Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9301, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_009091 |
Length | 1,641,879 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 126695993
Identifier: 126695993
GI number: 126695993
Start: 582149
End: 583537
Strand: Direct
Name: 126695993
Synonym: P9301_06551
Alternate gene names: NA
Gene position: 582149-583537 (Clockwise)
Preceding gene: 126695992
Following gene: 126695994
Centisome position: 35.46
GC content: 31.1
Gene sequence:
>1389_bases ATGTTTTTGAAATCATTGAATATTTTTTCGATACAGAATAAAGATATTTTTTCAAATTCTCTATTGATAAGTTTTTTTGG ATTGTTAATTATATTTTTTTTGTTGATTTTTGGAAGGAAATTTAAACTAGCTGTGCAACTAGAAAGATTTGGATTGCCGA TAGCAGTCATATCAGGAATCTTAGGTATATCTATAGGCCCATTTGGTGCGATACACTTTTTACCAAAAGAAACAATAAAT GTTTGGAGTAATTTTCCTACTCCTCTTTTATCATTAGTCTTCGCAACTTTAATGATGGGAAGACCTATACCGAATATAAA TGGTTTAGTTAAACCTATTTTTAATCAATTTCTATTAGCTCTTTCACTGGGTTTCGGACAATTTTTTGTCGGTGGCCTTG TTGTTAAATATTTGCTGCCTCCATCTATGGACGCAAATCCTCTAATGGGTTGTTTAATAGAGGTAGGTTTTGAGGGAGGT CATGGTGCTGCATCAATAATCGGTGAAAGTTTTAATAAACTAGGTTTCCCAAATGGCTTAGATCTTGGTTTGGCTATGGC AACAATGGGTCTTTTATCCTCTTCAATATTGGGTAGCATATTCATCTTCCTAGGAAGAACTTTAGGTCTTTCAGATACTG AGGAAATTCTTGAACAAAAAGATACTCTAAAGGAAAAAAATAAGACAGGAATTTTTGCGGATTTAAGAATTTTTATAATA AATCTTGGATTCTCTGGTTTGGCAATTTCTTTTGGTATTTTGCTACTTAAATTTTTAAGGTATATTTCAAGTTCTTTTGG AGATTTTTCGAAGGAAATTATTTTTTCACTACCAGTATTCCCTTTTATTCTTATAGGTTCGCTCCTCATAAGATATATTT TAGAGAAAACCAAAAATACAGAATTTATTTCAAATATTCTGCAAAGGGAGATTGGTATTTTATCCACAGATTTGTTGATT TTTACAGCTATGGCGAGTTTAGATATCGCAGTTGTTTTTGATAATTGGATACTTATTTTAGTGTTTACTATTTTCGGTTT ATTTTGGAATTTAATCTGCATTGCTTATTTCGCATACTTTATTTTTGATGATTATTGGTTTGAAAAGAGCTTGATAGAGT TTGGGAATTCTACAGGTGTAGTAGCTTCTGGGTTACTTCTTTTAAGGCTTGCAGATCCTAAAAATATTTCTAAGACTTTA CCAATTTTTACGTCAAAACAGCTTTTCGCTCAGTTAATTCTTTCTGGGGGACTATTTACAGTTCTTGCACCATTAATGAT TTCTAAAATTGGGTTAGATTATTGGACAGAAATTTGTGCCCTAATTACATTCGCAATTCTCTTTATTGCATTGATTTTTA ATAAAGTAGAGATGAAAAAGTTTCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGATTAATTTTCAAATTTTCTTACCAATATCAAAAGGCTCCTCTTACCGGAGCCTTTTTTATTTGAAAAATTTTGTTTAT TAATTTAGATTTAGAGTTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAACCCTAGAATAGTATTAGCCTAAATTTTATTTTAATGTCATTTACTCCCTACGATATTCCACCTCAAGAAAATAAAGG GAAGTGGTTTAGGAGTCATT
Product: sodium/solute symporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein
Number of amino acids: Translated: 462; Mature: 462
Protein sequence:
>462_residues MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISIGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYLLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNKLGFPNGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEQKDTLKEKNKTGIFADLRIFII NLGFSGLAISFGILLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILFIALIFNKVEMKKFQ
Sequences:
>Translated_462_residues MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISIGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYLLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNKLGFPNGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEQKDTLKEKNKTGIFADLRIFII NLGFSGLAISFGILLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILFIALIFNKVEMKKFQ >Mature_462_residues MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISIGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYLLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNKLGFPNGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEQKDTLKEKNKTGIFADLRIFII NLGFSGLAISFGILLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILFIALIFNKVEMKKFQ
Specific function: Unknown
COG id: COG0786
COG function: function code E; Na+/glutamate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51247; Mature: 51247
Theoretical pI: Translated: 8.43; Mature: 8.43
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGI CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEHHHHCCCHHHHHHH LGISIGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLA HHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LSLGFGQFFVGGLVVKYLLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNKLGFPNGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEQKDTLKEKNKTGIFADLRIFII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHE NLGFSGLAISFGILLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNT ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH VLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILFIALIFNKVEMKKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGI CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEHHHHCCCHHHHHHH LGISIGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLA HHCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LSLGFGQFFVGGLVVKYLLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNKLGFPNGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFLGRTLGLSDTEEILEQKDTLKEKNKTGIFADLRIFII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHE NLGFSGLAISFGILLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNT ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH VLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILFIALIFNKVEMKKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA