Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is mprF [H]

Identifier: 146300935

GI number: 146300935

Start: 3801118

End: 3803745

Strand: Reverse

Name: mprF [H]

Synonym: Fjoh_3190

Alternate gene names: 146300935

Gene position: 3803745-3801118 (Counterclockwise)

Preceding gene: 146300936

Following gene: 146300934

Centisome position: 62.39

GC content: 33.52

Gene sequence:

>2628_bases
ATGAAGGTACAAGCCATTTCGAATCGGTTTCTTGTTTTTTTTAAAGAAAGAAAAGGCATTTCTTTTCTTCGCGAAAATGA
TAAAATTATCAGACAATTTATTTTTACTATTTTTTTTATCGGAATTGGAATTTGGTTTATCAAACACGAAAATTCAGAAT
TAAAAGAAGTAAAAAATGTAATTGCAAATGCCGGCAGTTTCTGGGTTTTATGCGGTGTTATACTCGCTGCTGTTTATATA
CTGCTTCAGGCATTCATGTATTATGCATCATTTAAGGCTGTACAAAGTAAAATTTCTTTTAAAGATGCTGTGATTTTGTT
TCTGAAACGAAATTTTATAAGCGTTTTTCTTCCGGCAGGAGGAATTTCTTCCTTAGCTTTTTTTACGAAACCTATCGAAA
AGAAGGGTGTTAAACCCACTCAAATTCATTTTGCGTCAATTGTATACGGTTTCGTTGGAATTCTGTCTGTAATAATAGTG
GCAATTCCGGCTTTGTTGTATTCACTTTTTGAAGGAACCACCGGATCAGGAGAATGGTATGCATTTGGGGCCGTTGCAGG
ATTAAGTCTTATACTGTATTTCATTTATGATTCTGTTTTAAAGAAAGGATCCATCTACAGATTTATCATTAAGTTTTTTC
CATCTGCAGAAGTATTTATGGAGGACTTAAGAAACAACAGAATTATAAAAAGTAAATTTCTGCAGGTTGTTTTTTATTCG
GTGCTGATTGAGTTTGTTGGAATATCGCATTTGTATGTAGCTATGGTTGCTCTGGGATTTACACCGTCTTTAACTGCAGC
GATAATGGGCTATATTATTTCTGTTATTTTCCTGATTGTTTCGCCTTTTCTACGCGGCTTGGGCGCTATAGAAATATCGA
TGAGTTTTATCTTGATACAGTTTGGTTTTACAAACGTTAATGCTATAGCCATTACTTTTTTATATCGTTTTTTTGAATTT
TGGATTCCGCTTCTTGCCGGAGCATCGCTTTTTATATTTAGTGCCAATAAGCTGTTAATGCGTATAGTACCGTCATTCCT
TCTTTTTGTTTTAGGATTAATTAATATCATTTCGGTTTTAACACCCGCAATCTCTGAACGTCTGCATGTTTTAGAAAATA
TAATACCAATCTCGGCTATCAAAGTATCCAATTATTTTGTAATAACCGCCGGATTATTCATGCTTGTTAATGCTGCTTTT
CTGCTCAAAGGATTACGAACCGCCTGGTGGTCTGCTATTTTACTGACAAGTATTTCTGTTGTGGGAAACATAACAAAAGC
AATCGATTATGAAGAGGCTTTAATTGCTCTTATGGTTTTGGTTAGTCTAATCGTAACAAGAAAAGAATATTACATAAAAA
GCAATGCACATTTACAGAGCATAGGTTTAAAAACGGTTTTAATAAGCATTGCAGCTGTTTTAATCTACAGTATTTTAGGG
TTTTATTTTCTGGATAAAAAACACTTTAATATTGATTTTGACTGGCTTCAATCTATAAAATACGGGCTGCAGAATTACTT
TTTAATGGGAAGCTCAGATTTAGTTCCTTTAGATCGTTTCGCCAAACGTTTTTTACTTTCTATAAACATCTGCGGGTTTT
TATCTTTAGGATTTTTGGTTTATGCTTTAGTTCGTCCGTATACAATTAAAAAAGAAGCGGTTGAAGATGACTTCATGACC
GCAAATTCTATTTTAGAACAATACGGAGCTTCTGCTTTAGATTATTTTAAAACCTACGACGACAAAACTATTTTTATTAC
TCAAAACCGAAAAGCATTTTTAGCCTATCGTACAGCCGATAATTTTGCTGTAGTATTAGAAAATCCGGTTGCAGAATCTG
CTGCTGAAATGAAGGAATGTATTATAGAATTTGATAAATACTGTTATAACAACGGATTAAGAAGTATTTATTATCGTGTT
CCCGAAGAAAATCTGGATGTATTTACTTCTCTGCAAAAGAAAAGTTTGTTTATAGGGCAGGAGGGTGTTGTTGACTTAGC
AGCATTTACTTTAGAAGGAAGTGCCAAAAAAACACTGCGTAACGCCATAAACAAAGTGAAAGAAAAAGGATTTAAAACCA
CCGTTTATACTGCACCAATAAAAGACGGACTGCTGCAAAAAATAAAAGCGGTGAGTGATGAATGGCTTAAAAGTACAGAA
AGAAGTGAGCTTGTTTTTTCGCAAGGCAGATTTGAATGGGAAGAATTAAAAAACCAGACCATTATTACGGTTGAAAATCC
CGAAGAAAAAATTGTCGCTTTTTTAAACGTAATTCCGGATTATGTCAAAAACGAAGGAACATACGACTTAATTCGCAAAA
CTGATGATGCACCAAACGGAATCATAGATTTTATTTTGATAGAGTTATTTACGTATTTAAAATCTCAGGAATGTACTGCT
GTAAATTTAGGATTAGCAGCTATGAGCGGCATTGAAGAAGCAAATACTTTTCCCGAAAAATCAATGAAGTTTGCCTACGA
ACGAATTAAATATTTCTCACATTACAAAGGATTAAGAGATTACAAAGAAAAATTCTCTCCCGTATGGTATAATAAATATT
TAGTGTATTCTCATGATTATGATTTACTGCAGGCTCCTTTGGTTTTAAACAAAGTAGTCAAACCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCTTAATATTTTGTAAAAAGAAGAAACCGATGCAATAATTATCGTACATTTATATACCTTAAGATTTGATTTTCATTCG
CTTATTTTATTAGTATTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTAAAATAACAGCATTTAATTGTTCAATACTTAAAACCAAGTAAGATGAATAAAAAGATAATATTAATCTTGTCGAT
TTTTATTTGCAGCACAGTTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Lysylphosphatidylglycerol synthase; LPG synthase [H]

Number of amino acids: Translated: 875; Mature: 875

Protein sequence:

>875_residues
MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNVIANAGSFWVLCGVILAAVYI
LLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAGGISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIV
AIPALLYSLFEGTTGSGEWYAFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS
VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQFGFTNVNAIAITFLYRFFEF
WIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVLTPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAF
LLKGLRTAWWSAILLTSISVVGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG
FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLVYALVRPYTIKKEAVEDDFMT
ANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTADNFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRV
PEENLDVFTSLQKKSLFIGQEGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE
RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNGIIDFILIELFTYLKSQECTA
VNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRDYKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP

Sequences:

>Translated_875_residues
MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNVIANAGSFWVLCGVILAAVYI
LLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAGGISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIV
AIPALLYSLFEGTTGSGEWYAFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS
VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQFGFTNVNAIAITFLYRFFEF
WIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVLTPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAF
LLKGLRTAWWSAILLTSISVVGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG
FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLVYALVRPYTIKKEAVEDDFMT
ANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTADNFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRV
PEENLDVFTSLQKKSLFIGQEGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE
RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNGIIDFILIELFTYLKSQECTA
VNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRDYKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP
>Mature_875_residues
MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNVIANAGSFWVLCGVILAAVYI
LLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAGGISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIV
AIPALLYSLFEGTTGSGEWYAFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS
VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQFGFTNVNAIAITFLYRFFEF
WIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVLTPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAF
LLKGLRTAWWSAILLTSISVVGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG
FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLVYALVRPYTIKKEAVEDDFMT
ANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTADNFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRV
PEENLDVFTSLQKKSLFIGQEGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE
RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNGIIDFILIELFTYLKSQECTA
VNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRDYKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP

Specific function: Catalyzes the transfer of a lysyl group from L-lysyl- tRNA(Lys) to membrane-bound phosphatidylglycerol (PG), which produces lysylphosphatidylglycerol (LPG), one of the components of the bacterial membrane with a positive net charge. LPG synthesis contribu

COG id: COG2898

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the LPG synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016181
- InterPro:   IPR022791 [H]

Pfam domain/function: PF03706 UPF0104 [H]

EC number: =2.3.2.3 [H]

Molecular weight: Translated: 99311; Mature: 99311

Theoretical pI: Translated: 9.35; Mature: 9.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNV
CCCCEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHH
IANAGSFWVLCGVILAAVYILLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
GISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIVAIPALLYSLFEGTTGSGEWY
CHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE
AFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEE
FGFTNVNAIAITFLYRFFEFWIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVL
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAFLLKGLRTAWWSAILLTSISV
HHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLV
HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YALVRPYTIKKEAVEDDFMTANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTAD
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEEECC
NFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRVPEENLDVFTSLQKKSLFIGQ
CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
EGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE
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RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNG
HHHHHHHCCCCCHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCH
IIDFILIELFTYLKSQECTAVNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
YKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP
HHHHCCCEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNV
CCCCEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHH
IANAGSFWVLCGVILAAVYILLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC
GISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIVAIPALLYSLFEGTTGSGEWY
CHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE
AFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEE
FGFTNVNAIAITFLYRFFEFWIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVL
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TPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAFLLKGLRTAWWSAILLTSISV
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CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
EGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE
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HHHHHHHCCCCCHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCH
IIDFILIELFTYLKSQECTAVNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRD
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
YKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP
HHHHCCCEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8946165; 9384377 [H]