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The map label for this gene is ABC-2

Identifier: 13358073

GI number: 13358073

Start: 630813

End: 632789

Strand: Direct

Name: ABC-2

Synonym: UU510

Alternate gene names: 13358073

Gene position: 630813-632789 (Clockwise)

Preceding gene: 13358069

Following gene: 13358074

Centisome position: 83.92

GC content: 17.25

Gene sequence:

>1977_bases
ATGAAAATTGTTCAACAAACTTCTGATAATGAATGTGGTGTGTGTGTTATTAACATGTTAGCAAATTATTATCATAATAA
AACAATTGATAAAAACATCATTCTTCAAAAAGCAAATTTAACAAAAAATGGTTTGAGTTTGCAAGAACTTGAAAACTTAG
CAAATGAATTTAATTTAGATGCACAATCATTTGAATGTAGTTTTGAGGAGTTAATTGATGAAAAAATCAATGACTATTTT
ATAGCTTTAATTAACAAAAACGGTTTGAATCATTTTGTTATTGTTAAAAATTATAACAAAAATTTTTTTCGTATTTATGA
TCCAGAAAATAAAATATATGAATTAAATAATGAAGAATTTAAAAAAATATTTTTAAATATAATTGTGCGTGTTTCTAAAA
ATCATCAAATTTTTGACCTTCCCATATTTAAAGAATCTTATTTAAAAAATATTAAACTCTCATCGTTAATTATCATATTA
TTTATAGAGTTATTAAATATTCCTTTAAATATTTTTTTAAGTAAAATTGTAAACTTACTAATAGATTTAGTTTTAATTGA
CACACAAATTAAAAACTTAACATACTTATTTATTGTTTTTAGTTTATTTTATATTAGTAATGCTTTCAAAGATTTACTAA
TTACTATATACATAAATAAAATTAGTAATAATATTTTTTCTAATATTAATAATAAAATAGTTAATAATTTAGCTAATAAA
TCAATTATTTTTTTTAATAAAACAAATTTAGGTGAATTAAGCTCGATTCAGATTCATTTGAATAATATAATTCATTTTCT
ATTAGTTAGTCGTATAAAATTATTAGTTAATACTTTATTTGCAATTTGTATTATTTGTTTATTAGGTTTACAAAATTGAT
CTTTATTATTAATAAGTTTAGGGTTTAGTTTGTTAAATTTTATAATAGGATTGATTAATTGAAAATATTTTAAAATCCAC
AGTTTAAAAATAATTAATATTGAAAACTCATTATTTATTAAATATCAAAATTTTATTAAATTAATTAATCTCGAATACAA
TATCGATAAATATAATAACTATATTAATAGTTATAAAAAGCAATTTGATGAATTAATAATTTTTAAAAATAAAATTACTA
TTTTTAAATCGAATGTAAATTTTTATTTATCAATTATTAATAATATTGGTTTATTGATTTTATTAACTTATCTAATCATT
AATACCAATTATGATTATAAAGTTATTAGCGTAATCACTTATATAGTTTTTTTACATCAAAATCTAAATAATTTGTTTTT
TGGTATCTTTAATTTTTTTAATGAATTATTAAATTTTAAAAATGGAAAACAAATTGTTGAAAAAATTTTGTATATTGATA
ATTATGAAGAACATGATGGTATACAAATTAATAAAATTACATCATGTAAAATTACCGAAAACCAAAAGGAATTTGAATTT
AGCAAATCTTGTTTAATCATAGGAAAAAGTGGTGTTGGAAAAACAACATTATTAAAAAATTTTTTAAACTTTAATAATAA
AAATTTATTTTTTAATAACTTAAATGTAAATAATATAAATTTAAATCAACTTAAAGAATTAATTATCTATCATCCAACAA
ATCCTTTAATAAATGATTTTGATATAAATTGGTTTATAGATAAAAATGAAGAAATTATTAATGCTTTAAAAATAGTTATT
TTTATAACAAAGATCGATTGATCATTAAATAATAATTTTGAACATAATATTAACTTATCAACTGGTCAACAACAAATCCT
TGCTTTTTTAAATCTTTTAAAATACAAAAATAAATTATTACTACTTGATGAACCACTAGCACATGTTGATAATGATAATA
AAAAAATAATTTTAAACTCAATATTGCCTATAATTCTAAAAAATAATTTTGTCATTTATGTTTCACATGATCATTATTTA
AAAAAATATTTTGATCAAATAATTAATTTAAATGATGAAAAAATGGATAAGTATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAATCCTTAAATTATACTCTATTATATCTTATCGATATAAATATAAATTTTTTAAAAGAACATTATTTTCAACTAATT
ATTTAAAAGAGGTGATTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTGGGTTTTTTATTATCTTTATTAATAGCAATTGGTGTAATGTTTGGATTTAAAAATAAAAAATATTTTAAAACGA
CATTAAACATTCAAACAAAA

Product: ABC transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 658; Mature: 658

Protein sequence:

>658_residues
MKIVQQTSDNECGVCVINMLANYYHNKTIDKNIILQKANLTKNGLSLQELENLANEFNLDAQSFECSFEELIDEKINDYF
IALINKNGLNHFVIVKNYNKNFFRIYDPENKIYELNNEEFKKIFLNIIVRVSKNHQIFDLPIFKESYLKNIKLSSLIIIL
FIELLNIPLNIFLSKIVNLLIDLVLIDTQIKNLTYLFIVFSLFYISNAFKDLLITIYINKISNNIFSNINNKIVNNLANK
SIIFFNKTNLGELSSIQIHLNNIIHFLLVSRIKLLVNTLFAICIICLLGLQNWSLLLISLGFSLLNFIIGLINWKYFKIH
SLKIINIENSLFIKYQNFIKLINLEYNIDKYNNYINSYKKQFDELIIFKNKITIFKSNVNFYLSIINNIGLLILLTYLII
NTNYDYKVISVITYIVFLHQNLNNLFFGIFNFFNELLNFKNGKQIVEKILYIDNYEEHDGIQINKITSCKITENQKEFEF
SKSCLIIGKSGVGKTTLLKNFLNFNNKNLFFNNLNVNNINLNQLKELIIYHPTNPLINDFDINWFIDKNEEIINALKIVI
FITKIDWSLNNNFEHNINLSTGQQQILAFLNLLKYKNKLLLLDEPLAHVDNDNKKIILNSILPIILKNNFVIYVSHDHYL
KKYFDQIINLNDEKMDKY

Sequences:

>Translated_658_residues
MKIVQQTSDNECGVCVINMLANYYHNKTIDKNIILQKANLTKNGLSLQELENLANEFNLDAQSFECSFEELIDEKINDYF
IALINKNGLNHFVIVKNYNKNFFRIYDPENKIYELNNEEFKKIFLNIIVRVSKNHQIFDLPIFKESYLKNIKLSSLIIIL
FIELLNIPLNIFLSKIVNLLIDLVLIDTQIKNLTYLFIVFSLFYISNAFKDLLITIYINKISNNIFSNINNKIVNNLANK
SIIFFNKTNLGELSSIQIHLNNIIHFLLVSRIKLLVNTLFAICIICLLGLQN*SLLLISLGFSLLNFIIGLIN*KYFKIH
SLKIINIENSLFIKYQNFIKLINLEYNIDKYNNYINSYKKQFDELIIFKNKITIFKSNVNFYLSIINNIGLLILLTYLII
NTNYDYKVISVITYIVFLHQNLNNLFFGIFNFFNELLNFKNGKQIVEKILYIDNYEEHDGIQINKITSCKITENQKEFEF
SKSCLIIGKSGVGKTTLLKNFLNFNNKNLFFNNLNVNNINLNQLKELIIYHPTNPLINDFDINWFIDKNEEIINALKIVI
FITKID*SLNNNFEHNINLSTGQQQILAFLNLLKYKNKLLLLDEPLAHVDNDNKKIILNSILPIILKNNFVIYVSHDHYL
KKYFDQIINLNDEKMDKY
>Mature_658_residues
MKIVQQTSDNECGVCVINMLANYYHNKTIDKNIILQKANLTKNGLSLQELENLANEFNLDAQSFECSFEELIDEKINDYF
IALINKNGLNHFVIVKNYNKNFFRIYDPENKIYELNNEEFKKIFLNIIVRVSKNHQIFDLPIFKESYLKNIKLSSLIIIL
FIELLNIPLNIFLSKIVNLLIDLVLIDTQIKNLTYLFIVFSLFYISNAFKDLLITIYINKISNNIFSNINNKIVNNLANK
SIIFFNKTNLGELSSIQIHLNNIIHFLLVSRIKLLVNTLFAICIICLLGLQN*SLLLISLGFSLLNFIIGLIN*KYFKIH
SLKIINIENSLFIKYQNFIKLINLEYNIDKYNNYINSYKKQFDELIIFKNKITIFKSNVNFYLSIINNIGLLILLTYLII
NTNYDYKVISVITYIVFLHQNLNNLFFGIFNFFNELLNFKNGKQIVEKILYIDNYEEHDGIQINKITSCKITENQKEFEF
SKSCLIIGKSGVGKTTLLKNFLNFNNKNLFFNNLNVNNINLNQLKELIIYHPTNPLINDFDINWFIDKNEEIINALKIVI
FITKID*SLNNNFEHNINLSTGQQQILAFLNLLKYKNKLLLLDEPLAHVDNDNKKIILNSILPIILKNNFVIYVSHDHYL
KKYFDQIINLNDEKMDKY

Specific function: Unknown

COG id: COG2274

COG function: function code V; ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 peptidase C39 domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011527
- InterPro:   IPR005074 [H]

Pfam domain/function: PF03412 Peptidase_C39 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76754; Mature: 76754

Theoretical pI: Translated: 8.78; Mature: 8.78

Prosite motif: PS50990 PEPTIDASE_C39 ; PS50929 ABC_TM1F

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
0.5 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
0.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKIVQQTSDNECGVCVINMLANYYHNKTIDKNIILQKANLTKNGLSLQELENLANEFNLD
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
AQSFECSFEELIDEKINDYFIALINKNGLNHFVIVKNYNKNFFRIYDPENKIYELNNEEF
CHHHCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEECCCHHH
KKIFLNIIVRVSKNHQIFDLPIFKESYLKNIKLSSLIIILFIELLNIPLNIFLSKIVNLL
HHHHHHHHHEECCCCEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
IDLVLIDTQIKNLTYLFIVFSLFYISNAFKDLLITIYINKISNNIFSNINNKIVNNLANK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SIIFFNKTNLGELSSIQIHLNNIIHFLLVSRIKLLVNTLFAICIICLLGLQNSLLLISLG
EEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
FSLLNFIIGLINKYFKIHSLKIINIENSLFIKYQNFIKLINLEYNIDKYNNYINSYKKQF
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCEEEEEEHEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
DELIIFKNKITIFKSNVNFYLSIINNIGLLILLTYLIINTNYDYKVISVITYIVFLHQNL
HHEEEEECEEEEEECCCCEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCH
NNLFFGIFNFFNELLNFKNGKQIVEKILYIDNYEEHDGIQINKITSCKITENQKEFEFSK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHCCCC
SCLIIGKSGVGKTTLLKNFLNFNNKNLFFNNLNVNNINLNQLKELIIYHPTNPLINDFDI
CEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCE
NWFIDKNEEIINALKIVIFITKIDSLNNNFEHNINLSTGQQQILAFLNLLKYKNKLLLLD
EEEECCCHHHHHHHHHHHEEEEHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
EPLAHVDNDNKKIILNSILPIILKNNFVIYVSHDHYLKKYFDQIINLNDEKMDKY
CCHHHCCCCCCEEEHHHHHHHEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKIVQQTSDNECGVCVINMLANYYHNKTIDKNIILQKANLTKNGLSLQELENLANEFNLD
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
AQSFECSFEELIDEKINDYFIALINKNGLNHFVIVKNYNKNFFRIYDPENKIYELNNEEF
CHHHCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCEEECCCHHH
KKIFLNIIVRVSKNHQIFDLPIFKESYLKNIKLSSLIIILFIELLNIPLNIFLSKIVNLL
HHHHHHHHHEECCCCEEEECCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
IDLVLIDTQIKNLTYLFIVFSLFYISNAFKDLLITIYINKISNNIFSNINNKIVNNLANK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SIIFFNKTNLGELSSIQIHLNNIIHFLLVSRIKLLVNTLFAICIICLLGLQNSLLLISLG
EEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
FSLLNFIIGLINKYFKIHSLKIINIENSLFIKYQNFIKLINLEYNIDKYNNYINSYKKQF
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCEEEEEEHEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
DELIIFKNKITIFKSNVNFYLSIINNIGLLILLTYLIINTNYDYKVISVITYIVFLHQNL
HHEEEEECEEEEEECCCCEEEEHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCH
NNLFFGIFNFFNELLNFKNGKQIVEKILYIDNYEEHDGIQINKITSCKITENQKEFEFSK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHCCCC
SCLIIGKSGVGKTTLLKNFLNFNNKNLFFNNLNVNNINLNQLKELIIYHPTNPLINDFDI
CEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCE
NWFIDKNEEIINALKIVIFITKIDSLNNNFEHNINLSTGQQQILAFLNLLKYKNKLLLLD
EEEECCCHHHHHHHHHHHEEEEHHCCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
EPLAHVDNDNKKIILNSILPIILKNNFVIYVSHDHYLKKYFDQIINLNDEKMDKY
CCHHHCCCCCCEEEHHHHHHHEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7569993; 8253680 [H]