Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is ABC-3

Identifier: 13358079

GI number: 13358079

Start: 637428

End: 638483

Strand: Direct

Name: ABC-3

Synonym: UU515

Alternate gene names: NA

Gene position: 637428-638483 (Clockwise)

Preceding gene: 13358074

Following gene: 13358080

Centisome position: 84.8

GC content: 23.58

Gene sequence:

>1056_bases
ATGAATAAAATAAAAAATGCTAAATCTTCGTTTCTATATTTTAAAAAAATGCATAATTTAAAATCTTTTAACAAAAAAAG
AAATAGATTAAAAGGCATACAAATCATATTTATTGTTTTTCTAATAATCTTTTGTTCATTATTTTTCTTAATTGATTTAT
TTTTTACAGGTAATCATTTGAACGTCATTAAAAGAATGTTTGAAAATAGTTCTCTTTCAAATTCAACTTATATTTTTGTT
CCTGTTGCTAATATAATTACAGGATTTAGTTTAGGAATTGGTTCAATTTCTATCCAAATTACTTCTAAAAATATTTTAGC
TGGACCGTCAACACTTGGTTTTACACCAATGGCAATATTAGCATCAACCATTTCATTTATTATTACTTCAAGTGGTATTT
TTTCAACAATTTTAATTTACTGTTTAGGTTTAATTTTTTCATTTATTATAATAGGTGTTAATTTTATATTAGTGAGAAAT
AATTTTTTAGAAAATAGTTTTAAACCTATTTTAGTTGCTTTTGGGATTGGAGCATTAGTGACGGGAATTAATATTGTTTT
AATTGCAACACATGACAATTTAAAAATTGTGGGATGATGGCGTTTTATTACTATCAACAATACATTAATAAACAATTATC
GTATGATTGTTTCAAGTGTTCTAATGATTATTTCTACTATTATTTTATTATTTTTATCTCCTTATTTAAATATTATTAGA
AAAGATTATATACTTGCTAAATCATTGGGGATTAAAGTCAATCTAATTTATTGGTTAGTGGCTATTTGTGTGGTAACTAT
TACTATATCATCATCTATATTATTGGGAATAATTGCTTTATTAGGAGTAATTGTTGGAATTATTATTCAAACAATTTTTA
AAAAAACACACGTTTTATTACTAATGATACTAGCAGGACTTTTTGGTAGTGGAATCTTATCATTTTCAAGTTACATTAAT
GAATATATTCCTAGTGCCCGTGAAATGATTATTTGTGTTTTTGCTATACCAGTATTTGCTTACATTCTAAGTAAGAGAAA
AGGATTTATTAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATACATAAAAATCCTTCCTATATATTATATATGTTATAAATTTTATAATCTCAAAGACTATAAAAAATATTTTTAATAAG
CGTAAATAGGAGATGAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATGATTAATTTAAACACTTGAAATAAAACTCATTCTTTTAAAAACCCTTTAAAATATCAAAATAAAATCGCATATTTAA
AAACAATGATAACAGTAATT

Product: ferrichrome ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: Citrate-Dependent Iron Transport Membrane-Bound Protein

Number of amino acids: Translated: 351; Mature: 351

Protein sequence:

>351_residues
MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHLNVIKRMFENSSLSNSTYIFV
PVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAILASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRN
NFLENSFKPILVAFGIGALVTGINIVLIATHDNLKIVGWWRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIR
KDYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLLMILAGLFGSGILSFSSYIN
EYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK

Sequences:

>Translated_351_residues
MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHLNVIKRMFENSSLSNSTYIFV
PVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAILASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRN
NFLENSFKPILVAFGIGALVTGINIVLIATHDNLKIVG*WRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIR
KDYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLLMILAGLFGSGILSFSSYIN
EYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK
>Mature_351_residues
MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHLNVIKRMFENSSLSNSTYIFV
PVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAILASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRN
NFLENSFKPILVAFGIGALVTGINIVLIATHDNLKIVG*WRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIR
KDYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLLMILAGLFGSGILSFSSYIN
EYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 38937; Mature: 38937

Theoretical pI: Translated: 10.74; Mature: 10.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
NVIKRMFENSSLSNSTYIFVPVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAIL
HHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHH
ASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRNNFLENSFKPILVAFGIGALV
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TGINIVLIATHDNLKIVGWRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIRK
HCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLL
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MILAGLFGSGILSFSSYINEYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKIKNAKSSFLYFKKMHNLKSFNKKRNRLKGIQIIFIVFLIIFCSLFFLIDLFFTGNHL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
NVIKRMFENSSLSNSTYIFVPVANIITGFSLGIGSISIQITSKNILAGPSTLGFTPMAIL
HHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCEECCCCCCCCCHHHHH
ASTISFIITSSGIFSTILIYCLGLIFSFIIIGVNFILVRNNFLENSFKPILVAFGIGALV
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TGINIVLIATHDNLKIVGWRFITINNTLINNYRMIVSSVLMIISTIILLFLSPYLNIIRK
HCCEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DYILAKSLGIKVNLIYWLVAICVVTITISSSILLGIIALLGVIVGIIIQTIFKKTHVLLL
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MILAGLFGSGILSFSSYINEYIPSAREMIICVFAIPVFAYILSKRKGFIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA