Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358106

GI number: 13358106

Start: 670982

End: 673408

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: UU542

Alternate gene names: NA

Gene position: 670982-673408 (Clockwise)

Preceding gene: 13358099

Following gene: 13358107

Centisome position: 89.26

GC content: 22.62

Gene sequence:

>2427_bases
ATGAAAAAAATGTTTCTATTAATGAAGAATATGATGCGTTTATTCTTTAAAAATAAAACTTTAGTAACTCAACTTTCAAT
TTTAATGATTGTTTCAACAGTTGTTATTGTTGCAACAACGATTACAGTACAACGTTTGCAAAAATCACAAAGCGATATTA
AAAAAATTGGTTTACAAAGTGATTTTTTAATTGATACAAAAGAGCAAGATAATATTAATTTCAACGAAATTGACGTTAGC
AACAATCTTGTAAAACATAATGAAAAATTAATTCAATTAGCAACTTTTAATCAAAATATTTTAAAAAATTCAAATAATTA
TTTACAACTAGTTGATAATGCATTTCATAATCATAACCTTTTTTGGCCAACTAATGTAAACAATCAAAAAATAGATGTAC
TAAATCTTGAAGGAAATATCGATTGAAATAAAATTAATCAATTAAAATTACAAACTGTTTTTTGATTTGAAAACAATAAA
GAAAATAATCAAAATTTTGCTAACAATTATGATGATTTGGTTTATGAATATCATAATTCTAAAAATCAATTAGTAGGATT
TCAAAATTTAGATGGTGGGCATATTTTATTTAAAACACCGGCGTTAAAATCAGCAAACGGTAATTATGAAACAACATTTA
AAATTAATGCTGCAATTGTCCAAAAAAATAAACCATTTAAATCTTTTTTTAACTTTGATAAATATAAAGAATTAGGATTT
AAGAATAAATCTTATTTTACAAATCCTGTATTAATTAAAAATATAGATCTTTATTCAAAACAAGTTGTTCAAACACTAAA
CGATCGTTCAAATCAATCAATTGATTTTAAAGACTATCAAAGCACATTTCAAGCCATTGTTGATACACTTGAAACTAACA
CGATAAATAAAGATTTTTATAGTGTGAATTTACATGTTGATTTTAACACACTATCAACAAAATACCTACTATTTGCTAAT
TATTTAAAAAATGAAGGTATTGATAAAAACCGTTATATAAATGAATTAAAAATCGATAACTATAAACAGAAGTATTTAGA
TTTATTTCAAAACCAAGTTTTAATTCCAAAAGAATTAATTGACGATCCAAAAAAAATAGAAGAAGTGCAAAAAATTATTG
CAAAAGCCAAAGCCTTGTTAATTGCTAAAATTCGTGAAGAAACAAATATTTTTTATGAAAACTCACAAAAATCAGCTCTT
GAAAATAAAAATAAGATTCGTGATTATGAGATGCAATTAAAACAAATAAATATTGCTCTACAAAATTCGAATTATTCTAA
TAACGAACTTATTCAATTAAAAAATGAACAAAAAGTATTAGCAGCAAATCTCGATCAAGCAAAATTTAAACACTTTTTAT
ATAATGATTTAATTAAACAAGATTTCCGTTCGATTTTAAATAATTATAATATTTATTATCGCAAACATGAATCAGCAATT
TATAATGATGTTAAAAGTGATTCAAATTTTATTGTCACAAATGCAAGCAATCCAACATATACACAAAACGGTTTAATTGC
ACCAAGAAATCAATGAATTGATAATATGGTGCAAATTAATGAAAAAAATAAAAATAGTCAAAATCCAAATAAAAAATTTA
AGCGAATTTTTATTAATGATGATAATTCAAATAAAATTAATAACTTTTATGACCTTTATTCAAATTACATTAAAGTCATT
CAAATTTTAAAAAATAGTTATGAAAAAGATCCAGATACTGATAAAGATTTACTAGTTGAAGAGCGTGATTATACTCCTTG
AATTAATACATCACTAATTAATATATATCAACTTCCACAATTTTTTAATATCTTATTTAATCAATCTGAATGATTATTAT
CAATTCAATATCTAAAAGAAATGAGTGATTATAAAAAATATTTACTACAAATTTTTGAACCATATCAAGATAAAGAATGG
ATTTTTAATTTAAAACATAAAGATTGACAAGATGGCGAACAAGTGGTTGCTATTTATAAAAATGCAGATAGTAATAGCGA
CCAAAAAGAATATTATTTTAACGGCTATGTTAAAAATCAACGAGCTTATATTAATGTTAAATATAATAAAAATCTGCCAA
CACGTTTAAAATTAATTAATATTATTAAACAAAATCAAATAAATCAAAAAAACAATTTAGTTAATGTTTTAGATCAAGAT
TTAAATGATTATGCAAAGATTATTAATTTTAAAAAAGGTATTAAAGATATTAATACAAACCAGCAATCAGTTTATGATCA
GTGAGCTTTAAATAATCCACAAGATTATGCTATGTTTAAAATTTGATTATCAAAAATCATTAAACGTTATTATTTTCTAC
GCTTCAGCAATCACCTTATGGATATACAATTCAAGCACAAAACGTTTTATCAAAAGCTTTGTTATTGCCGTTTACAATTA
ATATTATTAATCGTAGTTCAGATCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTAATACTTGGTTTTAATGGTGAAGGATGGTATAATAATAAAATTATACTGATTTAAATAAACACAAGTTGTACATTT
GTTTTTAGTTTGGAGTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CATACGTAAGCACATCTTATATTAAAGCTAATCAAAGAACAACAAAAAATATAAATAATTATAAAGAAATTGGTAATTAT
GAAGATTTTTTACAAGCACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 808; Mature: 808

Protein sequence:

>808_residues
MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQSDFLIDTKEQDNINFNEIDVS
NNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNLFWPTNVNNQKIDVLNLEGNIDWNKINQLKLQTVFWFENNK
ENNQNFANNYDDLVYEYHNSKNQLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGF
KNKSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSVNLHVDFNTLSTKYLLFAN
YLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDDPKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSAL
ENKNKIRDYEMQLKQINIALQNSNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAI
YNDVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQWIDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNSNKINNFYDLYSNYIKVI
QILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTPWINTSLINIYQLPQFFNILFNQSEWLLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEW
IFNLKHKDWQDGEQVVAIYKNADSNSDQKEYYFNGYVKNQRAYINVKYNKNLPTRLKLINIIKQNQINQKNNLVNVLDQD
LNDYAKIINFKKGIKDINTNQQSVYDQWALNNPQDYAMFKIWLSKIIKRYYFLRFSNHLMDIQFKHKTFYQKLCYCRLQL
ILLIVVQI

Sequences:

>Translated_808_residues
MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQSDFLIDTKEQDNINFNEIDVS
NNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNLFWPTNVNNQKIDVLNLEGNID*NKINQLKLQTVF*FENNK
ENNQNFANNYDDLVYEYHNSKNQLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGF
KNKSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSVNLHVDFNTLSTKYLLFAN
YLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDDPKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSAL
ENKNKIRDYEMQLKQINIALQNSNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAI
YNDVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQ*IDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNSNKINNFYDLYSNYIKVI
QILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTP*INTSLINIYQLPQFFNILFNQSE*LLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEW
IFNLKHKD*QDGEQVVAIYKNADSNSDQKEYYFNGYVKNQRAYINVKYNKNLPTRLKLINIIKQNQINQKNNLVNVLDQD
LNDYAKIINFKKGIKDINTNQQSVYDQ*ALNNPQDYAMFKI*LSKIIKRYYFLRFSNHLMDIQFKHKTFYQKLCYCRLQL
ILLIVVQI
>Mature_808_residues
MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQSDFLIDTKEQDNINFNEIDVS
NNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNLFWPTNVNNQKIDVLNLEGNID*NKINQLKLQTVF*FENNK
ENNQNFANNYDDLVYEYHNSKNQLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGF
KNKSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSVNLHVDFNTLSTKYLLFAN
YLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDDPKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSAL
ENKNKIRDYEMQLKQINIALQNSNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAI
YNDVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQ*IDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNSNKINNFYDLYSNYIKVI
QILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTP*INTSLINIYQLPQFFNILFNQSE*LLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEW
IFNLKHKD*QDGEQVVAIYKNADSNSDQKEYYFNGYVKNQRAYINVKYNKNLPTRLKLINIIKQNQINQKNNLVNVLDQD
LNDYAKIINFKKGIKDINTNQQSVYDQ*ALNNPQDYAMFKI*LSKIIKRYYFLRFSNHLMDIQFKHKTFYQKLCYCRLQL
ILLIVVQI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 94546; Mature: 94546

Theoretical pI: Translated: 9.62; Mature: 9.62

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQS
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DFLIDTKEQDNINFNEIDVSNNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNL
CEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCCE
FWPTNVNNQKIDVLNLEGNIDNKINQLKLQTVFFENNKENNQNFANNYDDLVYEYHNSKN
EECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCC
QLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGFKN
CEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC
KSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSV
CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
NLHVDFNTLSTKYLLFANYLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDD
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC
PKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSALENKNKIRDYEMQLKQINIALQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEEEEEEC
SNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAIYN
CCCCCCCEEEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHH
DVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQIDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNS
HHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCC
NKINNFYDLYSNYIKVIQILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTPINTSLINIYQLPQFFNI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFNQSELLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEWIFNLKHKDQDGEQVVAIYKNADSNS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
DQKEYYFNGYVKNQRAYINVKYNKNLPTRLKLINIIKQNQINQKNNLVNVLDQDLNDYAK
CCCEEEEEEEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IINFKKGIKDINTNQQSVYDQALNNPQDYAMFKILSKIIKRYYFLRFSNHLMDIQFKHKT
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHH
FYQKLCYCRLQLILLIVVQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKKMFLLMKNMMRLFFKNKTLVTQLSILMIVSTVVIVATTITVQRLQKSQSDIKKIGLQS
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
DFLIDTKEQDNINFNEIDVSNNLVKHNEKLIQLATFNQNILKNSNNYLQLVDNAFHNHNL
CEEEECCCCCCCCCEEEECCCCHHHCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCCE
FWPTNVNNQKIDVLNLEGNIDNKINQLKLQTVFFENNKENNQNFANNYDDLVYEYHNSKN
EECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHEECCCC
QLVGFQNLDGGHILFKTPALKSANGNYETTFKINAAIVQKNKPFKSFFNFDKYKELGFKN
CEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCHHHHHCCHHHHHCCCCC
KSYFTNPVLIKNIDLYSKQVVQTLNDRSNQSIDFKDYQSTFQAIVDTLETNTINKDFYSV
CCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
NLHVDFNTLSTKYLLFANYLKNEGIDKNRYINELKIDNYKQKYLDLFQNQVLIPKELIDD
EEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC
PKKIEEVQKIIAKAKALLIAKIREETNIFYENSQKSALENKNKIRDYEMQLKQINIALQN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHEEEEEEC
SNYSNNELIQLKNEQKVLAANLDQAKFKHFLYNDLIKQDFRSILNNYNIYYRKHESAIYN
CCCCCCCEEEECCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHH
DVKSDSNFIVTNASNPTYTQNGLIAPRNQIDNMVQINEKNKNSQNPNKKFKRIFINDDNS
HHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCC
NKINNFYDLYSNYIKVIQILKNSYEKDPDTDKDLLVEERDYTPINTSLINIYQLPQFFNI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LFNQSELLSIQYLKEMSDYKKYLLQIFEPYQDKEWIFNLKHKDQDGEQVVAIYKNADSNS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEEEEEECCCCCC
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CCCEEEEEEEEECCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IINFKKGIKDINTNQQSVYDQALNNPQDYAMFKILSKIIKRYYFLRFSNHLMDIQFKHKT
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHH
FYQKLCYCRLQLILLIVVQI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA