Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 148266585

Identifier: 148266585

GI number: 148266585

Start: 171416

End: 172621

Strand: Direct

Name: 148266585

Synonym: SaurJH9_0145

Alternate gene names: NA

Gene position: 171416-172621 (Clockwise)

Preceding gene: 148266584

Following gene: 148266586

Centisome position: 5.9

GC content: 26.7

Gene sequence:

>1206_bases
ATGGTTAAGAAAGTTTTTATTATGGATAGCGTAAAGACAATAATTGGTACGTTGCTTATAGCTTTAGGATTACAATTTTT
AGCTTATCCAATTATTAATCAACGAGTAGGTAATGAAGCGTTTGGTTCTATTTTAACGATTTATACAATAATAACAATCA
CGAGTGTTGTATTAGGCAATACGCTTAACAATATACGATTAATTAATATGAATCTATACAAATCCAATCATTACTACTGG
AAATTTGTGTCGATACTTTTAATTTCAATTCTGATTGAGAGTATAGCTTTAATTATTGTATTTCTTTACTTTTTTAATTT
GAACACCATCGATATTATCTTTTTAATTCTACTTAATATTTTAATGTGTTTAAGGATTTATCTGAATGTATTTTTTAGGA
TGACTTTAAAATATAATCAGATTTTGTATATTGCTCTTATTCAATTTTTAGGTTTGCTGATAGGACTATTTCTATATTAT
TTAATCCAAAACTGGATTGTTTGTTTTATTACCAGTGAATTGTTTGCAACGATATATACATTGGTTAAATTACGGGGATT
AACTATAGGCGAGTATCAAAGTGAAGATAATAATGTGGTCAAAGATTATGTGATGCTACTGAGTACAAATAGCCTTAATA
ATTTGAATCTCTACTTAGATAGATTAATCTTATTACCAATTATAGGTGGAACAGCTGTAACTATATCATTTCTTTCAACA
TTTATTGGGAAAATGTTAGCTACATTTCTGTATCCGATTAATAATGTAGTACTTTCATATATTTCTGTAAATGAAAGCGA
CAATATAAAGAAGCAATATTTGAAAACTAATCTATTTGCTATAGCTGCACTATGTTTAGTCATGATTATATGTTATCCAA
TTACATTAATTATTGTCTCTTTACTGTATAACATTGATTCAAGTTTATATTCGAAGTTTATTATTTTAGGTAATATAGGT
GTTTTATTCAATGCAGTGAGTATTATGATCCAAACTTTAAATACAAAACACGCATCAATAACATTACAAGCGAATTATAT
GACGCTTCACACGATTACATTTATATTCATAACTATTTTAATGACAATTGCGTTTGGTCTAAATGGATTCTTTTGGACAA
CGCTGTTCAGCAACATTATTAAGTATGTGATTTTAAATATTATAGGTTTAAAGTCTAAATTCATTAATAAAAAGGACGTC
GATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTATCCAATCACATTATTAATGTTTAGTTCAAATTATTTAGTTGTAAGTGAATTTTGGTTTGTGTTGTTCTATTTTAT
TACAAAAGGACGGCGTCATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAGTGAAAAAAAGATTTTGATTTTATGTCAGTATTTTTATCCGGAATATGTATCTTCTGCGACGTTACCAACTCAATT
GGCGGAAGATTTAATTGCGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 401; Mature: 401

Protein sequence:

>401_residues
MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYW
KFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYY
LIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLST
FIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIG
VLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDV
D

Sequences:

>Translated_401_residues
MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYW
KFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYY
LIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLST
FIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIG
VLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDV
D
>Mature_401_residues
MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGNTLNNIRLINMNLYKSNHYYW
KFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNILMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYY
LIQNWIVCFITSELFATIYTLVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLST
FIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVSLLYNIDSSLYSKFIILGNIG
VLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITILMTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDV
D

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45764; Mature: 45764

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGN
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNI
CCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLST
HHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
FIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITIL
HHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
MTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MVKKVFIMDSVKTIIGTLLIALGLQFLAYPIINQRVGNEAFGSILTIYTIITITSVVLGN
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TLNNIRLINMNLYKSNHYYWKFVSILLISILIESIALIIVFLYFFNLNTIDIIFLILLNI
CCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
LMCLRIYLNVFFRMTLKYNQILYIALIQFLGLLIGLFLYYLIQNWIVCFITSELFATIYT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LVKLRGLTIGEYQSEDNNVVKDYVMLLSTNSLNNLNLYLDRLILLPIIGGTAVTISFLST
HHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
FIGKMLATFLYPINNVVLSYISVNESDNIKKQYLKTNLFAIAALCLVMIICYPITLIIVS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLYNIDSSLYSKFIILGNIGVLFNAVSIMIQTLNTKHASITLQANYMTLHTITFIFITIL
HHHHHCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
MTIAFGLNGFFWTTLFSNIIKYVILNIIGLKSKFINKKDVD
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA