Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
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Accession | NC_002162 |
Length | 751,719 |
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The map label for this gene is ABC-3
Identifier: 13358079
GI number: 13358079
Start: 637428
End: 638483
Strand: Direct
Name: ABC-3
Synonym: UU515
Alternate gene names: NA
Gene position: 637428-638483 (Clockwise)
Preceding gene: 13358074
Following gene: 13358080
Centisome position: 84.8
GC content: 23.58
Gene sequence:
>1056_bases ATGAATAAAATAAAAAATGCTAAATCTTCGTTTCTATATTTTAAAAAAATGCATAATTTAAAATCTTTTAACAAAAAAAG AAATAGATTAAAAGGCATACAAATCATATTTATTGTTTTTCTAATAATCTTTTGTTCATTATTTTTCTTAATTGATTTAT TTTTTACAGGTAATCATTTGAACGTCATTAAAAGAATGTTTGAAAATAGTTCTCTTTCAAATTCAACTTATATTTTTGTT CCTGTTGCTAATATAATTACAGGATTTAGTTTAGGAATTGGTTCAATTTCTATCCAAATTACTTCTAAAAATATTTTAGC TGGACCGTCAACACTTGGTTTTACACCAATGGCAATATTAGCATCAACCATTTCATTTATTATTACTTCAAGTGGTATTT TTTCAACAATTTTAATTTACTGTTTAGGTTTAATTTTTTCATTTATTATAATAGGTGTTAATTTTATATTAGTGAGAAAT AATTTTTTAGAAAATAGTTTTAAACCTATTTTAGTTGCTTTTGGGATTGGAGCATTAGTGACGGGAATTAATATTGTTTT AATTGCAACACATGACAATTTAAAAATTGTGGGATGATGGCGTTTTATTACTATCAACAATACATTAATAAACAATTATC GTATGATTGTTTCAAGTGTTCTAATGATTATTTCTACTATTATTTTATTATTTTTATCTCCTTATTTAAATATTATTAGA AAAGATTATATACTTGCTAAATCATTGGGGATTAAAGTCAATCTAATTTATTGGTTAGTGGCTATTTGTGTGGTAACTAT TACTATATCATCATCTATATTATTGGGAATAATTGCTTTATTAGGAGTAATTGTTGGAATTATTATTCAAACAATTTTTA AAAAAACACACGTTTTATTACTAATGATACTAGCAGGACTTTTTGGTAGTGGAATCTTATCATTTTCAAGTTACATTAAT GAATATATTCCTAGTGCCCGTGAAATGATTATTTGTGTTTTTGCTATACCAGTATTTGCTTACATTCTAAGTAAGAGAAA AGGATTTATTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATACATAAAAATCCTTCCTATATATTATATATGTTATAAATTTTATAATCTCAAAGACTATAAAAAATATTTTTAATAAG CGTAAATAGGAGATGAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGATTAATTTAAACACTTGAAATAAAACTCATTCTTTTAAAAACCCTTTAAAATATCAAAATAAAATCGCATATTTAA AAACAATGATAACAGTAATT
Product: ferrichrome ABC transporter
Products: NA
Alternate protein names: Citrate-Dependent Iron Transport Membrane-Bound Protein
Number of amino acids: Translated: 351; Mature: 351
Protein sequence:
>351_residues MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHLNVIKRMFENSSLSNSTYIFV PVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAILASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRN NFLENSFKPILVAFGIGALVTGINIVLIATHDNLKIVGWWRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIR KDYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLLMILAGLFGSGILSFSSYIN EYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK
Sequences:
>Translated_351_residues MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHLNVIKRMFENSSLSNSTYIFV PVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAILASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRN NFLENSFKPILVAFGIGALVTGINIVLIATHDNLKIVG*WRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIR KDYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLLMILAGLFGSGILSFSSYIN EYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK >Mature_351_residues MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHLNVIKRMFENSSLSNSTYIFV PVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAILASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRN NFLENSFKPILVAFGIGALVTGINIVLIATHDNLKIVG*WRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIR KDYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLLMILAGLFGSGILSFSSYIN EYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 38937; Mature: 38937
Theoretical pI: Translated: 10.74; Mature: 10.74
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH NVIKRMFENSSLSNSTYIFVPVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAIL HHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHH ASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRNNFLENSFKPILVAFGIGALV HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH TGINIVLIATHDNLKIVGWRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIRK HCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MILAGLFGSGILSFSSYINEYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH NVIKRMFENSSLSNSTYIFVPVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAIL HHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHH ASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRNNFLENSFKPILVAFGIGALV HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH TGINIVLIATHDNLKIVGWRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIRK HCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLL HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MILAGLFGSGILSFSSYINEYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA