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The map label for this gene is dinF-1

Identifier: 13358148

GI number: 13358148

Start: 729149

End: 730753

Strand: Reverse

Name: dinF-1

Synonym: UU583

Alternate gene names: NA

Gene position: 730753-729149 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358149

Following gene: 13358147

Centisome position: 97.21

GC content: 27.85

Gene sequence:

>1605_bases
ATGCGCTTCGATTTTTTTAAAAAATCACAGAAAATAAAACCAAATTGGTTTATAAATCAATTTGGTGATAAAATTTTCAT
GAAAACAGCTGCTAAATTATTTTTCCCAGCAATTCTTGAAGTTATCATTTTATCGTCTGTTAATTATTTTGATAGTCTTT
TCATTGCTTTATTTACACCTGAGAATATGGGGACAGCAGCCAAAACTGCAACCGTGTTAGCGACACAACTAATGTTTTTG
CCAACTATTTTTTTCTATTCTATTGTAGCAGCAGCGGGGATTTTAGCCGCTCAATATTATGGTAAAAAAGACTATTTAAA
ATTTAAAGAAACAATTAACTTTATGTTGTTGTTTAGTTTTATTGTTGTAATGATATTTATTGTTATTTATATGGCAGCAC
CATTACAAATGATTCAATTATATTCAGGAAATAATTTAGATGTTTCAGCTTCAGAAGAAGCAAAACGAATTTATGATTTA
ACAAATCATTGAGCAGCTAGTTATTTACGTTGACAATCATTAACTTTAATTCCTTACATGTTTTCATTTTCATTAGCCAC
TGCTTATCGTCAACATAATAATGCAATCATGCCTTTAATTTCAAGTTCAATTGCAGTAACTGTTAATGTTATTTTAGATC
CAATTTTGATTAAATATTGTGCCGTAACACCATTTGAGGCAATTTTATTTGTGGCTATTGCTACAATTGTTGCAAGATCT
ATTGATGCTTTAATAATGTTAATACTAACATTGTTTCGTAAACAATACCCTTATTATTTTTTAAATTATTTGAAATTAAG
CAAAAAGGTCGTTAAATTAATTTTTATTCATGGTTGACAAGTTTTACTAAATGAAATTTTATTTTCAGTTGGAACAACAA
TTATATTAATGTTTTATACAAGATATAGTCAAGATCATCGTGATGCTATTTCAACTGTTGCTTTAATTATTCAATTTACT
AACTTAATTTGGCCAGGTGCCGCATCAACAGTTGCTGTTTTAGTGTTAGCTAATTTAGGTGCTAACAAGCATGATTTAGC
TAAGGAAAACACGCGCAAATTAATTAATTGGGGTATGATAGTTGGAATTAGTTTGGGAATTATTTTGTTAGTTTTATCAT
CGTTTGTAAATAAATTATTAAATCCACCGTTGGATTATACAGAACAAGGTTTAAAACATGCAGCATACACTGCGACAATT
GCTATGTATTTAGAATGAATTGTAATTATGGTAGTATTGACACAAGGACCATATTCAGTTATTTACTTCTGCATTCGTGG
TGGTGGTAGTCGTTGATTATTAACAATCGACTGTTTATCAACTTTTATTTGATTGATTATTATGGGATGTATAACACATA
TAAATGTTCCAGAAGATTATAATGATCGTTTACATGTTGTATTATTATTTTTTATCATGGAATCCCAAAATATTTCTAAA
TTAATTATGGCTATTATTATCTTTAAAAAGACAAAATGAGCTCAAAATTTAGTTGATGAAGAAAAAGAAATTACAAACGA
AATTAATGATGATAAAAAAGAGAAAAATAAGCAAATAATAAAATTAGAAAACAAATTAATGGACACTGATATTGAGGCAC
GATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGTTTAAAAAGTTACTATAGATTATTTATTGAAGCTAAATAAAAACTCATTCATCTAACTTTTAGAAAGCAACTAAAA
GTATTTTAAAGGAGAAACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGAAATTTAATAGTAATTATCAAAAATGAATTCTTGATTCATTAATTAACCAAAAAATTTTCGAACCAACACCTATTCA
ATTAAAAACGATGCCATTAA

Product: MATE transporter family DNA damage inducible protein

Products: NA

Alternate protein names: Mate Efflux Family Protein; Na+ Driven Multidrug Efflux Pump; DNA Damage Inducible Protein; MATE Transporter Family DNA Damage Inducible Protein; Na+-Driven Multidrug Efflux Pump; Multi Anti Extrusion Family Protein; Cation Efflux Pump; MatE Efflux Family Protein

Number of amino acids: Translated: 534; Mature: 534

Protein sequence:

>534_residues
MRFDFFKKSQKIKPNWFINQFGDKIFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTPENMGTAAKTATVLATQLMFL
PTIFFYSIVAAAGILAAQYYGKKDYLKFKETINFMLLFSFIVVMIFIVIYMAAPLQMIQLYSGNNLDVSASEEAKRIYDL
TNHWAASYLRWQSLTLIPYMFSFSLATAYRQHNNAIMPLISSSIAVTVNVILDPILIKYCAVTPFEAILFVAIATIVARS
IDALIMLILTLFRKQYPYYFLNYLKLSKKVVKLIFIHGWQVLLNEILFSVGTTIILMFYTRYSQDHRDAISTVALIIQFT
NLIWPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINWGMIVGISLGIILLVLSSFVNKLLNPPLDYTEQGLKHAAYTATI
AMYLEWIVIMVVLTQGPYSVIYFCIRGGGSRWLLTIDCLSTFIWLIIMGCITHINVPEDYNDRLHVVLLFFIMESQNISK
LIMAIIIFKKTKWAQNLVDEEKEITNEINDDKKEKNKQIIKLENKLMDTDIEAR

Sequences:

>Translated_534_residues
MRFDFFKKSQKIKPNWFINQFGDKIFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTPENMGTAAKTATVLATQLMFL
PTIFFYSIVAAAGILAAQYYGKKDYLKFKETINFMLLFSFIVVMIFIVIYMAAPLQMIQLYSGNNLDVSASEEAKRIYDL
TNH*AASYLR*QSLTLIPYMFSFSLATAYRQHNNAIMPLISSSIAVTVNVILDPILIKYCAVTPFEAILFVAIATIVARS
IDALIMLILTLFRKQYPYYFLNYLKLSKKVVKLIFIHG*QVLLNEILFSVGTTIILMFYTRYSQDHRDAISTVALIIQFT
NLIWPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINWGMIVGISLGIILLVLSSFVNKLLNPPLDYTEQGLKHAAYTATI
AMYLE*IVIMVVLTQGPYSVIYFCIRGGGSR*LLTIDCLSTFI*LIIMGCITHINVPEDYNDRLHVVLLFFIMESQNISK
LIMAIIIFKKTK*AQNLVDEEKEITNEINDDKKEKNKQIIKLENKLMDTDIEAR
>Mature_534_residues
MRFDFFKKSQKIKPNWFINQFGDKIFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTPENMGTAAKTATVLATQLMFL
PTIFFYSIVAAAGILAAQYYGKKDYLKFKETINFMLLFSFIVVMIFIVIYMAAPLQMIQLYSGNNLDVSASEEAKRIYDL
TNH*AASYLR*QSLTLIPYMFSFSLATAYRQHNNAIMPLISSSIAVTVNVILDPILIKYCAVTPFEAILFVAIATIVARS
IDALIMLILTLFRKQYPYYFLNYLKLSKKVVKLIFIHG*QVLLNEILFSVGTTIILMFYTRYSQDHRDAISTVALIIQFT
NLIWPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINWGMIVGISLGIILLVLSSFVNKLLNPPLDYTEQGLKHAAYTATI
AMYLE*IVIMVVLTQGPYSVIYFCIRGGGSR*LLTIDCLSTFI*LIIMGCITHINVPEDYNDRLHVVLLFFIMESQNISK
LIMAIIIFKKTK*AQNLVDEEKEITNEINDDKKEKNKQIIKLENKLMDTDIEAR

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59607; Mature: 59607

Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRFDFFKKSQKIKPNWFINQFGDKIFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTP
CCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEECC
ENMGTAAKTATVLATQLMFLPTIFFYSIVAAAGILAAQYYGKKDYLKFKETINFMLLFSF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVVMIFIVIYMAAPLQMIQLYSGNNLDVSASEEAKRIYDLTNHAASYLRQSLTLIPYMFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSLATAYRQHNNAIMPLISSSIAVTVNVILDPILIKYCAVTPFEAILFVAIATIVARSID
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALIMLILTLFRKQYPYYFLNYLKLSKKVVKLIFIHGQVLLNEILFSVGTTIILMFYTRYS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QDHRDAISTVALIIQFTNLIWPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINWGMIVGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLGIILLVLSSFVNKLLNPPLDYTEQGLKHAAYTATIAMYLEIVIMVVLTQGPYSVIYFC
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEE
IRGGGSRLLTIDCLSTFILIIMGCITHINVPEDYNDRLHVVLLFFIMESQNISKLIMAII
EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
IFKKTKAQNLVDEEKEITNEINDDKKEKNKQIIKLENKLMDTDIEAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRFDFFKKSQKIKPNWFINQFGDKIFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTP
CCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEECC
ENMGTAAKTATVLATQLMFLPTIFFYSIVAAAGILAAQYYGKKDYLKFKETINFMLLFSF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVVMIFIVIYMAAPLQMIQLYSGNNLDVSASEEAKRIYDLTNHAASYLRQSLTLIPYMFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSLATAYRQHNNAIMPLISSSIAVTVNVILDPILIKYCAVTPFEAILFVAIATIVARSID
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALIMLILTLFRKQYPYYFLNYLKLSKKVVKLIFIHGQVLLNEILFSVGTTIILMFYTRYS
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QDHRDAISTVALIIQFTNLIWPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINWGMIVGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLGIILLVLSSFVNKLLNPPLDYTEQGLKHAAYTATIAMYLEIVIMVVLTQGPYSVIYFC
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEE
IRGGGSRLLTIDCLSTFILIIMGCITHINVPEDYNDRLHVVLLFFIMESQNISKLIMAII
EECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
IFKKTKAQNLVDEEKEITNEINDDKKEKNKQIIKLENKLMDTDIEAR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA