Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 126173612

Identifier: 126173612

GI number: 126173612

Start: 1576445

End: 1578607

Strand: Reverse

Name: 126173612

Synonym: Sbal_1374

Alternate gene names: NA

Gene position: 1578607-1576445 (Counterclockwise)

Preceding gene: 126173614

Following gene: 126173611

Centisome position: 30.79

GC content: 45.86

Gene sequence:

>2163_bases
ATGCAAAAACTCACGGTTATTTTATTTACTTTGTTGCTGTCACTACCTTTTAGCGTTCAAAGCCGAGATCTCGAAGCTGA
TGAGGTGGAGTTAAGAGAATCGCCACAGCAAATGTATGATGTACTCAACAAATCCATTTCCTTCCCCCTTGCGTTCCAAA
ACCGTGACCAATTTGAGCGTGCAGCCCAAGAACAAGGCTACAGCCCAATCGAATTTGAACAGATTTTGTATCTGCTGACT
CGGCTGAATATGGAGCCGAACGTGAAAACCAAGGTCGGTTTTCAAGACGCAAAAAGCTTGATTGAACTCTTATCCACTGC
GGCGCAATCGCCCTACGAACTGGCTATGGTCGCCATGTTGAATGGTCGTTACCTTGGCCGTACCGAACAGAAATATCAAG
AAGCGATTGGCCTATATAACGAAGCGCTCACTCGCATCAACGACAGTTATGACATCGAAGCATTGATTCTTAAGCACAAT
ATTCATGAGCACTTAGGCGGCTTACATTTATTGATCCGCCAAGAAGTACCGGCGCTGATGCACTTCCATACATACCGCGA
CATTGCCTATAAGCTCAGAAACGATTACTTAATCGCGGCGGCTGAAGCAAGACTGGGGTTCTATTACAATTTTAATCAGC
AGCTCACCAAATCATTGCAGCATTACAGTGAAGCAATTCGGATCTCCAATCGCTCTAATTACCCGGCGATGAAAACCAAT
CTGCAATTGCAACTTTCTAAGGTATATCGCGATTTAAAGCAGTGGGATGAAGCCCTTAAAAATGCCCACGAAGCCGCTGC
TGGTTTTAAAAAAATGGGCAATGACACCTATCTTTCAAGCTGTATGACAGTAATCGCTATGGTGTATGGCGAACAAGGGG
ATTGGAATAAAGCGATTGATTACTACCTTAATGCCCAGCAATTAGATGCCAAACGCGGTAACTATATTGCCCAAGGCCTT
AATTTCCACAATCTTGGGCAAGCCTACTCAAATATTAATGACAATGTTAACGCCCTAAAATATTTACTGATGGCCAATCA
AATATTCAAAGAAAAACAAAGCCATCACTATCAGGTTTATAACGAACTCTTAATTGGCGAAATCGCACAAACCAACCAAG
ATTGGCCGCTAATGATGACCCATGCCGACATCGCATTGGCACTGGCTATCGACTTAAAACTCGTCAATGAACAAAAAGCT
GCGCTCACACTGATTGCCTCGGCGTCGCAAAAATTAGGGGAATTATCCAAAACCATCGATGCCCAAACTCGTATCATAGA
GCTAGGCAACACCCTTGCAGAGAAAGAGAAAGACTCCCCAGTGTCAACCTCAGCCCTTGCGGAACAACAACTCAAACTTG
AGCTCAACATGGTTCAGGGAAAACTTGCCGAGACAGTGAAGGAAAGCAACAGCACCCACACGCTACTGCTCATCAGTTGC
CTCATTGCCGGACTCTTGCTGCTGGTGATTGCGTATATGTTGCATCATCGCCGCAAAATCTCGGCAATAAACGCCGCATT
AACTCAATTGAGCCTACAGGAACCCTTCACCCATAACTTAGGCTATGCGGCGCTATTAGCGCACTTGGGCCATAATCAAC
ATCAAGCGTCTACAACAGCTTTAGGGATTATCGCCTTCCCCGCCCAGCTCACGACCGACCTCGACTATGGCCAATATTTT
AGTGATGCAGTAACGGCGCAACTGGCCACTCATCTTACCGATGCGCTCGCAGCACCTGTGTATGTGATACGCCAAGGGGT
ATTTGCAGTGCGTTTCACCCAAGCCGTTGAGCCAACGCACGTGCTCAGCCAGATACGCCAGAAACTCGACCAACAGCACA
TCGTCCATCATTTCCGTCTTGGTTTTGCCAACTTGCCACTGTTAGCGAAATCAGAAATCAAAATGGCCGCGAAATTAAAG
TTCGAAACCGTGCAGATGGCGCTCGCCTGTGCCCGCAGTTTAGAGGGCAATAACGATTATTTTGTCGCCCTCAGAGCACT
CGACTTTGTCCCTCTAAGCTTATTTGCCAATCCGTTATTTTTACACCTTGAAAAAGGCATTGAGCGCGGGTTAATCAGAT
TAGATACCAACGGAAATAAAGAGGATGTTCGCTGGCCTTGCTGGGAAAACAACCAAGATAGGCAATTACTGGAAAATATT
TGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTTCCAAGTATAACAAGTCGATGTAGCATCCTCATTAGGCGCTAACAAAAGCTAACAAAATAAGTTCCTTGACTTAAGG
AATGAGGAATCACAGTTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCAATATCAGCAATTAATCACAGAGTCATACGTAAATCGCATTTGCACTCTACGCCCAGTGTTATAACATTAGTATCATA
TGAGTTAACAGCTAATCTGG

Product: TPR repeat-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: TPR Domain-Containing Protein; Tetratricopeptide Domain-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720

Protein sequence:

>720_residues
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT
RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN
IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYSEAIRISNRSNYPAMKTN
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL
NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA
ALTLIASASQKLGELSKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKISAINAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLGHNQHQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF
SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK
FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI

Sequences:

>Translated_720_residues
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT
RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN
IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYSEAIRISNRSNYPAMKTN
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL
NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA
ALTLIASASQKLGELSKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKISAINAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLGHNQHQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF
SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK
FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
>Mature_720_residues
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFERAAQEQGYSPIEFEQILYLLT
RLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAMLNGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHN
IHEHLGGLHLLIRQEVPALMHFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYSEAIRISNRSNYPAMKTN
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAIDYYLNAQQLDAKRGNYIAQGL
NFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVYNELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKA
ALTLIASASQKLGELSKTIDAQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKISAINAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLGHNQHQASTTALGIIAFPAQLTTDLDYGQYF
SDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTHVLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLK
FETVQMALACARSLEGNNDYFVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81492; Mature: 81492

Theoretical pI: Translated: 6.75; Mature: 6.75

Prosite motif: PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFER
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH
AAQEQGYSPIEFEQILYLLTRLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAML
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
NGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHNIHEHLGGLHLLIRQEVPALM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
HFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYSEAIRISNRSNYPAMKTN
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YYLNAQQLDAKRGNYIAQGLNFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVY
HHCCHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKAALTLIASASQKLGELSKTID
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKISAINAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLGHNQHQASTTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHE
LGIIAFPAQLTTDLDYGQYFSDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTH
EEHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH
VLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLKFETVQMALACARSLEGNNDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
FVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
EEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MQKLTVILFTLLLSLPFSVQSRDLEADEVELRESPQQMYDVLNKSISFPLAFQNRDQFER
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCHHHHHH
AAQEQGYSPIEFEQILYLLTRLNMEPNVKTKVGFQDAKSLIELLSTAAQSPYELAMVAML
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
NGRYLGRTEQKYQEAIGLYNEALTRINDSYDIEALILKHNIHEHLGGLHLLIRQEVPALM
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHH
HFHTYRDIAYKLRNDYLIAAAEARLGFYYNFNQQLTKSLQHYSEAIRISNRSNYPAMKTN
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
LQLQLSKVYRDLKQWDEALKNAHEAAAGFKKMGNDTYLSSCMTVIAMVYGEQGDWNKAID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
YYLNAQQLDAKRGNYIAQGLNFHNLGQAYSNINDNVNALKYLLMANQIFKEKQSHHYQVY
HHCCHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NELLIGEIAQTNQDWPLMMTHADIALALAIDLKLVNEQKAALTLIASASQKLGELSKTID
HHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQTRIIELGNTLAEKEKDSPVSTSALAEQQLKLELNMVQGKLAETVKESNSTHTLLLISC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LIAGLLLLVIAYMLHHRRKISAINAALTQLSLQEPFTHNLGYAALLAHLGHNQHQASTTA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHE
LGIIAFPAQLTTDLDYGQYFSDAVTAQLATHLTDALAAPVYVIRQGVFAVRFTQAVEPTH
EEHEEECHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH
VLSQIRQKLDQQHIVHHFRLGFANLPLLAKSEIKMAAKLKFETVQMALACARSLEGNNDY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
FVALRALDFVPLSLFANPLFLHLEKGIERGLIRLDTNGNKEDVRWPCWENNQDRQLLENI
EEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA