| Definition | Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009052 |
| Length | 5,127,376 |
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The map label for this gene is 126174191
Identifier: 126174191
GI number: 126174191
Start: 2278813
End: 2282859
Strand: Direct
Name: 126174191
Synonym: Sbal_1967
Alternate gene names: NA
Gene position: 2278813-2282859 (Clockwise)
Preceding gene: 126174190
Following gene: 126174192
Centisome position: 44.44
GC content: 47.52
Gene sequence:
>4047_bases ATGGCCTTAGATATTAATGCATTTAGTCATGCGGCTAAGCTTGACGGCCGTCTTACCTTAGTCGATACCCCCGAGGGCAT ACCGACGATTATAGCGGCCAAAGAAGGCTTTAAAGAAAAATTACTGAGCATGCTTAGCCACATTCCTTTACTCAAAAATA CCCAAGCGGTCCAAGATTATGTCAATGGCTTATCACTCGATAATAAGCAAGTGTTGGGCGTGTTCTTGCAGGCATTGGCG GCAAGATTTGGTCATGATGCTGCACTGGATATAGTCGATGCCGTCGATTTGTCCGGCCTTACTCCATTAACCCTGCGCAC GATCGAACAACTCACCGAGCGGAGTGAGGCATTTGCGCCTCTCCACCTTCCTTTAGACATATGTGAGACTGATGAAGATG GGCTCAAATTGCTTGTCTTACCTTCCCCTATCGCGATTGAGTCCGAGTCGTCGGAGAAGCAAACGCCCAGCCCCTCAGAG CTTAAACCTTTAACAGATCCCATAGCCGTTGCTAAAGGCATCAGGGGGACGGCTTCCCATGCTTTAAACCAGCAGCCTAT AGCGCCACAAGTTTTTTTACATGAACAGGATCAATGTCTTAAACAGTTGTTAACCACACCAATACCACAAAAAATAACTA TGCCGACAACTCAAACTTGGTTGGCTTCTTGGGTGTATTCAGAACCTGAACCCATTAAAACCTTACAACAAGCCATTAAA AATTATAATCAAGTACTCAGTGACACTCAGCTAGCAACATGTATACAAAACTTAAATCAGAGTCGAGATCCCTTGATTAC CAGCGATGAACTGACTGCGCAGCGAGAGCTTGTCATAACTGCGCTAGCAAAAGTTAAGCAGGCTTTAACCCTAGTCGCTG AGTTGAACGCGAATTTGTCGGTGGAACAGAGCGGTGTCCTGTCGCCACTACTGGCCGAAGTCAATCTGGGATTATCGCAA TATGAGGTCTTAACGGCGGCAATGCAGACATATGAGCAAGCCTTATTAGCATCGAACCCGGTGCGCCAAGCCTTATCTGA GTTTCATGCCGCGCTTCCCTATGCACTACAAAACAAGCTAACAGCGGATACCTTAGTGAGCAGTTATCAACTGTTTTCCC CTTTGATGCAAACTGAATTAGGTCAGACAGAGAGAGTAGAATACTTAGCGGCAAGCTTAGTCTCTATGCTCAATGAAGAG AACATCAGCGCGGTCTCTGAGCAAAAAAAAATGATGCCTGAGGTCAAAAGCTTAGTATTACTCATTAAGCAGTTTGTGCT AGAACCCATGCAAGAACCCCTGGCCGTAAGTTCGTCATTTCAGACTCCATTTGAAGCGCAGCAGGCCGAAGCCGAACAGT ATTTAACTCAGATAGAACAAGCACAAACCTTACTGGCCGATTGTCTTGCACGGGCCAGTAAGCTCAGTGGAGAAGCGCTC ATCACTGTCGGTAAGCAAGTGCAACTCGAAGAACATTTAGCAGCAGTGAAACAGGCGGGAGCTCAACTCGGTACAGTATT ATATAAGGCTATCAACCCAGCCGAAGAAGAGGTCCAAGTCGATGATCTCACCGCAACATTACTGTATCTTGGCGGACAAG AGTATGTCGAGAAAGGCAGTCGTTTGCAGTTCGATGAGCCAGTTCACTTTGATGATCTCGCCCTTGAGCTAACGCTAAGA AATGAGCTCGATGGCAGTACTTTTGCACCCCAAGTGGCAAGCTTAGCGCAGCAAGTTCTACAAACTCAGCATCATCTTAA TTGGTTTGAGGGCGTAAGCTCCATCAGCTTTAGTCCAAATAATTCACAAGATATTTCACTGTTTGATGATGTTAACAACC TGCGGCTAGTTTCGCAGATTGAGCAAGATCAAACTCGTTATCACAGTTTTCTTACCGAACGTCTTTCCCTGTGTAATGAT TATCATCGAGCCGTGACTGAGCTGCTGTTAGCTGTTCCCTCTGAGACGGTGCGTAATCAGCTATCCCAAGAACTCGTGCA CATTAATGCGGACCAAGATGCGACCCGAACTTTAGTCGAGCGACTCAATCGACTGCAGAGTGCACAAGACGTGTTAGTGA TTGCGGGTAATAACGTCGCTAAATTGTCGGCGTTAACCCAGCAACTTGAGCATGTAAGGAGGGAAACAAATGCTGAACGT GCTGCGGTGAATCAGAGTTATTTCCTTAGCTATCTACCTGAATTAAAAAATAATAATGAACAAGTGCGCGCCTTAACTCA AGAGCAGCATCTCTTATCGGCCAAACTGGACAAATTGACCGAACATTTACAGCAATTATATGGCGATGGCCTAGTACAAA CCTTAGCCGAACCAGAAGCCAGTTCCCCTGAACTGCGCGCTTTTCGCACTGTGACTAGCCAGTTAGCTGAAGTCAATCGC TCCCTTGAAGAACTCGATGATGCTTACCAACATGGTTTGTTACAGCTGAAAAAGGCCACTATCGCAGCAAAAAATAATGG CGGCTTTCCAGAACAAGGGGGTATGGCGAGTAGCCATGCATGGCAAAGTTGGTTAGTGCAAAAGTTTGTCGGCAATTGGT CTTCCCAATATCGCCCAAGTTTAGAAGAACTTATTTTATCTAGGCAACTGGCTAAAAATAACATGAGCAGTGTCGCCGAG GCTTATCTCGCTTTAGCCTCAAGTGTTAAAGCATCTAAAACGAGCTTAGTAAATGTGTCTGTTTTAACCTCGCCCAAGGT CATGGTGGCAGCACTGGGCGACCTGCATAATTGGTCTATGGCACACCCGATCGAGGCCCGTGAGCTCGCAGGCAATTTAA CTCAAGCCTACAATATTATTTTGGCTAACCCTGGCACCTTTGGACAGGAACTGGTTAACACTGTCACCACAGTGTGGCAA ACCGGGACAGTACAAAACCAAGTGCACGATATTCTGCAAGGCAAGAGAGAAGAGCTACCCGATAAAACGAATTTCGCTAT GACACCGCAAATGATTGCGTTATTACACATGGCACAGTTAGCACCGTATATTGCGGGTGGGGCGAAAGGGGCTGCTAATA CAGGCATAGGTGGGCCTTTAGTCAGTGGTGTATTTGGGATGATGTTTCCCAGCGCAGGGATAGCAACACCTGTCGTCGGC TTAGTTGGCGGCATCCTGCAAACCTGGTCAGAACGTCAGCTTGCCAATAACATGCGTGAGTATCGCAGCAGTGAAGTCAT GGTGAATGCTTTAATTAAAGGTATGCAGGCAGAAGGCGGGCTGAGTGCTCGTGGCGAGGCCATTGCTGGCTATATGCTAC AGCGACAGGCTCTGCAAGATGTTGGTACTGTCGCCCGTGATTGTTTTGAAGTCGGTAAAGTAGGCGCAGTCAAGCGTGCA TTCACAGATATCGCCAATTGGTGGAAACATGCTTCAACGGGAGCCAAAGCCTTGGCTGTGGTGATGACAATTGTGGCAGC CTCTGTGGTATCGGTGGGAGCGATCGCGGCGGCAGTGTTTACCTTAGGGACTGGCGGCGTCGGTATAGTGGCAGCCGTGG TGCTTGGCTTGGGAGGATTAATGGCTGGCGCCTATTCTTCCAAGGCTGTGGTGTCGACATTGCAAGGGGCTAATTTTTTA GGCATGGCCGATACTGCCCGCGCGGCCGAGGCTGAAATGACAGAAAAAAGGATCGAGCAAGCATTTGCGCAATTGGCTCA CACTCCTGTATCTCAAACCTCAGTCATTAAGACGACTGCCCTCAGTGCATCAGGCACCCAAGAAATCCCTAAATCGATGG CGGATGTACTGGGGCTTGAACAGCATCAAGCTGTGCTAAAAGCACATTTTCTGCCGCAATTAGTCGGCCTCGATATTGAT GCGCAGCAGGCCATATTTGTTCAGGGCATGCGGCAATACGCTAATGATAAAAGCCACGAAATAGAAATAAATCAAGCAAT AGACAGAGATAAAACCGTCGAGCGAGCCATGAAATGGGTAGCTGAACTGGACATAATGCCAGCGCAATTACAGCAATGCA TGGCAGAAATCGATGCGGCCTTATTGACGGAGATCTCGTCTCGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCCGACACTTATCAAGCACTGCTGAGCCATGTCGAAACCGAAATGACAGGGCAAACCTCATCAATAAATACCATAAACCT CAGTGCGGGAGGACAATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCACAGAGTTTGAATCGCTGTTGATTTAGTACTTGCGGGTATTCAGGTGTTCACCTGATACCCGCTTTTTATTGTCTAG GAGAAGATAAGACCGAGAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1348; Mature: 1347
Protein sequence:
>1348_residues MALDINAFSHAAKLDGRLTLVDTPEGIPTIIAAKEGFKEKLLSMLSHIPLLKNTQAVQDYVNGLSLDNKQVLGVFLQALA ARFGHDAALDIVDAVDLSGLTPLTLRTIEQLTERSEAFAPLHLPLDICETDEDGLKLLVLPSPIAIESESSEKQTPSPSE LKPLTDPIAVAKGIRGTASHALNQQPIAPQVFLHEQDQCLKQLLTTPIPQKITMPTTQTWLASWVYSEPEPIKTLQQAIK NYNQVLSDTQLATCIQNLNQSRDPLITSDELTAQRELVITALAKVKQALTLVAELNANLSVEQSGVLSPLLAEVNLGLSQ YEVLTAAMQTYEQALLASNPVRQALSEFHAALPYALQNKLTADTLVSSYQLFSPLMQTELGQTERVEYLAASLVSMLNEE NISAVSEQKKMMPEVKSLVLLIKQFVLEPMQEPLAVSSSFQTPFEAQQAEAEQYLTQIEQAQTLLADCLARASKLSGEAL ITVGKQVQLEEHLAAVKQAGAQLGTVLYKAINPAEEEVQVDDLTATLLYLGGQEYVEKGSRLQFDEPVHFDDLALELTLR NELDGSTFAPQVASLAQQVLQTQHHLNWFEGVSSISFSPNNSQDISLFDDVNNLRLVSQIEQDQTRYHSFLTERLSLCND YHRAVTELLLAVPSETVRNQLSQELVHINADQDATRTLVERLNRLQSAQDVLVIAGNNVAKLSALTQQLEHVRRETNAER AAVNQSYFLSYLPELKNNNEQVRALTQEQHLLSAKLDKLTEHLQQLYGDGLVQTLAEPEASSPELRAFRTVTSQLAEVNR SLEELDDAYQHGLLQLKKATIAAKNNGGFPEQGGMASSHAWQSWLVQKFVGNWSSQYRPSLEELILSRQLAKNNMSSVAE AYLALASSVKASKTSLVNVSVLTSPKVMVAALGDLHNWSMAHPIEARELAGNLTQAYNIILANPGTFGQELVNTVTTVWQ TGTVQNQVHDILQGKREELPDKTNFAMTPQMIALLHMAQLAPYIAGGAKGAANTGIGGPLVSGVFGMMFPSAGIATPVVG LVGGILQTWSERQLANNMREYRSSEVMVNALIKGMQAEGGLSARGEAIAGYMLQRQALQDVGTVARDCFEVGKVGAVKRA FTDIANWWKHASTGAKALAVVMTIVAASVVSVGAIAAAVFTLGTGGVGIVAAVVLGLGGLMAGAYSSKAVVSTLQGANFL GMADTARAAEAEMTEKRIEQAFAQLAHTPVSQTSVIKTTALSASGTQEIPKSMADVLGLEQHQAVLKAHFLPQLVGLDID AQQAIFVQGMRQYANDKSHEIEINQAIDRDKTVERAMKWVAELDIMPAQLQQCMAEIDAALLTEISSR
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 146444; Mature: 146312
Theoretical pI: Translated: 4.82; Mature: 4.82
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MALDINAFSHAAKLDGRLTLVDTPEGIPTIIAAKEGFKEKLLSMLSHIPLLKNTQAVQDY CEEECCHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH VNGLSLDNKQVLGVFLQALAARFGHDAALDIVDAVDLSGLTPLTLRTIEQLTERSEAFAP HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LHLPLDICETDEDGLKLLVLPSPIAIESESSEKQTPSPSELKPLTDPIAVAKGIRGTASH EECCHHHCCCCCCCCEEEEECCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHH ALNQQPIAPQVFLHEQDQCLKQLLTTPIPQKITMPTTQTWLASWVYSEPEPIKTLQQAIK HCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH NYNQVLSDTQLATCIQNLNQSRDPLITSDELTAQRELVITALAKVKQALTLVAELNANLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC VEQSGVLSPLLAEVNLGLSQYEVLTAAMQTYEQALLASNPVRQALSEFHAALPYALQNKL CCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH TADTLVSSYQLFSPLMQTELGQTERVEYLAASLVSMLNEENISAVSEQKKMMPEVKSLVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIKQFVLEPMQEPLAVSSSFQTPFEAQQAEAEQYLTQIEQAQTLLADCLARASKLSGEAL 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PDB accession: NA
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Structure class: Alpha
Cofactors: NA
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Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA