Definition Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome.
Accession NC_009052
Length 5,127,376

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 126175705

Identifier: 126175705

GI number: 126175705

Start: 4113683

End: 4116322

Strand: Direct

Name: 126175705

Synonym: Sbal_3508

Alternate gene names: NA

Gene position: 4113683-4116322 (Clockwise)

Preceding gene: 126175704

Following gene: 126175706

Centisome position: 80.23

GC content: 50.04

Gene sequence:

>2640_bases
ATGAACAATAAACCGCTCACTAAGGCGACTCCCACAGAACTTAAGCAGATAGAACTTAAGCAAACTTGGCTGAGGCTGAC
GTGGCTCAGCCTAAAGGTGTTTATCGCCCATTATCGTCATGCGCCCTTGCAGGCGTGCGCGATTCTACTCGGTATCGCCT
TGGCCGTGACTCTGCTGATTGGGGTTAAAGCGACCAACGACAATGCGGTGCGCAGTTATAGCGATGCGACTGAGCTTTTG
AGCCAGCGTGCCGATGTACTACTTACTCCGCCCCTTGGACAAAACACCTTAGATGAATCTGTTTATTTCGCCTTAAGACG
AGCCGGATTAAGTCAGGGTCTCGCCGTGGTGAATGGCAAAATTTCCGGTAAGAATGGTCAGTTTTGGCAACTGGAAGGCA
GCGATTTGATTGCCGCATTAACGCTACAAAAATCGAGAAGTCACGCCTCGACTGAAACGCAGTCAACGACCTCGCCGCAG
ATGAATGAGTTACCGCTTGCCGATCTCCTCAACGGCGCCCCCACAGTAATAATGAGCCGCAGTCTAGCCGCCAAAGTAGC
GCCAGAGGGTAAACTTGTTTTAGAAAATAACACCTTAGATGTCATTGCAATTGATGATAATTTTGGCCTCGGCAGCGCCA
TCTTGGCCGATATTTCCCTCGCCCAGCAATTACTGAACATGCAAGGCCGATTAAGCTATATCGCCATGTTCAGCGAGCGA
GAAAACTTACCTCAACTAAAATCCCAACTCGACGCTTTAGGAATTACGCCGCAAAATGCCAGTTTTAGCCAGCAAGATCA
AGGCCAAGCACTGATAGCGCTGACCCGCAGTTTTCATCTTAATCTCAATGCCATGAGCATGTTAGCCTTCGTTGTCGGCC
TCTTTATCGCCTACAACGGTGTGCGCTACAGCCTAATGAAACGGCAAGAACTGTTAGTGCAGTTATTACAACAGGGAATC
GAGCGCCGCGCCTTGATGACGGCGCTGATGTTAGAATTAATTTTGTTGGTTGTCATAGGCTCAAGTTTGGGCTTTATCAG
TGGCTTGCAACTCAGCCACTGGCTGCAACCTATGGTCGCCATGACCTTAGAGCAAATGTATGGCGCCCACTTACTCCCCG
GTATTTGGCAATGGACTTGGCTTATCGAGGCAATTGCCCTCACCTTAGGCGCTGCGTTCGCCGCTTGCTTGCCCTTGTAT
TTAGATCTTACGCGCCAAGCATTGGCACAAGGGGCGAATCGTTATCAGCAAATGCAGGCACACCGCAAAACTCATAGCAT
TCAATTTGCCTTAGCCTGTGGTTTACTGACCGTAGCGGCGCTGCTGTTTCCCTTCAGTCAAAGCTATAACATCAGCTTAG
TGTTGCTCGGTATCGTCGCTATCGCGATCCCCTTGTTGTTGCCGCAATTATTACATTGGGGCGTCAGTGCGTTAATGCCC
TTGGCACGCCCTGGATTATGGCAATATCTGCTCGCCGAAACCCGCGAGCTTATCGCACCGCTCTCCTTGGCTATGATGGC
AATCTTGCTGGCGCTCAGTGCCAATGTGTCGATGAACACGCTCGTTGGAAGCTTCGAGCAAACCCTGCGGACTTGGCTAG
AAACCCGCTTGCATGCCGATCTCTACATCCGTCCACCGAGCCAGCGCATCGACACGATTCAAACCCAACTGATGCACGAT
CCAGGAGTCAGCGGTCTTTATCAGCAATGGCAAATTGAAGCCCAGCTTTCACTCCCTGTATCGACGGATAATTCGAGCGC
ACAAACAATTCCAATAAGCCTACTTAGCCGTGATGAATATTCGATTCGCCACACCAGCGCCCTGAAAGAAAGCCTACCGA
CTCTGTGGCAATCCTACTTTAATGCCCCCGTGATCTTAGTGAGCGAGCCCCTCGCCATTAAATATCAATTGCAGCTTGGC
GATAGCGTGTCATTGGATGCGCTTAAGAAAACCGGTAACAGCCAAGCCATTATCGGCGGCATTTATTATGACCACGGCAA
TACCCGCAACGAGGTAATTATCAGCCAGCCATTATGGCAAAAGGCACAATTACCTGTGCTGCCGATCAGCTTGGCGGCGA
ATTTTTACGGTAAAGAGCGAGGCAGCAAGATCAGTGAAACGGATCTCGATGAACTGCAAATCCAACTGGCTGCCGAGTTA
GGCTTATCGCAAGCGCAAATCTACAGTCAAACTAAGATTAAAACCCAAGCTATCGCCATGTTTAAGCGGACTTTTTCGAT
TACCTTAGTGCTGAATAGTTTGACGCTAATTGTCGCCGCTATTGGTCTTTTTAGTGCCTGTTTAATGTTAACTCAGGCAC
GGCAAGCGCCACTGGCACGGCTGTATTCATTAGGCGTGAGTCGTAATGCGCTGCGCGGTATGGTGTTTATGCAGATGCTG
ATTGTGGTGCTGATCACTTGCCTGCTCGCTATGCCAACGGGTGCACTGCTAGGTTACCTGCTTATCAACAAGATCACCTT
GCAAGCCTTTGGCTGGACGATAAAAATGATTTGGGATTGGCAAGCCTATGGCAAAGCAATACTGATTGCCTTAACCACCT
GCACCTTAGCCGTGCTCTTGCCGCTGTATTGGCAAACCCGCAAGCCATTGGTCGCCAGTCTGCAGCAGGAGACCCTGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGGGAAAGCCAAACCAGTATCTTAATGGTTACCCACAGTGAAGAGTGCGCCGCCTTCATGCAAAAACGTTGGCACTTATC
CCAAGGTGCAGTCGCTATCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAACACTCAGTATTGTATGGGCAGTGGTTGGGTTAATGCTGATCGGCGGCTGCGACCAAACGCCACAGGCTCAAAGC
ACTCAATCCAAATCCATGGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 879; Mature: 879

Protein sequence:

>879_residues
MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELL
SQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQ
MNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER
ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQELLVQLLQQGI
ERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLY
LDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP
LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHD
PGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLG
DSVSLDALKKTGNSQAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL
GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQML
IVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL

Sequences:

>Translated_879_residues
MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELL
SQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQ
MNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER
ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQELLVQLLQQGI
ERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLY
LDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP
LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHD
PGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLG
DSVSLDALKKTGNSQAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL
GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQML
IVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
>Mature_879_residues
MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELL
SQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQ
MNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER
ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQELLVQLLQQGI
ERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLY
LDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP
LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHD
PGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLG
DSVSLDALKKTGNSQAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL
GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQML
IVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96740; Mature: 96740

Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLI
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVKATNDNAVRSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGK
HEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECE
ISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQMNELPLADLLNGAPTVIMSR
EECCCCCEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHH
SLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER
HHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC
ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNG
CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VRYSLMKRQELLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHH
MTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQA
HHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHAD
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LYIRPPSQRIDTIQTQLMHDPGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEY
EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCC
SIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGNSQAIIGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEE
IYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL
EEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLAR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYSLGVSRNALRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDW
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEH
QAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLI
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GVKATNDNAVRSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGK
HEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECE
ISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQMNELPLADLLNGAPTVIMSR
EECCCCCEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHH
SLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER
HHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC
ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNG
CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
VRYSLMKRQELLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHH
MTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQA
HHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHAD
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LYIRPPSQRIDTIQTQLMHDPGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEY
EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCC
SIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGNSQAIIGG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEE
IYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL
EEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLAR
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYSLGVSRNALRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDW
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEH
QAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA