| Definition | Geobacillus thermodenitrificans NG80-2 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009328 |
| Length | 3,550,319 |
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The map label for this gene is 138894939
Identifier: 138894939
GI number: 138894939
Start: 1352626
End: 1354506
Strand: Direct
Name: 138894939
Synonym: GTNG_1277
Alternate gene names: NA
Gene position: 1352626-1354506 (Clockwise)
Preceding gene: 138894938
Following gene: 138894940
Centisome position: 38.1
GC content: 46.52
Gene sequence:
>1881_bases TTGTTTCTTTATTTTCAGCTCGCACTGTTTTTAGCTATGGCTATTTGGCAATTTGTGCGTATTCAAAGGGAAATTGCGGT GATGAATCAATTAAAGCCGAAGCTGCTGGAACTGAATCGTTCGGCAAATGGAACTGCCTACGAAATCGATCAGGCCATTA ACGAACTTTTTGTTCAAGTGAAAAAGTCGAAATATAAGGAATTGTGGGAGCGGTATTATAATCGTGTTTCGCAAAAAAAT GAGGATGAACGTATTAATGTGGAACCATTTTTCGGCTTTGATGTGATGCATCATCATATGGGGTATCGGACATTGATGGA CATGGGGGCTGGCATTCATGTCAGCCTTGGTGTCCTCGGCACCTTTGTTGGCCTTTCGGTTGGACTGTCTGAATTGCATA TTAACGATACAGAAGCGTTGCGGTCGGGGATTGGCAGTTTGCTAGACGGAATGAAAGTGGCGTTTTATACGTCTGTATGG GGTGTGTTGCTTTCGCTTATGTGGACAATGTTTGACCGATGGATTAGCAGTACGCTTGACCGCAATATCGATTGGCACTC GGAGCGGCTTGATTTTTTGCTTAGCACGGACGACGAGGAGTTATTTTTAAATCGCTTGGAAAAGTTATCTCGCAATCAGG CCGACCATTTAAAAACGCTGTTGACCGATGCGCTTGAGAAGGCGATGCAGCCGATCGCCCTTTCACTTCAGCAATCGCAC GGCAACCTGCAGCAGGCGTTTAGCCAGCTTCATGACCAGTTTGCCCAGCTGCACGAAGGAATGGAAACACAGGCGAAGCT GCTTGAGTCGCAAATTGAGCTGACGAAAAATACGAGCGCTGATGTAACGAGTCGGCTTGTTGACGAGATTACAGGTGGAA CGCAACAGTCCATCGGCCGATTTAGCGAATTTGTTCAACAGTCGCAAGTGTGGCAAACGGAAATGATAAAAACAATCGAA GTGTTTGTCAGCCGTTTTGCCCATACGGAAGAACGGCAGGCGATGACGCTCGAGCGAACGGAAAAAATGTTTGCACAATT TGAGAAGATGGCGGTAGAACTTGAACTAATGAAGGAAAGCTATCAGAAAACGTCGGGCATGATGAACAGATTAGGGGAAA CGTTCCAACGGTTGCAAGAGTTGACGAAAGACCAGCTCCCTGTTCAACAGGAAGTAATGCGAAGCAACCAGTTGCTCGCT CAAAAATACGACGATTTGTCGGAGCGTTTTACACGCTTTAATGCGCAGATCGAAACGCAGTACAGCCAGTTGCTCGAACA GCTTGTTCATGCTACATCTTCCCTCTCCGCATCGTTTCAAACGATGGCCAACCGGTTTGATGAATCGCTTCGCATTCAAA AAGAATCACTGCATGATTCACAGCAGCTACTCGGCGATGTCCAGTCAGCCGTTGCAGCGCTGTCGCCGCTCGTTTCTGAA CTGCGTGAAACGTTTGATCACGTTCGTGAATTGAAGGAGCAGCTGCTTGAAATGCAGGAAGCGCAAAAACAGCTTCTTCC GGAGCTTGTGCAACTACGGACGCAAACGAAGGAAAGCGTTGAGGAAACGTTGCGGACGACGAAAGTATATATGCAGGAGA TGACGGAACAAATCGGGATGCTGCAAGAAAATTGGACGACGACGAAAGAGCAGTTGACGAAAATTACTGAAGCTCTCCAT CTCTCAATGAAAGATTTCGCTGAAAATATTGACAGCGGCTTAAGCAAAACGTATCAGCATTTTGATGAGACGCTGACAAA AGCCGTTCAGGAAGTGAGCGGACTCGTTTATCAGTTTAGTGAAGTGCAGTCAGACTTTATCGACAACTTGGAAGACCTGG TGGATCATTTCGATAAATGGAAAGCAGGGGCTTCGTCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGATTTACATAACAAAAGGTGCAGGTGATCTACGTTGTATACATTTTTTGAATCGTTCTTTTCTCTTATTAACAAAGTCG GGAATAAAGGGTTTACCGAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATACCGGAGACGGACAGAAGTAAATTATTGGATGTCCTATGCGGATTTAATGAGCGCCATGTTGATGGTGTTTGCCTTG CTGTTGACGTTTGTCATTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 626; Mature: 626
Protein sequence:
>626_residues MFLYFQLALFLAMAIWQFVRIQREIAVMNQLKPKLLELNRSANGTAYEIDQAINELFVQVKKSKYKELWERYYNRVSQKN EDERINVEPFFGFDVMHHHMGYRTLMDMGAGIHVSLGVLGTFVGLSVGLSELHINDTEALRSGIGSLLDGMKVAFYTSVW GVLLSLMWTMFDRWISSTLDRNIDWHSERLDFLLSTDDEELFLNRLEKLSRNQADHLKTLLTDALEKAMQPIALSLQQSH GNLQQAFSQLHDQFAQLHEGMETQAKLLESQIELTKNTSADVTSRLVDEITGGTQQSIGRFSEFVQQSQVWQTEMIKTIE VFVSRFAHTEERQAMTLERTEKMFAQFEKMAVELELMKESYQKTSGMMNRLGETFQRLQELTKDQLPVQQEVMRSNQLLA QKYDDLSERFTRFNAQIETQYSQLLEQLVHATSSLSASFQTMANRFDESLRIQKESLHDSQQLLGDVQSAVAALSPLVSE LRETFDHVRELKEQLLEMQEAQKQLLPELVQLRTQTKESVEETLRTTKVYMQEMTEQIGMLQENWTTTKEQLTKITEALH LSMKDFAENIDSGLSKTYQHFDETLTKAVQEVSGLVYQFSEVQSDFIDNLEDLVDHFDKWKAGASS
Sequences:
>Translated_626_residues MFLYFQLALFLAMAIWQFVRIQREIAVMNQLKPKLLELNRSANGTAYEIDQAINELFVQVKKSKYKELWERYYNRVSQKN EDERINVEPFFGFDVMHHHMGYRTLMDMGAGIHVSLGVLGTFVGLSVGLSELHINDTEALRSGIGSLLDGMKVAFYTSVW GVLLSLMWTMFDRWISSTLDRNIDWHSERLDFLLSTDDEELFLNRLEKLSRNQADHLKTLLTDALEKAMQPIALSLQQSH GNLQQAFSQLHDQFAQLHEGMETQAKLLESQIELTKNTSADVTSRLVDEITGGTQQSIGRFSEFVQQSQVWQTEMIKTIE VFVSRFAHTEERQAMTLERTEKMFAQFEKMAVELELMKESYQKTSGMMNRLGETFQRLQELTKDQLPVQQEVMRSNQLLA QKYDDLSERFTRFNAQIETQYSQLLEQLVHATSSLSASFQTMANRFDESLRIQKESLHDSQQLLGDVQSAVAALSPLVSE LRETFDHVRELKEQLLEMQEAQKQLLPELVQLRTQTKESVEETLRTTKVYMQEMTEQIGMLQENWTTTKEQLTKITEALH LSMKDFAENIDSGLSKTYQHFDETLTKAVQEVSGLVYQFSEVQSDFIDNLEDLVDHFDKWKAGASS >Mature_626_residues MFLYFQLALFLAMAIWQFVRIQREIAVMNQLKPKLLELNRSANGTAYEIDQAINELFVQVKKSKYKELWERYYNRVSQKN EDERINVEPFFGFDVMHHHMGYRTLMDMGAGIHVSLGVLGTFVGLSVGLSELHINDTEALRSGIGSLLDGMKVAFYTSVW GVLLSLMWTMFDRWISSTLDRNIDWHSERLDFLLSTDDEELFLNRLEKLSRNQADHLKTLLTDALEKAMQPIALSLQQSH GNLQQAFSQLHDQFAQLHEGMETQAKLLESQIELTKNTSADVTSRLVDEITGGTQQSIGRFSEFVQQSQVWQTEMIKTIE VFVSRFAHTEERQAMTLERTEKMFAQFEKMAVELELMKESYQKTSGMMNRLGETFQRLQELTKDQLPVQQEVMRSNQLLA QKYDDLSERFTRFNAQIETQYSQLLEQLVHATSSLSASFQTMANRFDESLRIQKESLHDSQQLLGDVQSAVAALSPLVSE LRETFDHVRELKEQLLEMQEAQKQLLPELVQLRTQTKESVEETLRTTKVYMQEMTEQIGMLQENWTTTKEQLTKITEALH LSMKDFAENIDSGLSKTYQHFDETLTKAVQEVSGLVYQFSEVQSDFIDNLEDLVDHFDKWKAGASS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 72434; Mature: 72434
Theoretical pI: Translated: 4.77; Mature: 4.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 4.2 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 4.2 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFLYFQLALFLAMAIWQFVRIQREIAVMNQLKPKLLELNRSANGTAYEIDQAINELFVQV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KKSKYKELWERYYNRVSQKNEDERINVEPFFGFDVMHHHMGYRTLMDMGAGIHVSLGVLG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH TFVGLSVGLSELHINDTEALRSGIGSLLDGMKVAFYTSVWGVLLSLMWTMFDRWISSTLD HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNIDWHSERLDFLLSTDDEELFLNRLEKLSRNQADHLKTLLTDALEKAMQPIALSLQQSH CCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GNLQQAFSQLHDQFAQLHEGMETQAKLLESQIELTKNTSADVTSRLVDEITGGTQQSIGR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH FSEFVQQSQVWQTEMIKTIEVFVSRFAHTEERQAMTLERTEKMFAQFEKMAVELELMKES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQKTSGMMNRLGETFQRLQELTKDQLPVQQEVMRSNQLLAQKYDDLSERFTRFNAQIETQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSQLLEQLVHATSSLSASFQTMANRFDESLRIQKESLHDSQQLLGDVQSAVAALSPLVSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRETFDHVRELKEQLLEMQEAQKQLLPELVQLRTQTKESVEETLRTTKVYMQEMTEQIGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQENWTTTKEQLTKITEALHLSMKDFAENIDSGLSKTYQHFDETLTKAVQEVSGLVYQFS HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVQSDFIDNLEDLVDHFDKWKAGASS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MFLYFQLALFLAMAIWQFVRIQREIAVMNQLKPKLLELNRSANGTAYEIDQAINELFVQV CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KKSKYKELWERYYNRVSQKNEDERINVEPFFGFDVMHHHMGYRTLMDMGAGIHVSLGVLG HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH TFVGLSVGLSELHINDTEALRSGIGSLLDGMKVAFYTSVWGVLLSLMWTMFDRWISSTLD HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNIDWHSERLDFLLSTDDEELFLNRLEKLSRNQADHLKTLLTDALEKAMQPIALSLQQSH CCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GNLQQAFSQLHDQFAQLHEGMETQAKLLESQIELTKNTSADVTSRLVDEITGGTQQSIGR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH FSEFVQQSQVWQTEMIKTIEVFVSRFAHTEERQAMTLERTEKMFAQFEKMAVELELMKES HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YQKTSGMMNRLGETFQRLQELTKDQLPVQQEVMRSNQLLAQKYDDLSERFTRFNAQIETQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSQLLEQLVHATSSLSASFQTMANRFDESLRIQKESLHDSQQLLGDVQSAVAALSPLVSE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LRETFDHVRELKEQLLEMQEAQKQLLPELVQLRTQTKESVEETLRTTKVYMQEMTEQIGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQENWTTTKEQLTKITEALHLSMKDFAENIDSGLSKTYQHFDETLTKAVQEVSGLVYQFS HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EVQSDFIDNLEDLVDHFDKWKAGASS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA