| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is mprF [H]
Identifier: 146300935
GI number: 146300935
Start: 3801118
End: 3803745
Strand: Reverse
Name: mprF [H]
Synonym: Fjoh_3190
Alternate gene names: 146300935
Gene position: 3803745-3801118 (Counterclockwise)
Preceding gene: 146300936
Following gene: 146300934
Centisome position: 62.39
GC content: 33.52
Gene sequence:
>2628_bases ATGAAGGTACAAGCCATTTCGAATCGGTTTCTTGTTTTTTTTAAAGAAAGAAAAGGCATTTCTTTTCTTCGCGAAAATGA TAAAATTATCAGACAATTTATTTTTACTATTTTTTTTATCGGAATTGGAATTTGGTTTATCAAACACGAAAATTCAGAAT TAAAAGAAGTAAAAAATGTAATTGCAAATGCCGGCAGTTTCTGGGTTTTATGCGGTGTTATACTCGCTGCTGTTTATATA CTGCTTCAGGCATTCATGTATTATGCATCATTTAAGGCTGTACAAAGTAAAATTTCTTTTAAAGATGCTGTGATTTTGTT TCTGAAACGAAATTTTATAAGCGTTTTTCTTCCGGCAGGAGGAATTTCTTCCTTAGCTTTTTTTACGAAACCTATCGAAA AGAAGGGTGTTAAACCCACTCAAATTCATTTTGCGTCAATTGTATACGGTTTCGTTGGAATTCTGTCTGTAATAATAGTG GCAATTCCGGCTTTGTTGTATTCACTTTTTGAAGGAACCACCGGATCAGGAGAATGGTATGCATTTGGGGCCGTTGCAGG ATTAAGTCTTATACTGTATTTCATTTATGATTCTGTTTTAAAGAAAGGATCCATCTACAGATTTATCATTAAGTTTTTTC CATCTGCAGAAGTATTTATGGAGGACTTAAGAAACAACAGAATTATAAAAAGTAAATTTCTGCAGGTTGTTTTTTATTCG GTGCTGATTGAGTTTGTTGGAATATCGCATTTGTATGTAGCTATGGTTGCTCTGGGATTTACACCGTCTTTAACTGCAGC GATAATGGGCTATATTATTTCTGTTATTTTCCTGATTGTTTCGCCTTTTCTACGCGGCTTGGGCGCTATAGAAATATCGA TGAGTTTTATCTTGATACAGTTTGGTTTTACAAACGTTAATGCTATAGCCATTACTTTTTTATATCGTTTTTTTGAATTT TGGATTCCGCTTCTTGCCGGAGCATCGCTTTTTATATTTAGTGCCAATAAGCTGTTAATGCGTATAGTACCGTCATTCCT TCTTTTTGTTTTAGGATTAATTAATATCATTTCGGTTTTAACACCCGCAATCTCTGAACGTCTGCATGTTTTAGAAAATA TAATACCAATCTCGGCTATCAAAGTATCCAATTATTTTGTAATAACCGCCGGATTATTCATGCTTGTTAATGCTGCTTTT CTGCTCAAAGGATTACGAACCGCCTGGTGGTCTGCTATTTTACTGACAAGTATTTCTGTTGTGGGAAACATAACAAAAGC AATCGATTATGAAGAGGCTTTAATTGCTCTTATGGTTTTGGTTAGTCTAATCGTAACAAGAAAAGAATATTACATAAAAA GCAATGCACATTTACAGAGCATAGGTTTAAAAACGGTTTTAATAAGCATTGCAGCTGTTTTAATCTACAGTATTTTAGGG TTTTATTTTCTGGATAAAAAACACTTTAATATTGATTTTGACTGGCTTCAATCTATAAAATACGGGCTGCAGAATTACTT TTTAATGGGAAGCTCAGATTTAGTTCCTTTAGATCGTTTCGCCAAACGTTTTTTACTTTCTATAAACATCTGCGGGTTTT TATCTTTAGGATTTTTGGTTTATGCTTTAGTTCGTCCGTATACAATTAAAAAAGAAGCGGTTGAAGATGACTTCATGACC GCAAATTCTATTTTAGAACAATACGGAGCTTCTGCTTTAGATTATTTTAAAACCTACGACGACAAAACTATTTTTATTAC TCAAAACCGAAAAGCATTTTTAGCCTATCGTACAGCCGATAATTTTGCTGTAGTATTAGAAAATCCGGTTGCAGAATCTG CTGCTGAAATGAAGGAATGTATTATAGAATTTGATAAATACTGTTATAACAACGGATTAAGAAGTATTTATTATCGTGTT CCCGAAGAAAATCTGGATGTATTTACTTCTCTGCAAAAGAAAAGTTTGTTTATAGGGCAGGAGGGTGTTGTTGACTTAGC AGCATTTACTTTAGAAGGAAGTGCCAAAAAAACACTGCGTAACGCCATAAACAAAGTGAAAGAAAAAGGATTTAAAACCA CCGTTTATACTGCACCAATAAAAGACGGACTGCTGCAAAAAATAAAAGCGGTGAGTGATGAATGGCTTAAAAGTACAGAA AGAAGTGAGCTTGTTTTTTCGCAAGGCAGATTTGAATGGGAAGAATTAAAAAACCAGACCATTATTACGGTTGAAAATCC CGAAGAAAAAATTGTCGCTTTTTTAAACGTAATTCCGGATTATGTCAAAAACGAAGGAACATACGACTTAATTCGCAAAA CTGATGATGCACCAAACGGAATCATAGATTTTATTTTGATAGAGTTATTTACGTATTTAAAATCTCAGGAATGTACTGCT GTAAATTTAGGATTAGCAGCTATGAGCGGCATTGAAGAAGCAAATACTTTTCCCGAAAAATCAATGAAGTTTGCCTACGA ACGAATTAAATATTTCTCACATTACAAAGGATTAAGAGATTACAAAGAAAAATTCTCTCCCGTATGGTATAATAAATATT TAGTGTATTCTCATGATTATGATTTACTGCAGGCTCCTTTGGTTTTAAACAAAGTAGTCAAACCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTCTTAATATTTTGTAAAAAGAAGAAACCGATGCAATAATTATCGTACATTTATATACCTTAAGATTTGATTTTCATTCG CTTATTTTATTAGTATTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTAAAATAACAGCATTTAATTGTTCAATACTTAAAACCAAGTAAGATGAATAAAAAGATAATATTAATCTTGTCGAT TTTTATTTGCAGCACAGTTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Lysylphosphatidylglycerol synthase; LPG synthase [H]
Number of amino acids: Translated: 875; Mature: 875
Protein sequence:
>875_residues MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNVIANAGSFWVLCGVILAAVYI LLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAGGISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIV AIPALLYSLFEGTTGSGEWYAFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQFGFTNVNAIAITFLYRFFEF WIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVLTPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAF LLKGLRTAWWSAILLTSISVVGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLVYALVRPYTIKKEAVEDDFMT ANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTADNFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRV PEENLDVFTSLQKKSLFIGQEGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNGIIDFILIELFTYLKSQECTA VNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRDYKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP
Sequences:
>Translated_875_residues MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNVIANAGSFWVLCGVILAAVYI LLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAGGISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIV AIPALLYSLFEGTTGSGEWYAFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQFGFTNVNAIAITFLYRFFEF WIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVLTPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAF LLKGLRTAWWSAILLTSISVVGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLVYALVRPYTIKKEAVEDDFMT ANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTADNFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRV PEENLDVFTSLQKKSLFIGQEGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNGIIDFILIELFTYLKSQECTA VNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRDYKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP >Mature_875_residues MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNVIANAGSFWVLCGVILAAVYI LLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAGGISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIV AIPALLYSLFEGTTGSGEWYAFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQFGFTNVNAIAITFLYRFFEF WIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVLTPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAF LLKGLRTAWWSAILLTSISVVGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLVYALVRPYTIKKEAVEDDFMT ANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTADNFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRV PEENLDVFTSLQKKSLFIGQEGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNGIIDFILIELFTYLKSQECTA VNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRDYKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP
Specific function: Catalyzes the transfer of a lysyl group from L-lysyl- tRNA(Lys) to membrane-bound phosphatidylglycerol (PG), which produces lysylphosphatidylglycerol (LPG), one of the components of the bacterial membrane with a positive net charge. LPG synthesis contribu
COG id: COG2898
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the LPG synthase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR016181 - InterPro: IPR022791 [H]
Pfam domain/function: PF03706 UPF0104 [H]
EC number: =2.3.2.3 [H]
Molecular weight: Translated: 99311; Mature: 99311
Theoretical pI: Translated: 9.35; Mature: 9.35
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNV CCCCEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHH IANAGSFWVLCGVILAAVYILLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAG HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC GISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIVAIPALLYSLFEGTTGSGEWY CHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE AFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEE FGFTNVNAIAITFLYRFFEFWIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVL ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAFLLKGLRTAWWSAILLTSISV HHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLV HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YALVRPYTIKKEAVEDDFMTANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTAD HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEEECC NFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRVPEENLDVFTSLQKKSLFIGQ CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC EGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE CCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNG HHHHHHHCCCCCHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCH IIDFILIELFTYLKSQECTAVNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRD HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH YKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP HHHHCCCEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKVQAISNRFLVFFKERKGISFLRENDKIIRQFIFTIFFIGIGIWFIKHENSELKEVKNV CCCCEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHH IANAGSFWVLCGVILAAVYILLQAFMYYASFKAVQSKISFKDAVILFLKRNFISVFLPAG HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC GISSLAFFTKPIEKKGVKPTQIHFASIVYGFVGILSVIIVAIPALLYSLFEGTTGSGEWY CHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE AFGAVAGLSLILYFIYDSVLKKGSIYRFIIKFFPSAEVFMEDLRNNRIIKSKFLQVVFYS EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH VLIEFVGISHLYVAMVALGFTPSLTAAIMGYIISVIFLIVSPFLRGLGAIEISMSFILIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEE FGFTNVNAIAITFLYRFFEFWIPLLAGASLFIFSANKLLMRIVPSFLLFVLGLINIISVL ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TPAISERLHVLENIIPISAIKVSNYFVITAGLFMLVNAAFLLKGLRTAWWSAILLTSISV HHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGNITKAIDYEEALIALMVLVSLIVTRKEYYIKSNAHLQSIGLKTVLISIAAVLIYSILG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYFLDKKHFNIDFDWLQSIKYGLQNYFLMGSSDLVPLDRFAKRFLLSINICGFLSLGFLV HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YALVRPYTIKKEAVEDDFMTANSILEQYGASALDYFKTYDDKTIFITQNRKAFLAYRTAD HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCEEEEEEECC NFAVVLENPVAESAAEMKECIIEFDKYCYNNGLRSIYYRVPEENLDVFTSLQKKSLFIGQ CEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC EGVVDLAAFTLEGSAKKTLRNAINKVKEKGFKTTVYTAPIKDGLLQKIKAVSDEWLKSTE CCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RSELVFSQGRFEWEELKNQTIITVENPEEKIVAFLNVIPDYVKNEGTYDLIRKTDDAPNG HHHHHHHCCCCCHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCH IIDFILIELFTYLKSQECTAVNLGLAAMSGIEEANTFPEKSMKFAYERIKYFSHYKGLRD HHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH YKEKFSPVWYNKYLVYSHDYDLLQAPLVLNKVVKP HHHHCCCEEECCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8946165; 9384377 [H]