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The map label for this gene is 148358331

Identifier: 148358331

GI number: 148358331

Start: 209934

End: 211376

Strand: Reverse

Name: 148358331

Synonym: LPC_0194

Alternate gene names: NA

Gene position: 211376-209934 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148358332

Following gene: 148358330

Centisome position: 5.91

GC content: 36.17

Gene sequence:

>1443_bases
ATGAATAACCAATTCAAAGCCAAGTCAAAAACTCCACTACAGTTTAAAGTTTTTCATACTTTATTGGGATTTGCGGTCTT
TTTCTCCCTGATTACCGTTCCTGCGGAAGCTCAGGTAATCATCTTTTTTGAAATACCGGTATCCTCTGAATTGCTCTGGT
GGCCGATTGTATTTTTCTCTTTTCAATTGATTCACAGCATCTATGGTTTTTCTTATTTGCGCCATGCTCTATATTTGGTG
ATTTTATTCCACGCTATCTACATTTTATTTTTAAAATTTGCGATCTGGCTACCAGCTTCATCATTCTGGCAAATGCAGGA
AACTTACACTCAAGTTTTAGGCAGGGATTTTTTATATATTGCCATGAGTTCTTTGTGCTTATGGGCATGTACATTGCTGC
CGTTAAAATTTATCAATGACATAAAAGAAAATCAGAGAAGGTTGCTATTTTTTGCAGGCTTAATGCTCTTTTCATTATTG
GACCGTGCTCTATTGAACCCACAAAGTTCAAGCAGCGAGGCACAATTTATCGTGCCGATATTAATTTATTATTTTCTTAA
TATTTTTTCCGGCACATTGTTTCAGTTTATTTCAAGAGTTGAAGGCATTACCCGGCAAAAGGATCTAGCGCGTGATTTAT
TTAAGTTTCAGATACCTGACATCACTAATGCCATTGACCAAAAATTTAAGTACCACCATATCCTTTTTTGCTCAAGCATT
GTTTTCTTTATTGCCTCTAAAACTATGGCGGCAAAATTTATATCCATTGGTTTTCTTACCATTAATGTTGGCGGAATTGT
CTTTTCACTGGCTTACCTGACAGCGGATATGATGACTGATGTTTATGGAATCGAGCGCACCAAGCAAATGGTGCTATTTA
TCATTTTTTGTAATTTGTTACTGGTAGGTGATGTATGGATAACAAACCTGCTGGCGATAGGAGAAAATGATCCGTTTAAA
TCCATTCTCCATAATCAGGCACGGATGTTTATAGCGTCTGCCACAGCTTTTTTCCTAGGGATGACCATTAATTCAACGGT
TATTTCCATTATCAAAGCGCGGCAAAGAAAACGCGGGATATCGTTAAAAAAAGAATTTATTACCACTGTCTGGACAAGGA
TCGCCACCTCATCGGCTTTTGGAATTATAATTGATGTGAGCTTGTTTTCACTGGTGGCATTTTATGGCATCGTGCCTAAC
GAAAAACTGGGAAGCGTGATTATTTTTGAAGATGCTTATAAAATATCCTACGAAATTGTATTAGCGCCTGTATCTATCCT
GTTAATTTATTTTCTTAAAATTAAAGAAAAAGTGGATATTTATGATGAGCTATCCAATTTAAATCCTTTTAGGATCAATA
CCAGTTATAACATTAATGCAAACAAATTTGCGGAAAACTATGTCCAACCTGAGCGAAGAAATGATAGAAAGCCACATTTA
TGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACAGTTTGGCGCCCATTCTGAAAAGCTCACTATTTTAGAGAAAAAACAGCCTGATTTAAAAACCAAATGCATCGCTGG
CTTAAAACGGGTGTTTATTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTCATGACGGCAACTATTGCAGTGGCCGGCGAAAACCCCATGGCTCCCTATGGTGCAATTATTGTTTATGATGATAAAG
AAATTCTTTTAAAATCGGTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480

Protein sequence:

>480_residues
MNNQFKAKSKTPLQFKVFHTLLGFAVFFSLITVPAEAQVIIFFEIPVSSELLWWPIVFFSFQLIHSIYGFSYLRHALYLV
ILFHAIYILFLKFAIWLPASSFWQMQETYTQVLGRDFLYIAMSSLCLWACTLLPLKFINDIKENQRRLLFFAGLMLFSLL
DRALLNPQSSSSEAQFIVPILIYYFLNIFSGTLFQFISRVEGITRQKDLARDLFKFQIPDITNAIDQKFKYHHILFCSSI
VFFIASKTMAAKFISIGFLTINVGGIVFSLAYLTADMMTDVYGIERTKQMVLFIIFCNLLLVGDVWITNLLAIGENDPFK
SILHNQARMFIASATAFFLGMTINSTVISIIKARQRKRGISLKKEFITTVWTRIATSSAFGIIIDVSLFSLVAFYGIVPN
EKLGSVIIFEDAYKISYEIVLAPVSILLIYFLKIKEKVDIYDELSNLNPFRINTSYNINANKFAENYVQPERRNDRKPHL

Sequences:

>Translated_480_residues
MNNQFKAKSKTPLQFKVFHTLLGFAVFFSLITVPAEAQVIIFFEIPVSSELLWWPIVFFSFQLIHSIYGFSYLRHALYLV
ILFHAIYILFLKFAIWLPASSFWQMQETYTQVLGRDFLYIAMSSLCLWACTLLPLKFINDIKENQRRLLFFAGLMLFSLL
DRALLNPQSSSSEAQFIVPILIYYFLNIFSGTLFQFISRVEGITRQKDLARDLFKFQIPDITNAIDQKFKYHHILFCSSI
VFFIASKTMAAKFISIGFLTINVGGIVFSLAYLTADMMTDVYGIERTKQMVLFIIFCNLLLVGDVWITNLLAIGENDPFK
SILHNQARMFIASATAFFLGMTINSTVISIIKARQRKRGISLKKEFITTVWTRIATSSAFGIIIDVSLFSLVAFYGIVPN
EKLGSVIIFEDAYKISYEIVLAPVSILLIYFLKIKEKVDIYDELSNLNPFRINTSYNINANKFAENYVQPERRNDRKPHL
>Mature_480_residues
MNNQFKAKSKTPLQFKVFHTLLGFAVFFSLITVPAEAQVIIFFEIPVSSELLWWPIVFFSFQLIHSIYGFSYLRHALYLV
ILFHAIYILFLKFAIWLPASSFWQMQETYTQVLGRDFLYIAMSSLCLWACTLLPLKFINDIKENQRRLLFFAGLMLFSLL
DRALLNPQSSSSEAQFIVPILIYYFLNIFSGTLFQFISRVEGITRQKDLARDLFKFQIPDITNAIDQKFKYHHILFCSSI
VFFIASKTMAAKFISIGFLTINVGGIVFSLAYLTADMMTDVYGIERTKQMVLFIIFCNLLLVGDVWITNLLAIGENDPFK
SILHNQARMFIASATAFFLGMTINSTVISIIKARQRKRGISLKKEFITTVWTRIATSSAFGIIIDVSLFSLVAFYGIVPN
EKLGSVIIFEDAYKISYEIVLAPVSILLIYFLKIKEKVDIYDELSNLNPFRINTSYNINANKFAENYVQPERRNDRKPHL

Specific function: Unknown

COG id: COG1738

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55299; Mature: 55299

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNQFKAKSKTPLQFKVFHTLLGFAVFFSLITVPAEAQVIIFFEIPVSSELLWWPIVFFS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
FQLIHSIYGFSYLRHALYLVILFHAIYILFLKFAIWLPASSFWQMQETYTQVLGRDFLYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
AMSSLCLWACTLLPLKFINDIKENQRRLLFFAGLMLFSLLDRALLNPQSSSSEAQFIVPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
LIYYFLNIFSGTLFQFISRVEGITRQKDLARDLFKFQIPDITNAIDQKFKYHHILFCSSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFFIASKTMAAKFISIGFLTINVGGIVFSLAYLTADMMTDVYGIERTKQMVLFIIFCNLL
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVGDVWITNLLAIGENDPFKSILHNQARMFIASATAFFLGMTINSTVISIIKARQRKRGI
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SLKKEFITTVWTRIATSSAFGIIIDVSLFSLVAFYGIVPNEKLGSVIIFEDAYKISYEIV
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCHHEEHHHH
LAPVSILLIYFLKIKEKVDIYDELSNLNPFRINTSYNINANKFAENYVQPERRNDRKPHL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNNQFKAKSKTPLQFKVFHTLLGFAVFFSLITVPAEAQVIIFFEIPVSSELLWWPIVFFS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
FQLIHSIYGFSYLRHALYLVILFHAIYILFLKFAIWLPASSFWQMQETYTQVLGRDFLYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
AMSSLCLWACTLLPLKFINDIKENQRRLLFFAGLMLFSLLDRALLNPQSSSSEAQFIVPI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
LIYYFLNIFSGTLFQFISRVEGITRQKDLARDLFKFQIPDITNAIDQKFKYHHILFCSSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFFIASKTMAAKFISIGFLTINVGGIVFSLAYLTADMMTDVYGIERTKQMVLFIIFCNLL
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVGDVWITNLLAIGENDPFKSILHNQARMFIASATAFFLGMTINSTVISIIKARQRKRGI
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SLKKEFITTVWTRIATSSAFGIIIDVSLFSLVAFYGIVPNEKLGSVIIFEDAYKISYEIV
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCHHEEHHHH
LAPVSILLIYFLKIKEKVDIYDELSNLNPFRINTSYNINANKFAENYVQPERRNDRKPHL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA