTGATGCGATTGAGCA
TCGACAATTGATTAAAAAGCAGGGAACGTTTACCTACAATCTCGCTTATCTCTACATATTGGGAGCCGCGTTCTGGAATT
TTGTTGGTGCCGGTGTATTCGGAGGAGGCACACTGAATGCGCCACTGATTAATTACTATGAGCATGGAACATTCTTGACT
TTAAATCATGCCCATACTGCTTTATTTGGCGCATTTGGGCTTCTTGCTCTCGGGTTAATCTATTTTTGCCTGAGATATGC
TGCTGGTGAAAGCAAGGCATGGAGTGATAGATTAGGTGTTTATGCCTTTTGGTTATATAATGCAGGGCTCTTTTTATGGA
TTGTCCTGAATTTTTTCCCAATTGGCTGGTCGCAGTTAATGGCAGTATATGAACATGGACTATCTTATGCCCGAAGTCTT
GAATTCTATAACACCACCTTATTATGGCAATGGCTTCGTTTTCCAGGGGATGTCGTATTTGCCTTGGGGGCTCTTCTTAT
GGCTTATGATTTTATTGTTAAGATTGGGCCTTTTTTTCCGAAATTTGTCCGTAATCGCCGCTTTATCGCTGGCCATCCAA
AAGCAACAGACCCAAGCTTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTTCTAAGAATCAGTCTTGTAGCTAACATGAATTGTTTCTTGTAAAGATCCTCTTTATAATCAATGCCGAATTGAACC
ATTCCGCTAAGGATAGCCTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCAATGATAGCAAAGACAAAGCCAGTGTATTTTTTTGAAAAATTATTTTGAGAAACTGAGTTTAGAAGTGAGTGTCGACA
TCCAGTTGATGGATGTCGGC

Product: nitric oxide reductase subunit B

Products: NA

Alternate protein names: NOR large subunit; Nitric oxide reductase cytochrome b subunit [H]

Number of amino acids: Translated: 780; Mature: 780

Protein sequence:

>780_residues
MHTIANETPVQINHPFDPITNVLKWILLVTAILCFLILIWGTVKTYQLAPPLPDRFVTSTGETVMTSQDIVEGKAGFQRA
DLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQGELAKIRFNKAYSELTESEQYVINKEMQSSLQHLDLIEKTSILTPALA
TSIRQLQTEISQSLLNHNFMAGYTQAYSLNPDTALKTANFLIYSSLTTIARRPNQNISYTNNWPYEPSVGNTPSSGTFYW
TWISFCFVFMGFGAVLYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLLLQIAVGAIMAHYYAERESFY
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AWFWLGNQGLSYIQLGRLWQIGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATFEFWTGRIKLENLFWASTMNVAVLYCFGMIP
LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESILIFLGGVIGTGHHWYWTGTPE
MWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYNLAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLT
LNHAHTALFGAFGLLALGLIYFCLRYAAGESKAWSDRLGVYAFWLYNAGLFLWIVLNFFPIGWSQLMAVYEHGLSYARSL
EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFVRNRRFIAGHPKATDPSL

Sequences:

>Translated_780_residues
MHTIANETPVQINHPFDPITNVLKWILLVTAILCFLILIWGTVKTYQLAPPLPDRFVTSTGETVMTSQDIVEGKAGFQRA
DLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQGELAKIRFNKAYSELTESEQYVINKEMQSSLQHLDLIEKTSILTPALA
TSIRQLQTEISQSLLNHNFMAGYTQAYSLNPDTALKTANFLIYSSLTTIARRPNQNISYTNNWPYEPSVGNTPSSGTFYW
TWISFCFVFMGFGAVLYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLLLQIAVGAIMAHYYAERESFY
GINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPIISGKEAKGQGFLVDLLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDK
AWFWLGNQGLSYIQLGRLWQIGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATFEFWTGRIKLENLFWASTMNVAVLYCFGMIP
LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESILIFLGGVIGTGHHWYWTGTPE
MWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYNLAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLT
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EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFVRNRRFIAGHPKATDPSL
>Mature_780_residues
MHTIANETPVQINHPFDPITNVLKWILLVTAILCFLILIWGTVKTYQLAPPLPDRFVTSTGETVMTSQDIVEGKAGFQRA
DLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQGELAKIRFNKAYSELTESEQYVINKEMQSSLQHLDLIEKTSILTPALA
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TWISFCFVFMGFGAVLYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLLLQIAVGAIMAHYYAERESFY
GINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPIISGKEAKGQGFLVDLLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDK
AWFWLGNQGLSYIQLGRLWQIGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATFEFWTGRIKLENLFWASTMNVAVLYCFGMIP
LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESILIFLGGVIGTGHHWYWTGTPE
MWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYNLAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLT
LNHAHTALFGAFGLLALGLIYFCLRYAAGESKAWSDRLGVYAFWLYNAGLFLWIVLNFFPIGWSQLMAVYEHGLSYARSL
EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFVRNRRFIAGHPKATDPSL

Specific function: Component of the anaerobic respiratory chain that transforms nitrate to dinitrogen (denitrification). NorB is the catalytic subunit of the enzyme complex. Shows proton pump activity across the membrane in denitrifying bacterial cells. The mononitrogen red

COG id: COG3256

COG function: function code P; Nitric oxide reductase large subunit

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the heme-copper respiratory oxidase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000883 [H]

Pfam domain/function: PF00115 COX1 [H]

EC number: =1.7.99.7 [H]

Molecular weight: Translated: 88707; Mature: 88707

Theoretical pI: Translated: 7.46; Mature: 7.46

Prosite motif: PS50855 COX1 ; PS00077 COX1_CUB

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MHTIANETPVQINHPFDPITNVLKWILLVTAILCFLILIWGTVKTYQLAPPLPDRFVTST
CCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHCCC
GETVMTSQDIVEGKAGFQRADLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQGELAKIRF
CCEEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKAYSELTESEQYVINKEMQSSLQHLDLIEKTSILTPALATSIRQLQTEISQSLLNHNFM
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
AGYTQAYSLNPDTALKTANFLIYSSLTTIARRPNQNISYTNNWPYEPSVGNTPSSGTFYW
CCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEH
TWISFCFVFMGFGAVLYIYHRYLSDVDHGPMEPIFSGFKPLTQSQRKVGQYFLVAALFLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQIAVGAIMAHYYAERESFYGINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPII
HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHC
SGKEAKGQGFLVDLLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDKAWFWLGNQGLSYIQLGRLWQ
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
IGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATFEFWTGRIKLENLFWASTMNVAVLYCFGMIP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHHCC
LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESIL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IFLGGVIGTGHHWYWTGTPEMWIPLGSMFSFIEVLPLVLLIIDAIEHRQLIKKQGTFTYN
HHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEH
LAYLYILGAAFWNFVGAGVFGGGTLNAPLINYYEHGTFLTLNHAHTALFGAFGLLALGLI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFCLRYAAGESKAWSDRLGVYAFWLYNAGLFLWIVLNFFPIGWSQLMAVYEHGLSYARSL
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFYNTTLLWQWLRFPGDVVFALGALLMAYDFIVKIGPFFPKFVRNRRFIAGHPKATDPSL
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MHTIANETPVQINHPFDPITNVLKWILLVTAILCFLILIWGTVKTYQLAPPLPDRFVTST
CCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHCCC
GETVMTSQDIVEGKAGFQRADLMDYGSLYGMGSYFGEDYTAKYLVRLGELVQGELAKIRF
CCEEECHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKAYSELTESEQYVINKEMQSSLQHLDLIEKTSILTPALATSIRQLQTEISQSLLNHNFM
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEH
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LQIAVGAIMAHYYAERESFYGINVNTWLPFNFLRDVHIQTPIIWIGLSWISAGIFMAPII
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SGKEAKGQGFLVDLLFYVTLLVVGGAILGNYLGIMGYIDKAWFWLGNQGLSYIQLGRLWQ
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IGFCIGLFLWSFIVFRGMWPTWDGLKKATFEFWTGRIKLENLFWASTMNVAVLYCFGMIP
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LTGIEKSFTITDFWRWWVVHLWVEQSFEFFAACATAYLLMGTGLVSRKAAERTVYFESIL
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7508388; 2542222; 9521721 [H]