| Definition | Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009004 |
| Length | 2,529,478 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 125624326
Identifier: 125624326
GI number: 125624326
Start: 1495463
End: 1497100
Strand: Reverse
Name: 125624326
Synonym: llmg_1522
Alternate gene names: NA
Gene position: 1497100-1495463 (Counterclockwise)
Preceding gene: 125624327
Following gene: 125624325
Centisome position: 59.19
GC content: 34.0
Gene sequence:
>1638_bases ATGAATAATATAGTATTTATTAAGTATAAAAAAAGATTCTGTCTTACTTTAATGATAGGGCTCTTTATTTTAATTAATGG GATTGCTGTCTCAATTACGAAGTCGTGGAATAGTGATCATATTATTGCACTTGTGTTAGGAAATCTTCTTTTAGTAGCAG CTTATTTTTATTTTATTGGGATTTTTAGATTATCAAAAAAACTTTTTGCTCCAAAAAATGAAATGGAAATCACTGACGAG TCTGTCAGTAAAATAGAAAGTAAATCTTTTTTGCTGACAGATTTGTCAGTAAAAAAATATTATCAAATAAGTTTTTGGGC AGTAGCGCTCGTGACCTTTATTTTGCCCTTTCTTTTTATGATTCATGTTCCTGATAGCAAGCATGCATGGGATTACTTTG TCATTTTTAATTCTACAACAGAGTTGCATGGTCAGTCTTTTGGGCTTCTCCCAGAAACAGCCTCACGTTTAGGTTACTTC CTGAGATATCCTAATAATCAATTTTTAGGAATCTTATTTAATCAGATTTTTTCTCCTTTTGCTGAGGATGTTCAGTTGAA AATGTGGGTTGTTACAGCCGTTTCTGCTTTGCTGACAAGTCTTGGTGTTCTAGCTGGAACCTTGAGTGTTAAAGCTTTAA GTGGGAAAAGACATGCCATTTTATATAATGTTTGTGCACTTGGTTTCTTACCTTTTTATGTATATGGCGCGCAACTTTAT AGTGATACGATTACTTTGCCTTTTGTATCTTTCGGATTATTATTTTTCATTTATGCAATTAAATCAGACAAGTTAAATCG ACAAATTCTCTGGTATTTCTTGGCTACTTTACTGACAGTTTTAGGTTATGAATTTAAACCGACAGTCTTAATTGTACTTA TTGCTGCATTGGTTTTCTTAGGCCTTAATAAAAAGTGGAAGCAACTTTTACTTTTAATCCCTATGTTTGCACTCTTATTT GTTGGGGGACATTTCATGGTCAAAGCAACAATTGCGACAGAGCCTGCTTTTTCACAGGAAGCAAATGAACGTCATAATCT CCCGATGATGCATTGGATTGCCATGTCTTGGGCGCCTAGCAATAAAACAGGGGGATTTAATAAAAAGATTCGTCAGTATT CTGAATCTTTCCCCACTTATGAGGCAAAAAAAGAGGCAGATAAACAACTTTTCATTGATAATATTAAGAAAATGGGACCT GCTGGTATTGTTAGACAAATAGGACGGAAATTGTCCTATACTTGGCTATATGGCGACTTGAATAGTGCTTTCTATACTAA TCATCATGAAAATAAATTCATTAATTGTTACTTTGATTATCTCTCAGGGACTTCATTTTCTTTAGATGGACCGGGGAATA TTACAGGTTGGTTTATGCTTAAAGCAGTTCAAACGCTGTATTGGATTGGCTTAGTTGTATTGCTTTGGCGACAAATTTGG CGGATTTTAAGTCGTAAGAAGAACTGGTCAAACCCTTGGTTTGTTCCAGCTTTAGCCTTTGTTGGATTGAGTTTTTTCCT TATTCTTTGGGAAACAAATTCACGTTATCTTTATCAATTTGCACCAGTAATGATTGCCTTAGCAAGTCTAGGTTTAATTG ATAATCAATTTAAAAAGAAAAAAAGAGTTAAGGAGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATTGTACTTTTTAGATTCAAAGTTAAAAATGAGAATTTATCATTTGAAAATTAAGGTTATTATAAGAAACAAAGGCCA AGCTATGGTAAAATAGTAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATGACTAAGATTCTTTATATGGTCGTGCCATGTTACAACGAAGAACTGGTACTTGATGAAACTTCCGAACGTCTCAAG GCCAAATACGAACAATTAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 545; Mature: 545
Protein sequence:
>545_residues MNNIVFIKYKKRFCLTLMIGLFILINGIAVSITKSWNSDHIIALVLGNLLLVAAYFYFIGIFRLSKKLFAPKNEMEITDE SVSKIESKSFLLTDLSVKKYYQISFWAVALVTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYF LRYPNNQFLGILFNQIFSPFAEDVQLKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHAILYNVCALGFLPFYVYGAQLY SDTITLPFVSFGLLFFIYAIKSDKLNRQILWYFLATLLTVLGYEFKPTVLIVLIAALVFLGLNKKWKQLLLLIPMFALLF VGGHFMVKATIATEPAFSQEANERHNLPMMHWIAMSWAPSNKTGGFNKKIRQYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNIKKMGP AGIVRQIGRKLSYTWLYGDLNSAFYTNHHENKFINCYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIW RILSRKKNWSNPWFVPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDNQFKKKKRVKE
Sequences:
>Translated_545_residues MNNIVFIKYKKRFCLTLMIGLFILINGIAVSITKSWNSDHIIALVLGNLLLVAAYFYFIGIFRLSKKLFAPKNEMEITDE SVSKIESKSFLLTDLSVKKYYQISFWAVALVTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYF LRYPNNQFLGILFNQIFSPFAEDVQLKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHAILYNVCALGFLPFYVYGAQLY SDTITLPFVSFGLLFFIYAIKSDKLNRQILWYFLATLLTVLGYEFKPTVLIVLIAALVFLGLNKKWKQLLLLIPMFALLF VGGHFMVKATIATEPAFSQEANERHNLPMMHWIAMSWAPSNKTGGFNKKIRQYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNIKKMGP AGIVRQIGRKLSYTWLYGDLNSAFYTNHHENKFINCYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIW RILSRKKNWSNPWFVPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDNQFKKKKRVKE >Mature_545_residues MNNIVFIKYKKRFCLTLMIGLFILINGIAVSITKSWNSDHIIALVLGNLLLVAAYFYFIGIFRLSKKLFAPKNEMEITDE SVSKIESKSFLLTDLSVKKYYQISFWAVALVTFILPFLFMIHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYF LRYPNNQFLGILFNQIFSPFAEDVQLKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHAILYNVCALGFLPFYVYGAQLY SDTITLPFVSFGLLFFIYAIKSDKLNRQILWYFLATLLTVLGYEFKPTVLIVLIAALVFLGLNKKWKQLLLLIPMFALLF VGGHFMVKATIATEPAFSQEANERHNLPMMHWIAMSWAPSNKTGGFNKKIRQYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNIKKMGP AGIVRQIGRKLSYTWLYGDLNSAFYTNHHENKFINCYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIW RILSRKKNWSNPWFVPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDNQFKKKKRVKE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62578; Mature: 62578
Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNIVFIKYKKRFCLTLMIGLFILINGIAVSITKSWNSDHIIALVLGNLLLVAAYFYFIG CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFRLSKKLFAPKNEMEITDESVSKIESKSFLLTDLSVKKYYQISFWAVALVTFILPFLFM HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYPNNQFLGILFNQIFSPF EECCCCCCCEEEEEEEECCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH AEDVQLKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHAILYNVCALGFLPFYVYGAQLY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SDTITLPFVSFGLLFFIYAIKSDKLNRQILWYFLATLLTVLGYEFKPTVLIVLIAALVFL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH GLNKKWKQLLLLIPMFALLFVGGHFMVKATIATEPAFSQEANERHNLPMMHWIAMSWAPS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHCCCCCHHHHEEEEECCC NKTGGFNKKIRQYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNIKKMGPAGIVRQIGRKLSYTWLYGDL CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCEEEEEEECC NSAFYTNHHENKFINCYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIW CCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RILSRKKNWSNPWFVPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDNQFKKK HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRVKE HCCCC >Mature Secondary Structure MNNIVFIKYKKRFCLTLMIGLFILINGIAVSITKSWNSDHIIALVLGNLLLVAAYFYFIG CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFRLSKKLFAPKNEMEITDESVSKIESKSFLLTDLSVKKYYQISFWAVALVTFILPFLFM HHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IHVPDSKHAWDYFVIFNSTTELHGQSFGLLPETASRLGYFLRYPNNQFLGILFNQIFSPF EECCCCCCCEEEEEEEECCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH AEDVQLKMWVVTAVSALLTSLGVLAGTLSVKALSGKRHAILYNVCALGFLPFYVYGAQLY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SDTITLPFVSFGLLFFIYAIKSDKLNRQILWYFLATLLTVLGYEFKPTVLIVLIAALVFL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH GLNKKWKQLLLLIPMFALLFVGGHFMVKATIATEPAFSQEANERHNLPMMHWIAMSWAPS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHCCCCCHHHHEEEEECCC NKTGGFNKKIRQYSESFPTYEAKKEADKQLFIDNIKKMGPAGIVRQIGRKLSYTWLYGDL CCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCEEEEEEECC NSAFYTNHHENKFINCYFDYLSGTSFSLDGPGNITGWFMLKAVQTLYWIGLVVLLWRQIW CCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RILSRKKNWSNPWFVPALAFVGLSFFLILWETNSRYLYQFAPVMIALASLGLIDNQFKKK HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRVKE HCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA