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The map label for this gene is glyS [H]

Identifier: 124025502

GI number: 124025502

Start: 728949

End: 731111

Strand: Direct

Name: glyS [H]

Synonym: NATL1_07951

Alternate gene names: 124025502

Gene position: 728949-731111 (Clockwise)

Preceding gene: 124025500

Following gene: 124025504

Centisome position: 39.09

GC content: 34.58

Gene sequence:

>2163_bases
TTGTCTACCTACCTTTTGGAAATCGGTACTGAGGAACTACCCGCTGATTTGGCTGAATCTGTTATTTCCCAGCTTGAGTT
AAGTGTAAATAATGACTTGAATTCTGCTCAAATAAAATTTAGTGAAATAAGTGTAACTACTACCCCCAGAAGAATTGCAT
TGACGATTGAAGGGATTGCTCCATTTTCTGAAGACAATATTGCAGAACGAAAAGGTCCTCCTGTTTCTCAAGCTTTTCAT
GATGGACAACCTACAAAAGCAGCAATTGGTTTTGCTAAAAGATATGAACTATCTCCTGAAAAATTAGAGATTCGAGAAAC
CTCTAAGGGTTCATTCGTTTTTGCTAAATCAATTGAGAAAGGCAAGCCAGTTACAACTTTATTGTCTGACTATTTACCTA
GATGGATCAGCAAGATTCAAGGAAGGAGGTTTATGAGATGGGGCAAAGGTGATTTTCGCTTTTCGAGACCTATTCGTTGG
ATTGTTTCTTTGCTTGATTCAGAAGTTCTACCTTTTAAAATTTCAGGGTGTGATCCAGAAATACAAATAGGTAATATCTC
AAGACCTCATAGGTTGTATGGAGCAAAATTAAAAATAAATGATGCGAAAACTTATTTTGATCAATTGCAAGATGTGGGAG
TCACAGTTGATAGGGGTCGTCGCCTTTCCTGTATCAATGATTTAGTTCTTAATCACGAAATAGATAAAAAAGTTAAGCCA
GATCTGACTGATCCCCTTTTAAATGAACTGACAGATTTAATTGAGTCTCCTTTACTTGTGACTGGGTGTTTTGATGAAAC
TTTTCTTGAGTTACCCCCTGAAGTTTTGTCCACTGTGATGAAGGTTCATCAAAGGTACATCCCTTTATACAAAGTGAATG
TTGAGTTTGATCCATTATCACTTGACTCTAAAAATATTTTATTACCTACTTTTTTGTGTATTAGTAACGGATTACCTACA
GCAAAAGAGAAAATTATTAAAGGAAATGAAAAAGTCTTAAAGGCAAGGTTTGCTGATGCCTCATTTTTTATAAAGTCTGA
TTTATTAATCAGTAGCTCTTCACGTATTAATAAGTTGAAAGATGTAACTTTTGCTGAAGGATTAGGTTCTTTATATGAGC
GTGTAAATCGAATCGAATGGCTTGTTAAATTATTAACGCTAAAACTTGAATTTGATCAAGAGGATATTCAAAAATCTGTA
AAAGTTGCACATTTCTCTAAACATGATTTAGTTAGTAACATGGTTGATGAATTTCCAGAGTTGCAAGGAATAATTGGATC
TAAATACTTACTTCACGAGGGAGAATCAAGAGATGTATGCCTTGGTGTTTTGGAACATTATAAACCTAAAGGAACTTCTG
ACTCGCTTCCTTCAAATAACCTTGGTAATGCGGTTTCATTAGGCGAACGTTTTGAATTGCTTATCAGCATTTATGCCAAG
GGCGAAAGGCCTTCTGGCTCATCTGATCCATATGCTTTGAGAAGGGCTGCTAATGGAATATTATTGATTTTGTGGAACAA
AGATTGGCAGTTAAATATTAACAAAATACTAGATGATTCACTGATTTATTGGCAGCAACTTTTTCCTTCTCTCTCTCTTG
ATATCAGTAATCTTTTGTCCGAGTTAAAGGAATTCTTTCGTCAAAGAATTATTAGTTTATTAGAAGAGAAAGATGTTGAA
TTTGATATCATTCAGGCAGTTGCAGGAGATACCACTTCAACATCAAAATTATTAGATGATCCAACAGACGTCTATTTTCG
AACTTCATTATTGATGGAAATGAGAAAAAATAATACACTTAATTTATTGCAAGCTGTAGTGACTCGAGCCTCTAAGTTGG
CAGCTAAAAGTTCTATCTCCAAAGATGTTATTGATCCTTTAGATTTTGTTGACAGGTCTCTATTTGAAAAGGATTGTGAA
AGAGAAATGTTTGATGTATTGGAGAAATTAAAACCTCTAGCTGTAAATTGTGATCGTGATAAATATAAGTTGTTAGCTGA
TGGGCTAGTCTCAAGCACTGAAACTTTATCCAACTTTTTTGATGGAGAAGGAAGTGTAATGGTTATGACGGAAGATGTTA
ATCTACGAAATAATAGACTTAATCTATTGACGATACTTAGGAATCAATCTTTAAAGCTTGCTGATTTCAGCAAGCTTGGT
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATGATCCATTCATTGAAGATTAAATTTTTTCTAGGACACAGAGTGTAGAAGTAATTCATATTTAGATCTACTCTTGTT
ATAAATACAAGGAAATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTATTTAATTTAATTTGATTTGGTATTGTTATTTACTGGCTTTAATACCACCTTTAATTGAACTTACCGCTAACATTTTA
TTAACTTCTTTATCATCTCT

Product: glycyl-tRNA synthetase beta subunit

Products: NA

Alternate protein names: Glycine--tRNA ligase beta subunit; GlyRS [H]

Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 719

Protein sequence:

>720_residues
MSTYLLEIGTEELPADLAESVISQLELSVNNDLNSAQIKFSEISVTTTPRRIALTIEGIAPFSEDNIAERKGPPVSQAFH
DGQPTKAAIGFAKRYELSPEKLEIRETSKGSFVFAKSIEKGKPVTTLLSDYLPRWISKIQGRRFMRWGKGDFRFSRPIRW
IVSLLDSEVLPFKISGCDPEIQIGNISRPHRLYGAKLKINDAKTYFDQLQDVGVTVDRGRRLSCINDLVLNHEIDKKVKP
DLTDPLLNELTDLIESPLLVTGCFDETFLELPPEVLSTVMKVHQRYIPLYKVNVEFDPLSLDSKNILLPTFLCISNGLPT
AKEKIIKGNEKVLKARFADASFFIKSDLLISSSSRINKLKDVTFAEGLGSLYERVNRIEWLVKLLTLKLEFDQEDIQKSV
KVAHFSKHDLVSNMVDEFPELQGIIGSKYLLHEGESRDVCLGVLEHYKPKGTSDSLPSNNLGNAVSLGERFELLISIYAK
GERPSGSSDPYALRRAANGILLILWNKDWQLNINKILDDSLIYWQQLFPSLSLDISNLLSELKEFFRQRIISLLEEKDVE
FDIIQAVAGDTTSTSKLLDDPTDVYFRTSLLMEMRKNNTLNLLQAVVTRASKLAAKSSISKDVIDPLDFVDRSLFEKDCE
REMFDVLEKLKPLAVNCDRDKYKLLADGLVSSTETLSNFFDGEGSVMVMTEDVNLRNNRLNLLTILRNQSLKLADFSKLG

Sequences:

>Translated_720_residues
MSTYLLEIGTEELPADLAESVISQLELSVNNDLNSAQIKFSEISVTTTPRRIALTIEGIAPFSEDNIAERKGPPVSQAFH
DGQPTKAAIGFAKRYELSPEKLEIRETSKGSFVFAKSIEKGKPVTTLLSDYLPRWISKIQGRRFMRWGKGDFRFSRPIRW
IVSLLDSEVLPFKISGCDPEIQIGNISRPHRLYGAKLKINDAKTYFDQLQDVGVTVDRGRRLSCINDLVLNHEIDKKVKP
DLTDPLLNELTDLIESPLLVTGCFDETFLELPPEVLSTVMKVHQRYIPLYKVNVEFDPLSLDSKNILLPTFLCISNGLPT
AKEKIIKGNEKVLKARFADASFFIKSDLLISSSSRINKLKDVTFAEGLGSLYERVNRIEWLVKLLTLKLEFDQEDIQKSV
KVAHFSKHDLVSNMVDEFPELQGIIGSKYLLHEGESRDVCLGVLEHYKPKGTSDSLPSNNLGNAVSLGERFELLISIYAK
GERPSGSSDPYALRRAANGILLILWNKDWQLNINKILDDSLIYWQQLFPSLSLDISNLLSELKEFFRQRIISLLEEKDVE
FDIIQAVAGDTTSTSKLLDDPTDVYFRTSLLMEMRKNNTLNLLQAVVTRASKLAAKSSISKDVIDPLDFVDRSLFEKDCE
REMFDVLEKLKPLAVNCDRDKYKLLADGLVSSTETLSNFFDGEGSVMVMTEDVNLRNNRLNLLTILRNQSLKLADFSKLG
>Mature_719_residues
STYLLEIGTEELPADLAESVISQLELSVNNDLNSAQIKFSEISVTTTPRRIALTIEGIAPFSEDNIAERKGPPVSQAFHD
GQPTKAAIGFAKRYELSPEKLEIRETSKGSFVFAKSIEKGKPVTTLLSDYLPRWISKIQGRRFMRWGKGDFRFSRPIRWI
VSLLDSEVLPFKISGCDPEIQIGNISRPHRLYGAKLKINDAKTYFDQLQDVGVTVDRGRRLSCINDLVLNHEIDKKVKPD
LTDPLLNELTDLIESPLLVTGCFDETFLELPPEVLSTVMKVHQRYIPLYKVNVEFDPLSLDSKNILLPTFLCISNGLPTA
KEKIIKGNEKVLKARFADASFFIKSDLLISSSSRINKLKDVTFAEGLGSLYERVNRIEWLVKLLTLKLEFDQEDIQKSVK
VAHFSKHDLVSNMVDEFPELQGIIGSKYLLHEGESRDVCLGVLEHYKPKGTSDSLPSNNLGNAVSLGERFELLISIYAKG
ERPSGSSDPYALRRAANGILLILWNKDWQLNINKILDDSLIYWQQLFPSLSLDISNLLSELKEFFRQRIISLLEEKDVEF
DIIQAVAGDTTSTSKLLDDPTDVYFRTSLLMEMRKNNTLNLLQAVVTRASKLAAKSSISKDVIDPLDFVDRSLFEKDCER
EMFDVLEKLKPLAVNCDRDKYKLLADGLVSSTETLSNFFDGEGSVMVMTEDVNLRNNRLNLLTILRNQSLKLADFSKLG

Specific function: Unknown

COG id: COG0751

COG function: function code J; Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789982, Length=726, Percent_Identity=30.7162534435262, Blast_Score=315, Evalue=7e-87,

Paralogues:

None

Copy number: 80 Molecules/Cell In: Growth Phase, Minimal Media (Based on E. coli). 400 Molecules/Cell In: Growth-Phase, Minimal-Media (Based on E. coli). 1,800 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006194
- InterPro:   IPR015944
- InterPro:   IPR002311 [H]

Pfam domain/function: PF02092 tRNA_synt_2f [H]

EC number: =6.1.1.14 [H]

Molecular weight: Translated: 81300; Mature: 81169

Theoretical pI: Translated: 5.45; Mature: 5.45

Prosite motif: PS50861 AA_TRNA_LIGASE_II_GLYAB

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTYLLEIGTEELPADLAESVISQLELSVNNDLNSAQIKFSEISVTTTPRRIALTIEGIA
CCEEEEECCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEECCC
PFSEDNIAERKGPPVSQAFHDGQPTKAAIGFAKRYELSPEKLEIRETSKGSFVFAKSIEK
CCCCCCCHHCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCC
GKPVTTLLSDYLPRWISKIQGRRFMRWGKGDFRFSRPIRWIVSLLDSEVLPFKISGCDPE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC
IQIGNISRPHRLYGAKLKINDAKTYFDQLQDVGVTVDRGRRLSCINDLVLNHEIDKKVKP
EEECCCCCCHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
DLTDPLLNELTDLIESPLLVTGCFDETFLELPPEVLSTVMKVHQRYIPLYKVNVEFDPLS
CCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCC
LDSKNILLPTFLCISNGLPTAKEKIIKGNEKVLKARFADASFFIKSDLLISSSSRINKLK
CCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHEECCCHHHHHHH
DVTFAEGLGSLYERVNRIEWLVKLLTLKLEFDQEDIQKSVKVAHFSKHDLVSNMVDEFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
LQGIIGSKYLLHEGESRDVCLGVLEHYKPKGTSDSLPSNNLGNAVSLGERFELLISIYAK
HHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEC
GERPSGSSDPYALRRAANGILLILWNKDWQLNINKILDDSLIYWQQLFPSLSLDISNLLS
CCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
ELKEFFRQRIISLLEEKDVEFDIIQAVAGDTTSTSKLLDDPTDVYFRTSLLMEMRKNNTL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
NLLQAVVTRASKLAAKSSISKDVIDPLDFVDRSLFEKDCEREMFDVLEKLKPLAVNCDRD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCH
KYKLLADGLVSSTETLSNFFDGEGSVMVMTEDVNLRNNRLNLLTILRNQSLKLADFSKLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure 
STYLLEIGTEELPADLAESVISQLELSVNNDLNSAQIKFSEISVTTTPRRIALTIEGIA
CEEEEECCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEEEECCC
PFSEDNIAERKGPPVSQAFHDGQPTKAAIGFAKRYELSPEKLEIRETSKGSFVFAKSIEK
CCCCCCCHHCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCC
GKPVTTLLSDYLPRWISKIQGRRFMRWGKGDFRFSRPIRWIVSLLDSEVLPFKISGCDPE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCC
IQIGNISRPHRLYGAKLKINDAKTYFDQLQDVGVTVDRGRRLSCINDLVLNHEIDKKVKP
EEECCCCCCHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
DLTDPLLNELTDLIESPLLVTGCFDETFLELPPEVLSTVMKVHQRYIPLYKVNVEFDPLS
CCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCC
LDSKNILLPTFLCISNGLPTAKEKIIKGNEKVLKARFADASFFIKSDLLISSSSRINKLK
CCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEEHHHEECCCHHHHHHH
DVTFAEGLGSLYERVNRIEWLVKLLTLKLEFDQEDIQKSVKVAHFSKHDLVSNMVDEFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
LQGIIGSKYLLHEGESRDVCLGVLEHYKPKGTSDSLPSNNLGNAVSLGERFELLISIYAK
HHHHHCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEC
GERPSGSSDPYALRRAANGILLILWNKDWQLNINKILDDSLIYWQQLFPSLSLDISNLLS
CCCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
ELKEFFRQRIISLLEEKDVEFDIIQAVAGDTTSTSKLLDDPTDVYFRTSLLMEMRKNNTL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
NLLQAVVTRASKLAAKSSISKDVIDPLDFVDRSLFEKDCEREMFDVLEKLKPLAVNCDRD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCH
KYKLLADGLVSSTETLSNFFDGEGSVMVMTEDVNLRNNRLNLLTILRNQSLKLADFSKLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]