Definition | Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9, complete genome. |
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Accession | NC_009487 |
Length | 2,906,700 |
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The map label for this gene is 148266626
Identifier: 148266626
GI number: 148266626
Start: 223333
End: 225018
Strand: Direct
Name: 148266626
Synonym: SaurJH9_0186
Alternate gene names: NA
Gene position: 223333-225018 (Clockwise)
Preceding gene: 148266625
Following gene: 148266627
Centisome position: 7.68
GC content: 23.37
Gene sequence:
>1686_bases ATGAATAATTCAATATTTTATACCTATTTAAAATTTAATCTTAGATATTTTATCCGTAGAAAATTTGAAATTGTAAAAAG GTCGCGACTTAATGTTACTACAAAAATACTGTTTTTAATTAAATTGATTTTTTCGTCACTATTATTATTTATTTCAACTA TTATGTTAGCTGACTATTTCAGTGATTATATTGATTTTATAGAATATTATTTCTATGCGAGTATGTTTATTTACATTGTA TTTATACCATTAATACCTAGAACTAAATTATTGATCAATCCAATGGATAAACAGCTGTTATATAGATCTAGTTTGAGAGA AGTTGACATTTTTAACTTGATATATGCTTCAGACGTTTTAAAAAAGTTTGTTGGATATTTTAATTTGTTGATAGTTGGTA TGGCTATTAGTTTATATCATATTAGTCCTTTTATATTTAACCTCAAGGTTTTTTGTGCACTAATATACTTTTCAACAATC TCTTATGTAATTCAAATTATTTTTATAAATATTAAAGTCATAAGCACAAAAAAATTATTTTCTTATCACTATTGTGTTTT TAATTTTATGATGGGAAGCATTGTTTCTGTTATTGGATTTGTCGTCTCATTTCTTTTAGTAAATTTATTAATAAAGCCCT TTTTAGTTTTTTCGACATATGTAATAAAAAGTAAGAAAACTTTTGAATGGTATAGTTATTTTCAGGATATAAAGAACGAA GTCATTATTATTAATGAAAAAGTTATGCAATTATTAGATTATATATCACCTCACACTATTTTTATGAGATTAAACTTTGT GAATATATCATTTGTGATTATTACAATAGCTTTATTTATAGCGTTATATTATTTTAATAAAATAGGGTTTTGGTATAGAA AAGAAGATATCTATCTATCTTCAACAAATATTAATTTTTCGTTGCCAATTTCAATAAAAGCTATAACAACAATACAGCTA AAACACTGGATAAGTAACAAAGAAGAAGTTAATTTACATAAACCTTTCTTCTATATTAGTTATTCAATATGGTTCTTTTT AGGGTGTTTAATCTATTTTTCACAGATGGCATATAATCAGTTAGCTAATGCAGTTATTTTTATTTTGATATTAAACACTA TAACTCGTGATAGTTTTTCTGCGGGGACGGATTTTTTTACTAAATCATTACGTTTTGATTCAGATAGAAAAAGTATCGGT TTGTATAGGATGTCAAACACTGATTTTAAACAAATTTACGATTCTAAATTATCTCTAATTCGCTTTATTGGTTTTAAAGA AACAATACTTGCTATTATTTTATTAGCAATATTTTTAAATCAAGACATATATTTATATATAATTGGATTTGAAATAATAA TCATCAATACAGTAATAATTCCTAATTTATCATTATTACCTTCGTATTTATCTCCACATTTCAATCATCAACATTACAGT GAATTAGAGTCTTTTGAAGAACAAATTTTTCTTGAAGATACTGTTTTTGATAAAGTTAAGAATTTTTTATCGTCATCATA TTTTTTAATTCTATTTGTAGGTTACTTATCTCAACGTAATTATATTGACATAATGATTTTTATAATTATTTTCAACATTT TAGCCTTAATACTTGTTTCGTTGTTTATTAGGTTTTCTAAACAAAAAATAACAAAGTCTTGGAGAAAGAGGGATTTATAT TTATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGGGCGTACGAAAAACAGCTGCTTGGTAAAAGATAATCTAATTCTTTATAAGAGAGGCTTTCTTTTTTGGGAAAGCCTC TTTTTAAAAAAGGAGATTCA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTAAATACAAAAAAATTTTTATTTTTAATATATTGGTGTTAATAATAGGCGGATTATTGGGATGCTTGGTTTATTACT TATTAAATATTGATTTAGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 561; Mature: 561
Protein sequence:
>561_residues MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYFSDYIDFIEYYFYASMFIYIV FIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVLKKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFNLKVFCALIYFSTI SYVIQIIFINIKVISTKKLFSYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKNE VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFIALYYFNKIGFWYRKEDIYLSSTNINFSLPISIKAITTIQL KHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQLANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIG LYRMSNTDFKQIYDSKLSLIRFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVSLFIRFSKQKITKSWRKRDLY L
Sequences:
>Translated_561_residues MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYFSDYIDFIEYYFYASMFIYIV FIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVLKKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFNLKVFCALIYFSTI SYVIQIIFINIKVISTKKLFSYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKNE VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFIALYYFNKIGFWYRKEDIYLSSTNINFSLPISIKAITTIQL KHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQLANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIG LYRMSNTDFKQIYDSKLSLIRFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVSLFIRFSKQKITKSWRKRDLY L >Mature_561_residues MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYFSDYIDFIEYYFYASMFIYIV FIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVLKKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFNLKVFCALIYFSTI SYVIQIIFINIKVISTKKLFSYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKNE VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFIALYYFNKIGFWYRKEDIYLSSTNINFSLPISIKAITTIQL KHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQLANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIG LYRMSNTDFKQIYDSKLSLIRFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVSLFIRFSKQKITKSWRKRDLY L
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 66715; Mature: 66715
Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYF CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SDYIDFIEYYFYASMFIYIVFIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH KKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFNLKVFCALIYFSTISYVIQIIFINIKVISTKKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHH SYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKNE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCC VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFIALYYFNKIGFWYRKEDIYLS EEEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECEEEEE STNINFSLPISIKAITTIQLKHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQ ECCCEEEECEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIGLYRMSNTDFKQIYDSKLSLI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH RFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFIRFSKQKITKSWRKRDLYL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNNSIFYTYLKFNLRYFIRRKFEIVKRSRLNVTTKILFLIKLIFSSLLLFISTIMLADYF CCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SDYIDFIEYYFYASMFIYIVFIPLIPRTKLLINPMDKQLLYRSSLREVDIFNLIYASDVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH KKFVGYFNLLIVGMAISLYHISPFIFNLKVFCALIYFSTISYVIQIIFINIKVISTKKLF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHH SYHYCVFNFMMGSIVSVIGFVVSFLLVNLLIKPFLVFSTYVIKSKKTFEWYSYFQDIKNE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCC VIIINEKVMQLLDYISPHTIFMRLNFVNISFVIITIALFIALYYFNKIGFWYRKEDIYLS EEEECHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECEEEEE STNINFSLPISIKAITTIQLKHWISNKEEVNLHKPFFYISYSIWFFLGCLIYFSQMAYNQ ECCCEEEECEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LANAVIFILILNTITRDSFSAGTDFFTKSLRFDSDRKSIGLYRMSNTDFKQIYDSKLSLI HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH RFIGFKETILAIILLAIFLNQDIYLYIIGFEIIIINTVIIPNLSLLPSYLSPHFNHQHYS HHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHEEHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHH ELESFEEQIFLEDTVFDKVKNFLSSSYFLILFVGYLSQRNYIDIMIFIIIFNILALILVS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFIRFSKQKITKSWRKRDLYL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA