Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yjbQ [H]

Identifier: 148267442

GI number: 148267442

Start: 1061051

End: 1062895

Strand: Direct

Name: yjbQ [H]

Synonym: SaurJH9_1008

Alternate gene names: 148267442

Gene position: 1061051-1062895 (Clockwise)

Preceding gene: 148267441

Following gene: 148267443

Centisome position: 36.5

GC content: 31.65

Gene sequence:

>1845_bases
ATGGAGTTTTTATCTTTAGTTATTGTTGTTTTAGCAGCGTTTTTAACTCCAATAATTGTCAATCGATTAAATATTAATTT
CTTGCCAGTTGTTGTTGCAGAAATTTTGATGGGGATTGTGATTGGAAATTCATTTCTAAATATAGTAGAAAGGGATTCAA
TTCTAAATATTTTATCAACGTTAGGCTTTATCTTTTTAATGTTTTTAAGTGGTTTAGAAATTGATTTTAAAGCTTTTAAA
AAAGATAAACGCGCACGTCAAGGACAAAATGATGATGAATCCTCAATTCCAGGGCATCTTAATCTAGCGTTAACTGTATT
TGCATTTATTATGATTATTTCGATTCTTTTAGCGTATGTATTTAAATGGCTTGGATTAGTGGATGATGTGTTATTAATGG
TCATTATCATTTCAACTATTTCCTTAGGCGTAGTTGTTCCAACTTTAAAAGAAATGAATATTATGAGAACAACTATAGGG
CAATTTATCCTATTAGTAGCAGTACTTGCGGACTTAGTAACTATGATTTTATTAACGGTCTATGGCGCAATCAATGGTCA
AGGCGGCAGTACAATATGGTTAATAGGTATATTAGTTGTTTTCACAGCAATTTCATATATTTTAGGTGTTCAATTTAAAA
GAATGTCATTTTTACAAAAATTGATGGATGGTACGACGCAAATCGGTATTCGTGCGGTATTTGCATTAATAATATTATTA
GTAGCCCTAGCAGAGGGAGTTGGCGCAGAAAATATATTAGGTGCATTCTTAGCAGGTGTCGTTGTTTCATTATTAAATCC
AGATGAAGAAATGGTTGAAAAGTTAGACTCATTTGGTTATGGGTTCTTTATTCCTATTTTCTTTATAATGGTTGGTGTAG
ATTTAAACATACCTTCATTAATTAAAGAACCGAAATTACTAATTATCATACCGATTTTAATCGTTGCATTTATCATTTCA
AAATTAATTCCAGTCATGTTTATTCGACGTTGGTTTGATATGAAAACAACGATTGCATCAGCATTTTTATTAACATCAAC
ATTATCGCTCGTGATAGCTGCAGCCAAAATTTCAGAAAGATTAAATGCTATTTCAGCTGAAACGTCAGGTATATTAATTT
TAAGCGCAGTCATTACATGTGTATTCGTTCCGATTATTTTCAAAAAACTGTTTCCAGTTCCAGATGAGTTTAACCGTAAA
ATTGAAGTTAGTTTAATTGGTAAAAATCAATTAACGATTCCTATAGCGCAAAATTTAACATCTCAGTTATATGACGTGAC
ATTATATTATCGCAAAGACTTGAGTGATCGTCGTCAATTGTCAGATGATATCACGATGATAGAAATTGCTGATTATGAAC
AAGATGTTTTAGAACGACTAGGTCTGTTTGACCGAGACATAGTTGTTTGTGCTACGAATGACGATGATATTAACCGAAAA
GTTGCTAAATTAGCCAAAGCACATCAAGTTGAGCGTGTCATTTGCAGACTTGAAAGCACAACGGACGATACAGAGTTAGT
TGATTCAGGTATTGAAATTTTCAGTAGCTACTTAAGTAATAAAATCTTATTAAAAGGTTTAATTGAAACACCTAACATGT
TGAATTTATTAAGTAATGTTGAAACGTCACTATATGAAATTCAAATGTTAAATTATAAATATGAAAATATTCAATTACGT
AATTTCCCATTCGGAGGAGACATCATCTTCGTGCGTATTATCCGTAATAATGAGTCGATTGTTCCGCATGGAGATACACA
ATTGCGATATGGAGATCGCTTAATTGTTACCGGTGCTAAAGAATACGTTGATGAATTGAAGCAAGAGTTAGAATTTTATT
TTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGTGGACCATTTATTACAACAATTAATGATATTATTAGTATGTTGATTTATTTTGGTTTAGCTACATCATTTATGGCTT
ACTTAATTTAAGGAGGAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAATAATGATATTAAAATGCAGACGTATTTTAGTACGACGTAAAATTAATGATTTTAAAATGCTAGTATGTATATGATTT
TGATAAATAAATGCTTTTTA

Product: sodium/hydrogen exchanger

Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Periplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 614; Mature: 614

Protein sequence:

>614_residues
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFKAFK
KDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYVFKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIG
QFILLVAVLADLVTMILLTVYGAINGQGGSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSLIKEPKLLIIIPILIVAFIIS
KLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISERLNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRK
IEVSLIGKNQLTIPIAQNLTSQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIQMLNYKYENIQLR
NFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAKEYVDELKQELEFYF

Sequences:

>Translated_614_residues
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFKAFK
KDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYVFKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIG
QFILLVAVLADLVTMILLTVYGAINGQGGSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSLIKEPKLLIIIPILIVAFIIS
KLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISERLNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRK
IEVSLIGKNQLTIPIAQNLTSQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIQMLNYKYENIQLR
NFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAKEYVDELKQELEFYF
>Mature_614_residues
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILSTLGFIFLMFLSGLEIDFKAFK
KDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYVFKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIG
QFILLVAVLADLVTMILLTVYGAINGQGGSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSLIKEPKLLIIIPILIVAFIIS
KLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISERLNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRK
IEVSLIGKNQLTIPIAQNLTSQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNVETSLYEIQMLNYKYENIQLR
NFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAKEYVDELKQELEFYF

Specific function: Probable Na(+)/H(+) antiporter [H]

COG id: COG0475

COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 RCK N-terminal domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786232, Length=549, Percent_Identity=24.5901639344262, Blast_Score=70, Evalue=4e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR016040
- InterPro:   IPR006037
- InterPro:   IPR003148 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger; PF02080 TrkA_C; PF02254 TrkA_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 68680; Mature: 68680

Theoretical pI: Translated: 4.70; Mature: 4.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILST
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGFIFLMFLSGLEIDFKAFKKDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYV
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIGQFILLVAVLADLVTMILLTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGAINGQGGSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSL
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
IKEPKLLIIIPILIVAFIISKLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISER
HCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRKIEVSLIGKNQLTIPIAQNLT
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCEEEHHHHHHH
SQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHH
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
ETSLYEIQMLNYKYENIQLRNFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAK
HHHHHHHHHHCEEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCEEEEECHH
EYVDELKQELEFYF
HHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEFLSLVIVVLAAFLTPIIVNRLNINFLPVVVAEILMGIVIGNSFLNIVERDSILNILST
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGFIFLMFLSGLEIDFKAFKKDKRARQGQNDDESSIPGHLNLALTVFAFIMIISILLAYV
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKWLGLVDDVLLMVIIISTISLGVVVPTLKEMNIMRTTIGQFILLVAVLADLVTMILLTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YGAINGQGGSTIWLIGILVVFTAISYILGVQFKRMSFLQKLMDGTTQIGIRAVFALIILL
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VALAEGVGAENILGAFLAGVVVSLLNPDEEMVEKLDSFGYGFFIPIFFIMVGVDLNIPSL
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
IKEPKLLIIIPILIVAFIISKLIPVMFIRRWFDMKTTIASAFLLTSTLSLVIAAAKISER
HCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNAISAETSGILILSAVITCVFVPIIFKKLFPVPDEFNRKIEVSLIGKNQLTIPIAQNLT
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEEEEECCCCEEEHHHHHHH
SQLYDVTLYYRKDLSDRRQLSDDITMIEIADYEQDVLERLGLFDRDIVVCATNDDDINRK
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCHHHHH
VAKLAKAHQVERVICRLESTTDDTELVDSGIEIFSSYLSNKILLKGLIETPNMLNLLSNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
ETSLYEIQMLNYKYENIQLRNFPFGGDIIFVRIIRNNESIVPHGDTQLRYGDRLIVTGAK
HHHHHHHHHHCEEECCEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCEEEEECHH
EYVDELKQELEFYF
HHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Periplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]