| Definition | Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009052 |
| Length | 5,127,376 |
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The map label for this gene is 126175705
Identifier: 126175705
GI number: 126175705
Start: 4113683
End: 4116322
Strand: Direct
Name: 126175705
Synonym: Sbal_3508
Alternate gene names: NA
Gene position: 4113683-4116322 (Clockwise)
Preceding gene: 126175704
Following gene: 126175706
Centisome position: 80.23
GC content: 50.04
Gene sequence:
>2640_bases ATGAACAATAAACCGCTCACTAAGGCGACTCCCACAGAACTTAAGCAGATAGAACTTAAGCAAACTTGGCTGAGGCTGAC GTGGCTCAGCCTAAAGGTGTTTATCGCCCATTATCGTCATGCGCCCTTGCAGGCGTGCGCGATTCTACTCGGTATCGCCT TGGCCGTGACTCTGCTGATTGGGGTTAAAGCGACCAACGACAATGCGGTGCGCAGTTATAGCGATGCGACTGAGCTTTTG AGCCAGCGTGCCGATGTACTACTTACTCCGCCCCTTGGACAAAACACCTTAGATGAATCTGTTTATTTCGCCTTAAGACG AGCCGGATTAAGTCAGGGTCTCGCCGTGGTGAATGGCAAAATTTCCGGTAAGAATGGTCAGTTTTGGCAACTGGAAGGCA GCGATTTGATTGCCGCATTAACGCTACAAAAATCGAGAAGTCACGCCTCGACTGAAACGCAGTCAACGACCTCGCCGCAG ATGAATGAGTTACCGCTTGCCGATCTCCTCAACGGCGCCCCCACAGTAATAATGAGCCGCAGTCTAGCCGCCAAAGTAGC GCCAGAGGGTAAACTTGTTTTAGAAAATAACACCTTAGATGTCATTGCAATTGATGATAATTTTGGCCTCGGCAGCGCCA TCTTGGCCGATATTTCCCTCGCCCAGCAATTACTGAACATGCAAGGCCGATTAAGCTATATCGCCATGTTCAGCGAGCGA GAAAACTTACCTCAACTAAAATCCCAACTCGACGCTTTAGGAATTACGCCGCAAAATGCCAGTTTTAGCCAGCAAGATCA AGGCCAAGCACTGATAGCGCTGACCCGCAGTTTTCATCTTAATCTCAATGCCATGAGCATGTTAGCCTTCGTTGTCGGCC TCTTTATCGCCTACAACGGTGTGCGCTACAGCCTAATGAAACGGCAAGAACTGTTAGTGCAGTTATTACAACAGGGAATC GAGCGCCGCGCCTTGATGACGGCGCTGATGTTAGAATTAATTTTGTTGGTTGTCATAGGCTCAAGTTTGGGCTTTATCAG TGGCTTGCAACTCAGCCACTGGCTGCAACCTATGGTCGCCATGACCTTAGAGCAAATGTATGGCGCCCACTTACTCCCCG GTATTTGGCAATGGACTTGGCTTATCGAGGCAATTGCCCTCACCTTAGGCGCTGCGTTCGCCGCTTGCTTGCCCTTGTAT TTAGATCTTACGCGCCAAGCATTGGCACAAGGGGCGAATCGTTATCAGCAAATGCAGGCACACCGCAAAACTCATAGCAT TCAATTTGCCTTAGCCTGTGGTTTACTGACCGTAGCGGCGCTGCTGTTTCCCTTCAGTCAAAGCTATAACATCAGCTTAG TGTTGCTCGGTATCGTCGCTATCGCGATCCCCTTGTTGTTGCCGCAATTATTACATTGGGGCGTCAGTGCGTTAATGCCC TTGGCACGCCCTGGATTATGGCAATATCTGCTCGCCGAAACCCGCGAGCTTATCGCACCGCTCTCCTTGGCTATGATGGC AATCTTGCTGGCGCTCAGTGCCAATGTGTCGATGAACACGCTCGTTGGAAGCTTCGAGCAAACCCTGCGGACTTGGCTAG AAACCCGCTTGCATGCCGATCTCTACATCCGTCCACCGAGCCAGCGCATCGACACGATTCAAACCCAACTGATGCACGAT CCAGGAGTCAGCGGTCTTTATCAGCAATGGCAAATTGAAGCCCAGCTTTCACTCCCTGTATCGACGGATAATTCGAGCGC ACAAACAATTCCAATAAGCCTACTTAGCCGTGATGAATATTCGATTCGCCACACCAGCGCCCTGAAAGAAAGCCTACCGA CTCTGTGGCAATCCTACTTTAATGCCCCCGTGATCTTAGTGAGCGAGCCCCTCGCCATTAAATATCAATTGCAGCTTGGC GATAGCGTGTCATTGGATGCGCTTAAGAAAACCGGTAACAGCCAAGCCATTATCGGCGGCATTTATTATGACCACGGCAA TACCCGCAACGAGGTAATTATCAGCCAGCCATTATGGCAAAAGGCACAATTACCTGTGCTGCCGATCAGCTTGGCGGCGA ATTTTTACGGTAAAGAGCGAGGCAGCAAGATCAGTGAAACGGATCTCGATGAACTGCAAATCCAACTGGCTGCCGAGTTA GGCTTATCGCAAGCGCAAATCTACAGTCAAACTAAGATTAAAACCCAAGCTATCGCCATGTTTAAGCGGACTTTTTCGAT TACCTTAGTGCTGAATAGTTTGACGCTAATTGTCGCCGCTATTGGTCTTTTTAGTGCCTGTTTAATGTTAACTCAGGCAC GGCAAGCGCCACTGGCACGGCTGTATTCATTAGGCGTGAGTCGTAATGCGCTGCGCGGTATGGTGTTTATGCAGATGCTG ATTGTGGTGCTGATCACTTGCCTGCTCGCTATGCCAACGGGTGCACTGCTAGGTTACCTGCTTATCAACAAGATCACCTT GCAAGCCTTTGGCTGGACGATAAAAATGATTTGGGATTGGCAAGCCTATGGCAAAGCAATACTGATTGCCTTAACCACCT GCACCTTAGCCGTGCTCTTGCCGCTGTATTGGCAAACCCGCAAGCCATTGGTCGCCAGTCTGCAGCAGGAGACCCTGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CGGGAAAGCCAAACCAGTATCTTAATGGTTACCCACAGTGAAGAGTGCGCCGCCTTCATGCAAAAACGTTGGCACTTATC CCAAGGTGCAGTCGCTATCT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAAAACACTCAGTATTGTATGGGCAGTGGTTGGGTTAATGCTGATCGGCGGCTGCGACCAAACGCCACAGGCTCAAAGC ACTCAATCCAAATCCATGGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 879; Mature: 879
Protein sequence:
>879_residues MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELL SQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQ MNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQELLVQLLQQGI ERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLY LDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHD PGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLG DSVSLDALKKTGNSQAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQML IVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
Sequences:
>Translated_879_residues MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELL SQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQ MNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQELLVQLLQQGI ERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLY LDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHD PGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLG DSVSLDALKKTGNSQAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQML IVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL >Mature_879_residues MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLIGVKATNDNAVRSYSDATELL SQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGKISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQ MNELPLADLLNGAPTVIMSRSLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNGVRYSLMKRQELLVQLLQQGI ERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVAMTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLY LDLTRQALAQGANRYQQMQAHRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHADLYIRPPSQRIDTIQTQLMHD PGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEYSIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLG DSVSLDALKKTGNSQAIIGGIYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLARLYSLGVSRNALRGMVFMQML IVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDWQAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL
Specific function: Unknown
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 96740; Mature: 96740
Theoretical pI: Translated: 9.07; Mature: 9.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLI CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVKATNDNAVRSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGK HEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECE ISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQMNELPLADLLNGAPTVIMSR EECCCCCEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHH SLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER HHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNG CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC VRYSLMKRQELLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHH MTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQA HHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHAD HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC LYIRPPSQRIDTIQTQLMHDPGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEY EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCC SIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGNSQAIIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEE IYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL EEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLAR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYSLGVSRNALRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDW HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEH QAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNNKPLTKATPTELKQIELKQTWLRLTWLSLKVFIAHYRHAPLQACAILLGIALAVTLLI CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVKATNDNAVRSYSDATELLSQRADVLLTPPLGQNTLDESVYFALRRAGLSQGLAVVNGK HEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECE ISGKNGQFWQLEGSDLIAALTLQKSRSHASTETQSTTSPQMNELPLADLLNGAPTVIMSR EECCCCCEEEECCCCEEEEEEEHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHH SLAAKVAPEGKLVLENNTLDVIAIDDNFGLGSAILADISLAQQLLNMQGRLSYIAMFSER HHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC ENLPQLKSQLDALGITPQNASFSQQDQGQALIALTRSFHLNLNAMSMLAFVVGLFIAYNG CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC VRYSLMKRQELLVQLLQQGIERRALMTALMLELILLVVIGSSLGFISGLQLSHWLQPMVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHH MTLEQMYGAHLLPGIWQWTWLIEAIALTLGAAFAACLPLYLDLTRQALAQGANRYQQMQA HHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HRKTHSIQFALACGLLTVAALLFPFSQSYNISLVLLGIVAIAIPLLLPQLLHWGVSALMP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LARPGLWQYLLAETRELIAPLSLAMMAILLALSANVSMNTLVGSFEQTLRTWLETRLHAD HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC LYIRPPSQRIDTIQTQLMHDPGVSGLYQQWQIEAQLSLPVSTDNSSAQTIPISLLSRDEY EEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCC SIRHTSALKESLPTLWQSYFNAPVILVSEPLAIKYQLQLGDSVSLDALKKTGNSQAIIGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEE IYYDHGNTRNEVIISQPLWQKAQLPVLPISLAANFYGKERGSKISETDLDELQIQLAAEL EEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH GLSQAQIYSQTKIKTQAIAMFKRTFSITLVLNSLTLIVAAIGLFSACLMLTQARQAPLAR CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYSLGVSRNALRGMVFMQMLIVVLITCLLAMPTGALLGYLLINKITLQAFGWTIKMIWDW HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEH QAYGKAILIALTTCTLAVLLPLYWQTRKPLVASLQQETL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA