| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
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The map label for this gene is 125624433
Identifier: 125624433
GI number: 125624433
Start: 1610468
End: 1612048
Strand: Reverse
Name: 125624433
Synonym: llmg_1634
Alternate gene names: NA
Gene position: 1612048-1610468 (Counterclockwise)
Preceding gene: 125624434
Following gene: 125624432
Centisome position: 63.73
GC content: 32.19
Gene sequence:
>1581_bases ATGAATCTTCAACAAATTAAAAGTCTTTTTAGTGTCAACCTCCTTTATGCCAATTCTCAAGCTACTCAACGTCAAAGAGA AAAAGGTAAAACAAAAAATTTAACCAAATCACTTTTGATTCAATATGGGCTTGTCTCGCTCATCATGTTGCCATTTTTCG GACTGATGATGTTAGCAATTGACTTTCCAAAATATCCGGGTTTTTTTACTTTTTATTGTGCTCTGTTTGCCCTGATGACT TTTTCTCAAGCCTTGTCAGCAATTTTAAATATTTTTTATGAAAGCAAAGACTTTCGAGATTATCTGCCTCTCCCTTTTGA AAATGTTAATATTTTTGCTGCTAAATTTTTAGTTGTAATTTTTGTTATATTACCTTATTTAATGCCTCTTTTGGTGCTTT TTGGAATAACAGGTTTTAGGGCAAACGGAGTGATTGGGCTCTTTCTCGGATTAGTTGGATTTTTTCTGTTTGCTCTATTA TTCTTACTGCTTAGTACATGGTTGATTACTTTTTTGGTTCAATCTAAAATATTTCAACGCTATAAAAAAGTTTCCCAGAC CATACTATTATTGATTTCAATGGTTGGAATTTTTGCTGGGATTATGTATCTAAATAATGCTCAAACGACGATTAGTGCGA CAGGTAAGTTGTTGGATAGAGGAACTTTTCTGCCATTTTTACCTTTTTGGAAATGGTTAGTAAATCCGTTCTCTTTCTAT AGTTTATTTAGTTTTCTCTTTTTTATAATCTTATTGATTGCTCTTTACTATGTTTTTACACTTCTAGTGGTTCCAGAAAT GTTTAAAATTCTCTTGGAAGAGTCAAAAGAAACGAGAATTGTTCAAAAAAGAAAAATAAGAAGAACGAGAAATTTTACCT CACAATTAAGAATTTATAATCTAGGACTAATTAAAAATCCTACCTTATGGATTCAAATGCTGACAGGATCCTTTATTTTT CCGCTTGCTATGCTGCCCGGTCTTTTATCTAGTGGTCTAAATTTTTCAAAATTGGATTTGAAATTTTTTGCTATTTTTCC TATCATCGGAATTAGTTTAGCTTTTCTGACCATTAACAATAGCTCTCTTCCTTCAATGATTATCTCACTTGATCGGGAAA ATTTTAATTATTTTAAAAGCTTACCCATGAAGTTGAATTTCTATCTCAGAGTGAAATTTCATTTTGCCTTTTTTATTCAA CTAGTTCTTGATTTAATCTTATCTTTAGTGATTGGTATTTTACTGAAAGTCCCTGTTACCTTGCTCTTTGGGCTGTTAAT TGGGAATATTATTGGGGTATATCTGATTTCACTTCATTATTTTGTCAGAGATTGGCATCTCTTAAATTTAAATTGGACTG CGTTGACTCAACTTTTTACAAGAGGTTCTGGGGGATTTCGGGTTTTTATCATTTTCTTTGCTACGCTTTTGGGAGCAGGA GCACTCATTGGAGCAATTATTGCCCTGATTATCTTTATTCCATATCCTTTAGTTGTTAACCTTGCCCTAGTCCTCCTTTT AGGATTTTCGGTAGGAGTGATACTTCATTTTTATCAGAAAAATTTTTGGAATAATCTCTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTGATGCTTTATTAGATTCAGCAGAAGATCAATCTTTGGAATCGGTTTATCTCAAAATGGTAGGTCGTCAGCAAGAAGA GCTAAATAGAGGAGACGATG
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAAAATTAACAAAAAAATTAAGAAAGGAAATAAGTGTGTTTTCTTGTTCAGATTAATAAATAAAGTTATAATATAATTA GGGTTTACGAATGTAAACGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease Protein; Ypothetical Protein SMU.
Number of amino acids: Translated: 526; Mature: 526
Protein sequence:
>526_residues MNLQQIKSLFSVNLLYANSQATQRQREKGKTKNLTKSLLIQYGLVSLIMLPFFGLMMLAIDFPKYPGFFTFYCALFALMT FSQALSAILNIFYESKDFRDYLPLPFENVNIFAAKFLVVIFVILPYLMPLLVLFGITGFRANGVIGLFLGLVGFFLFALL FLLLSTWLITFLVQSKIFQRYKKVSQTILLLISMVGIFAGIMYLNNAQTTISATGKLLDRGTFLPFLPFWKWLVNPFSFY SLFSFLFFIILLIALYYVFTLLVVPEMFKILLEESKETRIVQKRKIRRTRNFTSQLRIYNLGLIKNPTLWIQMLTGSFIF PLAMLPGLLSSGLNFSKLDLKFFAIFPIIGISLAFLTINNSSLPSMIISLDRENFNYFKSLPMKLNFYLRVKFHFAFFIQ LVLDLILSLVIGILLKVPVTLLFGLLIGNIIGVYLISLHYFVRDWHLLNLNWTALTQLFTRGSGGFRVFIIFFATLLGAG ALIGAIIALIIFIPYPLVVNLALVLLLGFSVGVILHFYQKNFWNNL
Sequences:
>Translated_526_residues MNLQQIKSLFSVNLLYANSQATQRQREKGKTKNLTKSLLIQYGLVSLIMLPFFGLMMLAIDFPKYPGFFTFYCALFALMT FSQALSAILNIFYESKDFRDYLPLPFENVNIFAAKFLVVIFVILPYLMPLLVLFGITGFRANGVIGLFLGLVGFFLFALL FLLLSTWLITFLVQSKIFQRYKKVSQTILLLISMVGIFAGIMYLNNAQTTISATGKLLDRGTFLPFLPFWKWLVNPFSFY SLFSFLFFIILLIALYYVFTLLVVPEMFKILLEESKETRIVQKRKIRRTRNFTSQLRIYNLGLIKNPTLWIQMLTGSFIF PLAMLPGLLSSGLNFSKLDLKFFAIFPIIGISLAFLTINNSSLPSMIISLDRENFNYFKSLPMKLNFYLRVKFHFAFFIQ LVLDLILSLVIGILLKVPVTLLFGLLIGNIIGVYLISLHYFVRDWHLLNLNWTALTQLFTRGSGGFRVFIIFFATLLGAG ALIGAIIALIIFIPYPLVVNLALVLLLGFSVGVILHFYQKNFWNNL >Mature_526_residues MNLQQIKSLFSVNLLYANSQATQRQREKGKTKNLTKSLLIQYGLVSLIMLPFFGLMMLAIDFPKYPGFFTFYCALFALMT FSQALSAILNIFYESKDFRDYLPLPFENVNIFAAKFLVVIFVILPYLMPLLVLFGITGFRANGVIGLFLGLVGFFLFALL FLLLSTWLITFLVQSKIFQRYKKVSQTILLLISMVGIFAGIMYLNNAQTTISATGKLLDRGTFLPFLPFWKWLVNPFSFY SLFSFLFFIILLIALYYVFTLLVVPEMFKILLEESKETRIVQKRKIRRTRNFTSQLRIYNLGLIKNPTLWIQMLTGSFIF PLAMLPGLLSSGLNFSKLDLKFFAIFPIIGISLAFLTINNSSLPSMIISLDRENFNYFKSLPMKLNFYLRVKFHFAFFIQ LVLDLILSLVIGILLKVPVTLLFGLLIGNIIGVYLISLHYFVRDWHLLNLNWTALTQLFTRGSGGFRVFIIFFATLLGAG ALIGAIIALIIFIPYPLVVNLALVLLLGFSVGVILHFYQKNFWNNL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 60251; Mature: 60251
Theoretical pI: Translated: 10.59; Mature: 10.59
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNLQQIKSLFSVNLLYANSQATQRQREKGKTKNLTKSLLIQYGLVSLIMLPFFGLMMLAI CCHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DFPKYPGFFTFYCALFALMTFSQALSAILNIFYESKDFRDYLPLPFENVNIFAAKFLVVI CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH FVILPYLMPLLVLFGITGFRANGVIGLFLGLVGFFLFALLFLLLSTWLITFLVQSKIFQR HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKKVSQTILLLISMVGIFAGIMYLNNAQTTISATGKLLDRGTFLPFLPFWKWLVNPFSFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHH SLFSFLFFIILLIALYYVFTLLVVPEMFKILLEESKETRIVQKRKIRRTRNFTSQLRIYN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE LGLIKNPTLWIQMLTGSFIFPLAMLPGLLSSGLNFSKLDLKFFAIFPIIGISLAFLTINN ECEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC SSLPSMIISLDRENFNYFKSLPMKLNFYLRVKFHFAFFIQLVLDLILSLVIGILLKVPVT CCHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLFGLLIGNIIGVYLISLHYFVRDWHLLNLNWTALTQLFTRGSGGFRVFIIFFATLLGAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ALIGAIIALIIFIPYPLVVNLALVLLLGFSVGVILHFYQKNFWNNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MNLQQIKSLFSVNLLYANSQATQRQREKGKTKNLTKSLLIQYGLVSLIMLPFFGLMMLAI CCHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DFPKYPGFFTFYCALFALMTFSQALSAILNIFYESKDFRDYLPLPFENVNIFAAKFLVVI CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH FVILPYLMPLLVLFGITGFRANGVIGLFLGLVGFFLFALLFLLLSTWLITFLVQSKIFQR HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YKKVSQTILLLISMVGIFAGIMYLNNAQTTISATGKLLDRGTFLPFLPFWKWLVNPFSFY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHH SLFSFLFFIILLIALYYVFTLLVVPEMFKILLEESKETRIVQKRKIRRTRNFTSQLRIYN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE LGLIKNPTLWIQMLTGSFIFPLAMLPGLLSSGLNFSKLDLKFFAIFPIIGISLAFLTINN ECEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECC SSLPSMIISLDRENFNYFKSLPMKLNFYLRVKFHFAFFIQLVLDLILSLVIGILLKVPVT CCHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLFGLLIGNIIGVYLISLHYFVRDWHLLNLNWTALTQLFTRGSGGFRVFIIFFATLLGAG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ALIGAIIALIIFIPYPLVVNLALVLLLGFSVGVILHFYQKNFWNNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA