| Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009487 |
| Length | 2,906,700 |
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The map label for this gene is 148268171
Identifier: 148268171
GI number: 148268171
Start: 1849777
End: 1851264
Strand: Reverse
Name: 148268171
Synonym: SaurJH9_1748
Alternate gene names: NA
Gene position: 1851264-1849777 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148268172
Following gene: 148268170
Centisome position: 63.69
GC content: 28.49
Gene sequence:
>1488_bases GTGAAAACAATTCAATTACACAAGACAACTTTGATATTAATTGCGATATTATTGTTTTATACTTTTATGGGTATCTTACT ACCAATCATGCACGATGATTTACAATGGTTTAGCAATTATAATACTGATATTTTAAAAGTAGGATTTGCATCACTTAATG GTCGCTATATCGGAAATATCTTTGAAATTATAGCTGTACATGTAAGCTGGTTACGTTGGCTTTCATATGGTCTCATTAGT ATGGGCATCATTTGGATGATTATGCACATTACACGTTGTAAAGCGTGGACAAGCTATTATTTGTTAGCATTTTCTTTAAT GTTAATTTTACCAAGTGCTATTTATGCAGATACATATGGCTGGTTTGCAGGATTTTATAATTATGCGACATCAACACTAA TTTCACTCTTTATTATTTATTATTGTATTAATGCAATTATATATAAAGAAAAGCAGCCGGTAAGTGTTACTGTACTATTC TATGTTTTATGCTTCTTCGGTCAATTATTTATGGAGAATGTGACATTATTCCACTGTATCATTTTAATTTTAGCTTTTCT GTATGAATTTACTGCAAATCGAACACTTAATTATAAATTATTGTTTTCATTTATGATTGCTACTATAGGTACAATCATTA TGTTTTCCAATCCAAATTATCGCAAAATTTTATTTGAAGGATCAGAATATCAACAAGTTTCAAATAATCAAGGTATCTTT TCAAAATTTGCAGAAATGATATCAACGTCACTTCCATATGGTGTCATTTTCAGTCAGATTATAATTTTAAGTATGATTGC AGCGCTTATTATTTATCTACTGCTTAGAAGTGATCGGTATGTACATTTAACAATATTAAAGCGTCGTATCATTATGATAG GATTTATCACTTTACCGCTTTATTATTTACTATTTTACAATCAGTTTTTATTAAATAAAAATACAGATATTGGATTGGTT GGTTTTGTGAACGTAATTGTATGTGGTTACTTTGCGTTTTCGATATTTGTAGGTATTTATTTGTCTATTAATGATCGTAA AACACAAATCACTTTATATTCCTTACTTATTGCAATATGTGTTTCGGCGTCGACACTAGTCATTGTTACTCCAATAGAAC CAGGTAATTTTTTGATTGTTTATACGATACATGTAATCATTTTAATTATTTTATTAAAAGAATTTCGGAAATATAAGTCA ATCAATGTTAATTTTATTAAAGGTGCATCACTAGTTTTAGCTGTGATATATCTTAGTGCATTTATTTATGTTCATTATGA ACATGAAAAAAGAGTTCAGTTATTAAAACAACAAATTAAAGATCATCCACGACAAGAGGTTTATACAGTGGAATCATTGC CGTTTGAACATTATATGCATCATCCGTCACCAATCAATAAAAATTACCAAGAGTGGTTTAATAATTATGAAGAATTACCG AAAATGACCAAAGTTAAATATATTCCATTTGGTTCAGACGATTCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAACATGCATAGGTGAAAATTAGAAATACATTAAAAATATTGAATTAATTTTTCGACCTACAAGTTGAGGAAAATTTAAC TAGATTTGAGGATTAGCAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTATTCTTACCTATAAAAATTTAAAATAGCAGCATAAAAATATTAAAAAGTAGACATAATCATGAAATGATAATGTGCA TCTCAAAAGTTGGACTTTTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 495; Mature: 495
Protein sequence:
>495_residues MKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPIMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLSYGLIS MGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLF YVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSNNQGIF SKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNTDIGLV GFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKS INVNFIKGASLVLAVIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNNYEELP KMTKVKYIPFGSDDS
Sequences:
>Translated_495_residues MKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPIMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLSYGLIS MGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLF YVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSNNQGIF SKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNTDIGLV GFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKS INVNFIKGASLVLAVIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNNYEELP KMTKVKYIPFGSDDS >Mature_495_residues MKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPIMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLSYGLIS MGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLF YVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSNNQGIF SKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNTDIGLV GFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKS INVNFIKGASLVLAVIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNNYEELP KMTKVKYIPFGSDDS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57697; Mature: 57697
Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPIMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNI CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHCCCCHHHHH FEIIAVHVSWLRWLSYGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLFYVLCFFGQLFMENVTLFHCI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSNNQGIF HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHCCCCCHH SKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPL HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH YYLLFYNQFLLNKNTDIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAIC HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH VSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKSINVNFIKGASLVLAVIYLSA HCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH FIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNNYEELP HHHEEECHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC KMTKVKYIPFGSDDS HHHCEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPIMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNI CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEHHHCCCCHHHHH FEIIAVHVSWLRWLSYGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLFYVLCFFGQLFMENVTLFHCI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSNNQGIF HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHCCCCCHH SKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPL HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH YYLLFYNQFLLNKNTDIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAIC HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHH VSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKSINVNFIKGASLVLAVIYLSA HCCCEEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH FIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNNYEELP HHHEEECHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCC KMTKVKYIPFGSDDS HHHCEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA