| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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The map label for this gene is leuS
Identifier: 13357931
GI number: 13357931
Start: 423256
End: 425676
Strand: Direct
Name: leuS
Synonym: UU371
Alternate gene names: 13357931
Gene position: 423256-425676 (Clockwise)
Preceding gene: 13357930
Following gene: 13357937
Centisome position: 56.31
GC content: 28.34
Gene sequence:
>2421_bases ATGTATAATCACAATAAAATTGAAAAAAAATGACAAAAGTATTGACTAGATAATAAGACTTTTAAATTTGTTGATAATCC TAACAATCCTAAGAAATTTTATGTATTAGACATGTTTCCATATCCTAGTGGAAAAGGATTGCATGTTGGTCATCCCAAAG GTTATACAGCAACTGATGTAATTAGTCGTTTTAAACGTTTGAATGGTTATGATGTTTTACATCCAATTGGTTGAGATGCT TTCGGTTTACCAGCAGAACAGTATGCATTAGAAACAAATAATCACCCTCATACTTTTACGCAACAAAATATTAAAATTTT TCGTAAACAATTACAAATGATTGGTTTTGATTTTGACTATGATAAAGAAGTTGATACAACCGATCCTCAATTTTATCAAT GAACGCAATGGATTTTTGTGCAATTATATAAACATAATTTAGCTGAAATTCAAGATATTGATGTTAATTGATGCGAAAAT TTAGGAACTGTTTTAAGTAATGAAGAAGTTGTTTTAAATGATAAAAACGAACGGGTAAGTGAGCGAGGTGGTCATCCTGT TGTTCGTAAACCAATGAAACAATGAGTTTTAAAAATTGTAGATTATGCTGATAAATTATTAGATGGTTTAAATGAAGTTG AATTTAGTGAATCATTAAAATCGTTGCAACGTAATTGAATTGGTAAATCAATCGGTACTAGTGTGCAATTTAAGATTAAA GATTCACTTTTAACACTTGATGTGTTCACTACACGAATTGATACTATTTATGGGGTACAATACTTAGTAGTTGCACCAGA ACATCCAATTCTTAAATCTATTACTAGTGAGCAACAAATTAATGTTGTTCAATCATATATTGAACAAACAAAGAAAATAA GCGATTTAGATCGCATTGCTGATACTAATAAAACTGGTGTTTTTAGTGGTGCATATGCTATTAATCCAATCAATCAAGAA ATCATTCCAATTTGAGTAAGTGATTATGTTTTAATGAATTTTGCAACTGGAGCTGTTATGGGTGTACCAGCACATGATGA ACGTGATTATGCTTTTGCTAAAAAATATGCATTACCAATTAAAAGTGTAATTGATACAAAACAAAAATTACCATATGCAG GTGATGGTTTACATATTAACTCAGCAATGATTAATGGTTTAAATATTAAACAATCTCAAAATGTTTTAAATGATTATTTA ATTAAAAATCATCTAGGAAAAAAAGTTGCAAACTATAAATTGCGTAATTGAATTTTTAGTCGTCAACGTTATTGAGGTGA ACCATTCCCAGTTTTATTCGATGAAAATAATCAAATAAAGATTATCGAAGACTTACCTGTTTTATTACCAAATTTAAATG AATTTAAACCTTCTAAAACTGGTGAATCTCCCCTTGCAAATGCCCAAGAATGATTATATGTAGAAATTGATGGTAAAAAA TATCGTCGCGAAACAAATACAATGCCACAATGAGCAGGCTCATCATGATATTTTTTAGCTTATATTTTAAAAAATGAAGA TGGTTCATACACACCATTAAATAGTGAAGAAGCTAAAAAGCGTTTTGCTAAATGATTGCCAGTTGATGTTTATATTGGTG GACAAGAACATGCTGTTTTACATTTACTATATTCGCGTTTTTGACATCGTTTTTTGTATGATATTGGTGTAGTGCCAACA AAAGAACCATTTTATAAAGTAATTAATCAGGGAATGATTTTAGGCGAAAATAATGAAAAAATGTCTAAATCAAAAGGGAA TGTTATTAATCCTGATGATATTATTGCTTCGCATGGTGCTGATACATTAAGAATTTATGAAATGTTTATGGGACCATTAA CAGCTTCATTACCATGAAATCCGGATGGGTTAGATGCGATGCGAAAATGATTAGATCGCGTTTATCGTTTATATCATAAT TTAAGTGAACTAGAAGTTGTCGAAGATCTTAATAAACTAAATGAAGAAATAATTATTGCCTATCATACTTTAATTAAAAA TTACACAAAAGCAATTAATGAACAAGCATTTAATATTGCGATTAGTGAAATGATGGTTTTTGTTAATGTTTTATACAAAA ATAAAGTTATTAATTATGAATTATTAGATAATTTTTTAATTTTACTTTCATGCTATGCACCACATTTAGCGGAGGAATTA TATAGTTTAAACCATTCAGAATCTGTTTGTTTACAAAAAATGCCTATTTATGATGAACAAAAAATTATTGCTCAAAATAT TACAATTCCAATTCAAATTAATGGTAAATTAAAGCACACAATCAATGTTTTAAGAGATACAAATGCTGAAGAGTTAGTTA ATTTAGCATTGGCTTGTGAACAAGTTAAACAAGAAATTGGGGATCAACCAATTAAAAAACAAATCGTTGTTGTTAATAAA ATTATTAATTTTGTTATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGCAGCTAAAATCAAAAAAGTTAAAGATAAAATGAGTGCTGTTGTTATTTTAGAAAGTTATTTAAGTAAAAATCATTTTA ATTAAAGAAAGGTAAGACTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTTTTTACTATGTAAAAAGACACTAATATTGATTTTTATTTACAATAAAAAAATAATTAACAAAACCCCAGTATTTTT TTCAATAGGCTCATTTTAAT
Product: leucyl-tRNA synthetase
Products: NA
Alternate protein names: Leucine--tRNA ligase; LeuRS [H]
Number of amino acids: Translated: 806; Mature: 806
Protein sequence:
>806_residues MYNHNKIEKKWQKYWLDNKTFKFVDNPNNPKKFYVLDMFPYPSGKGLHVGHPKGYTATDVISRFKRLNGYDVLHPIGWDA FGLPAEQYALETNNHPHTFTQQNIKIFRKQLQMIGFDFDYDKEVDTTDPQFYQWTQWIFVQLYKHNLAEIQDIDVNWCEN LGTVLSNEEVVLNDKNERVSERGGHPVVRKPMKQWVLKIVDYADKLLDGLNEVEFSESLKSLQRNWIGKSIGTSVQFKIK DSLLTLDVFTTRIDTIYGVQYLVVAPEHPILKSITSEQQINVVQSYIEQTKKISDLDRIADTNKTGVFSGAYAINPINQE IIPIWVSDYVLMNFATGAVMGVPAHDERDYAFAKKYALPIKSVIDTKQKLPYAGDGLHINSAMINGLNIKQSQNVLNDYL IKNHLGKKVANYKLRNWIFSRQRYWGEPFPVLFDENNQIKIIEDLPVLLPNLNEFKPSKTGESPLANAQEWLYVEIDGKK YRRETNTMPQWAGSSWYFLAYILKNEDGSYTPLNSEEAKKRFAKWLPVDVYIGGQEHAVLHLLYSRFWHRFLYDIGVVPT KEPFYKVINQGMILGENNEKMSKSKGNVINPDDIIASHGADTLRIYEMFMGPLTASLPWNPDGLDAMRKWLDRVYRLYHN LSELEVVEDLNKLNEEIIIAYHTLIKNYTKAINEQAFNIAISEMMVFVNVLYKNKVINYELLDNFLILLSCYAPHLAEEL YSLNHSESVCLQKMPIYDEQKIIAQNITIPIQINGKLKHTINVLRDTNAEELVNLALACEQVKQEIGDQPIKKQIVVVNK IINFVI
Sequences:
>Translated_806_residues MYNHNKIEKK*QKY*LDNKTFKFVDNPNNPKKFYVLDMFPYPSGKGLHVGHPKGYTATDVISRFKRLNGYDVLHPIG*DA FGLPAEQYALETNNHPHTFTQQNIKIFRKQLQMIGFDFDYDKEVDTTDPQFYQ*TQWIFVQLYKHNLAEIQDIDVN*CEN LGTVLSNEEVVLNDKNERVSERGGHPVVRKPMKQ*VLKIVDYADKLLDGLNEVEFSESLKSLQRN*IGKSIGTSVQFKIK DSLLTLDVFTTRIDTIYGVQYLVVAPEHPILKSITSEQQINVVQSYIEQTKKISDLDRIADTNKTGVFSGAYAINPINQE IIPI*VSDYVLMNFATGAVMGVPAHDERDYAFAKKYALPIKSVIDTKQKLPYAGDGLHINSAMINGLNIKQSQNVLNDYL IKNHLGKKVANYKLRN*IFSRQRY*GEPFPVLFDENNQIKIIEDLPVLLPNLNEFKPSKTGESPLANAQE*LYVEIDGKK YRRETNTMPQ*AGSS*YFLAYILKNEDGSYTPLNSEEAKKRFAK*LPVDVYIGGQEHAVLHLLYSRF*HRFLYDIGVVPT KEPFYKVINQGMILGENNEKMSKSKGNVINPDDIIASHGADTLRIYEMFMGPLTASLP*NPDGLDAMRK*LDRVYRLYHN LSELEVVEDLNKLNEEIIIAYHTLIKNYTKAINEQAFNIAISEMMVFVNVLYKNKVINYELLDNFLILLSCYAPHLAEEL YSLNHSESVCLQKMPIYDEQKIIAQNITIPIQINGKLKHTINVLRDTNAEELVNLALACEQVKQEIGDQPIKKQIVVVNK IINFVI >Mature_806_residues MYNHNKIEKK*QKY*LDNKTFKFVDNPNNPKKFYVLDMFPYPSGKGLHVGHPKGYTATDVISRFKRLNGYDVLHPIG*DA FGLPAEQYALETNNHPHTFTQQNIKIFRKQLQMIGFDFDYDKEVDTTDPQFYQ*TQWIFVQLYKHNLAEIQDIDVN*CEN LGTVLSNEEVVLNDKNERVSERGGHPVVRKPMKQ*VLKIVDYADKLLDGLNEVEFSESLKSLQRN*IGKSIGTSVQFKIK DSLLTLDVFTTRIDTIYGVQYLVVAPEHPILKSITSEQQINVVQSYIEQTKKISDLDRIADTNKTGVFSGAYAINPINQE IIPI*VSDYVLMNFATGAVMGVPAHDERDYAFAKKYALPIKSVIDTKQKLPYAGDGLHINSAMINGLNIKQSQNVLNDYL IKNHLGKKVANYKLRN*IFSRQRY*GEPFPVLFDENNQIKIIEDLPVLLPNLNEFKPSKTGESPLANAQE*LYVEIDGKK YRRETNTMPQ*AGSS*YFLAYILKNEDGSYTPLNSEEAKKRFAK*LPVDVYIGGQEHAVLHLLYSRF*HRFLYDIGVVPT KEPFYKVINQGMILGENNEKMSKSKGNVINPDDIIASHGADTLRIYEMFMGPLTASLP*NPDGLDAMRK*LDRVYRLYHN LSELEVVEDLNKLNEEIIIAYHTLIKNYTKAINEQAFNIAISEMMVFVNVLYKNKVINYELLDNFLILLSCYAPHLAEEL YSLNHSESVCLQKMPIYDEQKIIAQNITIPIQINGKLKHTINVLRDTNAEELVNLALACEQVKQEIGDQPIKKQIVVVNK IINFVI
Specific function: Unknown
COG id: COG0495
COG function: function code J; Leucyl-tRNA synthetase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [H]
Metaboloic importance: Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the class-I aminoacyl-tRNA synthetase family [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI7661872, Length=860, Percent_Identity=28.7209302325581, Blast_Score=296, Evalue=5e-80, Organism=Escherichia coli, GI1786861, Length=874, Percent_Identity=33.7528604118993, Blast_Score=395, Evalue=1e-111, Organism=Caenorhabditis elegans, GI71997510, Length=256, Percent_Identity=34.375, Blast_Score=137, Evalue=2e-32, Organism=Caenorhabditis elegans, GI71997517, Length=256, Percent_Identity=34.375, Blast_Score=137, Evalue=2e-32, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6323414, Length=877, Percent_Identity=30.7867730900798, Blast_Score=308, Evalue=3e-84, Organism=Drosophila melanogaster, GI21355409, Length=844, Percent_Identity=28.7914691943128, Blast_Score=243, Evalue=3e-64,
Paralogues:
None
Copy number: 800 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001412 - InterPro: IPR002300 - InterPro: IPR002302 - InterPro: IPR014729 - InterPro: IPR009080 - InterPro: IPR013155 - InterPro: IPR009008 [H]
Pfam domain/function: PF08264 Anticodon_1; PF00133 tRNA-synt_1 [H]
EC number: =6.1.1.4 [H]
Molecular weight: Translated: 89828; Mature: 89828
Theoretical pI: Translated: 6.80; Mature: 6.80
Prosite motif: PS00178 AA_TRNA_LIGASE_I
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYNHNKIEKKQKYLDNKTFKFVDNPNNPKKFYVLDMFPYPSGKGLHVGHPKGYTATDVIS CCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHH RFKRLNGYDVLHPIGDAFGLPAEQYALETNNHPHTFTQQNIKIFRKQLQMIGFDFDYDKE HHHHCCCCCHHHHCHHHHCCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC VDTTDPQFYQTQWIFVQLYKHNLAEIQDIDVNCENLGTVLSNEEVVLNDKNERVSERGGH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHCCCC PVVRKPMKQVLKIVDYADKLLDGLNEVEFSESLKSLQRNIGKSIGTSVQFKIKDSLLTLD CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEHH VFTTRIDTIYGVQYLVVAPEHPILKSITSEQQINVVQSYIEQTKKISDLDRIADTNKTGV HHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE FSGAYAINPINQEIIPIVSDYVLMNFATGAVMGVPAHDERDYAFAKKYALPIKSVIDTKQ EECCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHH KLPYAGDGLHINSAMINGLNIKQSQNVLNDYLIKNHLGKKVANYKLRNIFSRQRYGEPFP HCCCCCCCEEECHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC VLFDENNQIKIIEDLPVLLPNLNEFKPSKTGESPLANAQELYVEIDGKKYRRETNTMPQA EEECCCCCEEEEECCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHCCCCCCC GSSYFLAYILKNEDGSYTPLNSEEAKKRFAKLPVDVYIGGQEHAVLHLLYSRFHRFLYDI CCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVVPTKEPFYKVINQGMILGENNEKMSKSKGNVINPDDIIASHGADTLRIYEMFMGPLTA CCCCCCHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHC SLPNPDGLDAMRKLDRVYRLYHNLSELEVVEDLNKLNEEIIIAYHTLIKNYTKAINEQAF CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIAISEMMVFVNVLYKNKVINYELLDNFLILLSCYAPHLAEELYSLNHSESVCLQKMPIY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCC DEQKIIAQNITIPIQINGKLKHTINVLRDTNAEELVNLALACEQVKQEIGDQPIKKQIVV CCHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH VNKIINFVI HHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MYNHNKIEKKQKYLDNKTFKFVDNPNNPKKFYVLDMFPYPSGKGLHVGHPKGYTATDVIS CCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHH RFKRLNGYDVLHPIGDAFGLPAEQYALETNNHPHTFTQQNIKIFRKQLQMIGFDFDYDKE HHHHCCCCCHHHHCHHHHCCCHHHHEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC VDTTDPQFYQTQWIFVQLYKHNLAEIQDIDVNCENLGTVLSNEEVVLNDKNERVSERGGH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHCCCC PVVRKPMKQVLKIVDYADKLLDGLNEVEFSESLKSLQRNIGKSIGTSVQFKIKDSLLTLD CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEEHH VFTTRIDTIYGVQYLVVAPEHPILKSITSEQQINVVQSYIEQTKKISDLDRIADTNKTGV HHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE FSGAYAINPINQEIIPIVSDYVLMNFATGAVMGVPAHDERDYAFAKKYALPIKSVIDTKQ EECCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHH KLPYAGDGLHINSAMINGLNIKQSQNVLNDYLIKNHLGKKVANYKLRNIFSRQRYGEPFP HCCCCCCCEEECHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC VLFDENNQIKIIEDLPVLLPNLNEFKPSKTGESPLANAQELYVEIDGKKYRRETNTMPQA EEECCCCCEEEEECCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHCCCCCCC GSSYFLAYILKNEDGSYTPLNSEEAKKRFAKLPVDVYIGGQEHAVLHLLYSRFHRFLYDI CCCEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVVPTKEPFYKVINQGMILGENNEKMSKSKGNVINPDDIIASHGADTLRIYEMFMGPLTA CCCCCCHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHC SLPNPDGLDAMRKLDRVYRLYHNLSELEVVEDLNKLNEEIIIAYHTLIKNYTKAINEQAF CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIAISEMMVFVNVLYKNKVINYELLDNFLILLSCYAPHLAEELYSLNHSESVCLQKMPIY HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCCC DEQKIIAQNITIPIQINGKLKHTINVLRDTNAEELVNLALACEQVKQEIGDQPIKKQIVV CCHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH VNKIINFVI HHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA