| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358130
GI number: 13358130
Start: 705907
End: 707391
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU565
Alternate gene names: NA
Gene position: 707391-705907 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358131
Following gene: 13358128
Centisome position: 94.1
GC content: 25.72
Gene sequence:
>1485_bases TTGAGTAATAACGAAGAAAAAACGCATCATAAAAACAAAATTAAAAAGATTTTTAATTGAACAAATAAAACTAAAGAAGT ATTAAGAACAGAAAATAATTTATTAAAACAAATAAGCAACGAAGCAACTATTCAACAAAGTGTACAAATTGAAAAAATTC GTTATAAAGCAGGCCTTTTAAAGTTTGCCGCTCTTTATTCAACTAAAAAAATCTTCTTACGTTACTTAATTATTGTTATT TTTTCACTTCTTGCGAGTTTATTAGTTTTATTATTAGTTCATAATACTGGAATTTATTCAGCTGGCATTATGGGAACATC ACAAGGGATCGCACGAATTTTACAATCAATTATGATTTCAAATCATAGTTCACCAAAAGAAGCCAAATTAGCATACGATA TTATGTTTTGATTATTTGCAATTTTTGTAAATATTCCTTTATTAATTTTTTCTTATAAAAAAATTGGCAAGCATTTTACA TTAATGACATTGACATATATTATTACTGTGCAAGTTTTTGGTTTTGCTTTAAGTCAAATTCCAAACGTAGAAAAAATTAT GATTTTTGGCGACAACCGTTTAAGTTATCCACCTATTAATTTGTTTTTTACTAATGGTATTTTAGATGAAAAAATAGTTA AAAATATTGAAACTGGTGTCTTGAATTATTCTAATATTACTAATTCAAAAATTGCTGATGAATTTATGCATTATGTACAA GCAAATCCTAATGCGACAATTGGTGATTTATTTCATTTAAACCAAAGTTTGACTTATCGACAATCTTTGTATGAATTTGC TAAGCCCTTATATATTTTTCATGATCTTATTATTAATAAAGTACAAATTTTATCTTGAGTAGATCCTGATCAAGCAAGTA AAATTCCTTCAATTCTAATTTATGCAGTTATTTATCCAATTTTTGATGGTATCTTCTTATCGATTGTTTATATTGCTGGA GGTTCGTCAGGTGGAACAGATATTATCTCATTTTGATATTCTAAAAAATATGGAAAACCTACCGGTTCAATATTAACCTA TTTTAATGTTGCAACATTGATTATTGGAATTGTTTTAGGATCATTCATTCCTGCTGGTATGATTAACTCTCGTTATTGAG ATGCACAATATTTCTTTTCACCAAATATGGTAGCATCAATTCTTGCTTCAATTGTTTTAGGAATTGTTTTTAACATTTAT TTTCCAAAACATAAAAGTTTGAAAATTCAAGTTTATTCAAAAAACGTTAATGCTATCATTGAAAATTTACGTGCTAATGA TTTTAATAATTCAATTACTTTAAATAGTTTAAGTGATTCATTAACATTAAGAACAAATTATTCATTAGAAATTATTTCTC CATATATTGAGTTACCATCTTTAATTCATTTAGTGCGCGATATTGATAAGAATTGTTTAATAGTGATCTATCCAATTATT GATATTGATGGAGAAATGGTTGTTAAGAAATCTACTATTAGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATAGTTGTTGTTTTTTTTATGTTTATCCTTAAAATATTATTTTGAGTAGAATATAAAATTCTTTCTTTTTATAAAAAG ACTAAAAGGGGTTGATTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTTAATGAGAAATAAAATGGTCGTCGTGACCATTTTTTTTATTTTTTTTGAAATAAATTAGTTAAAAATAAGTTTAT TAATGATTATTTTTGTAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 494; Mature: 493
Protein sequence:
>494_residues MSNNEEKTHHKNKIKKIFNWTNKTKEVLRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLKFAALYSTKKIFLRYLIIVI FSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISNHSSPKEAKLAYDIMFWLFAIFVNIPLLIFSYKKIGKHFT LMTLTYIITVQVFGFALSQIPNVEKIMIFGDNRLSYPPINLFFTNGILDEKIVKNIETGVLNYSNITNSKIADEFMHYVQ ANPNATIGDLFHLNQSLTYRQSLYEFAKPLYIFHDLIINKVQILSWVDPDQASKIPSILIYAVIYPIFDGIFLSIVYIAG GSSGGTDIISFWYSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFIPAGMINSRYWDAQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIY FPKHKSLKIQVYSKNVNAIIENLRANDFNNSITLNSLSDSLTLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKNCLIVIYPII DIDGEMVVKKSTIS
Sequences:
>Translated_494_residues MSNNEEKTHHKNKIKKIFN*TNKTKEVLRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLKFAALYSTKKIFLRYLIIVI FSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISNHSSPKEAKLAYDIMF*LFAIFVNIPLLIFSYKKIGKHFT LMTLTYIITVQVFGFALSQIPNVEKIMIFGDNRLSYPPINLFFTNGILDEKIVKNIETGVLNYSNITNSKIADEFMHYVQ ANPNATIGDLFHLNQSLTYRQSLYEFAKPLYIFHDLIINKVQILS*VDPDQASKIPSILIYAVIYPIFDGIFLSIVYIAG GSSGGTDIISF*YSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFIPAGMINSRY*DAQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIY FPKHKSLKIQVYSKNVNAIIENLRANDFNNSITLNSLSDSLTLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKNCLIVIYPII DIDGEMVVKKSTIS >Mature_493_residues SNNEEKTHHKNKIKKIFN*TNKTKEVLRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLKFAALYSTKKIFLRYLIIVIF SLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISNHSSPKEAKLAYDIMF*LFAIFVNIPLLIFSYKKIGKHFTL MTLTYIITVQVFGFALSQIPNVEKIMIFGDNRLSYPPINLFFTNGILDEKIVKNIETGVLNYSNITNSKIADEFMHYVQA NPNATIGDLFHLNQSLTYRQSLYEFAKPLYIFHDLIINKVQILS*VDPDQASKIPSILIYAVIYPIFDGIFLSIVYIAGG SSGGTDIISF*YSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFIPAGMINSRY*DAQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIYF PKHKSLKIQVYSKNVNAIIENLRANDFNNSITLNSLSDSLTLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKNCLIVIYPIID IDGEMVVKKSTIS
Specific function: Unknown
COG id: COG1284
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003740 - InterPro: IPR019264 [H]
Pfam domain/function: PF02588 DUF161; PF10035 DUF2179 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54986; Mature: 54855
Theoretical pI: Translated: 9.71; Mature: 9.71
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNNEEKTHHKNKIKKIFNTNKTKEVLRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLK CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FAALYSTKKIFLRYLIIVIFSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC HSSPKEAKLAYDIMFLFAIFVNIPLLIFSYKKIGKHFTLMTLTYIITVQVFGFALSQIPN CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC VEKIMIFGDNRLSYPPINLFFTNGILDEKIVKNIETGVLNYSNITNSKIADEFMHYVQAN CEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCC PNATIGDLFHLNQSLTYRQSLYEFAKPLYIFHDLIINKVQILSVDPDQASKIPSILIYAV CCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH IYPIFDGIFLSIVYIAGGSSGGTDIISFYSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFIP HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AGMINSRYDAQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIYFPKHKSLKIQVYSKNVNAIIENLRA CCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHC NDFNNSITLNSLSDSLTLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKNCLIVIYPIIDIDGE CCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCC MVVKKSTIS EEEEECCCC >Mature Secondary Structure SNNEEKTHHKNKIKKIFNTNKTKEVLRTENNLLKQISNEATIQQSVQIEKIRYKAGLLK CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FAALYSTKKIFLRYLIIVIFSLLASLLVLLLVHNTGIYSAGIMGTSQGIARILQSIMISN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCC HSSPKEAKLAYDIMFLFAIFVNIPLLIFSYKKIGKHFTLMTLTYIITVQVFGFALSQIPN CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC VEKIMIFGDNRLSYPPINLFFTNGILDEKIVKNIETGVLNYSNITNSKIADEFMHYVQAN CEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCC PNATIGDLFHLNQSLTYRQSLYEFAKPLYIFHDLIINKVQILSVDPDQASKIPSILIYAV CCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHH IYPIFDGIFLSIVYIAGGSSGGTDIISFYSKKYGKPTGSILTYFNVATLIIGIVLGSFIP HHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AGMINSRYDAQYFFSPNMVASILASIVLGIVFNIYFPKHKSLKIQVYSKNVNAIIENLRA CCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHC NDFNNSITLNSLSDSLTLRTNYSLEIISPYIELPSLIHLVRDIDKNCLIVIYPIIDIDGE CCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCC MVVKKSTIS EEEEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7569993 [H]